Перечень кандидатских диссертации, выполненных под руководством Р.Р.Исмагилова:
1)Хамитов У.Н.Формирование урожая зерна озимой ржи в зависимости от гидротермических условий в Предуралье Республики Башкортостан. 60.01.09 – растениеводство. Уфа, 1997
2)Нурлыгаянов Р.Б. Зависимость урожайности и качества продовольственного зерна озимой ржи от приемов возделывания в условиях Предуралья Республики Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Казань, 1997
3).Багаутдинов И.И. Качество и урожайность зерна посевов яровой пшеницы различной густоты и сортов при корневых подкормках мочевиной. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 1999
4)Исламгулов Д.Р. Формирование урожая и экологическая пластичность различных сортов сахарной свеклы в условиях южной лесостепи Республики Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2000.
5)Ванюшина Т.Н. Формирование хлебопекарных качеств зерна озимой ржи и их зависимость от приемов возделывания и сортов. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2000.
6)Акчурин Р.Л. Зависимость урожайности и качества зерна гречихи от приемов возделывания в условиях Предуральской степи Республики Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2000.
7)Костылев Д.А. Формирование урожая календулы в зависимости от площади питания в условиях южной лесостепи Республики Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2000.
8)Гайфуллин Р.Р. Особенности формирования урожая и приемы повышения зимостойкости растений озимой пшеницы в условиях Республики Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2000.
9)Нигматьянов А.А. Формирование качества зерна яровой мягкой пшеницы в зависимости от почвенно-климатических условий. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2001.
10)Нуриманов Ф.С. Формирование урожая и качество семян ярового ячменя в зависимости от приемов возделывания в Предуральской степи Республики Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2002.
11)Ахметшин Р.Р. Формирования урожая и качества зерна яровой пшеницы при применении фунгицидов и биопрепарата фитоспорин в условиях Предуральской степи Республики Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2000.
12)Мухаметшин А.М. Урожайность и качество семян сахарной свеклы в зависимости от размера маточных корнеплодов и площади питания в условиях южной лесостепи Республики Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2003.
13)Абдулвалеев Р.Р. Урожайность и качество зерна мягкой пшеницы в зависимости от сорта, нормы высева семян и срока уборки в условиях Предуральской степи Республики Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2003.
14)Ишмакова Г.Х. Формирование продуктивности сахарной свеклы при применении фиторегуляторов в условиях Южной лесостепи Республики Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2004
15)Давлетшин Ф.М. Формирование урожая пшеницы при применении биологического препарата фитоспорин для защиты растений от болезней корневой системы 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2004
16)Камалов А.З. Влияние природных условий и технологических приемов на качество семян яровой пшеницы в лесостепи Предуралья. 06.01.09 – растениеводство. Йошкар-Ола, 2005
17)Барышникова Н.И. Эколого-фитоценотическая характеристика, ценопопуляционный анализ и опыт введения в культуру Valeriana Tuborosa L. И Valeriana Dubia Bunge в Степном Зауралье Республики Башкортостан. 03.00.05- Ботаника, 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2005
18)Аюпов Д.С. Влияние азотной подкормки и срока уборки на содержание пентозанов и хлебопекарные качества зерна озимой ржи. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2005
19)Бикбатыров Ф.Е. Формирование урожая пивоваренного ячменя сорта Михайловский в зависимости от сроков посева и норм высева семян. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2007
20)Ахиярова Л.М. Формирование кормовых свойств зерна сортов озимой ржи. 06.01.09 – растениеводство. Ижевск, 2008.
21)Гумеров И.М. Влияние применения биологического препарата фитоспорин в перио вегетации на формирование урожая яровой пшеницы в южной лесостепи Республики Башкортостан 06.01.09 – растениеводство. Ижевск, 2008.
22)Ахияров Б.Г. Урожайность и качество корнеплодов сортов столовой свеклы в зависимости от площади питания в условиях лесостепи Республики Башкортостан . 06.01.06 – овощеводство. Тюмень, 2008.
23)Юсупов А.Ш. Сорта и приемы технологии производства клубней картофеля в условиях предуральской степи Республики Башкортостан для переработки на хрустящий картофель. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2009.
24) Галикеев А.Г. Влияние гидротермических условий на хлебопекарные качества зерна сортов озимой ржи. 06.01.01 – общее земледелие, растениеводство. Уфа, 2011.
25) Гайсина Л.Ф., Хлебопекарные качества зерна гибридов озимой ржи F1 в условиях южной лесостепи Республики Башкортостан. 06.01.01 – общее земледелие, растениеводство. Уфа, 2014
26) Нехороших М.С. Матрикальная разнокачественность семян озимой ржи в условиях южной лесостепи Республики Башкортостан. 06.01.01 – общее земледелие, растениеводство. Уфа, 2016.
27)Малютина К.В. Кормовые качества зерна озимой ржи и приемы их повышения. 06.01.01 – общее земледелие, растениеводство. Уфа, 2018.
Печень докторских диссертации, выполненных при консультации Р.Р.Исмагилова:
1)Нурлыгаянов Р.Б. Технология производства продовольственного зерна озимой ржи в Уральском регионе. 06.01.09 – растениеводство. Москва, 2003.
2)Гайфуллин Р.Р. Адаптивное размещение и технологические приемы произвлдства хлебопекарного зерна озимой пшеницы в Республике Башкортостан. 06.01.09 – растениеводство. Уфа, 2007.
3)Абдулвалеев Р.Р. Особенности формирования урожая и качества зерна зерновых культур на мезорельефе Белебеевской возвышенности. 06.01.01 – общее земледелие, растениеводство. Уфа, 2017.
4)Исламгулов Д.Р. Формирование технологических качеств корнеплодов сахарной свеклы в условиях Среднего Предуралья. 06.01.01 – Общее земледелие, растениеводство. Уфа, 2018.
Опубликовал 708 научных работ, в том числе:
1)Качество и технология производства продовольственного зерна озимой ржи / Р. Р. Исмагилов, Р. Б. Нурлыгаянов, Т. Н. Ванюшина. – М. : АгриПресс, 2001. – 224 с. : ил. – Библиогр.: с. 208–221.
2)Качество и технология производства хлебопекарного зерна пшеницы / Р. Р. Исмагилов, Р. А. Хасанов ; АН РБ, БНЦ РАСХН и АН РБ. – Уфа : Гилем, 2005. – 195 с. – Библиогр.: с. 174–193.
3)Производство продукции растениеводства для целевого использования / Р.Р.Исмагилов, Б.Г.Ахияров, Р.К. Кадиков, К.Р.Исмагилов К.Р. Уфа: Гилем, 2016. 254 с.
Монографии и учебники:
1)Качество и технология производства продовольственного зерна озимой ржи / Р. Р. Исмагилов, Р. Б. Нурлыгаянов, Т. Н. Ванюшина. – М. : АгриПресс, 2001. – 224 с. : ил. – Библиогр.: с. 208–221.
2)Качество и технология производства хлебопекарного зерна пшеницы / Р. Р. Исмагилов, Р. А. Хасанов ; АН РБ, БНЦ РАСХН и АН РБ. – Уфа : Гилем, 2005. – 195 с. – Библиогр.: с. 174–193.
3)Озимая пшеница в Башкортостане / Р. Р. Исмагилов, Р. Р. Гайфуллин, Н. Р. Бахтизин ; МСХ РФ, Башкирский ГАУ. – Уфа : БГАУ, 2006. – 167 с. – Библиогр.: с. 128–163.
4)Свекловодство. - Уфа: Изд-во БГАУ, 2010.- 160 с. (Уразлин М.Х., Исламгулов Д.Р.)
5)Исмагилов Р.Р., Ахиярова Л.М. Кормовые качества зерна озимой ржи.-Уфа: Гилем, 2012.-116 с.
6)Производство продукции растениеводства для целевого использования / Р.Р.Исмагилов, Б.Г.Ахияров, Р.К. Кадиков, К.Р.Исмагилов К.Р. Уфа: Гилем, 2016. 254 с.
Докторская диссертация: «Оптимальные параметры и приемы формирования высокопродуктивных посевов короткостебельных сортов озимой ржи в условиях Среднего Предуралья». 06.01.09- Растениеводство. Моск. с.-х. академия. - Москва, 1992.
Научно-организационная работа. Председатель Научного совета Академии наук РБ, член общественного совета и НТС МСХ РБ, Европейского проекта «Rye belt», Государственной комиссии по включению в Государственный реестр сортов с.-х. культур, Научно-технического совета МСХ РБ, 5-ти диссертационных советов в разные годы, редакционной коллегии издательства «Энциклопедия Башкортостана» и 5 научных журналов. Член-корреспондентом Академии наук Республики Башкортостан. Удостоен почетного звания «Заслуженный деятель науки Республики Башкортостан» (2000 г.), «Заслуженный работник Высшей школы Российской Федерации» (2010 г.). Лауреат Государственной Премии Республики Башкортостан в области науки и техники (2013 г.), Награжден 7-мью Золотыми и 3 Серебряными медалями Всероссийской агропромышленной и Международной агропромышленной выставок, Золотой медалью Международной книжной выставки (г. Франкфурт на Майне).