Научная тема: «ЭВОЛЮЦИОННАЯ ДИНАМИКА БЕЛКОВ АДСОРБЦИОННОГО АППАРАТА НЕКОТОРЫХ ГРУПП БАКТЕРИОФАГОВ»
Специальность: 03.02.02; 03.01.03
Год: 2014
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. С-концевой домен [фолдон] фибритина бактериофага Т4 является автономно-тримеризующимся модулем, инициирующим фолдинг данного гомотримерного белка.
  2. В группе бактериофагов, родственных Т-чётным, имели место сравнительно частые модульные замены С-концевой области фибритина белковыми последовательностями различного происхождения; при этом генетически неродственные фолдону фага Т4 белковые домены выполняют сходную функцию в инициации фолдинга молекулы, что приводит к сохранению общего пути фолдинга этих природных химерных молекул. Имеющиеся данные о филогенетических взаимоотношениях бактериофагов, обладающих различными типами С-концевых доменов фибритина позволяют предположить, что указанные модульные замены активно происходили в течение некоторого ограниченного периода эволюционной истории группы фагов, родственных Т-четным (гетерохронная эволюция].
  3. Мишенью взаимодействия фибритина фага Т4 в процессе срабатывания молекулярного сенсора вирусной частицы является С-концевой домен пг 36. Взаимодействие фибритин - пгЗб является первым этапом в двухстадийном процессе срабатывания молекулярного сенсора фага Т4.
  4. Геномы бактериофагов, родственных Т-чётным, включают консервативную кор-область, гены которой эволюционируют преимущественно дивергентным путём, периферическую область, для которой характерна высокая частота обмена модулями генного и надгенного уровня, и промежуточную область, включающую ряд белков адсорбционного аппарата, для которых характерны перестановки модулей субгенного уровня.
  5. Микробная экосистема кишечника лошади включает в качестве автохтонных компонентов значительное количество вирулентных бактериофагов, в том числе вирулентных колифагов, причём вирусные популяции оказывают, по-видимому, селективное давление на популяции бактерий.
  6. Индивидуальные популяции E.coli и колиформных бактерий в кишечнике лошадей характеризуются чрезвычайно высоким уровнем внутривидового разнообразия - до тысячи одновременно присутствующих генетически различимых штаммов, обладающих также различной чувствительностью к индигенным бактериофагам.
  7. Наблюдаемые полиморфизмы белков адсорбционного аппарата у близкородственных экологически связанных изолятов индигенных колифагов лошадей свидетельствуют об активной селекции новых вариантов спектра хозяев у этих вирусов.
Список опубликованных работ
Статьи в научных журналах, рекомендованных ВАК РФ

1.Letarov A.V., Krisch H.M. The episodic evolution of fibritin: traces of ancient global environmental alterations may remain in the genomes of T4-like phages. // Ecol Evol. 2013. V. 3. P. 3628-3635. doi: 10.1002/ece3.730.

2.Miernikiewicz P., Dąbrowska K., Piotrowicz A., Owczarek В., Wojas-Turek J.,Kicielińska J., Rossowska J., Pajtasz-Piasecka E., Hodyra K., Macegoniuk K., Rzewucka K., Kopciuch A., Majka Т., Letarov A., Kulikov E., Maciejewski H., Górski A. T4 phage and its head surface proteins do not stimulate inflammatory mediator production. // PLoS One. 2013. 8(8]:e71036. doi: 10.1371/journal.pone.0071036.

3.Летарова М.А., Куликов Е.Е., Голомидова А.К., Прохоров Н.С., Кутузова Н.М., Стрелкова Д.М., Бакумова А.Д. Летаров А.В. Метастабильные ассоциации, формируемые в системе фаг -хозяин, выделенной из фекалий лошади. //Вестник УГСХА. 2013. Т. 3. №23. С. 57-61.

4.Kulikov E., Kropinski A.M., Golomidova A., Lingohr E., Govorun V., Serebryakova M., Prokhorov N., Letarova M., Manykin A., Strotskaya A. and Letarov A. Isolation and characterization of a novel indigenous intestinal N4-related coliphage vB_EcoP_G7C.// Virology. V. 426. P. 93-99.

5.Letarova, M., Strelkova, D., Nevolina, S., Letarov, A. A test for the "physiological phagemia" hypothesis-natural intestinal coliphages do not penetrate to the blood in horses. // Folia Microbiol [Praha] V. 57. P. 81-88.

6.Clokie,M.R.J., Millard A.D., Letarov A.V., Heaphy S. Phages in nature. // Bacteriophage. 2011. V.l. P. 31-45.

7.Летаров А.В., Голомидова А.К., Тарасян К.К. Экологические основы рациональной фаговой терапии. // Acta naturae. 2010. Т. 1. №2. 66-79.

8.Исаева А.С., Куликов Е.Е, Тарасян К.К., Летаров А.В. Новый метод высокоразрешающего геномного ПЦР-фингерпринтинга энтеробактерий. Acta naturae, 2010. T.l. №2. 82-87.

9.Letarov A. and Kulikov E. The bacteriophages in human- and animal body-associated microbial communities. // J. Appl. Microbiol. 2009. V. 107. P. 1-13.

10.Golomidova A., Kulikov E., Isaeva A., Manykin A. and Letarov A. The diversity of coliphages and coliforms in horse feces reveals a complex pattern of ecological interactions. //Appl. Environ. Microbiol. 2007. V.73. P. 5975-5981.

11. Латыпов О.Р., Голомидова А.К., Летаров А.В. «Характеристика продукта гена wac бактериофага JS98C3, близкородственного фагу JS98» // Ученые записки Казанского государственного университета Т.149. Кн.4. С. 1-11.

12.Куликов Е.Е., Исаева А.С., Роткина А.С., Маныкин А.А. и Летаров А.В. Биоразнообразие и динамика бактериофагов в фекалиях лошадей. // Микробиология. 2007. Т.76. С.271-278

13.Comeau A.M., Bertrand С, Letarov A., Tetart F. and Krisch H.M. Modular architecture of the T4 phage superfamily: A conserved core genome and a plastic periphery.// Virology. 2007. V. 362. P. 384-396.

14.Letarov A., Manival X., Desplats С and Krisch HM. gpwac of the T4-type bacteriophages: structure, function, and evolution of a segmented coiled-coil protein that controls viral infectivity. // J. Bacteriol. 2005. V.187. P. 1055-1066.

15.Mann N.H., Clokie M.R., Millard A., Cook A., Wilson W.H., Wheatley P.J., Letarov A. and Krisch HM. The genome of S-PM2, a "photosynthetic" T4-type 288bacteriophage that infects marine Synechococcus strains. // J. Bacteriol. 2005. V. 187. P. 3188-3200.

16.Boudko S.P., Londer Y.Y., Letarov A.V., Sernova N.V., Engel J., and Mesyanzhinov V.V. Domain organization, folding and stability of bacteriophage T4 fibritin, a segmented coiled-coil protein. //Eur. J. Biochem. 2002. V 269. P. 833-841.

17.Летаров А.В., Лондер Ю.Я., Будько СП. и Месянжинов В.В. Карбокси-концевой домен инициирует тримеризацию фибритина бактериофага Т4. // Биохимия. 1999. Т. 64. С. 817-823

18.Летаров А.В. Реконструкция возможных путей возникновения и морфологической эволюции бактериофагов. // Генетика. 1998. Т. 34. С. 1461-1469.

Избранные публикации в других изданиях

19.Letarov A. Bacteriophages as a part of the human microbiome. // in Bacteriophages in Health and Disease (Hyman and Abedon eds]. 2012. CAB International Press.

20.Летарова М.А., Стрелкова ДА, Бакумова А.Д., Куликов Е.Е., Голомидова А.К., Прохоров Н.С., Кутузова Н.М., Летаров А.В. Псевдолизогенные ассоциации вирулентного бактериофага G7C и шамма-хозяина Е. coli 4s. // Бактериофаги: теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности. Материалы Международной научно-практической конференции. 2013. Ульяновск Т.2. С. 140 -144.

21.Куликов Е. Е., Тарасян К. К., Голомидова А. К., Прохоров Н. С, Исаева А. С, Строцкая А. В., Татарский Е. В., Летарова М. А., Кутузова Н. М., Клунова С. М., Летаров А. В. Предварительный анализ генома нового колифага рЫКТ, близкородственного фагу Caulobacter crescentus Cdl. // Бактериофаги: теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности. Материалы Международной научно-практической конференции. 2013. Ульяновск Т..1 с. 54 - 59

22.Прохоров Н.С., Куликов Е.Е., Голомидова А.К., Летаров А.В. Механизмы взаимодействия фага vb_EcoP_G7C и родственных ему колифагов с клетками Escherichia coli на ранних стадиях инфекции. // Бактериофаги: теоретические и практические аспекты применения в медицине, ветеринарии и пищевой промышленности. Материалы Международной научно-практической конференции. 2013. Ульяновск Т. 1. С. 195 -198.

Летаров А.В. Эволюционная динамика, фолдинг и функция некоторых фибриллярных белков бактериофагов, родственных Т-чётным фагам энтеробактерий. // Труды ИНМИ им. С.Н. Виноградского РАН. 2004. Вып. XII. Москва. С. 269-288.