- Впервые в отечественной практике проведено комплексное популяционно-гентическое исследование по установлению особенностей распределения аллельных вариантов, определяющих устойчивость человека к ВИЧ-инфекции, динамику прогрессирования ВИЧ-инфекции в СПИД и возможность контроля вирусной нагрузки при ВИЧ-инфекции; обобщены популяционно-генетические данные по всемирному распространению делеционного полиморфизма CCR5delta32.
- Предложен и реализован подход к исследованию механизмов генетического контроля восстановления и адаптации организма в условиях хронического низкодозного радиационного воздействия. В результате анализа частот аллелей генов системы HLA класса II установлена ассоциация групповой специфичности HLA-DRB1*11 и подтверждена ассоциация SNP-маркера rs1799782 гена XRCC1 с формированием фенотипа, характеризующегося повышенной предрасположенностью к развитию онкопатологий. Установлены достоверные отличия в распределении аллельных вариантов генов ATM (rs1801516, rs664677) и OGG1 в группах лиц, подвергшихся хроническому низкодозному радиационному воздействию по сравнению с группами клинического и популяционного контроля.
- Разработан генодиагностический подход к оценке противоинфекционного иммунитета у реципиентов почечного трансплантата, основанный на мониторинге показателей вирусной нагрузки.
- Установлены частоты аллелей HLA-B*5701 и HLA-DRB*01, ассоциированных с развитием острых осложнений у ВИЧ-инфицированных лиц, принимающих препараты Абакавир и Невирапин. SNP rs2395029 может быть использован в качестве диагностического маркера для детекции аллеля HLA-B*5701 в русской популяции.
- Метод ПЦР в реальном времени эффективен при отборе антисмысловых препаратов, обладающих наибольшей противовирусной активностью в отношении вируса гепатита С.
2.Кофиади И.А., Ребриков Д.В. Методы детекции однонуклеотидных полиморфизмов: аллель-специфичная ПЦР и гибридизация с олигонуклеотидной пробой. Генетика, 2006, Т.42, № 1, С.22-32.
3.Кофиади И.А., Ребриков Д.В., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П., Хаитов Р.М. Распределение аллелей генов CCR5, CCR2 и SDF1 ассоциированных с устойчивостью к ВИЧ-инфекции в российских популяциях. Доклады Академии Наук, 2007, Т. 415, № 6, С. 842-845.
4.Кофиади И.А., Ребриков Д.В., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П., Хаитов Р.М. Распределение ВИЧ-протективных аллелей генов CCR5, CCR2 и SDF1 в российских популяциях. Иммунология, 2007, № 1, С. 10-13.
5.Черноусов А.Д., Петрова Т.В., Пичугина Л.В., Литвина М.М., Донецкова А.Д., Кофиади И.А., Ребриков Д.В., Апарин П.Г. Посттерапевтическая клеточная латентность ВИЧ у пациента с исходной развернутой картиной СПИДа. Иммунология, 2007, № 6, С. 327-331.
6.Деев А.Д., Панченко Е.П., Комаров А.Л., Стамбольский Д.В., Сироткина О.В., Кофиади И.А., Ребриков Д.В., Шахматова О.О. Факторы риска тромботических осложнений и прогноз у больных с хронической формой ишемической болезни сердца. Кардиология, 2009, № 11, С.4-10.
7.Кофиади И.А., Хаитов Р.М., Алексеев Л.П., Сидорович И.Г., Карамов Э.В. Генетический полиморфизм человека и устойчивость к ВИЧ/СПИДу. Популяционный аспект. Иммунология, 2009, № 1, C. 196-200.
8.Кофиади И.А., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П. Частота встречаемости 65 клинически значимых однонуклеотидных полиморфизмов у здоровых представителей русской популяции. Молекулярная медицина, 2011, № 2, С.47-52.
9.Рогатых С.В., Докшукина А.А., Хайнасова Т.С., Мурадов С.В., Кофиади И.А. Использование технологии ПЦР в реальном времени для оценки эффективности методов выделения ДНК из культур ацидофильных хемолитотрофных микроорганизмов. Прикладная биохимия и микробиология, 2011, Т. 47, № 2, С.226-230.
10.Уткин К.В., Кофиади И.А., Алексеев Л.П., Абрамов Д.Д., Батенева Е.И., Хаитов P.M., Веремеева Г.А., Площанская О.Г., Аклеев А.В., Киселев М.Ф. Однонуклеотидные полиморфизмы, как маркеры индивидуальной реакции на хроническое радиационное воздействие. Ядерная и радиационная безопасность, 2011, Т. 62, №4, С. 44-50.
11.Абрамов Д.Д., Кофиади И.А., Уткин К.В., Трофимов Д.Ю., Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. Полиморфизм одиночных нуклеотидов в генах цитокинов и их рецепторов: биологический эффект и методы идентификации. Иммунология, 2011, №5, С. 275-280.
12.Абрамов Д.Д., Кофиади И.А., Хаитов М.Р., Сергеев И.В., Трофимов Д.Ю., Гудима Г.О., Кадочникова В.В., Гончарова Е.В., Рагимов А.А., Алексеев Л.П. Особенности полиморфизма генов, регулирующих различные компоненты иммунного ответа в русской популяции. Российский аллергологический журнал, 2012, №6, С.72-75.
13.Рогатых С.В., Докшукина А.А., Левенец О.О., Мурадов С.В., Кофиади И.А. Оценка качественного и количественного состава сообществ культивируемых ацидофильных микроорганизмов методами ПЦР-РВ и анализа библиотеки клонов. Микробиология, 2013, Т. 82, № 2, с.26-31.
14.Уткин К.В., Кофиади И.А., Батенева Е.И., Аклеев А.В., Орадовская И.В., Рагимов А.А., Викулов Г.Х., Радзивил Т.Т., Пащенкова Ю.Г., Алексеев Л.П. Установление генетических маркеров устойчивости и чувствительности человека к радиационному воздействию. Иммунология, 2013, № 2, С. 74-81.
15.Долбин А.Г., Минина М.Г., Сергеев И.В., Кофиади И.А., Хаитов М.Р., Трофимов Д.Ю., Болдырева М.Н., Алексеев Л.П. Новые возможности поиска HLA-совместимых доноров для реципиентов листа ожидания почечного трансплантата. Физиология и патология иммунной системы, 2009, № 5, С.13-16.
16.Кофиади И.А., Гончарова Е.В., Каабак М.М., Бабенко Н.Н., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П. Разработка нового подхода к мониторингу вирусной инфекции у взрослых реципиентов почечного трансплантата. Физиология и патология иммунной системы, 2009, №9, C. 3-8.
17.Кофиади И.А., Кадочникова В.В., Донников А.Е. Геном человека расшифрован, что дальше? Вестник МЕДСИ, 2009, № 3, С. 33-39.
18.Кофиади И.А., Хаитов Р.М., Алексеев Л.П., Сидорович И.Г., Карамов Э.В. Иммуногеномика человека: чувствительность и устойчивость к ВИЧ/СПИД. Физиология и патология иммунной системы. 2009. Т.13. № 1. С. 3-8.
19.Хаитов Р.М., Кофиади И.А., Алексеев Л.П. Достижения в изучении генов иммунитета – решение проблем иммунобиобезопасности России. Медицина экстремальных ситуаций, 2009, Т.4, № 30, C. 99-108.
20.Ребриков Д.В., Саматов Г.А., Трофимов Д.Ю., Семенов П.А., Савилова А.М., Кофиади И.А., Абрамов Д.Д. ПЦР в реальном времени. 2009. М.: Бином.
21.Абрамов Д.Д., Кофиади И.А., Трофимов Д.Ю., Хаитов Р.М., Алексеев Л.П. Фундаментальные и прикладные аспекты иммуногенетики человека. Сообщение 4. Полиморфизм одиночных нуклеотидов в «не-HLA» генах иммунного ответа: биологический эффект и методы идентификации. Физиология и патология иммунной системы, 2010, Т.14, № 8, С.3-11.
22.Кофиади И.А., Кадочникова В.В., Абрамов Д.Д., Гончарова Е.В., Донников А.Е., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П., Хаитов Р.М. Частота встречаемости 100 клинически значимых однонуклеотидных полиморфизмов у здоровых представителей русской популяции. Физиология и патология иммунной системы, 2011, № 2, С. 3-10.
23.Елов А.А., Федоров Н.А., Жибурт Е.Б., Кофиади И.А., Трофимов Д.Ю. Количественная флуоресцентно-гибридизационная ПЦР на основе отечественной аппаратуры и тест-систем. Здравоохранение и медицинская техника, 2005, № 2, С. 10.
24.Sokolova М., Kofiadi I., Rebrikov D., Borodina Т., Kozlov A., Borinskaya S., Yankovsky N. DNA diagnostics of adult-type hypolactasia in populations of Russia and neighboring countries. Human Genome Meeting. Helsinki. Finland. 2006. Book of abstracts.
25.Кофиади И.А. Частоты связанных с тромбофилией аллелей генов F5, F2 и MTHFR у представителей евразийской этнической группы, проживающих на территории России и Беларуси. Материалы XVIII зимней молодежной научной школы «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии, 2006, С. 14.
26.Кофиади И.А., Морозова С.А., Ребриков Д.В. Частоты аллелей генов CCR5, CCR2 и SDF1, ассоциированных с устойчивостью к ВИЧ-инфекции у россиян. Материалы международной конференции «Генетика в России и в мире». 2006, C.100.
27.Kofiadi I.A., Trofimov D.Y., Gudima G.O., Alexeev L.P. Genetic susceptibility to HIV-infection in 4 populations from Russia. 16 European Congress of Immunology, 2006, Book of abstracts, P. 129.
28.Кофиади И.А., Морозова С.А., Ребриков Д.В. Распределение ВИЧ-протективных аллелей генов CCR5, CCR2 и SDF1 у россиян. Аллергология и иммунология, 2006, Т. 7, № 3, С. 403.
29.Кофиади И.А., Ребриков Д.В., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П., Хаитов Р.М. Анализ распространения ВИЧ-протективных аллелей среди этнических групп, проживающих на территории России и сопредельных государств. Российский аллергологический журнал, 2007, № 3, Пр. 1, С. 10-11.
30.Kofiadi I.A., Trofimov D.Y., Rebrikov D.V. Genetic susceptibility to HIV-1 infection in Russian populations. 21 European Immunogenetics and Histocompatibility Conference. The official journal of the European Federation for Immunogenetics, 2007, P. 430.
31.Черноусов А.Д., Петрова Т.В., Кофиади И.А., Апарин П.Г. Посттерапевтическая клеточная латентность ВИЧ у пациента с исходной развернутой картиной СПИДа. Российский аллергологический журнал, 2007, № 3, Пр.1, С. 10-11.
32.Ребриков Д.В., Кофиади И.А., Алексеев Л.П., Хаитов Р.М. Полиморфизм генов CCR5, CCR2 и SDF1 ассоциированных с устойчивостью к ВИЧ-инфекции среди этнических групп, проживающих на территории России и сопредельных государств. Медицинская иммунология, 2007, Т. 9, № 2-3, С. 309.
33.Кофиади И.А., Ребриков Д.В., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П., Хаитов Р.М. Анализ распространения ВИЧ-протективных аллелей среди этнических групп, проживающих на территории России и сопредельных государств. Российский аллергологический журнал, 2007, № 3, Пр. 1, С.10.
34.Комаров А.Л., Шахматова О.О., Стамбольский Д.В., Ребриков Д.В., Кофиади И.А., Сироткина О.В., Миронова И.Ю., Деев А.Д., Добровольский А.Б., Панченко Е.П. Генетические полиморфизмы, ассоциированные с тромбозами и прогноз больных с хронической ИБС. Кардиоваскулярная терапия и профилактика, 2008, Т.7, № 6, Пр.1, С. 184.
35.Кофиади И.А., Ребриков Д.В. Генетическая устойчивочть к ВИЧ в популяциях России и сопредельных государств. Сборник тезисов международной конференции «Вторая конференция по вопросам ВИЧ/СПИД в Восточной Европе и Центральной Азии. 2008. М.: РОО «СПИД инфосвязь». С. 8.
36.Черноусов А.Д., Петрова Т.В., Апарин П.Г., Кофиади И.А. Сохранение эффективности терапии ВИЧ-инфекции препаратами интерферонов (клинический случай, восьмилетнее наблюдение). Сборник тезисов международной конференции «Вторая конференция по вопросам ВИЧ/СПИД в Восточной Европе и Центральной Азии. 2008. М.: РОО «СПИД инфосвязь», С. 91.
37.Кофиади И.А., Хаитов Р.М., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П. Направления развития иммуногенетики в постгеномную эру. Материалы I международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине». 2010. М.: Парк-медиа, С. 192.
38.Abramov D., Trofimov D., Kofiadi I., Soroka N., Alexeev L., Ragimov A. Cytokine and cytokine receptor gene polymorphism in the Russian population Tissue antigens, 2010, V. 75, № 5, P.525.
39.Рогатых С.В., Кофиади И.А. Использование технологии ПЦР в реальном времени для оценки эффективности методов выделения ДНК из культур хемолитотрофных микроорганизмов. Актуальные аспекты современной микробиологии: материалы VI молодежной школы-конференции с международным участием. М.: Макс-пресс, 2010, С. 114–116.
40.Кофиади И.А., Рогатых С.В., Мурадов С.В. Разработка генодиагностических тест-систем для определения структуры аборигенного микробного сообщества месторождения Шануч (Западная Камчатка). Сохранение биоразнообразия Камчатки и прилегающих морей: материалы XI Международной научной конференции. Петропавловск-Камчатский: Камчатпресс, 2010, С. 96–99.
41.Абрамов Д.Д., Кофиади И.А., Гудима Г.О., Шеповалова Т.Э., Кадочникова В.В., Болдырева М.Н., Алексеев Л.П. Фармакогенетика противовирусных препаратов: характеристика распределения генетических маркеров, ассоциированных с индивидуальными особенностями реакции человека на терапию вирусных инфекций в Российской популяции. Российский аллергологический журнал, 2012, № 1, С. 10-12.
42.Уткин К.В., Кофиади И.А., Гудима Г.О., Веремеева Г.А., Площанская О.Г., Аклеев А.В., Абрамов Д.Д., Васильев Е.В., Алексеев Л.П. Оценка ассоциации вариантов генов иммунного ответа с формированием фенотипа, характеризующегося повышенной устойчивостью к радиационному воздействию. Российский аллергологический журнал, 2012, № 1, С. 317-318.
43.Utkin K.V., Kofiadi I.A., Goudima G.O., Bateneva E.I., Kadochnikova V.V., Boldyreva M.N., Kiselev M.F., Akleev A.V., Veremeeva G.A., Alexeev L.P. Assessing imunogenetic basis of inherited resistance to radiation: focus on HLA Class II. Tissue antigens, 2012, V. 79, № 6, P. 355.
44.Рогатых С.В., Левенец О.О., Хайнасова Т.С., Кофиади И.А. Разработка тест-систем и анализ структуры сообщества ацидофильных микроорганизмов, используемых в биовыщелачивании сульфидных руд месторождения Шануч (Камчатка). Материалы III Всероссийской научно-практической конференции «Природные ресурсы, их современное состояние, охрана, промысловое и техническое использование». Петропавловск-Камчатский: КамчатГТУ, 2012, С. 139–142.
45.Рогатых С.В., Мурадов С.В., Кофиади И.А., Балыков А.А., Левенец О.О., Хайнасова Т.С. Применение молекулярно-генетических методов в технологии биовыщелачивания сульфидных медно-никелевых руд месторождения Шануч (Камчатка). Материалы конференции с международным участием «Никеленосные провинции Дальнего Востока». Петропавловск-Камчатский: НИГТЦ ДВО РАН, 2012, С. 139–145.
46.Khaitov M., Kofiadi I., Mazurov D., Nikonova A,. Shilovskii P. Inhibition of Hepatitis C virus RNA replication by siRNAs. 19th international symposium on hepatitis C virus and related viruses. Abstract book, 2012, P. 298.