С 1970 года Владимир Мстиславович работал в институте точной механики и вычислительной техники. Здесь он в 1986 году возглавил разработку 32-разрядного микропроцессора Эль-90 для Эльбруса-3. К 1987 году архитектура микропроцессора была создана, в 1990 году были выпущены первые прототипы. В 1990 году Пентковский начинает работать над Эль-91С, взяв за основу микропроцессор Эль-90, однако финансирование разработки было прекращено из-за изменения в России политической и экономической системы.
В 1989 В. М. Пентковский получил приглашение приехать по обмену опытом в США в исследовательский центр Intel. В 1991 году он начал работать в Intel, где и работает сейчас. Он становится ведущим инженером компании и, под его руководством, в 1993 году в Intel был разработан процессор Pentium. К 1995 году фирмой Intel был выпущен более совершенный процессор Pentium Pro, который был схож по своим характеристикам с микропроцессором Эль-90. Главным архитектором этого процессора считается именно В. М. Пентковский. В настоящее время Пентковским разрабатываются следующие поколения процессоров Intel.
Владимир Мстиславович доктор технических наук, является лауреатом Государственно премии, победителем конкурса на получение грантов Правительства Российской Федерации для государственной поддержки научных исследований, проводимых под руководством ведущих учёных в российских образовательных учреждениях высшего профессионального образования
Работы: Пентковский В. М. Автокод Эльбрус. Принципы построения языка и руководство к использованию / под редакцией Ершова А. П. — М.: Наука, 1985; Пентковский В. М. Язык программирования Эль-76. Принципы построения языка и руководство к пользованию, 364 с схем. 20 см, 2-е изд., испр. и доп. М. Наука 1989