Огарков Олег Борисович

1. Соотношение эпидемических и неэпидемических генотипов возбудителя туберкулеза, циркулирующих в популяции населения, наиболее значительно изменяется при глобальных миграционных процессах и социальных катаклизмах. Современное соотношение генотипов возбудителя туберкулеза в России и странах постсоветского пространства установилось в средине ХХ века.
2. Широкое распространение штаммов M. tuberculosis генотипа "Пекин" по территории Советского Союза произошло в средине XX века через пенетенциарную систему страны, основным источником штаммов данного генотипа явились служащие КВЖД.
3. Углубленное генотипирование микобактерий туберкулеза на территории Иркутской области выявило наличие "сверх-трансмиссивного" высоковирулентного субтипа MIT17 генотипа "Пекин", значимо чаще являющегося носителем множественной лекарственной устойчивости, чем другие субтипы.
4. Среди исследованных кандидатных генов устойчивости к туберкулезу легких ( ACE, AT1R, AT2R, CD209, INF-y, MCP-1) из Иркутской области и генотипов микобактерий, выделенных от этих же больных, только аллель -336G гена CD209 обнаружил протективные свойства относительно генотипа "Пекин" для мужчин.
5. Вероятность летального исхода от туберкулеза легких у мужчин значимо повышается при сочетании генотипа "Пекин" M. tuberculosis и аллеля -336G в гене CD209 больного.

2.Огарков О.Б. Медведева Т.В. Стратегия ПЦР-диагностики туберкулеза. // Материалы ежегодной конференции ДиаМА, Москва, 10-13 октября 2000 г. – С.83.

3.Огарков О.Б., Медведева Т.В., Беликов С.И., Курепина Н.Е., Деникина Н.Н., Ушаков И.В. Оценка эффективности ERIC-PCR типирования Mycobacterium tuberculosis при изучении распространения устойчивых к антибиотикам штаммов. // Молекуляр. генет. микробиол. вирусол. - 2002.- № 1. - С.21-24.

4.Огарков О.Б., Медведева Т.В. Ретроспективное исследование глобальной динамики появления новых генотипов Mycobacterium tuberculosis: "Молекулярные следы прошлых эпидемий" // Бюллетень Восточно-Сибирского Научного Центра. – 2003.- №7. – С.27-29.

5.Медведева Т.В., Огарков О.Б., Некипелов О.М., Ушаков И.В., Козьякова Е.С., Скворцова Р.Г., Беликов С.И. Генотипирование штаммов Mycobacterium tuberculosis циркулирующих на территории Восточной Сибири / Материалы VII Российского съезда фтизиатров. Москва, изд. Бином. - 2003. – С. 113.

6.Огарков О.Б. Медведева Т.В., Некипелов О.М., Ушаков И.В., Козьякова Е.С., Скворцова Р.Г. Молекулярно-эпидемиологический анализ штаммов Mycobacterium tuberculosis циркулирующих на территории Восточной Сибири / Материалы ежегодной конференции ДиаМА, С.-Петербург, 29сентября-3 октября 2003 г. – С.76.

7.Медведева Т.В., Огарков О.Б., Некипелов О.М., Ушаков И.В., Козьякова Е.С., Скворцова Р.Г. MIRU-VNTR генотипирование штаммов Mycobacterium tuberculosis в Восточной Сибири: семейство Beijing против Kilimanjaro. // Молекуляр. генет. микробиол. вирусол. – 2004. - № 4. - С.33-38.

8.Огарков О.Б., Медведева Т.В. Диагностика туберкулеза: клиническое и эпидемиологическое значение современных лабораторных методов обз. лит. // Сибирский медицинский журнал. - 2004. - № 1. - С. 5-9.

9.Медведева Т.В., Огарков О.Б., Ушаков И.В., Козьякова Е.С., Некипелов О.М., Скворцова Р.Г. Случай персистенции у новорожденного двух различных штаммов Mycobacterium tuberculosis // Сибирский медицинский журнал. – 2004 - № 1. - С. 80-82.

10.Медведева Т.В, Огарков О.Б., Некипелов О.М., Ушаков И.В., Козьякова Е.С., Скворцова Р.Г. Молекулярное генотипирование штаммов туберкулеза циркулирующих в Иркутской области-эволюционные модели происхождения основных семейств / Сб. работ ИОДЦ, Иркутск. – 2004. - С. 187-189.

11.Огарков О.Б., Медведева Т.В., Некипелов О.М., Ушаков И.В., Козьякова Е.С., Скворцова Р.Г. "Молекулярный мониторинг генотипов Mycobacterium tuberculosis В Восточной Сибири" // Материалы 5-й Всероссийской конференции “Генодиагностика инфекционных болезней”, Москва 19-21 октября. – 2004. – С.88-93.

12.Огарков О.Б., Медведева Т.В., Погорелов В.И., Некипелов О.М., Гутникова М.Ю, Ушаков И.В., Sola C. Молекулярная эпидемиология туберкулеза в Иркутской области в 2000-2005 гг. // Материалы Всероссийской конференции “Генодиагностика инфекционных болезней”, Сосновка, Новосибирская обл. 25-27 октября. – 2005. – С.121-216.

13.О.Б.Огарков, Т.В. Медведева, T. Zozio., В.И Погорелов, О.М. Некипелов., М.Ю. Гутникова , Н.Ю Купцевич., И.В Ушаков., C Sola Молекулярное типирования штаммов микобактерий туберкулеза в иркутской области (Восточная Сибирь) В 2000-2005 гг. // Молекулярная медицина. - 2007. - № 2. - С. 33-38.

14.Медведева Т.В., Огарков О.Б., Антипина С.Л., некипелов о.м. полиморфизма гена DC-SIGN (-871A/G И -336A/G) у больных туберкулезом в иркутской области (Восточная Сибирь) // материалы Всероссийская научно-практическая конференция "Генодиагностика инфекционных болезней - 2007" 28 – 30 ноября 2007 года, Москва. - 2007. – С.29-34.

15.Огарков О.Б., Медведева Т.В., Некипелов О.М. Изучение полиморфизма гена DC-SIGN у больных, пораженных штаммами Mycobacterium tuberculosis различных генотипов в Иркутской области // Проблемы туберкулеза. - 2007. - № 11. - С. 37- 42.

16.Огарков О.Б., Синьков В.В., Медведева Т.В., Гутникова М.Ю., Некипелов О.М., Купцевич Н.Ю., Скворцова Р.Г полиморфизм генов ACE, AT1R и AT2R у больных туберкулезом легких // Мол. Генетика микробиол. вирусол. – 2008. – № 2. – С.12-18.

17.Огарков О.Б., Костюнин К.Ю., Медведева Т.В., Антипина С.Л., Гутникова М.Ю, Некипелов О.М., Цинзерлинг В.А. Полиморфизм гена человека DC-SIGN -336A/G у больных, пораженных штаммами Helicobacter pylori и Mycobacterium tuberculosis различных генотипов. // 4 съезд Российского общества биохимиков и молекулярных биологов. Новосибирск. тез. докл. - 2008. – С. 247.

18.Огарков О.Б., Костюнин К.Ю., Медведева Т.В., Антипина С.Л., Гутникова М.Ю., Никипелов О.М., Цинзерлинг В.А. Оценка клинической значимости метода молекулярного генотипирования полиморфизма гена человека DC-SIGN — 336А/G у больных туберкулезом и гастритом. // Материалы ежегодной конференции ДиаМА. Белек (Турция) 29 сентября – 4 октября, Изд. АМБ. Екатеринбург. - 2008. - С.108-110.

19.Ogarkov O.B., Zorkaltseva E.Yu., Savilov E.D. Sinkov V.V., Vorobeva O.A., Kosenkova D.V., Medvedeva T.V., Korchina S.I. Genetic assoCiation points to the role of “Beijing” family of Mycobacterium tuberculosis in the study of polymorphism of human gene DC-SIGN – 336 A/G in patient with pulmonary tuberculosis, but not genes MCP1 -2518A/G and +874 A/T / 8th Nord-Baltic Congress on Infection Diseases/ - Saint-Petersburg. September 23-26. - 2009. – P. 53

20.Синьков В.В., Огарков О.Б., Зоркальцева Е.Ю., Скворцова Р.Г., Савилов Е.Д., Воробьева Д.В., Корчина С.И., Жданова С.Н., Косенкова Д.В., Медведева Т.В. Полиморфизм генов DC-SIGN -336A/G, MCP1 -2518A/G И INFY +874A/T у больных туберкулезом легких в Иркутской области // Сиб. мед. журнал. - 2009. - Т. 90. - № 7. - С. 30-33.

21.Мальцева М.В., Заруднев Е.А., Огарков О.Б., Синьков В.В., Савилов Е.Д. Оценка эпидемиологической ситуации по туберкулезу на территории Иркутской области / Материалы региональной конференции Барнаул. – 2010. – С. 107-109.

22.Огарков О.Б., Синьков В.В., Антипина С.Л., Косенкова Д.В. Полиморфизм локуса -336A/G гена DC-SIGN в аутопсиях от ВИЧ-негативных и ВИЧ-позитивных с генерализованными формами туберкулеза в Иркутской области // Журнал инфекционной патологии - 2010. – Т. 17. – С.186-187.

23.Синьков В.В., Огарков О.Б., Савилов Е.Д. "Пекинский" генотип M. tuberculosis – ключевой фактор эпидемии туберклеза в России. // Журнал инфекционной патологии -2010 – Т. 17. – С.193-194.

24.Савилов Е.Д., Жданова С.Н., Огарков О.Б., Зоркальцева Е.Ю., Слепцова Л.Г. Изучение молекулярно-эпидемиологических особенностей туберкулеза в Восточной Сибири. // Журнал инфекционной патологии -2010 – Т. 17. – С.124-125.

25.Жданова С.Н., Савилов Е.Д., Огарков О.Б., Зоркальцева Е.Ю., Алексеева Г.И., Слепцова Л.Г., Унтанова Л.С. Современные эпидемиологические исследования туберкулеза на эпидемически неблагополучных территориях Восточно-Сибирского региона и республики Саха (Якутия). // Труды II Сибирского конгресса по экологии с международным участием. / МАНЭБ Иркутск-Листвянка - 2010. - С. 17-19.

26.Савилов E. Д., Синьков В. В., Огарков О. Б. Пекинский генотип M. tuberculosis // Эпидемиология и инфекционные болезни – 2010. - №4. – С.50-53.

27.Огарков О. Б., Синьков В. В., Савилов E. Д., Антипина С.Л. Генотипирование Mycobacterium tuberculosis от эпидемиологии к клинической практике. / Материалы межрегиональной научно-практической конференции сециалистов противотуберкулезных учреждений ДФО и СФО, 8-9 сентября Владивосток. Изд. Медицина ДВ. – 2010 – С.31.

28.Огарков О.Б., Синьков В.В., Мокроусов И.В., Савилов Е.Д., Жданова С.Н., Антипина С.Л. Одновременное исследование MIRU-VNTR профилей Mycobacterium tuberculosis и SNP полиморфизма ДНК от пациентов с туберкулезом легких в Иркутской области // Материалы Всероссийской конференции “Молекулярная диагностика -2010”, Москва. 24-27 ноября. – 2010. – Т.1. - С.164-167.

29.Синьков В.В., Огарков О.Б., Савилов Е.Д Полиморфизм гена витамин Д связывающего белка (генотип 36555GG) ассоциирован с восприимчивостью к туберкулезной инфекции у больных туберкулезом легких в Иркутской области // Материалы Всероссийской конференции “Молекулярная диагностика -2010”, Москва. 24-27 ноября. – 2010. – Т.1. - С.176-177.

30.Савилов Е.Д., Синьков В.В., Огарков О.Б. Моделирование истории распространения "Пекинского" генотипа Mycobacterium tuberculosis на постсоветском пространстве по молекулярным данным. / Материалы IX российско-немецкой научно-практической конференции Форума им. Р.Коха и И.И.Мечникова. Новосибирск. – 2010. – С.246-247.

31.Савилов Е.Д., Синьков В.В., Огарков О.Б. "Пекинский" генотип Mycobacterium tuberculosis – ключевой фактор эпидемии туберкулеза в России. / Третий съезд военных врачей медико-профилактического профиля вооруженных сил Российской Федерации. Труды съезда. 8-10 декабря, С.-Петербург. – 2010. – С. 94.

32.Жданова С.Н., Савилов Е.Д., Огарков О.Б., Алексеева Г.И. Молекулярно-генетическое изучение микобактерий туберкулеза, циркулирующих на территории Восточной Сибири и Республики Саха (Якутия) / Третий съезд военных врачей медико-профилактического профиля вооруженных сил Российской Федерации. Труды съезда. 8-10 декабря, С.-Петербург. – 2010. – С. 93.

33.Синьков В.В., Савилов Е.Д., Огарков О.Б. Реконструкция эпидемической истории "Пекинского" генотипа Mycobacterium tuberculosis в России и странах бывшего СССР по результатам солиготипирования. // Мол. генетика микробиол. вирусол. – 2011. – № 3. – С.25-29.

34.Жданова С.Н., Зоркальцева Е.Ю., Огарков О.Б., Воробьева О.А., Унтанова Л.С., Алексеева Г.И., Савилов Е.Д. Характеристика лекарственно устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis с помощью молекулярно-генетических методов // Сиб.мед. журнал. – 2011. – №6. - С.-228-230.

35.Жданова С.Н., Огарков О.Б., Синьков В.В., Мокроусов И.В., Савилов Е.Д. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis из группы Ural циркулирующих на территории Иркутской области // Туберкулез и болезни легких. - 2011. - Т. 88. № 4. - С. 140-141.

36.Ogarkov O. B., Zhdanova S.N., Sinkov V.V., Savilov E.D. / Lethal synergism between Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis and -336G allele of CD209 gene in patients with pulmonary TB // 3rd Conference of The Union Asia-Pacific Region.- 2011- P.47. Hong Kong, China on 8–11 July

37.Огарков О.Б., Жданова С.Н. Степаненко Л.А. Лац А.А. Применение пакета прикладных программ MIRU-VNTRplus в молекулярно-эпидемиологической оценке трасмиссивности генотипов Mycobacterium tuberculosis // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. - 2011. - № 2.- С. 159-162

38.Жданова С.Н., Огарков О.Б., Степаненко Л.А., Лац А.А., Синьков В.В., Унтанова Л.С., Алексеева Г.И., Савилов Е.Д. Применение делеционного анализа по RD105 для выявления генотипа Пекин Mycobacterium tuberculosis // Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра СО РАМН. - 2011. - № 2. - С. 194-197.

39.Синьков В.В., Огарков О.Б., Жданова С.Н., Антипина С.Л., Савилов Е.Д. Анализ полиморфизма -336A/G гена DC-SIGN (CD209) в аутопсийном материале // Бюллетень Восточно-Сибирского Научного Центра СО РАМН. - 2011. № 2. - С. 220-221.

40.Астафьев В.А., Савилов Е.Д., Зоркальцева Е.Ю., Мальцева М.В., Огарков О.Б., Погорелов В.И. Оценка эпидемиологической ситуации по туберкулезу в Иркутской области // Сиб. мед. журнал - 2011. - Т. 105. № 6. - С. 199-202.

41.Савилов Е.Д., Синьков В.В., Огарков О.Б. Оценка глобального движения инфекционной заболеваемости с использованием методов молекулярной биологии // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2011. - № 3. - С. 11.-16.

42.Ogarkov O., Mokrousov I., Sinkov V., Zhdanova S., Antipina S., Savilov E. 2012. ´Lethal´ combination of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and human CD209 -336G allele in Russian male population. // Infect. Genet. Evol. – 2012. – V.12. – 732-736.

43.Ogarkov O., Sinkov V., Savilov E., Zhdanova S. The historical reconstruction of the “Beijing” genotype spreading of Mycobacterium tuberculosis in Russian Federation and former USSR countries by the methods of molecular epidemiology // Int. J. Infect. Dis. 2012;16S1: 47.027

44.Zhdanova S., Pholwat S., Ogarkov O., Alekseeva G., Lats A., Kravchenko A., Savilov E., Zarudnev E., Houpt E. Comparative investigation of molecular epidemiology Mycobacterium tuberculosis drug-resistant strains in two regions of Eastern Siberia // Int. J. Infect. Dis. 2012;16S1: 47.048

45.Синьков В.В., Савилов Е.Д., Огарков О.Б Эпидемиология туберкулёза в России: молекулярные и исторические доказательства в пользу сценария распространения пекинского генотипа M. tuberculosis в XX в // Туберкулез и болезни легких. - 2012. - № 3. - С. 057-062.

46.Лац А.А., Жданова С.Н., Огарков О.Б., Савилов Е.Д. Делеционный анализ по RD181, RD150, RD142 штаммов генотипа Пекин Mycobacterium tuberculosis у больных туберкулезом в иркутской области // Сибирский медицинский журнал. - 2012. - Т. 113. № 6. - С. 88-90.

47.Жданова С.Н., Огарков О.Б., Pholwat S., Лац А.А., Алексеева Г.И., Кравченко А.Ф., Зоркальцева Е.Ю., Houpt E., Савилов Е.Д. Характеристика мутаций, ответственных за резистентность к противотуберкулезным препаратам первого и второго ряда у штаммов Mycobacterium tuberculosis циркулирующих на территории иркутской области и республики Саха (Якутия) // Сиб. мед. журнал. - 2012. - Т. 113. № 6. - С. 64-67.

48.Жданова С.Н., Огарков О.Б., Зарбуев А.Н., Унтанова Л.С., Савилов Е.Д. Исследование генетического разнообразия Mycobacterium tuberculosis при сочетанной патологии с ВИЧ-инфекцией в Восточно-Сибирском регионе. // Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра СО РАМН. - 2012. - № 5-1. -С. 47-50.

49.Свистунов В.В., Огарков О.Б., Гришина Л.П., Каня О.В. Сравнительная характеристика летальных исходов от туберкулеза в соматических и специализированных стационарах г. иркутска в период 2008-2011 г.по данным патологоанатомических исследований // Сиб. мед. журнал. - 2013. - Т. 117. № 2. - С. 087-090.

50.Савилов Е.Д., Синьков В.В., Огарков О.Б Эпидемиология туберкулеза на Евро-Азиатском континенте: оценка глобального движения штаммов генотипа "Пекин"– Иркутск: РИО ГБОУ ДПО ИГМАПО, 2013. – 120 с.

51.Zhdanova S, Heysell S., Ogarkov O., Boyarinova G., Alexeeva G., Pholwat S., Zorkaltseva E, Houpt E., Savilov E. Primary Multidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis in 2 Regions, Eastern Siberia, Russian Federation // Emerging infectious diseases 2013. - V.19., N.10. - P1649-1652