Научная тема: «ПАТОГЕНЕТИКА АЛЛЕРГИЧЕСКИХ БОЛЕЗНЕЙ: СИНТРОПНЫЕ ГЕНЫ, ПОЛНОГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ АССОЦИАЦИЙ, МЕЖГЕННЫЕ И ГЕННО-СРЕДОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ»
Специальность: 03.02.07
Год: 2013
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. Генетическая компонента подверженности аллергическим заболеваниям представлена синтропными и специфическими генами. Сферой компетенции синтропных генов является инициация и регуляция иммунного ответа (преимущественно гуморального) в процессе аллергического воспаления, а также регуляция противоинфекционного иммунитета, в то время как специфические гены связаны с характерными для каждой болезни фенотипическими проявлениями (гладко-мышечное сокращение для бронхиальной астмы; развитие покровных тканей для атопического дерматита; реакции биотрансформации для лекарственной аллергии).
  2. Аллергические болезни имеют общие гены с аутоиммунными, воспалительными, инфекционными, паразитарными и метаболическими болезнями. Большинство этих генов связано с регуляцией иммунного ответа и воспаления. По общности генетической компоненты подверженности аллергические заболевания близки к инфекционным болезням и дистанцированы от аутоиммунных патологий.
  3. Детская бронхиальная астма ассоциирована с полиморфными вариантами гена PPP1R12B (1q32.1). Аллергический ринит связан с полиморфными вариантами гена KCNE4 (2q36.1); коморбидность с бронхиальной астмой важна для фенотипического выражения этой ассоциации.
  4. Изменчивость аллергических фенотипов связана с межгенными и генно-средовыми взаимодействиями. Существенным компонентом системы генно-средовых взаимодействий является гельминтная инвазия Opisthorchis felineus; к генетическим факторам этой системы относятся: для бронхиальной астмы - IFNG и SOCS5; для атопического дерматита - GATA3 и IL4; для аллергического ринита - TBX21 и SOCS5; для поливалентной сенсибилизации - IFNG и IL4RA; для тяжести течения бронхиальной астмы - IFNG и PIAS3.
  5. Межгенные и генно-средовые комбинации, включающие гены-модификаторы иммунного ответа и описторхозную инвазию, имеют диагностическую и прогностическую ценность в отношении оценки риска бронхиальной астмы и тяжести ее течения, атопического дерматита и поливалентной сенсибилизации.
Список опубликованных работ
Патенты

1.Огородова Л.М., Фрейдин М.Б., Черевко Н.А., Васильева М.В., Брагина Е.Ю., Салтыкова И.В. (Россия). Патент № 2383019. Российская Федерация. МПК G01N 33/48. Способ прогнозирования риска развития бронхиальной астмы / №2008148685/15 // Бюллетень ФИПС. Москва, заявл. 09.12.2008; опубл. 27.02.2010. №6.

2.Огородова Л.М., Фрейдин М.Б., Салтыкова И.В., Куликов Е.С., Селиванова П.А., Сазонов А.Э. (Россия). Патент РФ № 2433401. Российская Федерация. МПК G01N33/48. Способ прогнозирования риска развития терапевтической резистентности у больных бронхиальной астмой. Выдан: 15.07.2010, опубликован: 10.11.2011.

Учебные пособия

3. Сеитова Г.Н., Буйкин С.В., Рудко А.А., Фрейдин М.Б. Наследственность иболезни легких (Наследственность и здоровье): Учебное пособие / Под ред.В.П. Пузырѐва. Томск: «Печатная мануфактура», 2008. 64 с.

Главы в монографиях

4.Огородова Л.М., Пузырев В.П., Фрейдин М.Б., Кобякова О.С. Взаимосвязь генетических и внешнесредовых факторов в формировании клинического фенотипа бронхиальной астмы // Клинические рекомендации: Бронхиальная астма у взрослых. Атопический дерматит / Под ред. А.Г. Чучалина. М.: Издательский холдинг «Атмосфера», 2002. С. 23-42.

5.Пузырев В.П., Степанов В.А., Фрейдин М.Б. Молекулярные основы распространенных многофакториальных заболеваний / Геномика – медицине // Под ред. академика РАМН В.И. Иванова и академика РАН Л.Л. Киселева. М.: ИКЦ «Академкнига», 2005. С. 100-137.

6.Фрейдин М.Б., Огородова Л.М., Цой А.Н., Бердникова Н.Г. Генетика бронхиальной астмы / Генетика бронхолегочных заболеваний: Монография // Под ред. Пузырева В.П., Огородовой Л.М. (Серия монографий Российского респираторного общества; Гл. ред. серии Чучалин А.Г.). М.: Издательский холдинг «Атмосфера», 2010. С. 78-104.

Статьи в журналах

7.Огородова Л.М., Петровская Ю.А., Камалтынова Е.М., Петровский Ф.И., Пузырев В.П., Кулманакова И.М., Фрейдин М.Б., Еномото Т. Тяжелая бронхиальная астма у детей: факторы риска, течение // Пульмонология. 2002. №1. С. 68-71.

8.Огородова Л.М., Федорова О.С., Брагина Е.Ю., Фрейдин М.Б. Значение генетических предикторов для первичной профилактики бронхиальной астмы у детей с атопическим дерматитом // Педиатрия. 2005. № 6. С. 4-6.

9.Фрейдин М.Б., Брагина Е.Ю., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Генетика атопии: современное состояние // Информационный вестник ВОГиС. 2006. Т. 10. № 3. С. 492-503.

10.Огородова Л.М., Фрейдин М.Б., Сазонов А.Э., Федорова О.С., Гербек И.Э., Черевко Н.А., Рудко А.А., Брагина Е.Ю., Перевозчикова Т.В., Файт Е.А., Лебедева Н.Ю. Изучение распространенности аллергической патологии и описторхозной инвазии и их взаимосвязи у населения Томской области // Бюллетень сибирской медицины. 2006. № 4. С. 48-51.

11.Фрейдин М.Б., Пузырев В.П. Геномные основы подверженности атопическим заболеваниям // Молекулярная медицина. 2007. № 3. С. 26-35.

12.Огородова Л.М., Федорова О.С., Брагина Е.Ю., Фрейдин М.Б., Петровская М.И. Генетические маркеры бронхиальной астмы у детей, больных атопическим дерматитом // Пульмонология. 2007. № 4. С. 37-40.

13.Огородова Л.М., Федорова О.С., Фрейдин М.Б., Васильева М.В., Черевко Н.А., Сазонов А.Э., Петрова И.В., Салтыкова И.В., Брагина Е.Ю., Куликов Е.С., Деев И.А. Характеристика эпидемиологических и молекулярных взаимоотношений аллергических и гельминтных болезней в эндемическом очаге описторхоза // Бюллетень сибирской медицины. 2008. № 4. С. 37-43.

14.Салтыкова И.В., Фрейдин М.Б., Брагина Е.Ю., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Вовлеченность генов сигнальных молекул цитокинов в патогенезе бронхиальной астмы и описторхоза // Якутский медицинский журнал. 2009. № 2. С. 121-123.

15.Пузырев В.П., Фрейдин М.Б. Генетический взгляд на феномен сочетанных заболеваний у человека // Acta Naturae. 2009. № 3. С. 57-63.

16.Фрейдин М.Б., Пузырев В.П. Синтропные гены аллергических заболеваний // Генетика. 2010. Т. 46. № 2. С. 224-229.

17.Огородова Л.М., Фрейдин М.Б., Сазонов А.Э., Фѐдорова О.С., Деев И.А., Кремер Е.Э. Влияние инвазии Opistorchis felineus на иммунный ответ при бронхиальной астме // Бюллетень сибирской медицины. 2010. Т. 9. № 3. С. 85-90.

18.Selivanova P.A., Kulikov E.S., Kozina O.V., Gereng E.A., Freidin M.B., Ogoro-dova L.M. Morphological and molecular characteristics of "difficult" asthma // Journal of Asthma. 2010. V. 47(3). P. 269-275.

19.Фрейдин М.Б., Брагина Е.Ю., Федорова О.С., Деев И.А., Куликов Е.С., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Полногеномный анализ ассоциаций аллергических заболеваний с молекулярными маркерами у русских жителей Западной Сибири // Молекулярная биология. 2011. Т. 45. № 3. С. 464-472.

20.Ogorodova L.M., Freidin M.B., Sazonov A.E., Fedorova O.S., Gerbek I.E., Cher-evko N.A., Lebedeva E.Yu. A pilot screening of prevalence of atopic states and op-isthorchosis and their relationship in people of Tomsk Oblast // Parasitology Research. 2007. V. 101(4). P. 1165-1168.

21.Puzyrev V.P., Makeeva O.A., Freidin M.B. Syntropy, genetic testing, and personalized medicine // Personalized Medicine. 2010. 7(4). P. 399-405.

22.Moffatt M.F., Gut I.G., Demenias F., Strakan D.P., Bouzigin E., Heath S., von Mu-tius E., Farrall M., Lathrop M., Cookson W.O.C.M., GABRIEL Consortium. (Collaborators (164): …Watson W.T., Freidin M.B., Bragina E.Iu….). A large-scale consortium-based genomewide association study of asthma // New England Journal of Medicine. 2010. V. 363. P. 1211-1221.

23.Куликов Е.С., Огородова Л.М., Фрейдин М.Б., Деев И.А., Рудко А.А., Селиванова П.А. Фармакогенетика неконтролируемой бронхиальной астмы // Российский аллергологический журнал. 2012. № 6. С. 6-14.

24.Фрейдин М.Б., Брагина Е.Ю., Салтыкова И.В., Деева Е.В., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Влияние дополнительной болезни (коморбидности) на ассоциацию аллергического ринита с вариантом rs12621643 гена KCNE4 // Генетика. 2013. Т. 49. № 4. 541-544.

25.Melen E., Granell R., Kogevinas M., … Daley D., Freidin M.B., Deev I.A. … et al. Genome-wide association study of body mass index in 23,000 individuals with and without asthma // Clinical and Experimental Allergy. 2012. V. 43. P. 463-474.

26.Freidin M.B., Polonikov A.V. Validation of the PPP1R12B as a candidate gene for childhood asthma in Russians // Journal of Genetics. 2013. V. 92. P. 93-96.

27.Куликов Е.С., Огородова Л.М., Фрейдин М.Б., Деев И.А., Селиванова П.А., Федосенко С.В., Кириллова Н.А. Молекулярные механизмы тяжелой бронхиальной астмы // Молекулярная медицина. 2013. №2. С. 24-32.

28.Куликов Е.С., Огородова Л.М., Фрейдин М.Б., Деев И.А., Селиванова П.А., Федосенко С.В., Кириллова Н.А. Молекулярные и фармакогенетические механизмы тяжелой бронхиальной астмы // Вестник РАМН. 2013. № 3. С. 15-23.

Тезисы

29.Огородова Л.М., Пузырев В.П., Фрейдин М.Б., Рудко А.А., Брагина Е.Ю., Черевко Н.А., Сазонов А.Э., Петрова И.В., Васильева М.В., Федорова О.С., Салтыкова И.В., Симакина А.Р., Кремер Е.Э., Спицко Ж.А., Мальцева О.А. Разработка алгоритма оценки риска аллергических заболеваний в регионах, эндемичных по гельминтой инвазии // Сб. тезисов по результатам выполнения мероприятий за 2008 год в рамках приоритетного направления "Живые системы" ФЦП "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы". Москва. 2008. С. 48-49.

30.Ozhegova D., Freidin M., Puzyrev V. Using the bioinformatic tools to choose the sNPs with highly possible phenotypic effect / European Human Genetics Conference 2008. May 31 – June 3, Barcelona, Spain // European Journal of Human Genetics. 2008. V. 16. Suppl. 2. P. 397.

31.Брагина Е.Ю., Рудко А.А., Фрейдин М.Б., Салтыкова И.В., Ан А.Р., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Взаимоотношение аллергических и инфекционных заболеваний на генетическом уровне // Сборник материалов VI международной конференции «Молекулярная медицина и биобезопасность» (г. Москва, 10-11 ноября 2009 г.). С. 47-48.

32.Пузырев В.П., Фрейдин М.Б. Бронхиальная астма: модельный объект генетических исследований многофакториальных заболеваний человека. Материалы VI съезда Российского общества медицинских генетиков (г. Ростов-на-Дону, 14-18 мая 2010 г.). С. 148.

33.Салтыкова И.В., Брагина Е.Ю., Фрейдин М.Б., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Роль генно-средовых взаимодействий в развитии бронхиальной астмы: описторхоз – SOCS5-IFNG / Материалы VI съезда Российского общества медицинских генетиков (г. Ростов-на-Дону, 14-18 мая 2010 г.). С. 158.

34.Фрейдин М.Б., Полоников А.В. Оценка ассоциации детской бронхиальной астмы с позиционными генами-кандидатами YWHAB и PPP1R12B / Вопросы сохранения и развития здоровья населения Севера и Сибири: материалы научно-практической конференции. Вып.11. // Под ред. В.Т. Манчука, С.В. Смирновой. Красноярск, 2012. С. 109.

35.Freidin M.B., Polonikov A.V. Validation of the PPP1R12B as a candidate gene for childhood asthma susceptibility (Электронный ресурс). Annual Meeting of American Society of Human Genetics, 6-10 November 2012, San Francisco, USA. Режим доступа: http://abstracts.ashg.org/cgi-bin/2012/ashg12s?author=Freidin& sort=ptimes& sbutton=Detail&absno=120120020&sid=182060.

36.Saltikova I.V., Bragina E.Y., Ogorodova L.M., Puzyrev V.P., Freidin M.B. Immune-response modifying gene polymorphisms and susceptibility to asthma and Opisthorchis felineus helminth invasion / European Human Genetics Conference 2012. Nürnberg, Germany, June 23-26, 2012 // European Journal of Human Genetics. 2012. V. 20. Suppl. 1. P. 222.

37.Freidin M.B., Saltikova I.V., Bragina E.Yu., Ogorodova L.M., Puzyrev V.P. Opist-horchis felineus liver fluke modifies genetic risk of bronchial asthma and serum IgE levels / European Human Genetics Conference 2012. Nürnberg, Germany, June 23-26, 2012 // European Journal of Human Genetics. 2012. V. 20. Suppl. 1. P. 231.

38.M.B. Freidin, A.V. Polonikov. Validation of the PPP1R12B as a candidate gene for childhood asthma susceptibility / The 8th International Conference on Bioinformat-ics of Genome Regulation and StructureSystems Biology. Novosibirsk, Russia, June 25-29. 2012. P.98.

39.Saltykova I., Freidin M., Bragina E., Ogorodova L., Puzyrev V. Opisthorchis feli-neus as environment factor modifying genetic risk of asthma / 22nd Annual Congress. Vienna, Austria, 1-5 September 2012 // European Respiratory Journal. 2012. Abstracts. P. 66s.

40.Брагина Е.Ю., Конева Л.А., Тийс Е.С., Фрейдин М.Б., Иванисенко В.А., Пузырев В.П. Общие генетические факторы патогенеза дистропных иммунозависимых болезней / Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине. III международная научно-практическая конференция, 22-24 ноября 2012. г. Казань. Сборник тезисов. С. 277-278.

41.Конева Л.А., Брагина Е.Ю., Тийс Е.С., Фрейдин М.Б., Иванисенко В.А., Пузырев В.П. Использование ассоциативных сетей для анализа отношений сочетаемости многофакторных заболеваний человека / Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине. III международная научно-практическая конференция, 22-24 ноября 2012. г. Казань. Сборник тезисов. С. 183-184.