1. Комплексный подход к прогнозу и составляющие его теоретические концепции являются методологической основой для разработки компьютерных систем прогноза биологической активности химических соединений. В рамках комплексной методологии создана ИТ «Микрокосм» – высокоэффективная информационная технология прогноза фармакологической активности химических соединений.
2. Новая информационная технология позволяет с высокой точностью проводить прогноз наличия и уровня 33 видов фармакологической активности структурно-разнородных соединений и 30 видов фармакологической активности структурно-сходных соединений и осуществлять на этой основе эффективный направленный поиск высокоактивных веществ с заданным фармакологическим действием – в том числе, для солей и молекулярных комплексов этих соединений.
3. Разработанная информационная технология успешно использована для прогноза наличия и уровня фармакологической активности смесей индивидуальных веществ, с учетом синергизма компонентов.
4. На основе созданной информационной технологии проведен анализ механизмов взаимодействия лигандов с сайтами связывания H1-, H2- и H3-гистаминовых рецепторов и построены содержательные модели этих сайтов.
5. С помощью новой информационной технологии с высокой достоверностью выполнена оценка канцерогенной опасности производных сульфенамидов и уровень острой токсичности производных конденсированных азотсодержащих гетероциклов.
6. С применением новой информационной технологии среди производных конденсированных азотсодержащих гетероциклов, адамантана, ГАМК и пирролидона в эксперименте найдены 182 вещества с высоким уровнем следующих видов активности: κ-опиоидной агонистической, P2Y1-антипуринергической, 5-HT3-антисеротониновой, антиагрегантной, гемореологической, антиаритмической, антиоксидантной, антиортовирусной, ноотропной, противоишемической; из них 30 соединений рекомендованы для углубленных экспериментальных фармакологических исследований.
1.Гистаминовые рецепторы (молекулярно-биологические и фармакологические аспекты): монография / А. А. Спасов, М. В. Черников, П. М. Васильев, В. А. Анисимова. – Волгоград: Изд-во ВолГМУ, 2007. – 152 с.
2.Васильев, П. М. Языки фрагментарного кодирования структуры соединений для компьютерного прогноза биологической активности / П. М. Васильев, А. А. Спасов // Рос. хим. ж. (Ж. Рос. хим. об-ва им. Д. И. Менделеева). – 2006. – Т. 50. – № 2. – С. 108-127.
3.Васильев, П. М. Применение компьютерной информационной технологии для прогноза фармакологической активности структурно разнородных химических соединений / П. М. Васильев, А. А. Спасов // Вестн. Волгогр. гос. мед. ун-та. – 2005. – № 1 (13). – С. 23-30.
4.Васильев, П. М. Компьютерный прогноз и экспериментальная проверка антиоксидантной активности новых химических соединений с использованием QSAR-зависимостей / П. М. Васильев, А. А. Спасов [и др.] // Там же. – № 2 (14). – С. 16-19.
5.Васильев, П. М. Компьютерный прогноз спектра фармакологических свойств активных соединений экстракта грецких орехов / П. М. Васильев, И. Ф. Горлов, О. С. Юрина // Докл. РАСХН. – 2002. – № 2. – С. 55-58.
6.Горлов, И. Ф. Экспериментальная проверка результатов компьютерного прогноза фармакологической активности экстракта грецких орехов / И. Ф. Горлов, О. С. Юрина, П. М. Васильев // Там же. – № 5. – С. 45-47.
7.Васильев, П. М. Прогноз канцерогенной опасности органических соединений методом шансов / П. М. Васильев, В. В. Орлов, В. Е. Дербишер // Хим.-фарм. журн. – 2000. – Т. 34. – № 7. – С. 19-22.
8.Ковалев, Г. В. Синтез, прогноз и исследование биологической активности 1,3-ди-(тридиметоксифосфорилпропил) производных урацила и 6-метилурацила / Г. В. Ковалев, А. И. Рахимов, А. А. Озеров, В. И. Петров, А. А. Спасов, С. Г. Ковалев, М. С. Новиков, П. М. Васильев [и др.] // Там же. – 1990. – Т. 24. – № 6. – С. 25-27.
9.Гурбанов, К. Г. Взаимосвязь между величиной отрицательного инотропного действия и химической структурой производных краун-эфиров / К. Г. Гурбанов, А. А. Паперно, А. А. Спасов, П. М. Васильев [и др.] // Эксперим. клин. фармакол. – 1993. – Т. 56. – № 3. – С. 32-34.
10.Старовойтов, М. К. Компьютерный прогноз канцерогенной опасности сульфенамидных ускорителей вулканизации / М. К. Старовойтов, П. М. Васильев [и др.] // Каучук и резина. – 2002. – № 1. – С. 28-31.
11.Васильев, П. М. Компьютерная мето¬дика прогнозирования свойств ускорителей вулканизации / П.М.Васильев [и др.] // Там же. – 2001. – № 3. – С. 22-25.
12.Орлов, В. В. Диагностика возможной активности производных адамантана в полимерных композициях методами молекулярного дизайна / В. В. Орлов, В. Е. Дербишер, Ю. Л. Зотов, П. М. Васильев [и др.] // Хим. пром-сть. – 2003. – Т. 80. – № 2. – С. 46-55 (98-107).
13.Но, Б. И. Компьютерное конструирование и целенаправленный синтез адамантилсодержащих соединений – высокоэффективных добавок в полимерные композиции / Б. И. Но, П. М. Васильев [и др.] // Пласт. массы. – 2003. – № 4. – С. 27-32.
14.Гермашев, И. В. Компьютерное конструирование активных добавок для поливинилхлорида / И. В. Гермашев, В. Е. Дербишер, Ю. Л. Зотов, М. Н. Цаплева, Е. В. Коннова, П. М. Васильев // Там же. – 2001. – № 7. – С. 36-38.
15.Гермашев, И. В. Прогнозирование на основе вероятностных методов ак¬тивности низкомолекулярных органических соединений в полимерных композициях / И. В. Гермашев, В. Е. Дербишер, П. М. Васильев // Теорет. основы хим. технологии. – 1998. – Т. 32. – № 5. – С. 563-567.
16.Дербишер, В. Е. Конструирование банка данных по низко-молекулярным добавкам для полимерных материалов / В. Е. Дербишер, П. М. Васильев [и др.] // Изв. ВУЗов. Химия и хим. технология. – 1995. – Т. 38. – Вып. 4-5. – С. 129-133.
Авторские свидетельства
17.А. с. 1121953 СССР, МПК C 07 D 487/04. Дигидро¬хлориды 2-диметокси-фенилимидазо-(1,2-а)бензимидазолов, обладающие спазмолитической, антиоксидантной, антиферментной и противоаллергической активностью / В. А. Анисимова, М. В. Левченко, Г. В. Ковалев, А. А. Спасов, П. М. Васильев [и др.] (СССР). – № 3484750/23-04; заявл. 19.08.82; зарег. 01.07.84. – 22 с.
18.А. с. 1103516 СССР, МПК C 07 D 487/04. Дигидрохлориды 3-(2,2,2-три-хлор-1-оксиэтил)имидазо(1,2-а)бензимидазолов, обладающие спазмолитической, антирадиомиметической, антиоксидантной и антиаритмической активностью / В. А. Анисимова, А. А. Спасов, Н. И. Авдюнина, Г. В. Ковалев, П. М. Васильев [и др.] (СССР). – № 3473843/23-04; заявл. 19.07.82; зарег. 15.03.84. – 22 с.
19.А. с. 1100876 СССР, МПК C 07 D 487/04. Гидробромиды 3-теноил-2-метил-имидазо-(1,2-а)бензимидазолов, обладающие спазмолитической, антирадиомиметической, антиоксидант¬ной, противоаллергической и антиферментной активностью / В. А. Анисимова, Г. В. Ковалев, А. А. Спасов, П. М. Васильев [и др.] (СССР). – № 3484748/23-04; заявл. 19.08.82; зарег. 01.03.84. – 14 с.
20.А. с. 1094304 СССР, МПК C 07 D 487/04. Дигидрохлориды N,N-дизамещенных 3-аминоацетилимидазо(1,2-а)бензимидазола, обладающие спазмолитической, антирадиомиметической и антиоксидант¬ной активностью / А. А. Спасов, В. А. Анисимова, Н. И. Авдюнина, Г. В. Ковалев, П. М. Васильев [и др.] (СССР). – № 3463771/23-04; заявл. 05.07.82; зарег. 22.01.84. – 13 с.
21.А. с. 1081977 СССР, МПК C 07 D 487/04. Гидрохлориды 1-замещенных 3-винил-2-иминобензимидазолина, обладающие антиферментной, гипогликемической и спазмолитической активностью / В. А. Анисимова, Р. Е. Либинзон, Г. В. Ковалев, А. А. Спасов, И. Н. Карасева, С. Г. Антонян, Н. А. Богачев, П. М. Васильев [и др.] (СССР). – № 3450293/23-04; заявл. 10.06.82; зарег. 22.11.83. – 17 с.
22.А. с. 1078862 СССР, МПК C 07 D 487/04. Соли 2-арил-9-диалкиламино-этилимидазо-(1,2-а)бензимидазолов, обладающие антирадиомиметической антиоксидантной, спазмолитической и противоаллергической ак¬тивностью / В. А. Анисимова, И. Д. Ионов, А. А. Спасов, Г. В. Ковалев, В. В. Шайдров, П. М. Васильев [и др.] (СССР). – № 3484749/23-04; заявл. 19.08.82; зарег. 08.11.83. – 15 с.
23.А. с. 803385 СССР, МПК C 07 D 487/04. Гидрохлориды 2-бензимидазолил-имидазо(1,2-а)бензимидазолов, повышающие резистентность миокарда к аноксии / В. А. Анисимова, А. А. Спасов, Г. В. Ковалев, А. М. Симонов, В. Г. Ватулин, П. М. Васильев (СССР). – № 2835243/23-04; заявл. 29.10.79; зарег. 08.10.80. – 9 с.
24.А. с. 803384 СССР, МПК C 07 D 487/04. Гидрохлориды 3-алкиламино-ацетилимидазо-(1,2-а)бензимидазолов, повышаю¬щие резистентность миокарда к аноксии / В. А. Анисимова, А. А. Спасов, Н. И. Авдюнина, Г. В. Ковалев, А. М. Симонов, П. М. Васильев (СССР). – № 2832817/25-04; заявл. 29.10.79; зарег. 08.10.80. – 10 с.
25.А. с. 1018362 СССР, МПК C 07 D 487/04. Гидрохлориды аминоме-тил(этил)-адамантанкарбоновых кислот, обладаю¬щие гипотензивной активностью / А. П. Хардин, И. А. Новаков, И. А. Кулев, С. С. Радченко, Г. В. Ковалев, И. Н. Тюренков, П. М. Васильев [и др.] (СССР). – № 3329850/23-04; заявл. 04.08.81; зарег. 14.01.83. – 8 с.
Депонированные рукописи
26.Расчет эффективной дозы методом непараметрической рег¬рессии / П. М. Васильев [и др.]; ВГМИ. – Волгоград, 1987. – 10 с. – Деп. в ВИНИТИ 23.04.87, №, 2897-В87. – Деп. науч. работы: Библиогр. указ. ВИНИТИ, 1987, № 8, б/о 293. – Фармакол. токсикол., 1988, № 3.
Статьи в журналах и сборниках материалов конференций 2009 - 2004 гг.
27.Бутов, Г. М. Синтез и виртуальный скрининг биологической активности адамантилсодержащих производных триметилбицикло[2.2.1]гептан-2-она / Г. М. Бутов, П. М. Васильев [и др.] // Новые информационные технологии в медицине: Матер. 3-й Всероссийск. конф. с междунар. участием (Волгоград, 30 окт. 2008 г.) / ВолГМУ. – Волгоград, 2008 // Бюл. Волгогр. науч. центра РАМН и Адм. Волгогр. обл. – 2008. – № 3. – С. 67.
28.Васильев, П. М. Миражи 3D-молекулярного моделирования / П. М. Васильев // Там же. – С. 69-71.
29.Васильев, П. М. Направленный поиск в ИТ «Микрокосм» новых производных бензимидазола и индола с высокой P2Y1 антипуринергической активностью / П. М. Васильев, А. Ю. Стуковина, А. А. Спасов [и др.] // Там же. – С. 71-72.
30.Васильев, П. М. Компьютерный прогноз и экспериментальная проверка 5-HT3-антисеротониновой активности новых азотсодержащих гетероциклических соединений / П. М. Васильев, Д. С. Яковлев, А. А. Спасов [и др.] // Там же. – С. 72-73.
31.Васильев, П. М. Сравнительный фармакофорный анализ противоишемической активности известных лекарственных веществ и молекулярных комплексов производных ГАМК / П. М. Васильев, В. Н. Перфилова, И. Н. Тюренков // Там же. – С. 73-75.
32.Бутов, Г. М. Синтез, компьютерный прогноз и экспериментальная проверка биологической активности новых производных адамантана / Г. М. Бутов, П. М. Васильев [и др.] // Фармакология – практическому здравоохранению: Матер. III съезда фармакологов России (Санкт-Петербург, 23-27 сент. 2007 г.) / ООО «Архив». – Санкт-Петербург, 2007 // Психофармакол. биол. наркол. – 2007. – Т. 7. – Спец. вып. (сентябрь). – Ч. 1. – С. 1627.
33.Васильев, П. М. Информационная технология компьютерного поиска новых лекарственных веществ / П. М. Васильев // Там же. – С. 1631-1632.
34.Васильев, П. М. Итеративный компьютерный скрининг новых азотсодержащих гетероциклических соединений с высокой гемореологической активностью / П. М. Васильев [и др.] // Там же. – С. 1632.
35.Гречко, О. Ю. Виртуальный скрининг и целенаправленный поиск соединений с высокой каппа-опиоидной активностью / О. Ю. Гречко, П. М. Васильев [и др.] // Там же. – С. 1666.
36.Гурова, Н. А. Компьютерный прогноз и экспериментальная проверка антиаритмической активности производных азотсодержащих гетероциклов / Н. А. Гурова, П. М. Васильев, В. А. Анисимова // Там же. – С. 1671.
37.Желтухина, А. Н. 3D-QSAR-анализ антагонистов 5-HT2-серотониновых рецепторов в ряду азотсодержащих гетероциклических соединений / А. Н. Желтухина, П. М. Васильев, А. А. Спасов [и др.] // Там же. – С. 1691.
38.Косолапов, В. А. Экспериментальная проверка точности компьютерного прогноза антиоксидантной активности новых гетероциклических соединений / В. А. Косолапов, П. М. Васильев [и др.] // Там же. – С. 1743.
39.Кучерявенко, А. Ф. Компьютерный поиск гетероциклических соединений с высокой антиагрегантной активностью / А. Ф. Кучерявенко, П. М. Васильев [и др.] // Там же. – С. 1760.
40.Самохина, М. П. QSAR-моделирование синергизма активных соединений экстракта Gymnema sylvestris / М. П. Самохина, П. М. Васильев, Н. И. Чепляева // Там же. – Ч. 2. – С. 1936.
41.Стуковина, А. Ю. QSAR-анализ новых антагонистов P2Y1-пуриновых рецепторов / А. Ю. Стуковина, П. М. Васильев [и др.] // Там же. – С. 1968.
42.Бутов, Г. М. Компьютерный прогноз биологической активности новых производных адамантана с помощью информационной технологии «Микрокосм» / Г. М. Бутов, П. М. Васильев [и др.] // Новые информационные технологии в медицине: Матер. Всероссийск. конф. с междунар. участием (Волгоград, 25-27 мая 2006 г.) / ВолГМУ. – Волгоград, 2006 // Бюл. Волгогр. науч. центра РАМН и Адм. Волгогр. обл. – 2006. – № 2. – С. 5-6.
43.Васильев, П. М. Информационная технология прогноза биологической активности химических соединений «Микрокосм» / П. М. Васильев // Там же. – С. 6-7.
44.Черников, М. В. Компьютерный скрининг новых производных бензимидазола с высокой 5-HT3-антисеротониновой активностью на базе информационной технологии «Микрокосм» / М. В. Черников, П. М. Васильев // Там же. – С. 7-8.
45.Васильев, П. М. Применение информационной технологии «Микрокосм» для прогноза фармакологической активности новых гетероциклических соединений / П. М. Васильев, А. А. Спасов [и др.] // Информационные технологии в образовании, технике и медицине: Матер. междунар. конф. (Волгоград, 18-22 окт. 2004 г.) / ВолгГТУ. – Вол¬гоград, 2004. – Т. 3. – С. 180-186.
Статьи в сборниках трудов ВУЗов 2009 - 2004 гг.
46.Бутов, Г. М. Виртуальный скрининг фармакологической активности производных адамантана / Г. М. Бутов, П. М. Васильев [и др.] // Современная инновационная медицина – населению Волгоградской области: Сб. науч. тр. / Под ред. акад. РАМН В. И. Петрова / Изд-во ВолГМУ. – Волгоград, 2008. – С. 134-135.
47.Васильев, П. М. Использование информационных технологий для поиска новых активных молекул / П. М. Васильев // Там же. – С. 135-137.
48.Васильев, П. М. Применение информационной технологии «Микрокосм» для прогноза антиангинальной активности производных ГАМК / П. М. Васильев, В. Н. Перфилова, И. Н. Тюренков // Там же. – С. 137-138.
49.Галенко-Ярошевский, А. П. Прогноз местноанестезирующей активности с использованием информационной технологии «Микрокосм» / А. П. Галенко-Ярошевский, П. М. Васильев // Там же. – С. 142-143.
50.Самохина, М. П. Экспериментальное исследование гипогликемической активности экстракта гимнемы лесной и компьютерное моделирование синергизма его компонентов / М. П. Самохина, П. М. Васильев, Н. И. Чепляева // Разработка, исследование и маркетинг новой фармацевтической продукции: Сб. науч. тр. / Под ред. М. В. Гаврилина / Пятигорская ГФА. – Пятигорск, 2008. – С. 490.
Тезисы докладов на конференциях 2009 - 2004 гг.
51.Гурова, Н. А. Проверка прогноза антиаритмической активности среди производных имидазобензимидазола / Н. А. Гурова, П. М. Васильев // Тез. докл. XVI Российск. Нац. конгр. «Человек и лекарство» (М., 6-10 апр. 2009 г.). – М., 2009. – С. 79.
52.Васильев, П. М. Компьютерный прогноз в ИТ «Микрокосм» синергизма гипогликемических и антиоксидантных соединений / П. М. Васильев, А. А. Спасов // Там же. – С. 528-529.
53.Васильев, П. М. QSAR-моделирование синергизма компонентов при прогнозе фармакологической активности смесей природных и синтетических органических соединений / П. М. Васильев, А. А. Спасов // Молекулярное моделирование: Тез. докл. 6-й Всероссийск. конф. (М., 8-10 апр. 2009 г.). – М., 2009. – С. 58.
54.Васильев, П. М. Компьютерный прогноз и экспериментальная проверка антиангинальной активности молекулярных комплексов производных фенибута / П. М. Васильев, В. Н. Перфилова, И. Н. Тюренков // Тез. докл. XV Российск. Нац. конгр. «Человек и лекарство» (М., 14-18 апр. 2008 г.). – М., 2008. – С. 599.
55.Васильев, П. М. 3D-QSAR-анализ азотсодержащих гетероциклических соединений с высокой антиагрегантной активностью / П. М. Васильев, А. А. Спасов [и др.] // Там же. – С. 599-600.
56.Васильев, П. М. Компьютерный прогноз и экспериментальная проверка антиагрегантной активности производных бензимидазола / П. М. Васильев [и др.] // Тез. докл. XIV Российск. Нац. конгр. «Человек и лекарство» (М., 16-20 апр. 2007 г.). – М., 2007. – С. 272.
57.Васильев, П. М. Компьютерный прогноз и экспериментальная проверка каппа-опиоидной агонистической активности конденсированных бензимидазолов / П. М. Васильев, А. А. Спасов [и др.] // Там же. – С. 272.
58.Косолапов, В. А. Компьютерный прогноз и экспериментальная проверка антиоксидантной активности азотсодержащих гетероциклических соединений / В. А. Косолапов, П. М. Васильев [и др.] // Там же. – С. 294-295.
59.Черников, М. В. Виртуальный скрининг конденсированных производных бензимидазола с H1- и H2-антигистаминной активностью / М. В. Черников, П. М. Васильев, А. А. Спасов, В. А. Анисимова // Там же. – С. 329-330.
60.Черников, М. В. Виртуальный скрининг полициклических бензимидазолов с 5-HT2- и 5-HT3-антисеротониновой активностью / М. В. Черников, П. М. Васильев, А. А. Спасов [и др.] // Там же. – С. 330.
61.Васильев, П. М. Прогноз биологической активности в информационной технологии «Микрокосм» с использованием анализа непротиворечивости спектра прогнозных оценок / П. М. Васильев // Молекулярное моделирование: Тез. докл. 5-й Всероссийск. конф. (М., 18-20 апр. 2007 г.). – М., 2007. – С. 42.
62.Васильев, П. М. Нотационные дескрипторы языка QLx информационной технологии «Микрокосм» / П. М. Васильев // Там же. – С. 43.
63.Васильев, П. М. Использование информационной технологии «Микрокосм» для прогноза фармакологической активности солей органических соединений / П. М. Васильев, А. А. Спасов [и др.] // Молекулярное моделирование: Тез. докл. 4-й Всероссийск. конф. (М., 12-15 апр. 2005 г.). – М., 2005. – C. 53.
64.Платонова, М. В. Синтез производных бензимидазола с потенциальной гипотензивной и противоаритмической активностью / М. В. Платонова, О. О. Тужиков, П. М. Васильев // Наукоемкие химические технологии – 2004: Тез. докл. междунар. науч.-техн. конф. (Волгоград, 7-10 сент. 2004 г.) / ВолгГТУ. – Волгоград, 2004. – Т. 1. – С. 310-312.
65.Васильев, П. М. Информационная технология прогноза свойств органических соединений «Микрокосм» / П. М. Васильев // Молекулярное моделирование в химии, биологии и медицине: Тез. докл. II Российск. шк.-конф. (Саратов, 13-16 окт. 2004 г.) / СГУ. – Саратов, 2004. – С. 8-9.
66.Васильев, П. М. Информационная технология прогноза свойств органических соединений «Микрокосм»: развернутый план краткого цикла лекций / П. М. Васильев // Там же. – С. 11-14.
67.Васильев, П. М. Эскиз нового языка описания структуры химических соединений для компьютерного прогноза свойств органических веществ / П. М. Васильев // Тез. докл. XI Российск. Нац. конгр. «Человек и лекарство» (М., 19-23 апр. 2004 г.). – М., 2004. – С. 596.
68.Спасов, А. А. Поиск гемореологически активных веществ среди производных имидазобензимидазола: использование классических и виртуальных методов скрининга / А. А. Спасов, А. В. Степанов, Н. В. Арькова, В. Н. Котов, П. М. Васильев [и др.] // Третья Всероссийск. с междунар. участием шк.-конф. по физиологии кровообращения: Тез. докл. (М., 27-30 янв. 2004 г.) / ФФМ МГУ. – М., 2004. – С. 102.
69.Vassiliev, P. M. The «Microcosm» information technology system for biological activity prediction of organic compounds: the prediction of hemorheological activity / P. M. Vassiliev, L. V. Naumenko, A. A. Spasov // Forth International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources (CMPTI-2007): Abstracts (Moscow, Russia, 1-5 Sept. 2007) – Moscow, 2007. – PO-56. – P. 126.
70.Vassiliev, P. M. The 3D-modeling, computer prediction and experimental testing of 5-HT3-antiserotonin activity of new chemical compounds / P. M. Vassiliev D. S. Yakovlev, V. V. Poroikov, D. A. Filimonov, A. A. Spasov [et al.] // Ibid. – PO-99. – P. 169.
71.Vassiliev, P. M. Computer forecast of carcinogenic hazard of rubber sulphonamide accelerators / P. M. Vassiliev [et al.] // 16-th International Congress of Chemical and Process Engineering (CHISA 2004): Summaries (Praha, Czech Republic, 22-26 Aug. 2004). – Praha, 2004. – V. 5 «Systems and Technology». – P7.91. – P. 1944-1945.