- Видовой состав почвенных микромицетов - возбудителей корневых и прикорневых гнилей плодовых и ягодных культур, их распространенность и вредоносность.
- Биологическая и экономическая значимость на плодовых и ягодных культурах наиболее распространенных и вредоносных почвенных микромицетов.
- Научно-обоснованная система мониторинга основных почвенных микромицетов, включающая в себя упрощенные и доступные методы диагностики и элементы прогноза.
- Концепция изменения патогенеза почвенных микромицетов на плодовых и ягодных растениях в условиях агроценозов.
- Научно-обоснованная система защитных мероприятий, направленная против возбудителей корневых и прикорневых гнилей в насаждениях плодовых и ягодных культур.
2.Головин С.Е. Предупреждение загнивания черенков черной смородины // Садоводство и виноградарство, 1991. № 4.-С. 20-21.
3.Головин С.Е. Основные виды почвенных грибов, связанные с гнилью зеленых черенков плодовых и ягодных культур, и методы их диагностики // Плодоводство и ягодоводство России. - М., 1994. –Т. 1., С. 118-123.
4.Головин С.Е., Павлова Н.Ю. Использование системных фунгицидов для борьбы с гнилями зеленых черенков крыжовника при окоренении в пленочных теплицах //Сб. конф. Актуальные проблемы развития питомниководства и науч. обеспечение отрасли. Тез. докл., М., 1993.-С. 42-44.
5.Головин С.Е., Метлицкий О.З. Влияние фитопатогенных грибов на развитие гнилей черенков смородины и крыжовника // Вест. Российской академии с./х. наук. 1993. №5. С. 31-34.
6.Головин С.Е., Павлова Н.Ю. Влияние фунгицидов на укореняемость зеленых черенков крыжовника // Рабочее совещание: «Регуляторы роста и развития растений». - Тез. докл. ТСХА, М., 1992.-С. 118.
7.Головин С.Е. Корневые гнили малины в питомниках, причины возникновения и борьба с ними // Ягодоводство в Нечерноземье - тр. ВСТИСП, М., 1993. – С. 30-38.
8.Головин С.Е., Павлова Н.Ю. Защита зеленых черенков крыжовника от гнилей при их укоренении в пленочных теплицах с использованием искусственного тумана // ж. Садоводство и виноградарство. - №5(6), 1994. – С. 12-13.
9.Метлицкий О.З., Белозёрова Г.С., Головин С.Е. Пути использования биоиндикаторов при диагностике здоровья почв // Тез. докл. координационного совещания: «Контроль фитосанитарного состояния с/х культур». - М., 1994.-С.41-42
10.Головин С.Е. Фитофтороз малины – новая опасная болезнь для маточников и промышленных плантаций России // Паразитарное загрязнение мегаполиса Москвы - Тез. док. научно-практическое совещание, М., 1994. – С. 14
11.Павлова Н.Ю., Белозёрова Г.С., Павлова А.Ю., Головин С.Е. Применение препарата Симбионт-1 в плодовом питомнике// Тез. докл. III межд. конф. Регуляторы роста и развития растений, М., 1995.-С. 172-173.
12.Головин С.Е. Фитофтороз малины – новая опасная болезнь в маточниках и промышленных плантациях России // Тез. докл. Всеросс. совещание: «Молодые ученые садоводству России». - М., ВСТИСП, 1995. – С. 222 – 225.
13.Головин С.Е. Фитофторозная гниль корней малины, причины возникновения, диагностика и меры борьбы // Сб. научн. тр. ВСТИСП. «Плодоводство и ягодоводство России". – М. – 1995, Т.2. – С. 203-209
14.Метлицкий О.З., Головин С.Е. Фитофтороз красной малины в России // Тез. докл. Все-росс. съезда по защите растений «Защита растений в условиях ре-формирования агропромышленного комплекса».- СПб.- 1995.- С. 65
15.Головин С.Е. Основные виды почвенных грибов, вызывающих гибель сеянцев семечковых и косточковых культур в условиях открытого и защищенного грунта // Сб. научн. тр. ВСТИСП. Плодоводство и ягодоводство России. – М. – 1996, Т.3. – С. 188-192
16.Головин С.Е. Комплекс фитофторовых грибов на малине, особенности диагностики // Сб. научн. тр. ВСТИСП - Плодоводство и ягодоводство России. – М. – 1997, Т.4. – С. 172-179
17.Головин С.Е. Корневые гнили ягодных культур // Ж. Защита и карантин растений, М., 1998, №7. - С.34-35
18.Метлицкий О.З., Головин С.Е. Фитофтороз на малине // Ж. Защита и карантин растений, 1996, №11 – С. 46-47
19.Головин С.Е. Фитофторозная гниль корней малины в России и ее диагностика // Актуальные вопросы теории и практики защиты плодовых и ягодных культур от вредных организмов в условиях многоукладного с.-х-ва // Тез. докл. Всеросс. совещание – М., ВСТИСП. – 1998. – С. 346 – 349.
20.Головин С.Е., Павлова А.Ю. Млечный блеск в питомниках и маточниках косточковых культур, его распространение с посадочным материалом и влияние на укореняемость зеленых черенков вишни // Плодоводство и ягодоводство России, 1998; Т.5, - С. 158-164
21.Головин С.Е. Интродукция новых патогенных расс фитофторовых грибов с посадочным материалом // тез. конф. - Теория и практика борьбы с паразитарными болезнями, М., 1999. С. 19-18.
22.Головин С.Е. Проблемы распознавания фитофторовых грибов на ягодных, декоративных и цветочных культурах и разработка способов их диагностики // Сб. научн. тр. ВСТИСП. Плодоводство и ягодоводство России. – М. – 1999. – Т.6. – С. 197 – 204.
23.Головин С.Е. Почвенная микофлора как ограничивающий фактор размножения и выращивания плодовых и ягодных культур // Сб. научн. тр. ВСТИСП. Плодоводство и ягодоводство России. – М. – 2000. – Т.7. – С. 205-215
24.Кашин В.И., Дроздовский Э.М., Головин С.Е., Романченко Т.И., Белозёрова Г.С., Наумова Л.В., Артюхов В.Ф., Корнацкая Г.А., Аристов А.Н., Булыгина Л.В //Справочник-определитель вредителей и болезней плодовых культур. - ВСТИСП. - М. – 2000. – 316 с.
25.Головин С.Е. Методические указания по диагностике и учёту болезней корней и стеблей земляники и малины, передающихся через почву // ВСТИСП. М.- 2001. – 43 с.
26.Метлицкий О.З., Аристов А.Н., Головин С.Е.,. Метлицкая К.В, Романченко Т.И., Зейналов А.С., Наумова Л.В. Усовершенствованная система фитосанитарии в питомниководстве // М.- ВСТИСП.- 2001.- 154 с.
27.Головин С.Е. Причины вспышки фитофтороза корней малины в Подмосковье в 2001 году // Сб. научн. тр. ВСТИСП - Плодоводство и ягодоводство России. – М. – 2002. – Т.9. – С. 334-342
28.Головин С.Е., Дроздовский Э.М., Белозерова Г.С., Романченко Т.И., Корнацкая Г.А., Наумова Л.В. Методические указания по долгосрочному прогнозу снижения численности вредных организмов в садах // ВСТИСП. - М. – 2006. – 104 с.
29.Головин С.Е., Романченко Т.И. Корневые гнили плодовых культур в питомнике, вредоносность и распространенность // Сб. науч. тр. ВСТИСП.- Плодоводство и ягодоводство России. – 2004. – Т.11. - С. 376-389.
30. Дроздовский Э.М., Белозерова Г.С., Романченко Т.И., Головин С.Е., Наумова Л.В. Повышение эффективности защиты садов и ягодников от вредителей и болезней в Нечерноземье (Семечковые сады) // Ж. Садоводство и виноградарство. – 2005. № 5. - С.15-18
31.Дроздовский Э.М., Белозерова Г.С., Романченко Т.И., Головин С.Е. Комплексная система защитных мероприятий в насаждениях яблони в Нечерноземной зоне РФ (Методические указания) //ВСТИСП. - М. – 2006. – 115 с.
32.Головин С.Е. Фитосанитарные проблемы питомниководства России спустя столетие после первых питомников И.В. Мичурина // Тр. ВСТИСП «Плодоводство и ягодоводство России» Т. ХIII, 2005. - С. 110-114
33.Головин С.Е., Павлова А.Ю., Джура Н.Ю. Защита зелёных черенков сливы при укоренении в теплице с использованием фунгицидов и налипателей // Материалы 2-ого Всероссийского Съезда по защите растений “Фитосанитарное оздоровление агроэкосистем” 5-10декабря 2005 г. Санкт-Петербург. С-Пб.–2005. – Т.2.–С.271-273
34.Головин С.Е. Методические подходы к фитосанитарной диагностики почвы на наличие фитопатогенных грибов и риска возникновения заболеваний растений // Тр. ВСТИСП, «Плодоводство и ягодоводство России» Т. 14, 2005. - С. 101-104
35. Белозерова Г.С., Романченко Т.И., Головин С.Е. Микозное усыхание в питомниках – причины возникновения и пути снижения вредоносности, возможности реализации биологического потенциала сада // Тез конф. Сб. «Методические аспекты создания прецизионных технологий возделывания плодовых культур и винограда» – Краснодар. – 2006.-С. 315-318.
36. Головин С.Е., Романченко Т.И. Фитосанитарные проблемы в питомниках плодовых культур // Тез. Конф. В сб. тр. ГНУ ВСТИСП, «Плодоводство и ягодоводство России» Т.18, М., 2008.-С. 73-79
37. Метлицкий О.З., Головин С.Е., Холод Н.А., Ундрицова И.А. Антракноз садовой земляники // Ж. «Агро ХХI век» 2007. №4-6.-С. 40-41
38. Метлицкий О.З., Головин С.Е., Зейналов А.С., Метлицкая К.В., Ундрицова И.А. Биологическое загрязнение экосистем насаждений ягодных культур // М.-РАСХН, ВСТИСП. 2007.-68 с.
39. Метлицкий О.З., Головин С.Е., Зейналов А.С., Метлицкая К.В., Ундрицова И.А. Защита ягодников // Ж. «Садоводство и виноградарство».-2005.- № 5.-С. 20-22.
40. Александров И.Н., Головин С.Е. Фитофторозная корневая гниль малины // Защита и карантин растений, №7, 2007.
41. Головин С.Е., Романченко Т.И. Проблемы защиты косточковых культур при производстве корнесобственного посадочного материала // Сб. тр. ГНУ ВСТИСП, «Плодоводство и ягодоводство России» Т. 20, М. 2008. - С.47-54
42.Головин С.Е. Возрастание вредоносности ризоктониоза земляники в средней полосе России // Сб. тр. ВСТИСП, «Плодоводство и ягодоводство России» Т.22, Ч.1, М. 2009. - С. 250-260.
43.Головин С.Е. Регрессионный прогноз фитофторозной гнили корней малины // Сб. тр. ВСТИСП, «Плодоводство и ягодоводство России» Т. 22, Ч. 1., М. 2009. - С.261-269.
44.Головин С.Е., Алхасов Э.Б. Метод микологической оценки субстратов для выращивания черенков плодовых культур //Тез. конф. «Методы изучения продукционного процесса растений и фитоценозов», Нальчик, 2009.-С. 57-59
45.Куликов И.М., Борисова А.А., Метлицкий О.З., Грачёва Т.А., Упадышев М.Т., Головин С.Е., Мельникова Н.Н., Романченко Т.И., Зейналов А.С. Производство и сертификация посадочного материала ягодных культур и винограда в России. Контроль качества. (Методические указания). Часть 1. Ягодные культуры (издание второе, дополненное) // ФГУ «Российский сельскохозяйственный центр). - Москва – 2009.-164 с.
46.Головин С.Е. Корневые и прикорневые гнили ягодных и плодовых культур, их диагностика (монография) // ГНУ ВСТИСП. - М.: ООО НИЦ «Инженер», 2010. - 306 с.
47. Головин С.Е., Алхасов Э.Б. Регрессионный прогноз развития гнилей зеленых черенков при их укоренении в теплице // Сб. тр. ВСТИСП, «Плодоводство и ягодоводство России». – М., 2010. - Т 24., Ч. 2. - С. 302-310.