Научная тема: «РАЗРАБОТКА НОВЫХ МЕТОДОВ АНАЛИЗА СПИРТОВ И АЛЬДЕГИДОВ И КОНСТРУИРОВАНИЕ ПРОДУЦЕНТОВ ЭТАНОЛА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ НЕТРАДИЦИОННЫХ ДРОЖЖЕЙ HANSENULA POLYMORPHA И PICHIA STIPITIS»
Специальность: 03.01.06; 03.02.03
Год: 2013
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  • Нетрадиционные дрожжи Н. рolymorpha и их мутанты - сверхпродуценты АО и ФАДГ впервые использованы  для анализа этанола и метанола в биогенных пробах  (вино, пиво, соки, безалкогольные напитки), метанола и формальдегида в модельных растворах и промстоках, а также формальдегида - в пищевых рыбных продуктах.
  • Разработан и использован в аналитической практике новый ферментно-химический метод определения метанола и формальдегида в смесях этих веществ, основанный на применении химического анализа формальдегида с гидразоном 3-метил-2-бензотиазолина без АО и последующей реакции с участием АО, что позволяет определять общее содержание метанола и формальдегида  в промстоках.
  • Разработаны новые типы амперометрических биосенсоров с использованием ферментов дрожжей Н. рolymorpha (АО, мутантная АО, ФАДГ) и осмий-содержащих катионных и анионных полимеров для получения быстрого отклика на аналит при высокой чувствительности и стабильности биосенсора. Сконструированные биосенсоры  использованы для анализа метанола, этанола и формальдегида.
  • Сконструирован рекомбинантный штамм дрожжей XYL1m9 P. stipitis с повышенной продуктивностью алкогольной ферментации ксилозы и гидролизатов растительного сырья. Обнаружена способность рекомбинантных штаммов H. polymorpha с увеличенным внутриклеточным содержанием глутатиона к сверхсинтезу этанола в среде с глюкозой.
Список опубликованных работ
А. Статьи в российских журналах, рекомендуемых ВАК, и в приравниваемых к ним периодических изданиях, входящих хотя бы в одну из библиографических баз цитирования, в том числе с международным импакт-фактором (IF)

1.Maidan M.M., Sybirny W.A., Gonchar M.V., Kotylak Z., Sybirny A.A. Wykorzystanie biosensora elektrochemicznego do oznaczania metanolu w ściekach przemysłowych. Ochrona Środowiska, 2000, N4(79), 27-28. [IF = 0,6]

2.Gonchar M., Maidan M., Korpan Y., Sibirny V., Kotylak Z., Sibirny A. Metabolically engineered methylotrophic yeast cells and enzymes as sensor biorecognition elements. FEMS Yeast Research, 2002, 2, 307-314. [IF= 1,172]

3.Gonchar М.V., Grabek D., Оklejewich B., Pavlishko H.М., Shamlian О.V., Sybirny V.А., Kotylak Z., Rudke K., Csoregi E., Sibirny A.A.. A New enzymo-chemical method for simultaneous assay of methanol and formaldehyde. Ukr. Biochem. J. 2005, 77, 146-154.

4.Сибирный В.А., Гончар М.В., Рябова О.В., Майдан М.М. Современные методы анаилиза формальдегида, метанола и этанола с использованием микробных и ферментных систем. Микробиол. ж. (Киев), 2005, 67, 85-110.

5.Sybirny A., Sybirny W., Puchalski Cz. Biopaliwowy etanol z lignocelulozy (biomasy roślinnej): osiągnięcia, problemy, perspektywy. Postępy Nauk Rolniczych, 2007, N 4, 15-23.

6.Sybirny W., Puchalski Cz., Sybirny A. Metaboliczna inżynieria drobnoustrojów dla konstruowania wydajnych producentów bioetanolu z lignocellulozy. Biotechnologia, 2007, N 4, 38-54.

7.Demkiv O.M., Paryzhak S.Y., Gayda G.Z., Sibirny V.A., Gonchar M.V. Formaldehyde dehydrogenase from recombinant yeast Hansenula polymorpha: isolation and bioanalitical application. FEMS Yeast Res., 2007, 7, 1153-1159. [IF= 2,812]

8.Dmytruk K.V., Smutok O.V., Ryabova O.B., Gayda G.Z., Sibirny V.A., Schuchman W. Gonchar M.V., Sybirny A.A. Isolation and characterization of mutated alcohol oxidases from the yeast Hansenula polymorpha with decreased affinity toward substrates and their use as selective elements of an amperometric biosensor. BMC Biotechnology, 2007, 7, 33-39. [IF= 2,723]

9.Sibirny V.А., Gonchar М.V., Grabek-Lejko D., Csoregi E., Pavlishko H.М., Sibirny A.A. Photometric assay of methanol and formaldehyde in industrial waste-waters using alcohol oxidase and 3-methyl-2-benzothiazoline hydrazone. Int. J. Environ. Anal. Chem., 2008, 88, 289-301. [IF= 1,114]

10.Sibirny V., Demkiv O., Klepach H., Honchar T., Gonchar M. Alcohol oxidase- and formaldehyde dehydrogenase-based enzymatic methods for formaldehydе assay in fish foods products. Food Chemistry, 2011, 127, 774-779. [IF= 3,458]

11.Kamińska-Kiszka E., Wit Ł., Sibirna L., Sibirny V., Gonchar M. Oznaczanie zawartości etanolu metodą enzymatyczną w winach i napojach owocowych oraz sokach. Żywność. Nauka. Technologia. Jakość, 2011, 4, 45-57. [IF= 0.157]

12.Sibirny V., Demkiv O., Paryzhak S., Klepach H., Korpan Y., Smutok O., Nisnevich M., Gayda G., Puchalski C., Gonchar M. Formaldehyde-oxidizing enzymes and genetically modified yeast Hansenula polymorpha cells in monitoring and removal of formaldehyde. In: Waste Water - Evaluation and Management, Fernando Sebastián García Einschlag (Ed.), InTech, 2011, p. 115-154. ISBN: 978-953-307-233-3.

13.Grabek-Lejko D., Kurylenko O.O., Sibirny V.A., Ubiyvovk V.M., Penninckx M., Sibirny A.A. Alcoholic fermentation by the wild-type and the recombinant strains of Hansenula polymorpha and Saccharomyces cerevisiae with elevated level of intracellular glutathione. J. Industrial Microbiol. and Biotechnol., 2011, 38, 11, 1853-1859 [IF= 2,416]

14.Smutok O., Gayda G., Dmytruk K., Klepach H., Nisnevitch M., Sibirny A., Puchalski Cz., Broda D., Schuhmann W., Gonchar M., Sibirny V. Ampеrоtometric biosensors for lactate, alcohols and glycerol assays in clinical diagnostics. In: Biosensors for Health, Environment and Biosecurity, Book 1, InTech, 2011, p.401-446. ISBN 978-953-307-328-6.

15.Сибирный В.А., Гончар М.В. Ферментативное oпределение содержания этанола в плодово-ягодных винах и соках. Вестник УГСХА, 2011, N2(14), 57-62.

16.Сибирный В.А., Гончар М.В. Определение формальдегида в рыбе с использованием алкогольоксидазы и формальдегиддегидрогеназы. Вестник УГСХА, 2012, N 1(17), 67-73.

17.Grabek-Lejko D., Sibirny V., Sibirny A. Regulacja ekspresji genów u drożdży metylotroficznych. Postępy Biochemii, 2013, 59 (1), 95-106.

Б. Монографии

18.Sybirny W. Nowe enzymatyczne i biosensorowe metody analizy formaldehydu, metanolu oraz etanolu w środowisku i artykułach spożywczych. Wydawnictwo Uniwersytetu Rzeszowskiego, Rzeszów, 2008, 101 s.

19.Сибирный В. Анализ спиртов и альдегидов, конструирование продуцентов этанола. Разработка новых методов с использованием неконвенционных дрожжей Hannsenula polymorpha и Pichia stipitis. ISBN 978-3-8473-9155-5. Palmarium Academic Publishing, Saarbrucken, Germany, 2012, 256 c.

В. Статьи в других журналах и сборниках

20.Bień J., Sybirny W., Sybirny A. Maidan N, Gonchar M. Nowa enzymatyczno-chemiczna metoda oznaczania formaldehydu i metanolu w ściekach przemysłowych. Inżynieria i Ochrona Środowiska, 1999, 2, N3-4, 323-331.

21.Бень Я., Гончар М., Майдан Т., Сибирный В., Сибирный А. Новые методы анализа метанола и формальдегида в сточных водах. В: Труды Международного экологического конгресса «Новое в экологии и безопасности жизнедеятельности». Санкт-Петербург, 2000, 182-186.

22.Gonchar M.V., Ryabova O.B., Dmytruk K.V., Zakalska O.M., Smutok O.V., Pavlishko H.M., Gayda G.Z., Sibirny V.A., Sybirny A.A. Isolation and characterization of the mutant forms of Hansenula polymorpha alcohol oxidase as a selective element of the amperometric biosensor. In: Investigations on sensor systems and Technologies. Ed. By A.V. Elskaya and V.D. Pokhodenko. Kiev, National Acad. Sci. of Ukraine, 2006, 134-140.

23.Paryzhak S., Demkiv. O., Gajda G., Sibirny V., Schuhmann W., Gonchar M. Enzyme- and cells-based biosensors for assay of formaldehyde in vaccines. In: 2nd Polish-Ukrainian Weigl Conference "Microbiology of the XXI century" Warsaw Agricultural University - SGGW, 24-26 September, 2007, p. 170-173.

24.Дмитрук К.В., Куриленко O.O., Ищук О.П., Убийвовк В.М., Сибирный В.А., Федорович Д.В., Сибирный А.А. Конструирование рекомбинантного штамма дрожжей Pichia stipitis с улучшенными параметрами алкогольной ферментации ксилозы. Наука та інновації (Київ), 2010, т. 6, № 6, 45-50.

25.Sibirny V., Kamińska-Kiszka E., Sibirna L., Gonchar M. Zastosowanie zestawu enzymatycznego „Alkotest” do oznaczania etanolu w winach owocowych, napojach i sokach. In: Proceeding Book of X International Scientific Conference “Risk factors of food chain”, September 13–14, 2010, Nitra, Slovak Republic, p. 282-288.

26.Sibirny W., Smutok O., Klepach H., Gayda G., Dmytruk K., Broda D., Gonchar M. Alcohol-selective amperometric biosensors based on natural and mutated alcohol oxidases. In: Nowoczesne metody analizy surowców roślinnych. G. Bartosz, Cz. Puchalski (red.), Wydawnictwo Uniwersytetu Rzeszowskiego, Rzeszów, 2011, 241-253.

27.Demkiv О., Chen D., Lupak М., Grabek-Lejko D., Gayda G., Gonchar М., Sibirny W. Konstruowanie laboratoryjnych modeli bioreaktorów do detoksykacji formaldehydu ze środowiska. W: Nowoczesne metody analizy surowców roślinnych. G. Bartosz, Cz. Puchalski (red.),Wydawnictwo Uniwersytetu Rzeszowskiego, Rzeszów, 2011, 255-264.

28.Grabek-Lejko D., Sybirny W., Sibirny A. Drożdże niekonwencjonalne jako potencjalni producenci etanolu paliwowego z lignocelulozowych odpadów rolniczych. W: Nowoczesne metody analizy surowców roślinnych. G. Bartosz, Cz. Puchalski (red.),Wydawnictwo Uniwersytetu Rzeszowskiego, Rzeszów, 2011, 369-378.

29.Сибирный В.А., Гончар М.В. Биотехнологические параметры определения формальдегида с использованием алкогольоксидазы и формальдегиддегидрогеназы. В: Настоящее и будущее биотехнологии в решении проблем экологии, медицины, сельского, лесного хозяйства и промышленности. Сборник научных трудов научно-практического семинара с международным участием. Ульяновск, УлГУ, 2011, 141-146.

Г. Тезисы научных конференций

30.Sibirny V., Maidan M., Pavlishko H., Stasyk O., Smutok O., Stel’mashchuk S., Gonchar M., Sibirny A. Bioanaliyical application of enzymes from methylotrophic yeasts. In: Proc. 21st Intern. Spec. Symp. On Yeasts (ISSY 2001)”Biochem., Genetics, Biotechnol. and Ecol. Of Non-conventional Yeasts (NSY)”, 2001, Lviv, Ukraine, 84.

31.Ryabova O.B., Maidan M.M., Gonchar M.V., Zaczek A., Grabek D., Oklejewicz B., Grzadka M., Sibirny V.A., Kotylak Z., Sibirny A.A. Glukose and xylose fermentation to acetaldehyde and etanol by the yeasts Hansenula polymorpha and Pichia stipitis. In: Proc. 22nd Intern. Spec. Symp. On Yeasts (ISSY 2002) „Yeast Fermentations and other Yeast Bioprocesses”, 2002, Pillanesburg National Park, South Africa, 64.

32.Ryabova O.B., Chmil O.M., Grabek D., Sibirny V.A., Kotylak Z., Sibirny A.A. Xylose and cellulose fermentation to ethanol by the thermotolerant methylotrophic yeast Hansenula polymorpha and Pichia stipitis. In: Proc.22nd Intern. Spec. Symp. On Yeasts (ISSY 2002) „Yeast Fermentations and other Yeast Bioprocesses”, 2002, Pillanesburg National Park, South Africa, 86.

33.Sibirny A., Kotylak Z., Sibirny W., Grabek D., Oklejewicz B., Grządka M., Ryabova O. Biotechnologia produkcji etanolu paliwowego z ligninocellulozy przez drożdże. Materiały II Krajowego Kongresu Biotechnologii. Łódź, 2003, 89.

34.Grabek D., Oklejewicz B., Kotylak Z., Sibirny A., Sibirny V., Gonchar M. Biosensory na zasadzie genetycznie zmodyfikowanych komórek drożdży metylotroficznych oraz enzymów i perspektywy ich wykorzystania. Materiały II Krajowego Kongresu Biotechnologii. Łódź, 2003, 92.

35.Gonchar M., Pavlishko H., Oklejewicz B., Grabek D., Kotylak Z., Sibirny A., Sibirny V. Nowa enzymatyczna metoda równoczesnego oznaczania zawartości formaldehydu i metanolu w ściekach przemysłowych. Materiały II Krajowego Kongresu Biotechnologii. Łódź, 2003, 86.

36.Kotylak Z., Sibirny A., Sibirny V., Żaczek A., Kus-Liśkiewicz M. Genetyczna analiza termotolerancyjnych szczepów drożdży Saccharomyces cerevisiae. Materiały II Krajowego Kongresu Biotechnologii. Łódź, 2003, 227.

37.Gonchar M., Korpan Y., Grabek D., Kotylak Z., Sibirny V., Elska A., Sibirny A. Yeast cells- and alcohol oxidase-based biosensors for assay of formaldehyde. In: 6-th International Conference on Role of Formaldehyde in Biological Systems. Pécs, Hungary, 2003, 54.

38.Gonchar M., Gayda G., Pavlishko H., Smutok O., Sibirny V., Kotylak Z., Sibirny A. Metabolically engineered yeast cells and enzymes as the biorecognition elements of biosensors. First (Inaugural) Ukrainian Congress for Cell Biology. Lviv, UCCB, 2004, 85.

39.Sibirny A., Gonchar M., Ryabova O., Dmytruk K., Zakalska O., Smutok O., Pavlishko H., Gayda G., Sibirny V., Schuchman W. Genetically engineered oxidases: structural and functional characterization and analytical exploration. Abstracts of Ukrainian-German Symposium on Nanobiotechnology "Current State and Prospects for Future Cooperation" Kyiv, December 14-16, 2006, p.133.

40.Sibirny V.А., Grabek-Lejko D., Gonchar М.V., Sibirny A.A Enzymo-chemical method for simultaneous assay of methanol and formaldehyde in industrial waste-waters using alcohol oxidaseand 3-methyl-2-benzothiazolinone hydrazone. Abstracts of 12-th International Congress on Yeasts, Kyiv, August 11-15, 2008, p.332.

41.Sybirny V., Dmitruk K., Zakalska O., Klepach H., Smutok O., Gonchar M., Sybirny A.. Alcohol oxidases from the yeast Hansenula polymorpha with decreased affinity toward substrates as the bioelements of amperometric biosensors. Abstracts of 3rd Ukrainian-Polish Weigl Conference “Microbiology on Service for Human”, Odessa, September 14-17, 2009, p. 108-109.

42.Sibirny V., Kamińska-Kiszka E., Sibirna L., Gonchar M. Application of the enzymatic kit „Alkotest” for etanol assai In fruit wines, soft drinks and juices. Abstracts of X International Scientific Conference “Risk factors of food chain”, Nitra, Slovak Republic, September, 13–14, 2010, p. 37.

43.Grabek-Lejko D., Kurylenko O., Ubiyvovk V.M., Sibirny V., Penninckx M., Sibirny A. Interactions between glutathione metabolism and glucose fermentation in Hansenula polymorpha and Saccharomyces cerevisiae yeasts. Abstracts of 28th International Specialized Symposium on Yeasts, Bangkok, Thailand, September 15-16, 2010, p. 78.

44.Sibirny V., Honchar T., Gonchar M. New enzymatic method for formaldehyde assay in fish food products using enzymes of Hansenula polymorpha. Abstracts of XI International Scientific Conference “Risk factors of food chain”, Iwonicz, Poland, September, 5-6, 2011, p. 77.

45.Demkiv O., Gayda G., Korpan Y., Sigawi S., Nisnevich M., Sibirny V., Gonchar M. Recombinant yeast Hansenula polymorpha cells for formaldehyde monitoring and bioconversion in bioreactor. Abstracts of International Symposium on Cell Biology jointly with 3rd Ukrainian Congress for Cell Biology, Yalta, May 16-20, 2012, p. 68.