Головин Андрей Викторович

Научная тема: «КОНФОРМАЦИОННАЯДИНАМИКА НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ ПРИ ВЗАИМОДЕЙСТВИИС ЛИГАНДАМИ»

Специальность: 02.00.10

Год: 2014

Отрасль науки: Химические науки

Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:

Модель структуры комплекса тмРНК с рибосомой E. coli. Структурные модели взаимодействия производных макролидов с рибосомным тоннелем. Структурная динамика аптамера к тромбину 15-ТВА. Структурные модели взаимодействия катионов металлов с аптамером 15-ТВА. Улучшение терапевтических свойств аптамерной ДНК к тромбину.

Список опубликованных работ

1. Akhmadishina K., Bobrinetskii I., Komarov I., Malovichko A., Nevolin V., Petukhov V., Golovin A., Zalevskii A. Flexible biological sensors based on carbon nanotube films // Nanotechnologies in Russia. — 2013. — Т. 8, 11-12. — С. 721—726.

2.Anti-thrombosis aptamers and method for stabilizing the structure thereof : Patent PCT/RU2010/000 / A. Golovin, А. ГОЛОВИН, A. Kopylov, А. КОПЫЛОВ, R. Reshetnikov, Р. РЕШЕТНИКОВ, E. Zavyalova, Е. ЗАВЬЯЛОВА, G. Pavlova, Г. ПАВЛОВА [и др.]. — Заявл. 06 23.2011.

3.Bugaeva E. Y., Surkov S., Golovin A. V., Ofverstedt L.-G., Skoglund U., Isaksson L. A., Bogdanov A. A., Shpanchenko O. V., Dontsova O. A. Structural features of the tmRNA–ribosome interaction // RNA. — 2009. — Т. 15, № 12. — С. 2312—2320.

4.Reshetnikov R., Golovin A., Spiridonova V., Kopylov A., Sponer J. Structural dynamics of thrombin-binding DNA aptamer d (GGTTGGTGTGGTTGG) quadruplex DNA studied by large-scale explicit solvent simulations // Journal of Chemical Theory and Computation. — 2010. — Т. 6, № 10. — С. 3003— 3014.

5.Reshetnikov R. V., Sponer J., Rassokhina O. I., Kopylov A. M., Tsvetkov P. O., Makarov A. A., Golovin A. V. Cation binding to 15-TBA quadruplex DNA is a multiple-pathway cation-dependent process // Nucleic acids research. — 2011. — Т. 39, № 22. — С. 9789—9802.

6.Reshetnikov R., Golovin A., Kopylov A. Comparison of models of thrombin-binding 15-mer DNA aptamer by molecular dynamics simulation // Biochemistry (Moscow). — 2010. — Т. 75, № 8. — С. 1017—1024.

7.Reshetnikov R., Kopylov A., Golovin A. Classification of G-Quadruplex DNA on the Basis of the Quadruplex Twist Angle and Planarity of G-Quartets // Acta naturae. — 2010. — Т. 2, № 4. — С. 72.

8.Shishkina A., Makarov G., Tereshchenkov A., Korshunova G., Sumbatyan N., Golovin A., Svetlov M., Bogdanov A. Conjugates of amino acids and peptides with 5-O-mycaminosyltylonolide and their interaction with the ribosomal exit tunnel // Bioconjugate chemistry. — 2013. — Т. 24, № 11. — С. 1861—1869.

9.Shpanchenko O. V., Golovin A. V., Bugaeva E. Y., Isaksson L. A., Dontsova O. A. Structural aspects of trans-translation // IUBMB life. — 2010. — Т. 62, № 2. — С. 120—124.

10.Shpanchenko O., Bugaeva E. Y., Golovin A., Dontsova O. Trans-translation: Findings and hypotheses // Molecular Biology. — 2010. — Т. 44, № 4. — С. 495—502.

11.Shpanchenko O., EIu B., Golovin A., Dontsova O. [Trans-translation: facts and hypothesis]. // Molekuliarnaia biologiia. — 2009. — Т. 44, № 4. — С. 563— 572.

12.Zavyalova E., Golovin A., Pavlova G., Kopylov A. Module-Activity Relationship of G-quadruplex Based DNA Aptamers for Human Thrombin // Current medicinal chemistry. — 2013. — Т. 20, № 38. — С. 4836—4843.

13.Zavyalova E., Golovin A., Timoshenko T., Babiy A., Pavlova G., Kopylov A. DNA Aptamers for Human Thrombin with High Anticoagulant Activity Demonstrate Target-and Species-Specificity // Current medicinal chemistry. — 2012. — Т. 19, № 30. — С. 5232—5237.

14.Аптамерный олигонуклеотид - прямой ингибитор тромбина : Patent RU 2401306 / В. Спиридонова, А. Головин, А. Копылов, А. Добровольский, А. Мазуров. — Заявл. 12 12.2008.

15.Днк-аптамеры, ингибирующие тромбин, и способ стабилизации их структуры : Patent RU 2429293 / А. Головин, Р. Решетников, Е. Завьялова, А. М. Копылов, Г. Павлова, В. Бабий. — Заявл. 12 12.2009.

16.Модифицированные ДНК аптамеры, ингибирующие активность тромбина : Patent RU 2410432 / В. Спиридонова, А. Головин, А. Копылов, А. Добровольский, А. Мазуров. — Заявл. 11 11.2009.