Научная тема: «МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ ГОЛЬЦОВ РОДА SALVELINUS: ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ И ФИЛОГЕОГРАФИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ»
Специальность: 03.02.07
Год: 2013
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. Митохондриальная ДНК является эффективным молекулярным маркером для реконструкции филогенетических отношений между видами и филогенетическими группами, анализа микроэволюционных процессов (дивергенция, дифференциация, историческая демография популяций) на внутривидовом уровне, при условии использования репрезентативного комплекса признаков для описания структуры анализируемого биоразнообразия лососевых рыб семейства Salmonidae.
  2. Гольцы рода Salvelinus представляют монофилетическую группу лососевых рыб. Спецификой рода Salvelinus является существование двух групп таксонов, с филогенетическими проблемами разной степени сложности. Поэтому общую топологию дендрограмм рода Salvelinus следует охарактеризовать как сложную, с длинными внешними и короткими внутренними ветвями, неустойчивую к эффекту притяжения длинных ветвей при филогенетических реконструкциях.
  3. Процессы видообразования гольцов рода Salvelinus преимущественно определялись глобальными климатическими и географическими изменениями в позднем кайнозое. В филогенезе рода прошло четыре цикла дивергенции. Первый этап филогенеза связан с последовательной дивергенцией базальных ветвей (S. fontinalis, S. namaycush, S. levanidovi и S. leucomaenis). Позже произошло обособление линии S. curilus (S. m. krascheninnikovi) и последующее разделение общего предка рода на два митохондриальных филума, дивергенция которых привела к образованию четырех монофилетических групп: арктической, западной тихоокеанской, берингийской и группы S. alpinus. На последнем этапе проходила диверсификация внутри филогенетических групп.
  4. Дисперсалистская модель расселения из аллопатрических рефугиумов объясняет внутривидовую дифференциацию у двух таксонов гольцов (S. m. malma и S. m. krascheninnikovi), исторические ареалы которых располагались на территориях, испытавших ледниковое воздействие и не подвергавшихся оледенению в позднем кайнозое. Особенности популяционной дифференциации S. m. malma обусловлены событиями, сопровождавшими смену периодов оледенений и межледниковья в плейстоцене. В то же время, самостоятельная дивергенция S. m. krascheninnikovi связана с циклическими процессами геологического формирования бассейна Японского моря и прилегающих территорий.
  5. В пределах географического региона северо-восточной Азии для гольцов рода Salvelinus обосновано существование двух эволюционных моделей формирования исследованных бимодальных зон симпатрии, опирающихся на гипотезу аллопатрического видообразования. Присутствие симпатрических популяций связано с вторичным контактом предков значительно дивергировавших филетических линий и множественными вселениями представителей близкородственных филетических линий, дивергировавших в разных рефугиумах.
  6. Cовременная систематика рода Salvelinus, объединяющая в рамках полнокомплексного вида Salvelinus alpinus - Salvelinus malma complex большую часть таксонов гольцов, вероятно, не полностью отражает филогенетические взаимоотношения, поскольку основана на гомопластичных морфологических и экологических признаках. Альтернативой объединения в полнокомплексный вид является переосмысление содержания таксонов и разделения их на несколько видов, соответствующих монофилетическим группам.
Список опубликованных работ
Статьи в журналах, рекомендованных ВАК:

1.Олейник А.Г., Полякова Н.Е. Генетическая дифференциация и филогения лососевых рыб сем. Salmonidae // Генетика. 1992. Т. 28, № 9. С. 141–149.

2.Скурихина Л.А., Олейник А.Г., Невшупов С.В., Брыков Вл.А. Филогения дальневосточных лососевых рыб по данным рестриктазного анализа ядерной ДНК // Генетика. 1993. Т. 29, № 9. С. 1508–1518.

3.Олейник А.Г. Филогения лососевых рыб сем. Salmonidae по данным рестриктазного анализа митохондриальной ДНК // Генетика. 1994. Т. 30, № 11. C. 1458–1465.

4.Олейник А.Г., Полякова Н.Е. Рестриктазный анализ митохондриального генома лососевых рыб сем. Salmonidae // Генетика. 1994. Т. 30, № 9. С. 120–21214.

5.Олейник А.Г. Молекулярная филогения лососевых рыб: соответствие результатов анализа ядерной и митохондриальной ДНК // Генетика. 1997. Т. 33, № 2. С. 229–234.

6.Олейник А.Г., Скурихина Л.А. Родственные взаимоотношения проходных гольцов рода Salvelinus (Salmonidae, Salmoniformes) по данным рестриктазного анализа ядерной ДНК // Генетика. 1999. Т. 35, № 9. С.1258–1268.

7.Олейник А.Г., Скурихина Л.А. О родственных взаимоотношениях проходных гольцов рода Salvelinus по данным рестриктазного анализа ядерной ДНК // Доклады Академии Наук. 1999. Т. 364, № 5. С. 711–713.

8.Олейник А.Г. О темпах эволюции митохондриального и ядерного геномов лососевых лососевых рыб сем. Salmonidae // Биология моря. 2000. Т. 26, № 6. С. 410– 416.

9.Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Брыков Вл.А., Фролов С.В., Черешнев И.А. Дивергенция митохондриальной ДНК двух подвидов мальмы Salvelinus malma (Salmonidae: Pisces) // Доклады РАН. 2001. Т. 367, № 6. С. 844–846.

10. Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Брыков Вл.А. Дивергенция мальмы Salvelinus malma в азиатской части Северной Пацифики по данным PCR-RFLP анализа митохондриальной ДНК // Генетика. 2002. Т. 38, № 10. С. 1393–1401.

11. Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Брыков Вл.А. Генетическая дифференциация трех симпатричных видов гольцов рода Salvelinus по данным PCR-RFLP анализа митохондриальной ДНК // Генетика. 2003. Т. 39, № 8. С. 1099–1105.

12. Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Брыков Вл.А. Дифференциация мальмы Salvelinus malma и гольца Таранца Salvelinus taranetzi по данным PCR-RFLP анализа митохондриальной ДНК // Генетика. 2004. Т. 40, № 3. С. 386–392.

13. Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Брыков Вл.А., Крэйн П.А., Венбург Дж.К. Дифференциация мальмы Salvelinus malma Азии и Северной Америки по данным PCR-RFLP анализа митохондриальной ДНК // Генетика. 2005. Т. 41, №5. С. 626–634.

14.Олейник А.Г., Скурихина Л.А. Генетическая дивергенция симпатричных гольцов рода Salvelinus из озера Начикинское (Камчатка) // Генетика. 2007. Т. 43, № 8. С. 1097–1106.

15.Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Чукова Е.И. Влияние изоляции на генетические характеристики популяций гольцов рода Salvelinus // Генетика. 2007. Т. 43, № 9. С. 1209–1217.

16.Олейник А.Г., Скурихина Л.А. Филогенетические связи сахалинского тайменя Parahucho perryi по данным PCR-RFLP анализа митохондриальной ДНК // Генетика. 2008. Т. 44, № 7. С. 885–895.

17.Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Чукова Е.И. Филогеография южной азиатской мальмы Salvelinus malma krascheninnikovi: генеалогический анализ митохондриальной ДНК // Генетика. 2010. Т. 46, № 2. С. 226–238.

18.Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Брыков Вл.А. Генетическая дивергенция митохондриальной ДНК белого гольца Salvelinus albus и северной мальмы Salvelinus malma malma // Генетика. 2010. Т. 46, № 3. С. 389–400.

19.Брыков Вл.А., Олейник А.Г., Полякова Н.Е., Скурихина Л.А., Семина А.В., Подлесных А.В., Кухлевский А.Д. Неравномерность дивергентной эволюции у рыб Северной Пацифики // Генетика. 2010. Т. 46, № 7. С. 967–973.

20.Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Брыков Вл.А. Популяционно-генетическая структура северной мальмы Salvelinus malma malma Азии и Северной Америки // Генетика. 2011. Т. 47, № 12. С. 1642–1654.

21.Oleinik A.G., Skurikhina L.A., Frolov S.V., Brykov V.A., Chereshnev I.A. Differences between two subspecies of Dolly Varden, Salvelinus malma, revealed by RFLP-PCR analysis of mitochondrial DNA // Environmental Biology of Fishes. 2004. V. 69, № 1–4. P. 449–459.

22.Oleinik A.G., Skurikhina L.A., Brykov V.A. Divergence of the Salvelinus species mitochondrial DNA from northeastern Asia // Ecology of Freshwater Fish. 2007. V. 16, № 1. P. 87–98.

23.Oleinik A.G., Skurikhina L.A. Mitochondrial DNA diversity and relationships of endemic charrs of the genus Salvelinus from lake Kronotskoye (Kamchatka Penisula) // Hydrobiologia. 2010. V. 650, № 1. P. 145–159.

24.Gordeeva N.V., Chukova E.I., Oleinik A.G. Microsatellite genetic variation of Asian populations of Dolly Varden charr // Hydrobiologia. 2010. V. 650, № 1. P. 133–144.

Статьи, опубликованные в других изданиях:

25. Oleinik A.G. Salmonid’s molecular phylogeny: data congruence from nuclear and mitochondrial DNA // Bridges of Science Between North America and the Russian Far East: Proceedings of the 45th Arctic Science Conference: 25–27 August, 1994, Anchorage, Alaska, 29 August – 2 September, 1994, Vladivostok, Russia / Eds. R.H. Meehan, V. Sergienko, G. Weller. Vladivostok: Far East Branch, Russian Academy of Sciences, 1994. P. 112–116.

Работы, опубликованные в материалах всесоюзных, всероссийских и международных конференций:

26.Oleinik A.G. Molecular systematics of fish of the family Salmonidae // Bridges of sciences between North America and Russian Far East: Proceedings of the 45th Arctic Science Conference. Vladivostok: Dalnauka, 1994. P. 129.

27.Олейник А.Г. Количественный анализ влияния начальных условий описания таксонов на результаты филогенетических реконструкций в сем. Salmonidae // Систематика, биология и биотехника разведения лососевых рыб: Тезисы Всесоюзного совещания по лососевидным. СПб., 1994. С.144–146.

28.Олейник А.Г. Направление и темпы молекулярной эволюции лососевых рыб // Первый конгресс ихтиологов России: тезисы докладов, Астрахань, сентябрь 1997 г. М.: ВНИРО, 1997. С. 22.

29.Oleinik A.G., Skurikhina L.A. Phylogenetic relationships among anadromous chars of the genus Salvelinus based on restriction endonuclease analysis of nuclear DNA // Biology and Evolution of Chars of the Northern Hemisphere: Abstracts of the ISACF Workshop. Kamchatka, Russia, September 2–10, 1998. Vladivostok: Dalnauka, 1998. P. 27.

30. Oleinik A.G., Skurikhina L.A., Brykov Vl.A., Crane P.A., Wenburg J.K. Phylogeography of the Dolly Varden char Salvelinus malma of Asia and North America // Bridges of science between North America and the Russian Far East: Past, present and future: Proceedings of an International Scientific Conference on the Arctic and North Pacific. Vladivostok, Russia, September 14–16, 2004. Vladivostok: Dalnauka, 2004. P. 92.

31.Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Брыков В.А. Молекулярная эволюция гольцов рода Salvelinus по данным PCR-RFLP анализа митохондриальной ДНК // Современные проблемы биологической эволюции: Материалы конференции к 100-летию Государственного Дарвиновского музея. Москва, 17–20 сентября 2007 г. М.: Изд-во ГДМ, 2007. С. 146–148.

32.Oleinik A.G., Skurikhina L.A., Brykov Vl.A. Dolly Varden charr: phylogeography, genetic differentiation and origin, based on PCR-RFLP analysis of mitochondrial DNA // Proceedings of the International Scientific Conference “Computational Phylogenetics and Molecular Systematics, CPMS´ 2007”. Moscow, Russia, November 16–19, 2007. M.: KMK Scientific Press, 2007. P. 226–228.

33. Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Брыков В.А. Проблемы генетического разнообразия и эволюции гольцов рода Salvelinus // Международная конференция «Генетика, селекция, гибридизация, племенное дело и воспроизводство рыб». С- Петербург, 10–12 сентября 2008 г.: Тезисы докладов. Спб.: Изд-во ГосНИОРХ, 2008. С. 19–20.

34.Олейник А.Г., Чукова Е.И., Скурихина Л.А., Гордеева Н.В. Эффект случайного дрейфа генов в изолированных природных популяциях гольцов рода Salvelinus // Международная конференция «Генетика, селекция, гибридизация, племенное дело и воспроизводство рыб». С-Петербург, 10–12 сентября 2008 г.: Тезисы докладов. Спб.: Изд-во ГосНИОРХ, 2008. С. 20–22.

35.Oleinik A.G., Skurikhina L.A. Mitochondrial DNA diversity and relationships of endemic charrs of the genus Salvelinus from lake Kronotskoye (Kamchatka Penisula) // 6th International Charr Symposium, June 15-18, 2009, Stirling, Scotland: Abstracts of Poster Presentations. Stirling, Scotland, 2009. P. 22.

36.Chukova E.I., Gordeeva N.V., Oleinik A.G. Microsatellite genetic variation of Asian populations of Dolly Varden charr // 6th International Charr Symposium, June 15–18, 2009, Stirling, Scotland: Abstracts of Poster Presentations. Stirling, Scotland, 2009. P. 4.

37.Олейник А.Г., Скурихина Л.А., Брыков В.А. Филогенетические отношения и эволюция митохондриальной ДНК гольцов рода Salvelinus // V съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (Москва, 21–28 июня 2009 г.): Тезисы докладов. М., 2009. Ч. 2. C. 296.

38.Чукова Е.И., Олейник А.Г., Скурихина Л.А. Действие случайного дрейфа генов в изолированных популяциях гольцов рода Salvelinus // V съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (Москва, 21–28 июня 2009 г.): Тезисы докладов. М., 2009. Ч. 2. С. 196.

39. Oleinik A.G., Skurikhina L.A., Brykov Vl.A. Genetic differentiation and phylogeography of northern Dolly Varden, Salvelinus malma malma (Salmonidae), from northeastern Asia and northwestern North America // Proceedings of the International Scientific Conference “Problem of Population and General Genetics”. Moscow, November 14–16, 2011. M.: “Cifrovichok LTD”, 2011. P. 80.

40. Oleinik A.G., Skurikhina L.A., Bondar E.I., Crane P.A., Brykov Vl.A. Phylogeography of northern Dolly Varden Salvelinus malma malma from northeastern Asia and northwestern North America // 7th International Charr Symposium, September 3–6, 2012, Yuzhno-Sakhalinsk, Russia: Program and Abstracts of Presentations. Yuzhno-Sakhalinsk, Russia, 2012. P. 15.

41.Yamamoto S., Maekawa K., Morita K., Crane P., Oleinik A. Population genetic structure and phylogeography of a salmonid fish, Dolly Varden Salvelinus malma: multiple glacial refugia in the North Pacific rim // 7th International Charr Symposium, September 3– 6, 2012, Yuzhno-Sakhalinsk, Russia: Program and Abstracts of Presentations. Yuzhno-Sakhalinsk, Russia, 2012. P. 16.

42.Bondar E.I., Oleinik A.G., Skurikhina L.A. Changes of genetic variability due to genetic drift in populations of charrs genus Salvelinus // 7th International Charr Symposium, September 3–6, 2012, Yuzhno-Sakhalinsk, Russia: Program and Abstracts of Presentations. Yuzhno-Sakhalinsk, Russia, 2012. P. 51.