Научная тема: «МЕХАНИЗМЫ РЕГУЛЯЦИИ ДЛИНЫ ТЕЛОМЕР И ДИСТАНЦИОННЫХ РЕГУЛЯТОРНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ У DROSOPHILA MELANOGASTER.»
Специальность: 03.01.07
Год: 2013
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
Большинство генов, контролирующих длину теломер, в настоящее время неизвестны. В представленной работе впервые показано, что несмотря на весьма близкую генетическую локализацию, два доминантных генетических фактора, Telomere elongation (Tel) и Enhancer of terminal gene conversion (E(tc)), являются разными мутациями, но при этом влияют на один и тот же механизм удлинения теломер - терминальную конверсию. Обе мутации тестировались в модельной системе, основой которой являются Х хромосомы дрозофилы с терминальными обрывами в регуляторной области гена yellow. Эта модельная система использовалась практически во всех экспериментах по изучению структуры и свойств теломерного хроматина. Результаты экспериментов свидетельствуют, что данная система может служить хорошим инструментом in vivo анализа происходящих на конце хромосомы событий и тестирования различных факторов, участвующих в поддержании определенной структуры и размера теломер. Кроме того, точное описание функциональных свойств мутаций Tel и E(tc) позволяет использовать их для быстрой модификации модельной системы и получения линий дрозофил, несущих на конце хромосом заранее заданные последовательности ДНК. Накопленный в ходе  выполнения работы методический и фактический материал в дальнейшем может быть использован научными коллективами, ведущими сходные по тематике исследования.

Ранее было найдено и изучено лишь несколько отдельных белков, входящих в состав теломерного комплекса дрозофилы: это НР1 (основной компонент гетерохроматина), HOAP (белок,  взаимодействующий с НР1), Mre11/Rad50 (белки систем репарации и рекомбинации). В представленной работе впервые в различных модельных системах подробно изучалось влияние мутаций  гена Su(var)2-5, кодирующего белок HP1, и делеций генов, кодирующих Ku80 и Ku70,   на частоту терминальных генных конверсий и присоединений к концу хромосомы HeT-A/TART элементов. Показано, что частота терминальных генных конверсий на фоне уменьшения количества белка HP1 значительно возрастает, если на конце хромосомы присутствуют тандемные копии гомологичных последовательностей. В прочих модельных системах мутации Su(var)2-5 значительно увеличивают частоту присоединений HeT-A/TART транспозонов к концам терминально делетированных хромосом.  Уменьшение концентрации белков Ku70 и Ku80 так же  значительно увеличивает частоту присоединений HeT-A/TART элементов  и частоту элонгации терминальной ДНК путем генной конверсии. Эффект Df Ku80   более выражен, чем эффект Df Ku70. Однако снижение концентрации  Ku70 приводит к дестабилизации концов терминально делетированных хромосом. Кроме того, белки Ku70 и Ku80 не влияют на транскрипцию HeT-A элементов. Таким образом, гетеродимер Ku70/Ku80 играет важную роль в защите концов хромосом у Drosophila, тогда как  белок HP1 преимущественно регулирует транскрипцию HeT-A элементов.

С помощью различных модельных систем были исследованы свойства теломерного хроматина, формирующегося на концах терминально делетированных хромосом. На основании полученных результатов сделано заключение, что размер теломерного хроматина составляет 4-5 т.п.н. и эта структура способна блокировать взаимодействия между различными регуляторными белковыми комплексами.

Список опубликованных работ
1. Melnikova L, Kulikov A, Georgiev P.Interactions between cut wing mutations and mutations in zeste, and the enhancer of yellow and Polycomb group genes of Drosophila melanogaster. Mol Gen Genet. 1996. 252(3):230-6. 2. П.Г. Георгиев, Л.С. Мельникова, Т.Г. Кан, О.И. Кравчук, С.С. Михайловский, М.Ю. Савицкий. Различные механизмы регуляции длины теломер. Молекулярная биология. 2000. 34(5):743-752.

3. Savitsky M, Kravchuk O, Melnikova L, Georgiev P. Heterochromatin protein 1 is involved in control of telomere elongation in Drosophila melanogaster. Mol Cell Biol. 2002. 22(9):3204-18.

4. Зобачева П.Ю., Куллыев А.П., член-корр. РАН Георгиев П.Г., Мельникова Л.С. Изучение взаимодействия между Su(Hw) инсулятором и сайтами связывания для белка GAF на регуляторной системе гена yellow у Drosophila melanogaster. ДАН. 2003. 391(5):692-695.

5. Зобачева П.Ю., Куллыев А.П., член-корр. РАН Георгиев П.Г., Мельникова Л.С.

Взаимодействие между сайтами связывания для белка Zeste не блокирует активацию гена yellow изолированными энхансерами у Drosophila melanogaster.ДАН. 2003 391(6):825-827.

6. Melnikova L, Juge F, Gruzdeva N, Mazur A, Cavalli G, Georgiev P. Interaction between the GAGA factor and Mod(mdg4) proteins promotes insulator bypass in Drosophila. Proc Natl Acad Sci U S A 2004. 101: 14806-14811.

7. Karakozova M, Savitskaya E, Melnikova L, Parshikov A, Georgiev P. The Mod(mdg4) component of the Su(Hw) insulator inserted in the P transposon can repress its mobility in Drosophila melanogaster. Genetics. 2004. 167:1275-1280. 8. Melnikova L, Biessmann H, Georgiev P. Excision of a P element is suppressed at the end of a terminally deficient chromosome in Drosophila melanogaster. Mol Genet Genomics. 2004. 272:512-518.

9. Melnikova L, Biessmann H, Georgiev P. The Ku protein complex is involved in length regulation of Drosophila telomeres. Genetics. 2005. 170:221-35.

10. Melnikova L, Georgiev P. Drosophila telomeres: the non-telomerase alternative. Chromosome Res. 2005. 13(5):431-41. Review.

11. Savitskaya E., Melnikova L*., Kostuchenko M., Kravchenko E., Pomerantseva E., Boikova T., Chetverina D., Parshikov A., Zobacheva P., Gracheva E., Galkin A., and Georgiev P. Study of long-distance functional interactions between Su(Hw) insulators that can regulate enhancer-promoter communication in Drosophila melanogaster. Mol Cell Biol. 2006. 26(3):754-61.

12. Melnikova L, Biryukova I, Kan T, Georgiev P. Long-distance interactions between regulatory elements are suppressed at the end of a terminally deficient chromosome in Drosophila melanogaster. Chromosoma. 2008. 117(1):41-50.

13. Melnikova L, Kostuchenko M, Silicheva M, Georgiev P.

Drosophila gypsy insulator and yellow enhancers regulate activity of yellow promoter through the same regulatory element. Chromosoma. 2008. 117(2):137-45.

14. Проскуряков К.А., Мельникова Л.С. Антогонизм между теломерным и Polycomb – зависимым хроматином на конце терминально делетированных хромосом у Drosophila melanogaster. Генетика. 2008. 44(11):1562-1566.

15. Проскуряков К.А., Мельникова Л.С. Функциональное разделение генетических факторов Telomere elongation (Tel) и Enhancer of terminal gene conversion (E(tc)), участвующих в регуляции длины теломер у Drosophila melanogaster. ДАН. 2008. 421(3):406-410

16. Kostyuchenko M, Savitskaya E, Koryagina E, Melnikova L, Karakozova M, Georgiev P. Zeste can facilitate long-range enhancer-promoter communication and insulator bypass in Drosophila melanogaster. Chromosoma. 2009. 118(5):665-74.

17. Мельникова Л.С., Проскуряков К.А., академик Георгиев П.Г.Изучение функционального взаимодействия между GAGA-содержащими участками из промоторных районов генов теплового шока hsp26 и hsp70 в модельной системе гена white у Drosophila melanogaster.

ДАН. 2010. 434 (4):553-557.