- Геном вируса гепатита С подвержен природной рекомбинации. Рекомбинация является одним из механизмов эволюции ВГС.
- Природный рекомбинант RF1_2k/1b сформировался в результате гомологичной рекомбинации геномов 1b и 2k по механизму непроцессивной смены матрицы.
- Природный рекомбинант RF1_2k/1b обладает селективным преимуществом, обеспечивающим ему значимую роль в эпидемическом процессе по сравнению с «родительским» изолятом субтипа 2k.
- Синонимические точечные мутации в core области генома вируса гепатита С могут приводить к формированию изолятов с измененным белковым профилем.
2.Жданов, К. В. Особенности течения гепатита С у наркоманов / К. В. Жданов, Ю. В. Лобзин, С. Л. Мукомолов, В. С. Чирский, О. В. Калинина, С. А. Повзун, В. А. Плотникова, Д. А. Гусев // Рос. журн. гастр., гепат., колопрокт. - 2000. - Т. 10. - № 1. - Прил. 9. - C. 8.
3.Жданов, К. В. Генотипы HCV и их взаимосвязь с морфологическими изменениями в печени у больных хроническим гепатитом С / К. В. Жданов, Ю. В. Лобзин, С. Л. Мукомолов, В. С. Чирский, О. В. Калинина, Д. А. Гусев. // Рос. журн. гастр., гепат., колопрокт. - 2000. - Т. 10. - № 5. -Прил. 11. - C. 79.
4.Zhdanov, K. Influence of HCV genotypes on clinical and histological features in young HCV-infected patients in Northwest region of Russia / K. Zhdanov, Y. Lobzin, S. Mukomolov, V. Chirsky, O. Kalinina, D. Gusev // 9th International Congress on Infectious Diseases. - 2000. - Buenos Aires. - P. 293.
5.Ветров, Т. А. Иммунный ответ структурным и неструктурным белкам вируса гепатита С у больных с острой и хронической формой инфекции / Т. А. Ветров, О. В. Калинина, В. Н. Плотникова, А. А. Колобов, Е. В. Эсауленко, С. Л. Мукомолов // Мат. 4-й росс.-итал. науч. конф. «Инфекционные болезни: диагностика, лечение, профилактика». - 2000.– СПб. – C. 299.
6.Kalinina, O. Transmission of HCV in hemodialysis units in Saint-Petersburg involves only nosocomial strains / O. Kalinina, H. Norder, M. Borzanova, S. Mukomolov, L. Magnius // J. Clin. Virol. - 2001. – V. 22. – N. 2. – P. 174.
7.Жданов, К. В. Значение количественного определения РНК у больных хроническим гепатитом С / К. В. Жданов, Ю. В. Лобзин, В. С. Чирский, С. Л. Мукомолов, О. В. Калинина, Д. А. Гусев // Рос. журн. гастр., гепат., колопрокт. - 2001. - Т. 11. - № 5. - Прил. 15. - C. 77.
8.Kalinina, O. Shift in predominanting subtype of HCV from 1b to 3a in St.Petersburg mediated by increase in injection drug use / O. Kalinina, H. Norder, T. Vetrov, K. Zhdanov, V. Plotnikova, S. Mukomolov, L. Magnius // 8th International Symposium on Hepatitis C and related Viruses. - 2001. - Sept. 2-5. – Paris. - P. 302.
9.Калинина, О. В. Превалирование генотипа HCV 3а у больных острым гепатитом С в Санкт-Петербурге / О. В. Калинина, Е. В. Эсауленко, С. Л. Мукомолов // Гепатит В, С, D - проблемы диагностики, лечения и профилактики: тез. докл. IV Рос. науч.-практ. конф. - 2001. – Москва. - C. 160.
10.Kalinina, O. Shift in predominating subtype of HCV from 1b to 3a in St. Petersburg mediated by increase in injecting drug use / O. Kalinina, H. Norder, T. Vetrov, K. Zhdanov, M. Barzunova, V. Plotnikova, S. Mukomolov, L. Magnius // J. Med. Virol. - 2001. – V. 65. - P. 517-524.
11.Калинина, О. Распространение вируса гепатита С в условиях тесного бытового контакта / О. Калинина, В. Чахарьян, В. Плотникова, С. Мукомолов // VIII Съезд ВНПОЭМП. – 2002. - Mарт 26-28. - Москва. – С. 108.
12.Шляхтенко, Л. И. Перспективы современной и полной этиологической диагностики вирусных гепатитов. Новые препараты в профилактике, терапии и диагностике вирусных инфекций / Л. И. Шляхтенко, О. В. Калинина, В. А. Плотникова, Л. Г. Сулягина, В. В. Чахарьян, Е. П. Шаргородская, Н. Н. Птичникова, Н. А. Авсюкевич, С. Л. Мукомолов // Тез. Всерос. науч.-практ. конф. - 2002. - СПб. C. 87–88.
13.Kalinina, O. A natural intergenotypic recombinant of hepatitis C virus identified in St. Petersburg / O. Kalinina, H. Norder, S. Mukomolov, L. Magnius // J. Virol. - 2002. – V. 76. – P. 4034-4043.
14.Kalinina, O. Intrahospital outbreak of hepatitis C connected with virus transmission from an ansthesiologist to patients / O. Kalinina, H. Norder, L. Kryga, O. Parkov, L. Magnius, S. Mukomolov // 5th Baltic Nordic Congress of Infectious Diseases. – 2002. - May 22-25. - St. Petersburg. – P. 78.
15.Kalinina, O. Natural intergenotyping HCV recombinant in St. Petersburg / O. Kalinina, H. Norder, V. Tchexorjan, S. Mukomolov, L. Magnius // 9th International Meeting on HCV and Related Viruses. – 2002. - July 7-11. - San-Diego. - P. 215.
16.Kalinina, O. More recombinant HCV strains recovered in St. Petersburg / O. Kalinina, H. Norder, V. Thcakharian, K. Zhdanov, P. Kislii, T. Vetrov, S. Mukomolov, L. Magnius // 9th International Meeting on HCV and Related Viruses. – 2002. - July 7-11. - San-Diego. - P. 225.
17.Kalinina, O. Recombination in hepatitis C virus / O. Kalinina, H. Norder, S. Mukomolov, L. Magnius // XIIth International Congress of Virology. – 2002. - July 27- August 1. – Paris. - P. 100.
18.Cristina, J. Hepatitis C virus phylogeny: a useful clinical tool / J. Cristina, S. Mukomolov, R. Colina, O. Kalinina, L. Garcia, B. Khan, C. Mogdasy, P. Karayiannis // Acta Virol. - 2002. - V. 46. – P. 179-182.
19.Вирусные гепатиты в Российской Федерации : Аналитический обзор (4-й выпуск) / под. ред. Жебруна А. Б. – СПб: НИИЭМ им. Пастера, 2003. - C. 143-183.
20.Мукомолов, С. Л. Молекулярная эпидемиология вирусных гепатитов : Пособие для врачей / С. Л. Мукомолов, О. В. Калинина. - СПб.: Фолиант, 2003. - 24 с.
21.Мукомолов, С. Л. Молекулярная эпидемиология вирусных гепатитов / С. Л. Мукомолов, О. В. Калинина // Мир вирусных гепатитов. - 2003. - № 11. - C. 2– 7.
22.Мукомолов, С. Л. Молекулярная эпидемиология вирусных гепатитов / С. Л. Мукомолов, О. В. Калинина // Мир вирусных гепатитов. - 2003. - № 12. - C. 5-13.
23. Kalinina, O. Secondary RNA structures of parental strains support HCV recombination by template switch at negative strand synthesis / O. Kalinina, H. Norder, L. Magnius // 10th International Meeting on HCV and Related Viruses. –2003. – December. – Kyoto. - P. 215.
24.Schijman, A. Comparison of Hepatitis C Viral Load in Patients with or without Coinfection with Different Genotypes / A. Schijman, R. Colina, S. Mukomolov, O. Kalinina, L. Garcia, S. Broor, A. Bhupatiraju, P. Karayiannis, B. Khan, C. Mogdasy, J. Cristina // Clin. Diag. Lab. Immun. - 2004. – V. 11. – P. 433-435.
25.Kalinina, O. More Strains of the HCV Recombinant Recovered in Russia / O. Kalinina, H. Norder, O. Znoiko, V. Thcakharian, S. Mukomolov, L. O. Magnius // 14th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. – 2004. -1–4 May. – Praga. - P. 211.
26.Kalinina, O. Natural recombinant hepatitis C virus strain: a useful tool for understanding of the interferon-alpha resistance // O. Kalinina, H. Norder, S. Мukomolov, L. O. Magnius // 6th Nordic-Baltic Congress on Infectious Diseases. -2004. - 3-6 June. – Palanga. - P. 169.
27.Kalinina, O. Full-Length Open Reading Frame of a Recombinant hepatitis C Virus Strain from St. Petersburg: Proposed mechanism for its formation // O.Kalinina, H. Norder, L. Magnius // J. Gen. Virol. - 2004. – V. 85. – P. 1853-1857.
28.Kalinina, O. Spread of the natural hepatitis C virus recombinant, RF1_2k/1b, outside Russia / O. Kalinina, C. Jern, T. Tallo, O. Znoiko, M. Isaguliants, S. Mukomolov, H. Norder, L. Magnius // 11th International Meeting on HCV and Related Viruses. –2004. – October. – Heidelberg (Germany). – P. 189.
29. Mavromara, P. The impact of HCV diversity on diagnosis tools for HCV infection / P. Mavromara, A. Sall, O. Kalinina, V. Horm, A. Budkowska, HCV Collaborative Team of the International Pasteur Network // Med. Mal. Infect. -2005. – V. 35. – Suppl. 2. – P. 103-104.
30.Kalinina, O. Spread of the natural hepatitis C virus recombinant outside Russia / O. Kalinina, C. Jern, T. Tallo, V. Thcakharian, D. Gusev, O. Znoiko, M. Isaguliants, S. Mukomolov, H. Norder, L. O. Magnius // 12th International Symposium on Viral Hepatitis and Liver Disease. - 2006. - July 1-5. - Paris. – P. 208.
31.Andréo, U. Lipoprotein lipase mediates hepatitis C virus (HCV) cell entry and inhibits HCV infection / U. Andréo, P. Maillard, O. Kalinina, M. Walic, E. Meurs, M. Martinot, P. Marcellin, A. Budkowska // Cell Microbiol. - 2007. – V. 9. – N. 10. – P. 2445-2456.
32.Budkowska, A. Biologycal role of a novel protein (CORE+1/F) encoded by the alternative open reading frame of the hepatitis C virus genome / A. Budkowska, A. Kakkanas, E. Nerrienet, O. Kalinina, P. Maillard, V. Sorn, G. Dalagiorgou, N. Vassilaki, P. Mavromara // Confer. Scientif. Internat. Du Reseau Internat. Des Instituts Pasteur. - 2008. - Juin 26-27. - Paris.
33.Мукомолов, С. Л. Молекулярно-биологическая характеристика возбудителей вирусных гепатитов В и С / С. Л. Мукомолов, О. В. Калинина, И. В. Ликий, М. В. Сталевская // Вестник СПбГМА им. И.И. Мечникова. - 2008. - Т. 28. - № 3. – C. 27-31.
34. Budkowska, A. Synonymous Mutations in the Core Gene Are Linked to Unusual Serological Profile in Hepatitis C Virus Infection / A. Budkowska, A. Kakkanas, E. Nerrienet, O. Kalinina, P. Maillard, S. Horm, G. Dalagiorgou, N. Vassilaki, U. Georgopoulou, M. Martinot, A. Sall, P. Mavromara // PLoS One. -2011. – V. 6. – N. 1. – P. 1-12.
35.Kalinina, O. Analysis of cases of nosocomial infection with HCV / O. Kalinina, S. Mukomolov, H. Norder, L. O. Magnius // The 8th Annual Conference on Hepatitis C. - 2011. - 13-16 February. – Vilnius.
36.Исагулянц, М. Г. Клинический случай: желтушная форма острого гепатита G с серологическими маркерами HCV-инфекции на фоне заместительной стероидной терапии / М. Г. Исагулянц, Е. В. Цыганова, О. О. Знойко, Т. В. Петрова, Н. В. Петракова, А. Виделль, Н. Д. Ющук, К. Р. Дудина, Н. В. Федосеева, В. Д. Смирнов, С. А. Солонин, О. В. Исаева, К. К. Кюрегян, М. С. Вонский, О. В. Калинина, Т. Талло, В. Тефанова // Мир вирусных гепатитов. - 2011. - № 1. - C. 35-43.
37.Жебрун, А. Б. Разнообразие и изменчивость популяций микроорганизмов на современном этапе / А. Б. Жебрун, С. Л. Мукомолов, О. В. Нарвская, И. В. Мокроусов, Г. Я. Ценева, Л. А. Кафтырева, Н. И. Романенкова, О. В. Калинина // Тез. Х Съезда Всеросс. научно-практ. общества эпидем., микроб. и паразит. -2012. - 12-13 апреля. – Москва. - C. 82.
38.Калинина, О. В. Природный рекомбинант вируса гепатита С RF1_2k/1b: 10 ЛЕТ СПУСТЯ / О. В. Калинина, О. О. Знойко, Т. Г. Талло, М. Г. Исагулянц, К. В. Жданов, Д. А. Гусев, П. Н. Кислый, С. М. Мукомолов, В. В. Чахарьян , H. Norder, L. O. Magnius // Тез. Х Съезда Всеросс. научно-практ. общества эпидем., микроб. и паразит. - 2012. - 12-13 апреля. – Москва. - C. 446.
39.Калинина, О. В. Природный рекомбинант вируса гепатита С RF1_2k/1b: клинико-эпидемиологическое значение / О. В. Калинина, О. О. Знойко, М. Г. Исагулянц // Тез. IV Ежегодного Всеросс. Конгресса по инфекц. болезням. -2012. - 26-28 марта. – Москва. - C. 169.
40.Kalinina, O. Clinical and epidemiological features of the natural hepatitis C virus recombinant RF1_2k/1b / O. Kalinina, O. Znoiko // The 9th Annual Conference on Hepatitis C. - 2012. - 31 March-04 April. – St. Petersburg.
41.Калинина, О. В. Организация генома и география природного межгенотипного рекомбинанта вируса гепатита С RF1_2k/1b / О. В. Калинина // Инфекции и иммунитет. - 2012. - Т. 2. - № 4. - C. 677-686.
42.Kalinina, O. Somatic Changes in Primary Liver Cancer from Russia: a pilot study / O. Kalinina, A. Marchio, A. Urbanskii, A.Tarkova, Kh. Rebbani, D. A. Granov, A. Dejean, M. Generalov, P. Pineau // Mutation Research-Genetic Toxicology and Environmental Mutagenesis. - 2013. - In press.
43.Kalinina, O. Atypical Somatic Changes in Primary Liver Cancer from Russia: a pilot study / O. Kalinina, A. Marchio, M. Generalov, A. Urbanskii, A. Tarkova, Kh. Rebbani, A. Dejean3, D. A. Granov, P. Pineau // 10th Annual Conference of New Visby Network in Hepatitis. - 2013. - 10-13 February. – Riga.