Кандидатские диссертации, руководителем которых был Чернодубов А.И.:
1. Авдеева И.А. Культуры сосны обыкновенной в Хреновском бору [Текст]: дис. … канд. с.-х. наук: 06.03.01 / И.А. Авдеева. – Воронеж, 2002. .
2. Галдина Т.Е. Сосна обыкновенная из таежных и смешанных лесов в географических культурах Центральной лесостепи [Текст]: дис. … канд. с.-х. наук : 06.03.01 / Т.Е. Галдина. – Воронеж, 2003.
3. Горгун А.И. Измечивость и фитоценотическая структура можжевельников Черноморского побережья Кавказа (на примере Анапского лесхоза) [Текст]: дис. … канд. с.-х. наук: 03.00.16/А. И. Горгун. – Воронеж, 2006.
4. Деденко Т.П. Рост лесных культур в антропогенно-меловых ландшафтах ЦЧО [Текст]: дис. … канд. с.-х. наук: 06.03.01/Деденко Т.П.- Воронеж, 2006.
5.Клещева Е.В. Индивидуальная изменчивость березы повислой по формам трещиноватости коры в ЦЧО [Текст]: дис. … канд. с.-х. наук: 06.03.01/Клещева Е.В. – Воронеж, 2007.
6. Попов Г.Д. Эколого-генетические основы селекции яблони на зимостойкость [Текст]: дис. … канд. с.-х. наук: 03.00.16 / Г. Д. Попов. – Воронеж, 2003.
7.Федосова Т.В. Фитоценотическая структура лесных сообществ и лесоразведение на карбонатных почвах Белгородской области (на примере Шебекинского лесничества): дис. … канд. с.-х. наук: 03.06.01/ Т.В. Федосова.- Воронеж: 2009.
8. Филиппова,В.О. Культуры сосны обыкновенной в Усманском бору [Текст] : дис. … канд. с.-х. наук : 06.03.01 / В. О. Филиппова. – Воронеж, 2006.
9. Фуников А.И. Каштан посевной на Северо-Западном Кавказе (изменчивость, селекция, лесные культуры) [Текст]: дис. … канд. с.-х. наук: 06.03.01 / А. И. Фуников. – Воронеж, 2003.
Докторская диссертация, кнсультантом которой был Чернодубов А.И.:
1. Максименко, А.П. Лесоразведение в Восточном Приазовье [Текст]: дис. … д-ра с.-х. наук: 06.03.04 и 06.03.01 / А. П.Максименко. – Воронеж, 2003.
Чернодубовым А.И. опубликовано 153 научные и методические работы. Основные из них:
1. Характеристика ясенево-дубовых ценозов Центральной лесостепи [Текст]/А.И. Чернодубов, Е.Е. Шелестов //Лесн.журнал.- 2008.- №6.- С.76-80.
2. Цитологический мониторинг аутохтонных лесов Усманского и Хреновского боров [Текст]/А.К. Буторина и др. // Известия РАН. Сер. биол.- 2007.- N4 .- С.508-512.
3. Цитогенетические особенности экотипа сосны меловой [Текст] / А. К. Буторина, И. Г. Мозгалина, А. И. Чернодубов // Лесоведение. –2002. – № 2. – С. 42-46.
4. Меловые боры: современное состояние, селекция, семеноводство, лесные культуры [Текст] / А.И. Чернодубов // Лесохозяйственная информация. – 1995. – № 4. – С. 134-147.
5. The Structure of the Pinus sylvestris in the Insular Pine Forests of the South Russian Plain [Text] / A.I. Chernodubov // Silvae Genetica. – 1994. – V. 34, № 4. – P. 186-189.
Монографии:
1. Эфирные масла сосны [Текст]/ А.И. Чернодубов, Р.И. Дерюжкин. – Воронеж: ВГУ, 1990. – 112 с.
2. Островные боры Восточно-Европейской равнины: история, генетика, экология, география [Текст] / А.И. Чернодубов; ВГЛТА, 1995. – 190 с. – Деп. в ВИНИТИ, № 1424-В95.
3. Сосна обыкновенная в островных борах юга Русской равнины [Текст] / А.И. Чернодубов. – Воронеж: ИПЦ ВГПУ. 1998. – 80 с.
4. Каштан посевной на северном макросклоне Кавказа [Текст] / А.И. Фуников, А.И. Чернодубов. – Воронеж-Апшеронск, 2003. – 80 с.
5. Лесные эфирномасличные и лекарственные растения Центрального Черноземья [Текст] / А.И. Чернодубов. – Воронеж, 2002. – 80 с.
6. Географические культуры сосны обыкновенной на юге Русской равнины [Текст] / А.И. Чернодубов, Т.Е. Галдина, О.А. Смогунова. – Воронеж, 2005. – 128 c.
7. Сосна обыкновенная в островных борах Восточно-Европейской равнины [Текст] // А.И. Чернодубов. – Воронеж: ВГЛТА, 2009.- 156с.
Докторская диссертация на тему «Внутривидовая изменчивость и популяционная структура Pinus sylvestris L. в островных борах Восточно-Европейской равнины» была защищена Чернодубовым А.И. в 1996 году в Санкт-Петербургской лесотехнической академии.
Чернодубов А.И. - Член Ученого Совета ВГЛТА и лесохозяйственного факультета; редколлегии «Лесного журнала»; докторского диссертационного Совета при Всероссийском научно-исследовательском агролесомелиоративном институте (ВНИАЛМИ) г. Волгоград; действительный член Нью-Йорской академии наук; награжден медалью Н.И.Вавилова. Имееет 2 патента на изобретения.