По окончании высшего учебного заведения с 1997 по 2010 год работал в органах федеральной службы безопасности. Последняя должность - заместитель начальника Инспекторского управления ФСБ России. В 2008-2009 годах неоднократно исполнял обязанности начальника Инспекторского управления ФСБ России.
Имеет государственные и ведомственные награды.
С 2010 года заместитель генерального директора корпорации «Русские машины». Член Совета директоров «Военно-промышленной компании».
С 2017 г. – директор по защите ресурсов корпорации РУСАЛ. С 2019 г. – в банке «Союз».
С 2017 года по совместительству – заведующий кафедры адвокатуры и правоохранительной деятельности Российского государственного социального университета.
В 2016-2019 г.г. Председатель государственной экзаменационной комиссии Московской юридической академии им. О.Е. Кутафина.
В 2002 году защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата юридических наук по теме «Прослушивание телефонных переговоров в оперативно-розыскной деятельности и уголовном процессе». В 2004 году защитил диссертацию на соискание ученой степени доктора юридических наук по теме «Теория и правовая регламентация оперативно-розыскных мероприятий».
Автор более 400 научных и учебно-методических работ, в том числе 21 монографии.
Академик РАЕН, член-корреспондент РАРАН, член-корреспондент РАЕ.
С.И. Захарцев входит в 20 наиболее цитируемых в России юристов. Самый цитируемый российский ученый в науке оперативно-розыскной деятельности России. Член редакционных коллегий многих юридических журналов.
В 2004 году первым обосновал и разработал открытую (несекретную) теорию оперативно-розыскных мероприятий как частную теорию науки оперативно-розыскной деятельности (ОРД). Создал новую прикладную юридическую науку – оперативно-розыскное экстрасенсоведение, знания которой сейчас активно используются в борьбе с преступностью. Является разработчиком нового научного направления – философии ОРД.
Как теоретик и философ права получил известность после разработки вместе с В.П. Сальниковым компрехендной теории права, ставшей широко известной в России и за рубежом. Является автором обоснования правового прогресса. Посвятил много работ правосознанию и профессиональной деформации, биомедицинским экспериментам над человеком и информационному пространству как угрозе правам человека.
Как философ вместе с В.П. Сальниковым является автором гипотезы катаклизмов и круговорота человеческой жизни на Земле. Является автором концепции убыстрения темпа жизни на Земле.
Автобиография С.И. Захарцева приведена в Википедии.
Работы С.И. Захарцева переведены на английский, немецкий, французский, украинский, казахский и таджикский языки.
Научные публикации:
Основные научные труды
1. Захарцев С.И. Оперативно-розыскные мероприятия в России и за рубежом: Монография / Под общ. ред. В.П. Сальникова. – СПб.: Фонд «Университет», 2003. ISBN 5-94201-342-X
2. Захарцев С.И. Оперативно-розыскные мероприятия. Общие положения: Монография. – СПб.: «Юридический центр «Пресс», 2004. 18,5 п.л.
3. Винниченко Н.А., Захарцев С.И., Рохлин В.И. Правовая регламентация использования результатов оперативно-розыскной деятельности в уголовном судопроизводстве: Монография / Под общ. ред. В.П. Сальникова. – СПб.: Фонд «Университет», 2004. 11 п.л.
4. Захарцев С.И., Медведев В.Н. Снятие информации с технических каналов связи: правовые вопросы. Монография / Под общ. ред. В.П. Сальникова. – СПб.: Фонд «Университет», 2004. 10 п.л. ISBN 5-94201-342-X
5. Захарцев С.И. Оперативно-розыскные мероприятия: Теория и практика. Монография / Под ред. В.П. Сальникова. – СПб.: Санкт-Петербургский университет МВД России, 2004. 20,5 п.л.
6. Евстратиков Б.М., Захарцев С.И., Медведев В.Н., Сальников В.П. Оперативно-розыскные мероприятия на каналах связи (правовой анализ): Монография / Под общ. ред. В.П. Сальникова. – СПб.: Фонд «Университет», 2005. 16 п.л. ISBN 5-95598-134-3
7. Захарцев С.И., Игнащенков Ю.Ю., Сальников В.П. Оперативно-розыскные мероприятия в ХХI веке: Монография. – СПб.: Фонд «Университет», 2006. 20 п.л. ISBN 5-93598-110-8
8. Рохлин В.И., Захарцев С.И., Миронов М.А., Стуканов А.П. Институт реабилитации в российском законодательстве: возникновение, развитие, понятие, перспективы / Под ред. В.И. Рохлина. – СПб.: «Юридический центр «Пресс», 2007. 26 п.л. ISBN 978-5-94201-538-1
9. Захарцев С.И., Чабукиани О.А. Оперативно-розыскные мероприятия и следственные действия: понятия и соотношение: Монография. – СПб.: Санкт-Петербургскй университет МВД России, 2010. 16 п.л.
10. Захарцев С.И. Наука оперативно-розыскной деятельности: философский, теоретико-правовой и прикладной аспекты: Монография. – СПб.: Издательский Дом С-Петерб. гос. ун-та, Издательство юридического факультета СПбГУ, 2012. 16,5 п.л. ISBN 978-5-288-05209-5
11. Захарцев С.И. Некоторые проблемы теории и философии права: Монография / Под ред. В.П. Сальникова. - М.: Норма, 2014. 11 п.л. ISBN 978-5-91768-491-8
12. Захарцев С.И., Игнащенков Ю.Ю., Сальников В.П. Оперативно-розыскная деятельность в ХХI веке: Монография. – М.: Норма, 2015. 25 п.л. ISBN 978-5-91768-538-0
13. Захарцев С.И., Сальников В.П. Философия. Философия права. Юридическая наука: Монография. – М.: Юрлитинформ, 2015. 16,5 п.л.
14. Захарцев С.И. Некоторые проблемы теории и философии права: Монография.– М.: Норма, 2016 ISBN 978-5-91768-491-8
Захарцев Сергей Иванович имеет награды:
Почетное звание "Заслуженный деятель науки и образования РАЕ"
Орден LABORE ET SCIENTIA (ТРУДОМ И ЗНАНИЕМ)
Награда «Орден ПЕТРА ВЕЛИКОГО «НЕБЫВАЕМОЕ БЫВАЕТЪ»
Участник Интернет-энциклопедии "Ученые России"
Почетное звание «Основатель научного направления»