- Интеграза ДКП-ретротранспозона gypsy функционирует в клетках E.coli и осуществляет эксцизии длинного концевого повтора gypsy с полным восстановлением последовательности сайта-мишени.
- Интеграза ДКП-ретротранспозона gypsy специфична in vitro в отношении конструкций, содержащих длинные концевые повторы gypsy и других ДКП-ретротранспозонов группы gypsy. Ключевой домен интегразы -центральный.
- В лабораторной линии SS D.melanogaster мутация в локусе flamenco является следствием нарушения процессинга первичного транскрипта-предшественника piРНК.
- Группа gypsy ДКП-ретротранспозонов D.melanogaster биологически неоднородна и разделяется на подгруппы согласно сравнительному анализу последовательностей и специфичности их интеграции.
- Эррантивирусы и их производные проявляют специфичность в отношении выбора нуклеотидной последовательности ДНК-мишени и в отношении гетеро- и эухроматина.
- В процессе эволюции у дрозофил появился новый ген, доместицированный от гена gag эррантивирусов. Функция доместицированного гена высококонсервативна у дрозофилы и связана с участием в иммунном ответе.
1.Нефедова Л.Н., Любомирская Н.В., Ильин Ю.В., Ким А.И. Точные эксцизии длинных концевых повторов ретротранспозона МДГ4 (gypsy) Drosophila melanogaster, регистрируемые в клетках Escherichia coli, обусловлены его интегразной функцией // Генетика. 2006. 42(12):1654-1661.
2.Нефедова Л.Н., Романова Н.И., Ким А.И. Мутации в гене flamenco Drosophila melanogaster коррелируют с изменениями структуры гена DIP1 // Вестник Московского университета. Серия 16. Биология. 2006. 4:53-58.
3.Нефедова Л.Н., Романова Н.И., Ким А.И. Особенности структурной организации гена DIP1 в линиях Drosophila melanogaster, мутантных по гену flamenco // Генетика. 2007. 43(1):71-78.
4.Нефедова Л.Н., Ким А.И. Мобильный элемент НВ в геноме Drosophila melanogaster: структурный и функциональный анализ // Генетика. 2007. 43(5):620-632.
5.Нефедова Л.Н., Ким А.И. Эволюция от ретротранспозонов к ретровирусам: источник и происхождение гена env // Журнал общей биологии. 2007. 68(6):459-467.
6.Нефедова Л.Н., Ким А.И. Эволюция эррантивирусов Drosophila melanogaster. Стратегия 2: от ретровирусов к ретротранспозонам // Генетика. 2007. 43(10):1388-1395.
7.Нефедова Л.Н., Ким А. И. Молекулярная эволюция мобильных элементов группы gypsy: гомолог гена gag у Drosophila // Генетика. 2009. 45(1):30-37.
8.Нефедова Л.Н., Потапова М.В., Романова Н.И., Ким А.И. Анализ структуры и экспрессии гена DIP1 в линиях Drosophila melanogaster, мутантных по гену flamenco // Генетика. 2009. 45(2):203-208.
9.Нефедова Л.Н., Ким А.И. Геномика вирусов: новый подход и старая модель // Природа. 2009. 8:22-25.
10. Нефедова Л.Н., Ким А.И. Молекулярная филогения и систематика ретротранспозонов и ретровирусов дрозофилы // Молекулярная биология. 2009. 43(5):807-815.
11.Потапова М.В., Нефедова Л.Н., Ким А.И. Анализ структуры и экспрессии кластера генов D.melanogaster DIP1, CG32500, CG32819 и CG14476, входящих в область гена flamenco // Генетика. 2009. 45(10):1324-1331.
12.Нефедова Л.Н., Дыйканов Д.Т., Мартиросян И.А., Ким А.И. Ретротранспозоны Idefix и ZAM способны к транспозиции в линии MS Drosophila melanogaster, мутантной по гену flamenco // Вестник Московского университета. Серия 16: Биология. 2010. 2:3-8.
13.Nefedova L.N., Mannanova M.M., Kim A.I. Integration specificity of LTR-retrotransposons and retroviruses in the Drosophila melanogaster genome // Virus Genes. 2011. 42(2):297-306.
14.Нефедова Л.Н., Кузьмин И.В., Бурмистрова Д.А., Резазадех C., Ким А.И. Анализ транскрипции гена Grp, геномного гомолога гена gag ретротранспозона gypsy, у Drosophila melanogaster // Генетика. 2011. 47(8):1032-1037.
15.Кузьмин И.В., Шнырева А.А., Нефедова Л.Н., Ким А.И. Анализ экпспрессии гена Grp, геномного гомолога гена gag ретротранспозона gypsy Drosophila melanogaster, на уровне трансляции // Генетика. 2011. 47(9):1275-1278.
16.Маннанова М.М., Нефедова Л.Н., Ким А.И. Исследование активности интегразы ретротранспозона gypsy Drosophila melanogaster in vitro // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2011. 15(2):261-270.
17.Нефедова Л.Н., Маннанова М.М., Гусев Н.Б., Ким А.И. Структурно-функциональный анализ интегразы ретротранспозона gypsy Drosophila melanogaster // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2011. 15(2):277-282.
18.Урусов Ф.А., Нефедова Л.Н., Ким А.И. Анализ ткане- и стадиеспецифичности транскрипции ретротранспозонов группы gypsy у Drosophila melanogaster // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2011. 15(2):283-288.
19.Нефедова Л.Н., Урусов Ф.А., Романова Н.И., Ким А.И. Исследование транскрипционной и транспозиционной активности ретротранспозона Tirant в линиях Drosophila melanogaster SS, мутантных по гену flamenco // Генетика. 2012. 48(11):1271-1279.
20.Урусов Ф.А., Нефедова Л.Н., Лавренов А.Р., Романова Н.И., Ким А.И. Генетический и молекулярный анализ комплементации локусов flamenco и piwi у Drosophila // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013. 17(3):381-389.
21.Nefedova L., Kuzmin I., Makhnovskii P. , Kim A. Domesticated retroviral gag gene in Drosophila: new functions for an old gene // Virology. 2014. 450-451:196–204.
22.Лавренов А.Р., Нефедова Л.Н., Романова Н.И., Ким А.И.. Экспрессия генов семейства hp1 и их возможная роль в формировании фенотипа flamenco у D. melanogaster // Биохимия. 2014. 79(11):1554 – 1560.