2. Федотов А. А. Духовное образование в Иваново-Вознесенской и Кинешемской епархии // Вестн. Иван. гос. энерг. ун-та. 2005. Вып. 2. С. 98–102.
3. Федотов А. А. Советское государство и общество в репрессивной модели отношений с Церковью («оттепель Хрущева») // Вестн. Нижегород. ун-та. 2005. Вып. 1 (4). С. 264–270.
4. Федотов А. А. Некоторые аспекты церковно-государственных отношений в условиях постсоветской России // Вестн. Иван. гос. энерг. ун-та. 2006. (Приложение.) С. 45–47.
5. Федотов А. А. Православное духовное образование в России в 1943-1988 годах // Вестн. Костром. гос. ун-та. 2006. № 3. С. 115–117.
6. Федотов А. А. Патриотическое служение Русской Православной Церкви в годы Великой Отечественной войны 1941–1945 гг. // Вестн. Костром. гос. ун-та. 2006. № 1. С. 53–56.
7. Федотов А. А. Подготовка кадров священнослужителей в Русской Православной Церкви и православное духовное образование в 60–80-е гг. XX века // Вестн. Костром. гос. ун-та. 2006. № 4. С. 100–103.
8. Федотов А. А. Русская Православная Церковь в 1943–2000 гг.: внутрицерковная жизнь, взаимоотношения с государством и обществом: (По материалам Центральной России). Иваново, 2005. 206 с.
9. Федотов А. А. Из истории Православия в советской и постсоветской России. Иваново, 2006. 518 с.
10.Федотов А. А. Русская Православная Церковь в 1943–2000 гг.: К постановке проблемы // Церковь, государство и общество в истории России XX века. Иваново, 2001. С. 16–18.
11.Федотов А. А. Религиозное образование и духовное просвещение в Ивановской епархии: 1990-е годы // Журн. Московской Патриархии. 2001. № 5. С. 42–53.
12.Федотов А. А. Реформа приходского управления и закрытие храмов в 1960-е годы: по материалам Ивановской, Владимирской и Костромской областей // Ист. вестн. (Москва – Воронеж). 2001. С. 158–165.
13.Федотов А. А. Ивановское Духовное училище: современное состояние и перспективы развития // Журн. Московской Патриархии. 2002. № 5. С. 72–77.
14.Федотов А. А. Архипастырь Ивановской земли, святитель Василий Кинешемский. Митрополит Павел (Гальковский). Епископ Борис (Воскобойников). Архиепископ Иов (Кресович) // Вестн. русского христианского движения (Париж – Нью-Йорк – Москва). 2000. С. 103–118.
15.Федотов А. А. На пути к осмыслению истории Русской Православной Церкви в XX веке // Церковно-исторический ежегодник. Иваново, 2002. С. 18–23.
16.Федотов А. А. Монастырское возрождение в Ивановской области // Церковь, государство и общество в истории России XX века. Иваново, 2002. С. 11–12.
17.Федотов А. А. Свято-Алексеевская Иваново-Вознесенская Духовная семинария: духовный центр епархии // Журн. Московской Патриархии. 2003. № 6. С. 17–19.
18.Федотов А. А. Историография истории Русской Православной Церкви XX века // Церковь, государство и общество в истории России XX века. Иваново, 2003. С. 115–122.
19.Федотов А. А. Характеристика источников по истории Русской Православной Церкви в ХХ веке // Церковь, государство и общество в истории России XX века. Иваново, 2004. С. 37–43.
20.Федотов А. А. III Международная научная конференция «Церковь, государство и общество в истории России XX века» в Иваново-Вознесенской епархии // Журн. Московской Патриархии. 2004. № 5. С. 39–45.
21.Федотов А. А. Свято-Успенский мужской монастырь в Иванове: становление новой обители // Журн. Московской Патриархии 2004. № 11. С. 32–35.
22.Федотов А. А. Архиерейский Собор Русской Православной Церкви 2000 года – важнейший этап истории Российского Православия // Церковь, государство и общество в истории России XX века. Иваново, 2005. С. 22–25.
23.Федотов А. А. Архипастыри земли Ивановской // Церковно-исторический вестн. (Москва). 2003. № 10. С. 101–135.
24.Федотов А. А. Методологический аспект изучения истории Русской Православной Церкви ХХ века // Интеллигенция и мир. 2004. № 1/2. С. 123–125.
25.Федотов А. А. Духовное образование в России в 1990–2003 гг. // Церковно-исторический ежегодник. Иваново, 2004. Вып. 2/3. С. 95–128.
26.Федотов А. А. Общественное сопротивление в России советской атеистической политике // Церковно-исторический ежегодник. Иваново, 2005. Вып. 4. С. 229–235.
27.Федотов А. А. Реформа приходского управления. Закрытие храмов как одно из важнейших направлений хрущевской антицерковной политики // Вестн. Иван. гос. ун-та. 2005. № 2. С. 52–58.