Научная тема: «ГИБРИДИЗАЦИОННЫЕ ПОДХОДЫ В ШИРОКОМАСШТАБНЫХ ИССЛЕДОВАНИЯХ ГЕНОМОВ»
Специальность: 03.00.03
Год: 2009
Отрасль науки: Биологические науки
Список опубликованных работ
Обзоры:

1. Гайнетдинов, И. В., Ажикина, Т.Л., Свердлов Е.Д. (2007). Короткие репрезентативные последовательности в геномных исследованиях. Биохимия 72(11): 1179–86.

2. Ажикина, Т.Л., Свердлов, Е.Д. (2005). Изучение тканеспецифического CpG метилирования ДНК в протяженных геномных локусах. Биохимия 70(5): 596–603.

3. Ажикина, Т.Л., Монастырская, Г.С., Свердлов, Е.Д. (2004). Полногеномные несеквенирующие анализы патогенов – неотъемлемый компонент мероприятий биобезопасности. Молекулярная медицина 3: 33–40

4. Sverdlov, E. and Azhikina Т. (2005). Primer Walking. Encyclopedia of Life Sciences: DOI: 10.1038/npg.els.0005382

5. Azhikina, T. (2000). Sequencing Strategies and Tactics in DNA and RNA Analysis. Encyclopedia of Analytical Chemistry. R. A. Meyers. Chichester, John Wiley&Sons Ltd.

6. Potapov, V., T. Azhikina, Demin, V.V., Limborskaja, S.A. and Sverdlov E.D. (1996). Modified oligonucleotides as a tool for DNA sequencing, fingerprinting and mapping. Pure&Appl Chem 68 (6): 1315–1320.

Статьи:

7. Быченко, О.С., Суханова, Л.В., Уколова, С.С., Скворцов, Т.А., Потапов, В.К., Ажикина, Т.Л., Свердлов, Е.Д. (2009) Геномная близость байкальского омуля и сига. Биоорганическая Химия, 35, 95–102.

8. Gvozdevskiy, N.A., Azhikina, T.L., Botvinnik, A.O., Evsyukova, I.Y., Shemyakin, I.G. and Sverdlov, E.D. (2006) New approach aimed at investigation of genomic polymorphism of the Russian M. tuberculosis population. FEBS Journal, 273, 270

9. Гвоздевский, Н.А., Ажикина, Т.Л., Свердлов, Е.Д. (2006) Делеционно-инсерционные различия геномов высоковирулентного штамма HN878 Mycobacterium tuberculosis и менее вирулентного штамма CDC1551. Журнал Микробиологии Эпидемиологии и Иммунологии, 1, 10–15

10. Azhikina, T., Gvozdevsky, N., Botvinnik, A., Fushan, A., Shemyakin, I., Stepanshina, V., Lipin, M., Barry, C., 3rd and Sverdlov, E. (2006) A genome-wide sequence-independent comparative analysis of insertion-deletion polymorphisms in multiple Mycobacterium tuberculosis strains. Res Microbiol, 157, 282–290.

11. Azhikina, T., Gainetdinov, I., Skvortsova, Y. and Sverdlov, E. (2006) Methylation-free site patterns along a 1-Mb locus on Chr19 in cancerous and normal cells are similar. A new fast

approach for analyzing unmethylated CCGG sites distribution. Mol Genet Genomics, 275, 615–622.

12. Azhikina, T., Gainetdinov, I., Skvortsova, Y., Batrak, A., Dmitrieva, N. and Sverdlov, E. (2004) Non-methylated Genomic Sites Coincidence Cloning (NGSCC): an approach to large scale analysis of hypomethylated CpG patterns at predetermined genomic loci. Mol Genet Genomics, 271, 22–32.

13. Kurdyukov, S.G., Lebedev, Y.B., Artamonova, II, Gorodentseva, T.N., Batrak, A.V., Mamedov, I.Z., Azhikina, T.L., Legchilina, S.P., Efimenko, I.G., Gardiner, K. and Sverdlov, E.D. (2001) Full-sized HERV-K (HML-2) human endogenous retroviral LTR sequences on human chromosome 21: map locations and evolutionary history. Gene, 273, 51–61.

14. Kostina, M., Azhikina, T., Gorodentseva, T., Berg, D. and Sverdlov, E. (2000) Contiguous strings of strongly binding short oligonucleotides as a useful tool for completing sequencing experiments. DNA Seq, 10, 355–364.

15. Kurdjukov, S., Azhikina, T., Lebedev, Y., Gardiner, K. and Sverdlov, E. (1999) Mapping of endogenous retroviral LTRs on Chr21-concentration of the regulatory elements within the gene-enriched 21q22 region. Cytogenet Cell Genet, 86, 17.

16. Чернов, И.П., Поляков, А.С., Акопов, С.Б., Николаев, Л.Г., Ажикина, Т.Л., Костина, М.Б., Свердлов, Е.Д. (1999) Идентификация и картирование на хромосоме 19 человека хромосомспецифического повторяющегося элемента, предпочтительно связывающегося с ядерным матриксом. Биоорганическая Химия, 25, 242–247.

17. Хиль, П.П., Костина, М.Б., Ажикина, Т.Л., Колесник, Т.Б., Лебедев, Ю.Б., Свердлов, Е.Д. (1997) Структурные характеристики четырех длинных концевых повторов (LTR) эндогенных человеческих ретровирусов и особенности участков их интеграции. Биоорганическая Химия 23, 434–440.

18. Lebedev, Y., Akopyants, N., Azhikina, T., Shevchenko, Y., Potapov, V., Stecenko, D., Berg, D. and Sverdlov, E. (1996) Oligonucleotides containing 2-aminoadenine and 5-methylcytosine are more effective as primers for PCR amplification than their nonmodified counterparts. Genet Anal, 13, 15–21.

19. Azhikina, T., Kostina, M., Skaptsova, N., Potapov, V., Berg, D. and Sverdlov, E. (1996) Factors affecting the priming efficiency of short contiguous oligonucleotide strings in the primer walking strategy of DNA sequencing. DNA Seq, 6, 211–216.

20. Azhikina, T., Veselovskaya, S., Myasnikov, V., Potapov, V., Ermolayeva, O. and Sverdlov, E. (1993) Strings of contiguous modified pentanucleotides with increased DNA-binding affinity can be used for DNA sequencing by primer walking. Proc Natl Acad Sci USA, 90, 11460–11462.

21. Ажикина, Т.Л., Шевченко, Ю.О., Лебедев, Ю.Б., Веселовская, С.В., Мясников, В.А., Потапов, В.К., Свердлов, Е.Д.(1993) Олигонуклеотиды, образующие высокостабильные дуплексы, их использование в качестве праймеров при секвенировании и в полимеразной цепной реакции. Докл Акад Наук 330, 642–645.

22. Ажикина, Т.Л., Потапов, В.К., Веселовская, С.В., Мясников, В.А., Свердлов, Е.Д.(1993) Комбинации коротких олигонуклеотидов с повышенной прочностью образования дуплексов в качестве объединенных праймеров в секвенировании. Докл Акад Наук, 331, 751–753.