1. Хакимов Р.С. Сущность и социальная роль управленческих отношений. – Казань: Изд-во КГУ, 1986. – 192 с.
2. Хакимов Р.С. Сумерки империи (К вопросу о нации и государстве). – Казань: Татарское книжное издательство, 1993. – 87 с.
3. Хакимов Р.С. История татар и Татарстана: методологические и теоретические проблемы. – Казань: Институт истории АН РТ, 1999. – 44 с.
4. Хакимов Р.С. Белая книга Татарстана. Путь к суверенитету. 1990-1995 / Составитель и отв. ред. Р. Хакимов // Панорама-форум. – 1996, № 5 (8). – Специальный выпуск (1). – Казань, 1996. – 102 с.
5. Хакимов Р.С. Метаморфозы духа (к вопросу о тюрко-татарской цивилизации). – Казань: «Идель-Пресс», 2005. – 304 с.
6. Хакимов Р.С. Тернистый путь к свободе. – Казань: Татарское книжное издательство, 2007. – 368 с.
7. Хакимов Р.С. Российский федерализм в условиях социально-политической трансформации. – Казань: Институт истории АН РТ, 2009. – 216 с.
Разделы в коллективных монографиях:
8. Хакимов Р.С. Татары и Татарстан проблемы идентичности в 80-90-е гг. ХХ века / Р.С.Хакимов // Татары. – М.: Наука, 2001. – С.540–548.
9. Хакимов Р.С. Перспективы федерализма в России / Р.С.Хакимов // Федерализм: российское и международное измерения. (Опыт сравнительного анализа). Под редакцией Рафаэля Хакимова. – Казань: Казанский институт федерализма, 2004. – С.679–687.
10. Хакимов Р.С. Федерализм: обзор основных понятий / Р.С.Ха¬кимов // Федерализм в России и в мире. Учебное пособие. – Казань: Казанский институт федерализма, 2004. – С.4–22.
11. Хакимов Р.С. Перестройка и новейшая история Татарстана: взгляд через 20 лет / Р.С.Хакимов // Политико-правовые ресурсы федерализма в России. Под редакцией Рафаэля Хакимова. – Казань: Казанский институт федерализма, 2006. – С.107–115.
Статьи в изданиях, рекомендованных ВАК:
12. Хакимов Р.С. Управленческие отношения как разновидность общественных отношений / Р.С.Хакимов // Вестник Московского университета. Серия 7. Философия. – № 2, 1984. – С. 21-29.
13. Хакимов Р.С. Федерализация России: взгляд из Казани / Р.С.Хакимов // Родина. – 1998. – №4. – С.12–14.
14. Хакимов Р.С. Процессы трансформации российского федерализма на современном этапе / Р.С.Хакимов // Вестник Саратовского государственного социально-экономического университета. – Саратов, 2009. – №3. – С.15–20.
15. Хакимов Р.С. Многообразие форм федеративных государств / Р.С.Хакимов // Известия АлтГУ. – Барнаул, 2009. – №4. – Т.3. – С.38–46.
16. Хакимов Р.С. К вопросу о модели российского федерализма / Р.С.Хакимов // Евразийский международный научно-аналитический журнал «Проблемы современной экономики». – СПб., 2009. – №2. – С.34–37.
17. Хакимов Р.С. «Народный федерализм»: к постановке вопроса / Р.С.Хакимов // Известия Самарского научного центра РАН. – Самара, 2009. – Т.11. №6. – С.217–225.
18. Хакимов Р.С. Евразия как конфедерация стран и народов Востока / Р.С.Хакимов // Ученые записки Казанского государственного университета. Серия «Гуманитарные науки». – Казань, 2009. – Т. 151, кн. 2, ч. 1. – С.248–254.
Статьи и материалы:
19. Хакимов Р.С. Проблемы экономической самостоятельности автономной республики / Р.Курчаков, Р.С.Хакимов // Вопросы экономики. – 1989. – №12. – С.16–23.
20. Хакимов Р.С. Федерализация через стабильность / Р.С.Хакимов // Панорама-форум. – 1995. – №1. – С.34–39.
21. Хакимов Р.С. Выступления на консультативном круглом столе «Международный опыт урегулирования этно-политических конфликтов» (Дворец мира, 14–15 января 1995 г., Гаага, Нидерланды) / Р.С.Хакимов // Международный опыт урегулирования этно-политических конфликтов. Стенографический отчет и аналитические материалы под редакцией Рафаэля Хакимова. – Казань, 1996. – С.23–24; 33–34; 56–57; 60–61; 98–100; 151–155.
22. Хакимов Р.С. Выступления на консультативном круглом столе «От конфронтации к наведению мостов» (Дворец мира, 27–29 марта 1996 г., Гаага, Нидерланды) / Р.С.Хакимов // От конфронтации к наведению мостов. Стенографический отчет под редакцией Рафаэля Хакимова. – Казань, 1996. – С.21–23; 50–52; 79; 83–84; 106–108.
23. Хакимов Р.С. Стержневая проблема – история государственности / Р.С.Хакимов // Научный Татарстан. – 1997. – №3/4. – С.23–29.
24. Хакимов Р.С. Перспективы федерализации России: взгляд из Татарстана / Р.С.Хакимов // Ислам в татарском мире: история и современность. – Казань, 1997. – С.325–337.
25. Хакимов Р.С. Россия и Татарстан: у исторического перекрестка / Р.С.Хакимов // Панорама-форум. – 1997. – № 9. – С.34–63.
26. Хакимов Р.С. Россия и Татарстан: у исторического перекрестка (продолжение) / Р.С.Хакимов // Панорама-форум. – 1997. – №16. – С.39–54.
27. Хакимов Р.С. Об основах асимметричности / Р.С.Хакимов // Асимметричная федерация: взгляд из центра, республик и областей. – М.: Институт социологии РАН, 1998. – С.37–48.
28. Хакимов Р.С. Будущее Татарстана – вызов времени / Р.С.Хакимов // Панорама-форум. Спец. выпуск «Экономика Татарстана после 17 августа». – 1999. – №21. – С.75–89.
29. Хакимов Р.С. Тенденции конституционного процесса в Российской Федерации / Р.С.Хакимов // Правосудие в Татарстане. – 1999. – №1. – С.35–37.
30. Хакимов Р.С. Татарстан как полиэтническое сообщество / Р.С.Хакимов // Этнопанорама. – Оренбург, 1999. – №1. – С.45–57.
31. Хакимов Р.С. Заключительное слово / Р.С.Хакимов // Федерализм: российское и швейцарское измерения. Под редакцией Томаса Фляйнера и Рафаэля Хакимова. – Москва, 2001. – С.181–182.
32. Хакимов Р.С. Об основах асимметричности Российской Федерации / Р.С.Хакимов // Федерализм в России. – Казань, 2001. – С.266–272.
33. Хакимов Р.С. Перспективы федерализма в России: решение старых и возникающих новых проблем / Р.С.Хакимов // Материалы научно-практической конференции «Настоящее и будущее федерализма в России». – М., 2002. – С.27–36.
34. Хакимов Р.С. Конституция Российской Федерации и опыт договорных отношений / Р.С.Хакимов // Конституционное право: Восточноевропейское обозрение. – М., 2003. – № 4(45). – С.126–131.
35. Хакимов Р.С. Критическое мышление и обновление ислама / Р.С.Хакимов // Россия в глобальной политике. – Т.1. – № 4. – Октябрь-декабрь 2003. – С.108–117.
36. Хакимов Р.С. Перспективы федерализма в России / Р.С.Хакимов // Феде¬рализм: российское и международное измерения. – Казань, 2004. – С.679–687.
37. Хакимов Р.С. Двести лет исламской реформации / Р.С.Хакимов // Вестник Института Кеннана в России. – Вып. 6. – Москва, 2004. – С.39–47.
38. Хакимов Р.С. Критическое мышление и обновление ислама / Р.С.Хакимов // Ислам, идентичность и политика в постсоветском пространстве. – Казань, 2005. – С. 28–35.
39. Хакимов Р.С. Перестройка и новейшая история Татарстана: взгляд через 20 лет / Р.С.Хакимов // Политико-правовые ресурсы федерализма в России. – Казань, 2006. – С.107–115.
на англ. языке:
40. Khakimov R.S. Prospects of Federalism in Russia: A View from Tatarstan / R.S.Khakimov // Security Dialogue. – Oslo, 1996. – Vol. 27 (1). – Рp.69–80.
41. Khakimov R.S. Russia and Tatarstan. At a Crossroad of History / R.S.Khakimov // Anthropology & Archeology of Eurasia. Vol. 37, no. 1 (Summer 1998). N.J. – Рp.30–71.
42. Khakimov R.S. Tatarstan’s Model For Developing Russian Federalism / R.S.Khakimov // Centre and Periphery in Russian Politics. The Development of Russian Federalism. Nr. 235. September, 1998. Norwegian Institute of International Affairs. – Рp.43–52.
43. Khakimov R.S. Concluding Remarks / R.S.Khakimov // Federalism: Russia and Swiss perspectives. Materials of the Conference. Edited by Thomas Fleiner and Rafael Khakimov. – Moscow, 2001. – Рp.155–156.
44. Khakimov R.S. Political-legal resources of federalism in Russia / R.S.Khakimov // Kazan federalist. – Kazan, 2003. – №4 (8), autumn. – Рp.5–12.
45. Khakimov R.S. Islam’s Modernization: How Plausible Is It? / R.S.Khakimov // Russia in Global Affairs. Vol.1. – No.4. – October–December 2003. – Рp.126-139.
46. Khakimov R.S. Euro Islam in the Volga Region / R.S.Khakimov // Journal of South Asian and Middle Eastern Studies. Vol. XXVII. – No. 2. Winter 2004. – Рр.1–13.
47. Khakimov R.S. The Tatars. An afterword / R.S. Khakimov // Tatars. – Kazan, 2007. – Рp.142–156.