- Исходный селекционный материал для создания сортов риса, устойчивых к пирикуляриозу, - линии с интродуцированными генами устойчивости к патогену Pi1, Pi2, Pi33, полученные методом маркерной селекции; в их числе - линия с тремя пирамидированными указанными генами.
- Доминантный ПЦР-маркер для выявления доноров эффективного гена устойчивости к пирикуляриозу Pi-ta. Проведенный автором массовый ПЦР- анализ коллекционных образцов риса - эффективный лабораторный и единственный способ идентификации донорных генотипов при отсутствии совместимых рас патогена.
- Кодоминантный ПЦР-маркер гена Pi-ta, с помощью которого возможен маркерный контроль аллельного состояния целевого гена в расщепляющихся популяциях в селекционных программах, направленных на создание устойчивых к пирикуляриозу сортов риса,
- Методическая схема контроля краснозерной примеси в питомниках размножения первичных звеньев семеноводства риса на основе созданного ПЦР-маркера, идентифицирующего аллельное состояние гена красной окраски перикарпа риса Rc задолго до фенотипического проявления признака (появление метелки), повышающая качество контроля. Полевая апробация методической схемы показала ее эффективность для контроля чистоты питомников размножения от засорения краснозерными формами.
- База данных, содержащая данные об аллельном разнообразии 14 микросателлитных локусов ДНК коллекционных сортообразцов и районированных сортов риса селекции ВНИИ риса. Генотипирование сортообразцов риса на основе полиморфизма ДНК (микросателлитных) - локусов целесообразно использовать в селекционном процессе, для более эффективного подбора родительских пар при гибридизации. При этом один из основных критериев подбора - разнокачественность микросателлитных профилей родительских форм планируемой комбинации скрещивания по большинству изученных локусов. В этом случае можно рассчитывать на гетерозисный эффект.
- Оптимизация системы молекулярного маркирования для оценки генетической чистоты партий семян изученных в рамках исследования простых гибридов подсолнечника отечественной селекции для последующего использования в семеноводстве этих гибридов.
- База данных, содержащая данные об аллельном разнообразии 21-го микросателлитного локуса ДНК образцов российской государственной коллекции Magnoporthe grisea (Herbert) Barr - возбудителя пирикуляриоза риса. Сравнивая микросателлитные профили вновь выделенных полевых изолятов и коллекционных образцов патогена с известным патотипом, можно оценивать степень их генетического сходства. Это усовершенствует селекционный процесс при создании устойчивых к пирикуляриозу сортов риса, облегчая генотипирование зональных популяций паразита.
- База данных, содержащая данные об аллельном разнообразии 4-х микросателлитных локусов ДНК экотипов злостного сорняка рисовых полей рода Echinochloa (ежовники), собранных из разных зон рисосеяния стран СНГ, для использования ее при изучении зависимости отзывчивости разных генотипов сорняка на гербициды, применяемые в системе рисоводства в России, а также в селекционных программах, направленных на создание сортов риса с высокой энергией роста из-под слоя воды при безгербицидной технологии борьбы с сорняками рисовых полей.
1. Мухина, Ж.М. Комплексный подход к селекции риса на устойчивость к пирикуляриозу с применением молекулярных маркеров / В.С. Ковалев, Ж.М. Мухина, Е.Т. Ильницкая [и др.] // Доклады Российской академии с.-х. наук, 2006. - №4. - С.10–12.
2. Мухина, Ж.М. Создание внутригенного ДНК-маркера гена устойчивости к пирикуляриозу риса Pi-b и его использование в практической селекцию / И.И. Супрун, Е.Т. Ильницкая, Ж.М. Мухина // С.-х. биология, 2007. - № 5. -С.63-67.
3. Мухина, Ж.М. Поиск доноров гена расоспецифической устойчивости риса к пирикуляриозу Pi-b с помощью методов молекулярного маркирования / Ж.М. Мухина, Е.М. Харитонов, Е.Т. Ильницкая [и др.] // Доклады Российской Академии с.-х. наук, 2008. - № 5. - С.13-14.
4. Мухина, Ж.М. Создание исходного селекционного материала риса, устойчивого к пирикуляриозу, с применением методов маркерной селекции / Ж.М. Мухина, Е.М. Харитонов, Е.Т. Ильницкая [и др.] // Вестник РАСХН, 2008. - № 4. – С.34.
5. Мухина, Ж.М. Изучение биоразноразнообразия возбудителя пирикуляриоза риса молекулярно-генетическими методами / Ж.М. Мухина, С.В. Волкова, Т.М. Коломиец [и др.] // Труды КубГАУ, 2008. - 5 (14). - С.112-114.
6. Мухина, Ж.М. Изучение биоразнообразия сорных растений рода Echinochloa на территории Краснодарского края на основе морфологического и молекулярно-генетического подходов / Ж.М. Мухина, Г.Л. Зеленский, Д.П. Кассанелли [и др.] // Труды КубГАУ, 2008.- 2 (11). - С.110-114.
7. Мухина, Ж.М. Применение методов молекулярного маркирования для оценки сортовых качеств семян простых гибридов подсолнечника / Ж.М. Мухина, Ю.А. Мягких, С.В. Токмаков // Масличные культуры. Науч.-техн. бюлл. ВНИИМК. – Краснодар, 2009. – Вып.2 (141). - С.13–17.
8. Мухина, Ж.М. Создание молекулярного маркера для оценки внутривидового полиморфизма по гену Rc, обуславливающему красную окраску перикарпа риса oryza sativa / С.В. Токмаков, Ж.М. Мухина, Д.И. Богомаз [и др.] // Экологическая генетика, 2011. - 11(3).- С.57 – 67.
9. Мухина, Ж.М. Картирование территорий Краснодарского края и Ростовской области по видовому составу и распространенности сорных растений. Создание коллекции видов грибных патогенов и штаммов, перспективных для создания микогербицидов / Ж.М. Мухина, Д.П. Кассанелли, Т.М. Коломиец [и др.] // Труды КубГАУ, 2011. - 1(28). - С.60 - 65.
10. Мухина, Ж.М. Молекулярное маркирование в селекции риса на устойчивость к пирикуляриозу / С.В. Токмаков, Е.В. Дубина, Ж.М. Мухина // Труды КубГАУ, 2011. - № 2(29). - С.132–134.
11. Мухина, Ж.М. Изучение феномена возникновения «краснозерных фенокопий» белозерных сортов риса на основе молекулярно-генетического подхода / С.В. Токмаков, Ж.М. Мухина, Е.В. Дубина // Труды КубГАУ, 2011. - № 2 (29). - С.97–99.
12. Мухина, Ж.М. Создание внутригенных молекулярных маркеров риса для повышения эффективности селекционного и семеноводческого процессов / Ж.М. Мухина, С.В. Токмаков, Ю.А. Мягких [и др.] // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета. Режим доступа: http//ej.kubagro.ru/2011/03/pdf/19.pdf. № 67(03). - 2011.
13. Мухина, Ж.М. Интрогрессия генов Pi-ta, Pi-b, Pi-z в отечественный сорт риса Снежинка с применением методов маркерной селекции / Е.В. Дубина, Ж.М. Мухина // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета. Режим доступа: http//ej.kubagro.ru/2011/03/pdf/19.pdf. № 66(02). - 2011.
14. Мухина, Ж.М. Молекулярные маркеры и их использование в селекционно- генетических исследованиях / Ж.М. Мухина, Е.В. Дубина // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета. Режим доступа: http//ej.kubagro.ru/2011/03/pdf/19.pdf. № 66(02). – 2011.
II. Монография
15. Мухина, Ж.М. Использование ДНК-маркеров для изучения генетического разнообразия растительных ресурсов // Краснодар: Просвещение-Юг, 2008. – 99 с.
III. Научные статьи в аналитических сборниках и материалах конференций
16. Мухина, Ж.М. Генотипирование российских сортов риса микросателлитными маркерами / Ж.М. Мухина, В.С. Ковалев, И.И. Супрун [и др.] // Рисоводство, 2002. - №2. - С.32-35.
17. Мухина, Ж.М. Сортовая идентификация риса с использованием белковых маркеров / Е.В. Кругликова, Ж.М. Мухина // Материалы междунар. науч. интернет-конф. – Ставрополь, 2002. - С.122-127.
18. Мухина, Ж.М. Апробация метода изоэлектрофокусирования применительно к отечественным сортам риса / Е.В. Кругликова, Ж.М. Мухина, В.С. Ковалев // Рисоводство, 2002. - №1. - С.21-22.
19. Мухина, Ж.М. Молекулярное маркирование генетической плазмы риса на основе полиморфизма проламинов / Ж.М. Мухина, И.И. Супрун, Е.В. Кругликова // Междунар. науч.-практ. конф.: Трансгенные растения – новое направление в биологической защите растений. – Краснодар, 2002. – С.238–241.
20. Мухина, Ж.М. Проламин зерновки риса и его использование в селекции и семеноводстве / Е.В. Кругликова, Ж.М. Мухина, В.С. Ковалев // Рисоводство, 2002. - №2. - С.44- 49.
21. Мухина, Ж.М. Сортовая идентификация риса с использованием белковых маркеров / Е.В. Кругликова, Ж.М. Мухина // Материалы междунар. науч. интернет-конф. – Ставрополь, 2002. - С.122-127.
22. Мухина, Ж.М. Системы молекулярного ДНК-маркирования и их использование в селекционно-генетических исследованиях риса / И.И. Супрун, Ж.М. Мухина, Е.Т. Ильницкая // Рисоводство, 2003. - №3. -С.25-30.
23. Мухина, Ж.М. Селекция устойчивых к пирикуляриозу сортов риса с использованием методов молекулярной биологии / Е.Т. Ильницкая, Ж.М. Мухина // Научное обеспечение агропромышленного комплекса: материалы 5-й региональной науч.–практ. конф. молодых ученых. - 18–19 декабря 2003 г. / КубГАУ. – Краснодар, 2003. – С.315-317.
24. Мухина, Ж.М. Идентификация количественных локусов полевой устойчивости риса к пирикуляриозу / И.И. Супрун, Ж.М. Мухина, Е.М. Харитонов // Рисоводство, 2004. - №4. - С.33-37.
25. Мухина, Ж.М. Молекулярный полиморфизм Waxy-гена у сортов риса российской селекции с различным содержанием амилозы / И.И. Супрун, Ж.М. Мухина, Е.М. Харитонов // Рисоводство, 2004. - №5. - С.18.
26. Мухина, Ж.М. Создание сорта риса с длительной полевой устойчивостью к пирикуляриозу/ И.И. Супрун, Ж.М. Мухина, Е.Т. Ильницкая // Материалы докладов междунар. науч.-практ. конф.: «Биологическая защита растений -основа стабилизации агроэкосистем». – Краснодар, 2004. – Вып.3. - С.149-151.
27. Мухина, Ж.М. Селекция риса на устойчивость к пирикуляриозу с применением молекулярного маркирования / И.И. Супрун, Ж.М. Мухина, Е.М. Харитонов // Сб. науч. трудов, посвященный 90-летию КНИИСХ им. П.П. Лукьяненко. – Краснодар, 2004. - Т.3. - С.279-284.
28. Mukhina, Zh.M. Marker assisted selection on rice blast resistance / E.M. Kharitonov, Zh.M. Mukhina, E.T. Ilnitskaya, I.I. Suprun // Proceeding of the conference «Challenges and opportunities for sustainable rice-based production systems». – Turin, 2004. - P.410-411.
29. Мухина, Ж.М. Пирамидирование генов устойчивости к пирикуляриозу риса Pi-1, Pi-2, Pi-33 с помощью молекулярных маркеров / Е.Т. Ильницкая, Ж.М. Мухина // Рисоводство, 2004. - №5. - С.32-33.
30. Мухина, Ж.М. Создание устойчивых к пирикуляриозу сортов риса с привлечением методики маркерной селекции / Е.Т. Ильницкая, Ж.М. Мухина // Эволюция научных технологий в растениеводстве: сб. науч. трудов, посвященных 90-летию КНИИСХ им. П.П.Лукьяненко. – Краснодар, 2004. – Т.3. - С.284-286.
31. Мухина, Ж.М. Изучение биоразнообразия возбудителя пирикуляриоза риса фитопатологическими и молекулярными методами / С.А. Волкова, Ж.М. Мухина // Рисоводство, 2004. - №4. – С.101-104.
32. Мухина, Ж.М. Апробация метода электрофореза в кислом (pH 3,2) буфере для целей сортовой идентификации и контроля сортовой чистоты риса. – Эволюция научных технологий в растениеводстве / Е.В. Дубина, Ж.М. Мухина // Сб. научных трудов в честь 90-летия со дня образования Краснодарского НИИСХ им. П.П. Лукъяненко. – Краснодар, 2004. - С.273.
33. Мухина, Ж.М. Биотехнологические подходы к изучению пирикуляриоза риса / С.А. Волкова, Ж.М. Мухина // Рисоводство, 2004. - №4. – С.44-46.
34. Мухина, Ж.М. Фило-географическое изучение Magnaporthe grisea (Herbert) Barr фитопатологическими и молекулярными методами / С.А. Волкова, Ж.М. Мухина // Материалы докладов междунар. науч.-практ. конф.: «Биологическая защита растений - основа стабилизации агроэкосистем». – Краснодар, 2004. - №3. - С.47-48.
35. Мухина, Ж.М. Фило-географическое изучение популяций Magnaporthe grisea (Herbert) Barr / С.А. Волкова, Ж.М. Мухина // Материалы всероссийской науч. конф. молодых ученых и студентов: «Современное состояние и приоритеты развития фундаментальных исследований в регионах». – Анапа, 2004. –С.52-53.
36. Мухина, Ж.М. Адаптация методики микросателлитного анализа для изучения генетического разнообразия сортов винограда пино белый, рислинг и их клонов / А.С. Звягин, Л.П. Трошин, Ж.М. Мухина [и др.] // «Новации и эффективность производственных процессов в виноградарстве и виноделии». – Т.II. - Виноградарство. – Краснодар, 2005. – С.113-117.
37. Мухина, Ж.М. Селекция риса на устойчивость к пирикуляриозу с применением методов молекулярного (микросателлитного) маркирования / Е.Т. Ильницкая, С.А. Волкова, Ж.М. Мухина // Новые и нетрадиционные растения и перспективы их использования: материалы 6-го междунар. симпозиума. – Москва–Пущино, 2005. – Т.II. – С.288-290.
38. Мухина, Ж.М. Филогеографическое изучение популяции возбудителя пирикуляриоза / С.А. Волкова, Ж.М. Мухина // Материалы всероссийской науч.-практ. конф.: «Развитие инновационных процессов в рисоводстве – базовый принцип стабилизации отрасли». – Краснодар, 2005. – С.51-52.
39. Мухина, Ж.М. Использование метода молекулярного маркирования для решения проблемы пирикуляриоза / С.А. Волкова, Ж.М. Мухина // Материалы международной научной конференции «Устойчивое производство риса: настоящее и перспективы»: материалы междунар. науч.-практ. конф. - Краснодар, Россия, 5-9 сентября 2006. – С.199-201.
40. Мухина, Ж.М. Перенос генов устойчивочти к пирикуляриозу в сорта риса с помощью маркерного контроля / П.И. Костылев, Н.Н. Вожжова, Е.Т. Ильницкая, Ж.М. Мухина // Устойчивое производство риса: настоящее и перспективы: материалы междунар. науч.-практ. конф. - Краснодар, Россия, 5-9 сентября 2006. - С.98-107.
41. Мухина, Ж.М. Идентификация фитопатогенных грибов для биологического контроля тростника обыкновенного – Phragmitis australis / Т.М. Коломиец, Л.Ф. Панкратова, Ж.М. Мухина [и др.] // Устойчивое производство риса: настоящее и перспективы: материалы междунар. науч.-практ. конф. -Краснодар, Россия, 5-9 сентября 2006.- С.266.
42. Мухина, Ж.М. Изучение биоразнообразия растений рода Echinochloa на территории Краснодарского края / Ж.М. Мухина, С.А. Волкова, Д.П. Кассанелли [и др.] // Устойчивое производство риса: настоящее и перспективы: материалы междунар. науч.-практ. конф. - Краснодар, Россия, 5-9 сентября 2006. - С.278.
43. Мухина, Ж.М. Маркерная селекция как ресурсосберегающая технология в селекции важных сельскохозяйственных культур / Ж.М. Мухина, Т.Е. Соловьева, Д.А. Соловьев // Российское предпринимательство: современное состояние и приоритеты развития. Коллективная монография. - Краснодарский Центр науч.-техн. информации. Кубанский государственный университет, 2008. - С.152–160.
44. Мухина, Ж.М. Создание кодоминантного молекулярного ПЦР-маркера для идентификации гена расоспецифической устойчивости к пирикуляриозу риса Pi-ta / Ж.М. Мухина, Ю.А. Мягких, Д.И. Богомаз [и др.] // Рисоводство, 2008. - №12. – С.3–6.
45. Мухина, Ж.М. Использование молекулярно-генетических подходов для идентификации гена расоспецифической устойчивости к пирикуляриозу риса Pi-tа / Ж.М. Мухина, Ю.А. Мягких, С.В. Токмаков // Материалы XVII междунар. Симпозиум: «Нетрадиционное растениеводство. Селекция. Охрана природы. Эниология. Экология и здоровье». – Алушта, 2008. -С.472-473.
46. Мухина, Ж.М. Поиск грибов – потенциальных агентов биологического контроля сорного растения Echinichloa crus-galli (L.) Beauv. / Т.М. Коломиец, О.О. Скатенок, Ж.М. Мухина [и др.] // «50 лет на страже продовольственной безопасности страны»: юбилейный сб. трудов. -Большие Вяземы, 2008. - С.453–460.
47. Мухина, Ж.М. Отбор грибных фитопатогенов на территории Краснодарского края России для биологического контроля наиболее значимых сорняков / Т.М. Коломиец, Е.Д. Коваленко, Ж.М. Мухина [и др.] // «50 лет на страже продовольственной безопасности страны»: юбилейный сб. трудов. - Большие Вяземы, 2008. - С.461–471.
48. Мухина, Ж.М. Создание внутригенных ДНК-маркеров и их использование в практической селекции риса / Ж.М. Мухина, И.И. Супрун, Е.Т. Ильницкая [и др.] // 5-й Московский междунар. конгресс: «Биотехнология: состояние и перспективы развития», 16–20 марта 2009.
49. Мухина, Ж.М. Молекулярно-генетический подход к созданию исходного материала в программах селекции риса / Ю.А. Мягких, Ж.М. Мухина, С.В. Токмаков // Материалы: междунар. науч.-практ. конф.: «Селекция сортов риса, устойчивых к абиотическим и биотическим стрессам, для стран умеренного климата и Центральной Азии». – Краснодар, 2009. -С.60-63.
50. Мухина, Ж.М. Создание внутригенного маркера к гену RC окраски перикарпа краснозерного риса / С.В. Токмаков, Ж.М. Мухина, Ю.А. Мягких // Материалы: междунар. науч.-практ. конф.: «Селекция сортов риса, устойчивых к абиотическим и биотическим стрессам, для стран умеренного климата и Центральной Азии». – Краснодар, 2009. -С.75-78.
51. Мухина, Ж.М. Изучение генетической однородности сортов риса в системе
первичного семеноводства на основе прмененя молекулярно-генетических методов / Дубина Е.В., Мухина Ж.М., Солонина Т.В., Трофимова И.А., Коркина Н.Н., Науменко В.П., Токмаков С.В. // Материалы междунар. науч.-практ. конф.: Основные направления селекции и современные технологии повышения адаптационного потенциала культуры риса в странах умеренного климата. – Краснодар, 2011.- С.128-135.
52. Mukhina, Zh.M. The usage of prolamin storige proteins polimorphism for identification and estimation of rice cultivars purity / E.V. Kruglikova, Zh. Mukhina, V.G. Vlasov // Proceedings of Eurorice 2001 Symposium. -Krasnodar, Russia, 2001.
53. Mukhina, Zh.M. Polymorphism of prolamines of rice variety kernels, widely used in seed production and storage of proteins formula / E.V. Kruglikova, Zh. Mukhina, V.G. Vlasov, V.S. Kovalyov // Proceedings of Eurorice 2001 Symposium. - Krasnodar, Russia, 2001.
54. Mukhina, Zh.M. Genotyping of russian rice cultivars by microsatellite markers / J. Chantereau, Zh. Mukhina // Dissemination Conference of current European Research on Rice. - June 6-8, 2002. - Р.61.
55. Mukhina, Zh.M. Mutual benefits through formalized international collaboration on biological control of weeds with plant pathogens / D. Berner, T. Souissi, E.Smallwood, C. Cavin, F. Eskandari, B. Tunali, O. Buyuk, A. Yildirim, Z. Mukhina [et al.] // Tunisian Journal of Plant Protection, 2011. - №6. – Р.74.
III. Методические разработки
56. Мухина, Ж.М. Изучение биоразнообразия фитопатогенного гриба Magnaporthe grisea (Herbert) Barr с использованием методов молекулярного маркирования / Ж.М. Мухина, С.А. Волкова, Е.В. Дубина [и др.] // Методические рекомендации. – Краснодар, 2007. – 19 с.
IV. Авторские свидетельства на гибриды подсолнечника
57.А.с. № 44648. Подсолнечник МАХАОН 40 / Мухина Жанна Михайловна, Бенко Н.И., Бенко И.Н. - № 9464416; Заявл. 27.12.2005. - (Зарег. Гос. ком. РФ по исп. и охране селекц. достиж.).
58.А.с. № 40606. Подсолнечник АНЮТА / Мухина Жанна Михайловна, Бенко Н.И. - № 9610331; Заявл. 09.12.2003. - (Зарег. Гос. ком. РФ по исп. и охране селекц. достиж.).
59.А.с. № 46072. Подсолнечник ДАЯ / Бенко Илья Николаевич, Бенко Н.И., Мухина Ж. М. - № 9359455; Заявл. 28.11.2006. - (Зарег. Гос. ком. РФ по исп. и охране селекц. достиж.).
60.А.с. № 38165. Подсолнечник ВУЛКАН / Мухина Жанна Михайловна, Васильев А.В. - № 9705075; Заявл. 13.02.2002. - (Зарег. Гос. ком. РФ по исп. и охране селекц. достиж.).
61.А.с. № 54209. Подсолнечник ЛЮБО / Мухина Жанна Михайловна, Бенко И.Н., Бенко Н.И. - № 9252993; Заявл. 14.11.2007. - (Зарег. Гос. ком. РФ по исп. и охране селекц. достиж.).