- Найдены различные варианты биохимического полиморфизма белков че ловека: а - обусловленные единичными аминокислотными заменами (single ami-no acid substitution, SAAS), включая новый вариант триозофосфат изомеразы 1 (SAAS 233Gh>D), и разрешены в одну из сторон «конфликтные» определения первичной аминокислотной последовательности по 135 позициям 59 белков человека, б - в гладкомышечных тканях и органах, содержащих значительное ко личество гладкомышечных клеток, показана множественность и органоспеци-фичность спектра изоформ трансгелина.
- Сформированы двуязычная база данных «Протеомика мышечных орга нов», содержащая 7 модулей и информацию по 510 идентифицированным бел кам и новая, расширенная версия (2012 г.) отечественного информационного ресурса - база данных «Протеомика рака простаты», включающая 9 модулей (570 идентифицированных белков), в том числе комплексный модуль «Белки клеток DU-145», обобщающий результаты протеомного анализа суммарных бел ков этих клеток, а также отдельных белковых препаратов (ядерные белки, гисто-ны, фосфопротеины).
- Выявлено и охарактеризовано несколько безымянных и других малоизу ченных белков человека.
- На основе количественной денситометрии из потенциальных белковых онкомаркеров для рака простаты отобрана панель наиболее перспективных бел ков для дальнейшего использования.
- Определены видоспецифичные белковые биомаркеры мышечных тканей, а также белки различных немышечных пищевых добавок, позволяющие харак теризовать качество мясной продукции, включая выявление нарушений норма тивов ГОСТ и ТУ.
Шишкин С.С. Ковалев Л.И., Крахмалева И.Н., Ковалева М.А. Полиморфизм мышеч ных белков человека. Изд-во РУДН. 2011. 572с.
Shishkin S.S., Kovalev L.I., Krakhmaleva I.N., Kovaleva M.A., Eremina L.S., Popov V.O. Biomedical aspects in investigations of biochemical polymorphism of actins and some actin-binding proteins. // In: «Molecular Polymorphism of Man: Structural and Functional Individual Multiformity of Biomacromolecules». Editors: Sergei D. Varfolomyev and Gennady E. Zaikov. Nova Publisher Hauppauge, NY, 11788-3619 USA. 2011. P.237-280.
Статьи в рецензируемых журналах, рекомендованных ВАК РФ:
Ковалев Л.И., Северин С.С, Ершова Е.С., Лукашова М.В., Ковалева М.А., Шишкин С.С. Двумерный электрофоретический анализ белков миокарда при некоторых формах сердечно-сосудистой патологии человека.// Вопр. мед. химии. 1998. т.44 .№1. С.106-110.
Малашенко А.М., Бескова Т.Б., Ковалева М.А., Ковалев Л.И. Выявление различий в составе белков печени у мышей рекомбинантных линий, отличающихся по чувствитель ности к воздействию тиоТЭФ. // Генетика. 2000. т.36. № 4. С.533-537.
Шишкин С.С, Ковалев Л.И., Ковалева М.А. Протеомные исследования мышечных белков человека и некоторых других позвоночных. // Биохимия. 2004. т.69. №11. С. 1574-1591.
Ковалев Л.И., Шишкин С.С, Хасигов П.З., Дзеранов Н.К, Казаченко А.В., Ковалева М.А., Торопыгин И.Ю., Мамыкина СВ. Идентификация белка AGR2 - нового потенци ального маркера рака с использованием протеомных технологий. // Прикладная биохимия и микробиология, 2006, т.42, № 4, с.480-484.
Ковалев Л.И., Ковалева М.А., Ковалев П.Л., Серебрякова М.В., Мошковский С.А., Шишкин С.С. Полиморфизм АЗ,5-А2,4-диеноил-коэнзим А изомеразы (белкового продук та гена ЕСН1) в поперечно-полосатой мышечной ткани человека. // Биохимия. 2006. Т.71, № 4, С.554-560
Ковалев Л.И., Шишкин С.С, Хасигов П.З., Дзеранов Н.К, Казаченко А.В., Ковалева М.А., Торопыгин И.Ю., Еремина Л.С, Грачев СВ. Новые подходы к молекулярной диаг ностике рака простаты. // Урология. 2006. № 5. С.16-19
Ковалев Л.И. Ковалева М.А., Буракова М.В., Еремина Л.С, Шишкин С.С, Шигеев СВ., Серебрякова М.В., Захарова М.Н., Завалишин И.А. Исследование патогенеза мед ленных нейроинфекций протеомными технологиями. // Нейрохимия, 2007, т.24, №3, С.248-256.
Еремина Л.С, Ковалев ЛИ, Шишкин С.С, Торопыгин И.Ю., Буракова М.И., Кова лева М.А., Макаров А.А., Дзеранов Н.К., Казаченко А.В., Тотров К.И., Кононков И.В., Лоран О.Б. Биохимический полиморфизм трансгелинов в предстательной железе челове ка при гиперплазии и раке. // Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии, 2007, № 3, С.50 - 53.
Еремина Л.С., Ковалев Л.И., Ковалева М.А., Макаров А.А., Шишкин С.С., Буракова М.И., Чернов Н.Н., Торопыгин И.Ю., Кононков И.В. Cравнительное изучение белка AGR2 в некоторых культивируемых клетках и образцах тканей простаты. // Вестн. РУДН. Серия «Медицина». 2007. №6. С. 257-261
Ковалева М.А., Ковалев Л.И., Серебрякова М.В., Мошковский С.А., Шишкин С.С. Возрастные изменения альбумина и актина миокарда человека. // Биомедицинская хи-мия.2007. 53.6.644 – 653
Ковалева М.А., Ковалев Л.И., Еремина Л.С., Макаров А.А., Буракова М.В.,Торопыгин И.Ю., Серебрякова М.В., Шишкин С.С., Арчаков А.И. Определение «аминокислотных конфликтов» и аминокислотных замен в первичных структурах 41 белка человека проте-омными технологиями. // Биомедицинская химия. 2008. Т.54. №4. с.420-434
Макаров А.А., Ковалев Л.И., Ковалева М.А., Торопыгин И.Ю., Шишкин С.С. Изуче ние изменений белкового профиля в дифференцирующихся миобластах человека. // Он тогенез. 2009. т.39. №2. С.112-119.
Шишкин С.С., Дзеранов Н.К., Тотров К.И., Казаченко А.В., Ковалев Л.И., Еремина Л.С., Ковалева М.А., Торопыгин И.Ю. Клинико-биохимическое исследование диагности ческой значимости панели из 10 потенциальных белковых маркеров рака простаты. // Урология, 2009. №1. С.56-58.
Ковалева М.А., Ковалев Л.И., Торопыгин И.Ю., Шигеев С.В., Иванов А.В., Шишкин С.С. Протеомный анализ белков скелетной мышцы (m.vastus lateralis) человека, иденти фикация 89 белковых продуктов генной экспрессии. // Биохимия, 2009, т.74, №11, С.1524-1538.
Шишкин С.С., Ковалев Л.И., Ковалева М.А., Крахмалева И.Н., Лисицкая К.В., Ереми на Л.С., Иванов А.В., Герасимов Е.В., Садыхов Е.Г., Уласова Н.Ю., Соколова О.С., Торо-пыгин И.Ю., Попов В.О. База данных «Протеомика рака простаты». // Acta naturae, 2010, т.2, №4, С.104-114.
Shishkin S., Kovaleva M., Ivanov A., Eryomina L., Lisitskaya K., Toropugin I., Kovalev L., Okhritz V., Loran O. Comparative proteomic study of proteins in prostate cancer and benign hyperplasia cells. // J. Cancer Sci. Ther. 2011. S1. http://dx.doi.org/10.4172/1948-5956.S1-003 (P.1-8)
Ковалев Л.И., Макаров А.А., Черкашин Е.А., Дулиньска Й., Ковалева М.А.,Лисицкая К.В., Иванов А.И., Торопыгин И.Ю., Серебрякова М.В., Лайдлер П, Шишкин С.С. Новый аллельный вариант триозофосфатизомеразы выявленный в культивируемых клетках рака простаты человека. // Молек. генет., микроб., вирусол. 2011, №1, С.14-19.
Охриц В.Е., Лоран О.Б., Велиев Е.И., Лисицкая К.В., Еремина Л.С., Ковалева М.А., Ковалев Л.И., Шишкин С.С., Обейд А.Х. Изучение белков DJ-1, хроматогранина А и Bcl-2 у больных с раком простаты и доброкачественной гиперплазией предстательной желе зы. //Медицинский вестник Башкортостана. 2011. 6. 2. 271-274.
Лисицкая К.В., Еремина Л.С., Иванов А.В., Ковалева М.А., Охриц В.Е., Торопыгин И.Ю., Ковалев Л.И., Шишкин С.С. Изучение белка DJ-1 при раке простаты в образцах тканей, в культивируемых клетках и в сыворотке крови больных. // Биомедицинская хи мия 2011, т. 57, вып. 4. С.392-401.
Ковалева М.А., Иванов А.В., Ковалев Л.И., Шишкин С.С., Хряпова Е.В., Лисицын А.Б., Чернуха И.М., Вострикова Н.Л. Протеомные технологии в исследованиях белкового состава образцов вареных колбасных изделий // Всё о мясе. 2012. №2, С.48-52.
Статьи в тематических сборниках и материалах научных конференций:
Ковалев Л.И., Ковалева М.А., Макаров А.А., Шишкин С.С., Тихонова О.В., Мошков-ский С.А., Серебрякова М.В. Протеомные технологии в исследованиях проблемы гипер трофии мышечных клеток (возможности тестирования молекулярных эффектов при ис пользовании медико-биологических технологий повышения работоспособности). «Медико-биологические технологии повышения работоспособности в условиях напряженных физических нагрузок». ЗАО «Фон». Москва.2004. С. 160-168
Шенкман Б.С. Нетреба А.И. Литвинова К.С. Таракин П.П. Вихлянцев И.М. Подлубная З.А. Немировская Т.Л. Ковалева М.А., Стеханова Т.Н. Попов В.О. Виноградова О.Л. Креатин как метаболический модулятор сократительной функции мышц человека в усло виях силовой тренировки. Медико-биологические технологии повышения работоспособ ности в условиях напряженных физических нагрузок». ЗАО «Фон». М.,.2004, с.102-116.
Шишкин С.С., Макаров А.А., Ахунов В.С., Ковалев Л.И, Ковалева М.А., Князев А.И., Воронина А.С., Лисицкая К.В., Еремина Л.С. Создание и использование лабораторного регламента для определения биологической активности рекомбинантных ростовых фак торов и некоторых других биологически активных веществ. «Медико-биологические тех нологии повышения работоспособности в условиях напряженных физических нагрузок». ООО «Анита Пресс». Москва. 2006. С. 8 - 22.
Ковалев Л.И., Ковалева М.А., Торопыгин И.Ю., Шигеев СВ., Шишкин С.С. Полимор физм Р- енолазы (белкового продукта гена EN03) в скелетной мышечной ткани человека и некоторые проблемы мышечной работоспособности. «Медико-биологические техноло гии повышения работоспособности в условиях напряженных физических нагрузок». ООО «Анита Пресс». Москва. 2006. С.52-62.
Патент:
Ковалев Л.И., Шишкин С.С, Еремина Л.С., Ковалева М.А., Дзеранов Н.К., Казаченко А.В., Тотров К.И. Маркер рака предстательной железы. Патент № 2360924 Зарегистриро ван в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 10 июля 2009г. Опубликован: 10.07.2009, Бюл., №19. С. 1-7.
Информационно-методические письма:
Шишкин С.С, Ковалев ЛИ, Ковалева М.А., Крахмалева И.Н, Еремина Л.С., Лисиц-кая К.В., Дзеранов НК, Ощепков В.Н, Кешишев НГ, Тотров К.И. Рак простаты и современ ные протеомно-биотехнологические подходы к его молекулярной диагностике. (Инфор мационно-методическое письмо). // М. Изд-во ООО «Оригинальная компания» (www.pechatay.ru) 2009. 1-36.
Шишкин С.С, Ковалев ЛИ.. Ковалева М.А., Крахмалева И.Н., Еремина Л.С., Мака ров А.А., Лисицкая К.В., Лоран О.Б. Велиев Е.И., Охриц В.Е. Проблемы ранней диагно стики рака простаты и возможности применения новых потенциальных биомаркеров. (Информационно-методическое письмо). М. Изд-во ООО «Оригинальная компания» (www.pechatay.ru) 2009. 1-45.
Шишкин С.С, Ковалев Л.И., Ковалева М.А., Крахмалева И.Н., Еремина Л.С, Лисицкая К.В., Иванов А.В., Лоран О.Б., Велиев Е.И., Охриц В.Е. Протеомные и другие постге номные технологии в онкоурологии. // М. Изд-во ООО «Оригинальная компания» (www.pechatay.ru). 2012. С. 1-38.