Помимо профессиональной научно-медицинской деятельности М.М. Мамакеев активно вел общественно-политическую деятельность в качестве депутата Фрунзенского городского совета депутатов двух созывов; депутата Верховного Совета Киргизской ССР двух созывов; депутата Жогорку Кенеша Кыргызской Республики двух созывов. На сегодня Мамакеев М.М. - академик Национальной академии наук Кыргызской Республики; член Всемирной Ассоциации хирургов-гастроэнтерологов (Греция), Международной Ассоциации хирургов (Швейцария) и Международной Ассоциации хирургов им. Н.И. Пирогова (Российская Федерация), академик Академии медицинских наук Республики Казахстан; Президент Ассоциации хирургических обществ Кыргызской Республики; Лауреат Государственной премии Кыргызской Республики в области науки и техники; Лауреат премии им. И.К.Ахунбаева НАН КР, Лауреат Международной премии «Руханият», Заслуженный деятель науки Кыргызской Республики; Заслуженный врач Кыргызской Республики; директор Национального хирургического центра; профессор кафедры госпитальной хирургии с курсом оперативной хирургии Кыргызской Государственной медицинской академии.
Перечень кандидатских диссертаций утвержденных ВАК СССР или ВАК КР, выполненных под руководством академика М.М. Мамакеева.
Сулайманов Т.С.Значение билиодигестивных анастомозов в оперативном лечении острого холецистита и осложненной желчекаменной болезни, 1971
Акматов А.А. Невротомия и новокаиновые блокады нервов поджелудочной железы при остром панкреатите в клинике и эксперименте, 1975
Кутманбеков А.К. Показатели гемодинамики и данные эндоскопии в оценке тяжести состояния больных при ГД кровотечениях язвенной этиологии, 1983
Бектуров Ж.Т. Объективизация тактических решений при ранениях и разрывах лёгких, 1989
Ниязов Б.С. Клиническая гистохимия печени при остром холецистите, 1989
Абдуллаев Ж.С. Обоснование тактики хирурга при кровотечениях из хронической язвы желудка и двенадцатиперстной кишки, 1992
Абдымомунов Т.С. Сравнительная оценка эффективности дренирующих сорбентов Гелевин и Дебризан в лечении гнойных ран, 1993
Уметалиев Ю.К.Пути оптимизации диагностики острого аппендицита, 1993
Маллаев А.М.Диагностические, тактические и технические решения для оперативных вмешательств при сочетанных ранениях груди и живота, 1994
Алыбаев Э.У.Пути совершенствования радикального хирургического лечения перфоративной язвы двенадцатиперстной кишки, 1994
Калжикеев А.М.Пути оптимизации лечения разлитого перитонита, 1994
Сыдыгалиев К.С.Коррекция постгастрорезекционной энтеральной недостаточности при остром язвенном кровотечении, 1994
Токтоматов Н.Т.Лечение острого лактационного мастита в условиях полустационара, 1994
Тойгонбаев А.Т.Оптимизация лапароскопической диагностики при острых хирургических заболеваниях органов брюшной полости, 1995
Иманов Б.М.Оптимизация и оценка эффективности тактико-технических решений при остром деструктивном панкреатите, 1999
Байсеркеев З.Б.Гистоэнзимологическая оценка и прогнозирование жизнеспособности почечного трансплантата, 2003
Сыдыгалиев Н.А.Логико-информационное моделирование аварийно компенсаторного и лечебно детерминированного регулирования крови при остром холецистите, 2004
Акназаров К.КСравнительная эффективность методов комбинированной интра- и экстракорпоральной детоксикации при тяжелом эндотоксикозе и полиорганной недостаточности, 2005
Коомбаев К.К.Результаты хирургического протезирования зубов с опорой на пластиночные дентальные имплантаты,2006
Маллаев С.Х.Клинико-математические модели диагностики и хирургических решений
при осложненном раке ободочной кишки в зависимости от локализации опухоли, 2006
Тилеков Э.А.Сравнительная диагностическая и лечебная эффективность лапароскопии с использованием озоносанации и региональной лимфостимуляции при острой пельвиоабдоминальной патологии, 2006
Рысбеков М.Т.Комплексная оперативно-техническая профилактика постгастрорезекционных расстройств при осложненной язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки, 2007
Жортучиев Р.К.Конверсия лапароскопической холецистэктомии, 2009
Перечень докторских диссертаций утвержденных ВАК СССР или ВАК КР, при выполнении которых Вы являлись научным консультантом.
Ашимов И.А.Комплексная диагностика, оценка и коррекция клинико-физиологических и морфофункциональных нарушений при остром холецистите, 1995
Ниязов Б.С.Морфофизиология печени при остром холецистите и осложненной ЖКБ, 1999
Усупбаев А.Ч.Клинико-функциональная взаимосвязь почечно-каменной болезни с заболеваниями органов пищеварения, их лечение и профилактика, 2000
Кутманбеков А.К.Комплексное определение метода и срока лечения при гастродуоденальных кровотечениях язвенной этиологии, 2002
Бектуров Ж.Т.Полисистемные нарушения и тактико-технические решения при травме органов грудной полости и живота, 2003
Маллаев А.М.Клиническая рискология тяжелых сочетанных травм и ранений, 2003
Уметалиев Ю.К.Острый осложненный аппендицит: диагностические и тактико-технические решения, 2004
Сопуев А.А.Медико-социальный анализ острой хирургической патологии и неотложная хирургическая помощь при острых заболеваниях органов брюшной полости в кыргызской республике, 2004
Алыбаев Э.У.Органосохраняющие операции при пилородуоденальных перфоративных язвах, 2004
Мамбетов Ж.С.Оптимизация диагностики и лечения хронического простатита, сочетающегося с заболеваниями аноректальной области, 2005
Салибаев О.А.Профилактика и методы коррекции хирургических заболеваний у мужчин-призывников в Кыргызской Республике, 2009
Мамакеев является автором 216 научных трудов, в том числе:
а) Мамакеев М.М., Сопуев А.А., Иманов Б.М. Хирургическое лечение обширного панкреонекроза // Хирургия. - 1998. - №7. - С.31-33.
б) Мамакеев м.м., Сопуев А.А., Иманов Б.А. Хирургическое лечение острого некротического панкреатита // Хирургия. - 1999. - №12. - С.28-32.
в) Мамакеев М.М., Сопуев А.А., Салибаев О.А. Измерение скорости распространения поверхностных акустических волн в прогнозировании и диагностике течения раневого процесса // Хирургия. - 2000. - №1. - С.54-55.
М.М. Мамакеев является автором 13 монографий, в том числе на русском языке:
Мамакеев М.М. ХИРУРГИЧЕСКОЕ ЛЕЧЕНИЕ ОСТРОГО ХОЛЕЦИСТИТА. – Фрунзе, «Кыргызстан», 1971. – 308 с. (21 п.л.)
Мамакеев М.М. ОБХОДНЫЕ АНАСТОМОЗЫ ПРИ ОСЛОЖНЕННОЙ ЖЕЛЧНОКАМЕННОЙ БОЛЕЗНИ. – Фрунзе: Изд-во «Кыргызстан», 1974. – 236 с. (13,8 п.л.).
Мамакеев М.М., Акматов А.А. ОСТРОЕ ВОСПАЛЕНИЕ ПОДЖЕЛУДОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ (КЛИНИЧЕСКОЕ И ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЯ). – Фрунзе: Изд-во «Кыргызстан», 1977. – 242 с. (14 п.л.).
Мамакеев М.М. ХИРУРГИЧЕСКОЕ ЛЕЧЕНИЕ ОСТРОГО ХОЛЕЦИСТИТА И ОСЛОЖНЕННОЙ ЖЕЛЧНОКАМЕННОЙ БОЛЕЗНИ. – Фрунзе: Изд-во «Кыргызстан», 1981. – 275с. (16п.л.).
Рожинский М.М., Мамакеев М.М., Кожокматов С.К. ЗАКРЫТАЯ ТРАВМА ЖИВОТА. – Фрунзе: Изд-во «Кыргызстан», 1986. – 136 с. (8 п.л.)
Мамакеев М.М., Рожинский М.М. ОТКРЫТАЯ ТРАВМА ЖИВОТА. – Фрунзе: Изд-во «Кыргызстан», 1990. – 145 с. (8,5 п.л.).
Мамакеев М.М., Рожинский М.М., Бектуров Ж.Т. ХИРУРГИЧЕСКАЯ ТАКТИКА ПРИ РАНЕНИЯХ И РАЗРЫВАХ ЛЕГКИХ. – Бишкек: Изд-во «Кыргызстан», 1994.- 168 с. (9,8 п.л.).
Горбашко А.И., Мамакеев М.М., Рахманов Р.К., Батчаев О.Х., Абдуллаев Д.С. ПИЛОРУССОХРАНЯЮЩИЕ РЕЗЕКЦИИ ЖЕЛУДКА. – Бишкек, 1995. – 128 с. (8,0 п.л.)
В 1970 г. Мамакеев М.М. защитил докторскую диссертацию на тему: «Хирургическое лечение острого холецистита и осложненной желчнокаменной болезни».