Найден и выделен белковый комплекс BTFly. Он включает коактиваторы транскрипции SAYP, Brahma и TFIID. Впервые продемонстрировано объединение полноразмерных белковых транскрипционных комплексов в один суперкомплекс. Выяснено, что BTFly стабилен в отсутствие хроматиновой матрицы.
Показано, что BTFly формируется на основе коактиватора SAYP. Обнаружен домен SAY, обеспечивающий активирующий потенциал SAYP. Показано, что расположенные рядом с SAY PHD домены белка SAYP не способны активировать транскрипцию, но стимулируют активность SAY-домена.
Изучена молекулярная структура суперкомплекса, показаны белковые домены в составе его субъединиц, на основе которых осуществляется сборка всего комплекса: SAY домен взаимодействует с белками BAP170 и TAF5 (WD-40 доменом последнего).
Показана локализация BTFly на промоторах активных генов. Изучены функциональные свойства BTFly в активации транскрипции: наличие всех компонентов необходимо для активации транскрипции и привлечения РНК-полимеразы.
Продемонстрировано, что SAYP, TFIID и Brahma локализуются совместно во многих сайтах генома и совместно участвуют в развитии организма.
Показано участие SAYP в экдизоновом каскаде. Найдено взаимодействие SAYP с ядерным рецептором DHR3 - компонентом экдизонового каскада. Локализованы фрагменты белков SAYP и DHR3, опосредующие найденное взаимодействие. Показана совместная экспрессия указанных факторов в развитии, совместная локализация во многих сайтах хромосом. Продемонстрировано привлечение SAYP на DHR3-зависимые гены в организме.
Подобраны условия для активации DHR3-зависимой экспрессии в культуре клеток S2, найдены новые гены-мишени DHR3. Продемонстрировано участие BTFly в активации последних.
Изучено проявление мутации е(у)3u1 (в гене, кодирующем SAYP): обнаружено нарушение пролиферации и дифференцировки клеток при развитии крыльев и оогенезе.
Показано участие SAYP в сигнальном пути Jak/Stat. Найдено взаимодействие SAYP и специфического фактора транскрипции STAT, взаимодействие осуществляется через активационный домен STAT и консервативный домен SAY-PHD. Обнаружена совместная локализация STAT и SAYP во многих сайтах хромосом, участие SAYP в активации STAT-зависимых генов и привлечение SAYP на указанные гены в организме.
Подобраны условия активации Jak/STAT пути в культуре клеток, показана положительная роль SAYP в активации генов-мишеней указанного пути. Продемонстрировано привлечение BTFly на промоторы STAT-зависимых генов и его участие в их активации.
1)Шидловский Ю.В., Марданов П.В., Федорова О.Н., Набирочкина Е.Н. Молекулярный аппарат инициации транскрипции РНК-полимеразой II. Генетика (2005) 41(4): 493-507
2)Шидловский Ю.В., Набирочкина Е.Н. Влияние ремоделирования и модификации хроматина на процесс инициации транскрипции РНК-полимеразой II. Генетика (2005) 41(7): 884-93
3)Шидловский Ю.В., Копытова Д.В., Куршакова М.М., Набирочкина Е.Н. Принципы функционирования аппарата инициации транскрипции РНК-полимеразой II. Генетика (2005) 41(9): 1157-69
4)Сошникова Н.В., Воробьева Н.Е., Краснов А.Н., Георгиева С.Г., Набирочкина Е.Н., Ильин Ю.В., Шидловский Ю.В. Взаимодействие коактиваторов на промоторе. Доклады АН (2008), 423 (4): 561-3
5)Воробьева Н.Е., Сошникова Н.В., Николенко Ю.В., Набирочкина Е.Н., Георгиева С.Г., Шидловский Ю.В. Новый эволюционно консервативный белковый домен, активирующий транскрипцию. Доклады АН (2008), 423 (5): 694-6
6)Vorobyeva NE, Soshnikova NV, Nikolenko JV, Kuzmina JL, Nabirochkina EN, Georgieva SG and Shidlovskii YV. Transcription coactivator SAYP combines chromatin remodeler Brahma and transcription initiation factor TFIID into a single supercomplex. Proc Natl Acad Sci USA (2009); 106(27):11049-54.
7)Vorobyeva NE, Soshnikova NV, Kuzmina JL, Kopantseva MR, Nikolenko JV, Nabirochkina EN, Georgieva SG, Shidlovskii YV. The novel regulator of metazoan development SAYP organizes a nuclear coactivator supercomplex. Cell Cycle (2009); 8(14):2152-6.
8)Сошникова Н.В., Воробьева Н.Е., Краснов А.Н., Георгиева С.Г., Набирочкина Е.Н., Шидловский Ю.В. Новый комплекс, образуемый коактиватором транскрипции SAYP. Молекулярная биология (2009), 43(6): 1055-62.
9)Kopytova DV, Orlova AV, Krasnov AN, Gurskiy DY, Nikolenko JV, Nabirochkina EN, Shidlovskii YV, and Georgieva SG. Multifunctional factor ENY2 is associated with the THO complex and promotes its recruitment onto nascent mRNA. Genes and Development (2010); 24:86-96.
10) Kopytova DV, Orlova AV, Krasnov AN, Gurskiy DY, Nabirochkina EN, Georgieva SG and Shidlovskii YV. ENY2: couple, triple… More? Cell Cycle (2010); 9(3):479-81.
11)Воробьева Н.Е., Сошникова Н.В., Николенко Ю.В., Кузьмина Ю.Л., Набирочкина Е.Н., Георгиева С.Г., Шидловский Ю.В. Новый консервативный домен коактиватора SAYP опосредует взаимодействие транскрипционных комплексов TFIID и Brahma. Молекулярная биология (2010); 44 (5):867–875.
12)Кузьмина Ю.Л., Панов В.В., Воробьева Н.Е., Сошникова Н.В., Копанцева М.Р., Николенко Ю.В., Набирочкина Е.Н., Георгиева С.Г., Шидловский Ю.В. SAYP – новый регулятор развития многоклеточных организмов. Генетика (2010); 46 (8), 1033–40.
13)Гурский Д.Я., Набирочкина Е.Н., Копытова Д.В., Николенко Ю.В., Ильин Ю.В., Георгиева С.Г., Шидловский Ю.В. Белок ENY2 входит в состав THO-комплекса Drosophila melanogaster. Доклады АН (2010); 433 (6):831-4.
14)Гурский Д.Я., Орлова А.В., Копытова Д.В., Краснов А.Н., Набирочкина Е.Н., Георгиева С.Г., Шидловский Ю.В. Мультифункциональный фактор ENY2 интегрирует различные этапы экспрессии генов. Генетика (2010) 46 (12), 1700– 3.
15)Vorobyeva NE, Nikolenko JV, Krasnov AN, Kuzmina JL, Panov VV, Nabirochkina EN, Georgieva SG, Shidlovskii YV. SAYP interacts with DHR3 nuclear receptor and participates in ecdysone-dependent transcription regulation. Cell Cycle (2011) 10(11):1821-7.
16)Panov VV, Kuzmina JL, Doronin SA, Kopantseva MR, Nabirochkina EN, Georgieva SG, Vorobyeva NE, Shidlovskii YV. Transcription coactivator SAYP mediates the action of STAT activator. Nucleic Acids Research (2012) 40(6): 2445-53.
17)Воробьева Н.Е., Николенко Ю.В., Краснов А.Н., Кузьмина Ю.Л., Панов В.В., Набирочкина Е.Н., Георгиева С.Г., Шидловский Ю.В. Коактиватор SAYP взаимодействует с ядерным рецептором DHR3 и контролирует экдизон-зависимую транскрипцию. Генетика (2012) 48 (1), 21–29.
Тезисы конференций
1)Molecular characterization of novel transcription factor SAYP. Shidlovskii Y.V., Fedorova O.N., Nabirochkina E.N., Georgieva S.G. 7th International Conference on Molecular Biology, Suzdal, Russia, 28.11-2.12.2004, Abstract book, p. 11
2)Novel transcription coactivator SAYP. Shidlovskii Y., Nikolenko J., Krasnov A., Fedorova O., Lebedeva L., Nabirochkina E., Georgieva S.1st International EMBL-Monterotondo (6th EMBL) International PhD Students Symposium “Animal Models”, Rome, Italy, May 12-14, 2005, Symposium handbook, p.54
3)Роль доменов транскрипционного коактиватора SAYP при активации транскрипции в эукариотической системе. Воробьева Н.Е., Шидловский Ю.В., Николенко Ю.В., Набирочкина Е.Н., Георгиева С.Г. Международная Конференция «Генетика в России и мире», 28 июня – 2 июля 2006, Москва, Россия, Материалы, стр. 37
4)Novel multidomain transcription coactivator SAYP possesses repressor properties in heterochromatin. Shidlovskii Y., Krasnov A., Nikolenko J., Lebedeva L., Kopantseva M., Nabirochkina E., Georgieva S. IV International Summer School “DNA and Chromosomes”, Cargèse, France, June 19 – July 1, 2006, Abstract book, p. 21
5)Структурно-функциональный анализ коактиватора транскрипции SAYP. Воробьева Н.Е., Шидловский Ю.В., Николенко Ю.В., Набирочкина Е.Н., Георгиева С.Г. XIX Зимняя Молодежная Научная Школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, 7-9 февраля 2007, Тезисы докладов и стендовых сообщений, стр. 25
6)SAYP, новый коактиватор РНК-полимеразы II у высших эукариот. Шидловский Ю.В., Николенко Ю.В., Воробьева Н.Е., Лебедева Л.А., Набирочкина Е.Н., Георгиева С.Г. Семинар российско-германской группы «Взаимодействие белков и нуклеиновых кислот», Суздаль, Россия, 20-24 июня, 2007, Тезисы докладов, стр. 30
7)Novel transcription coactivator SAYP. Shidlovskii YV, Vorobyeva NE, Soshnikova NV, Kopantseva MR, Moshkin YM, Georgieva SG, Ilyin YV FEBS-EMBO Advanced Lecture Course “Molecular Mechanisms in Signal Transduction and Cancer”, Spetses, Greece, 15-24 August 2007, Abstract book, p. 21
8)Novel mechanism of coupling of chromatin remodeling, transcription activation and mRNP formation. Shidlovskii YV, Vorobyeva NE, Soshnikova NV, Ivliev AE, Nikolenko JV, Nabirochkina EN, Moshkin YM, Verrijzer CP, Georgieva SG, Ilyin YV Meeting on Mechanisms of eukaryotic transcription, Cold Spring Harbor Laboratory, NY, USA, 29 August – 2 September 2007, Abstract book, p. 214
9)Novel mechanism of coupling of chromatin remodeling, transcription activation and mRNA export. Shidlovskii YV, Vorobyeva NE, Soshnikova NV, Nikolenko JV, Ivliev AE, Lebedeva LA, Georgieva SG. EMBO Conference Series on Nuclear Structure and Dynamics, Montpellier, France, 1-5 September 2007, Abstract book, p-043
10)Structural and functional study of domains of novel transcription coactivator SAYP. Vorobyeva N.E., Soshnikova N.V., Georgieva S.G., Shidlovskii Y.V., Ilyin Y.V. FEBS workshop “The biology of modular protein domains”, Tirol, Austria, 8-13 September, 2007, Abstract book, p.122
11)Новый транскрипционный фактор SAYP объединяет аппарат ремоделинга хроматина и инициации транскрипции. Сошникова Н.В., Воробьева Н.Е., Георгиева С.Г., Шидловский Ю.В., Ильин Ю.В. Конференция молодых ученых по молекулярной биологии и генетике, посвященная 120-летию Н.И. Вавилова, Украина, Киев, 20-22 сентября 2007, Тезисы докладов, стр. 92
12)Novel export complex is responsible for efficient transcription and mRNA transport through nuclear pore. Yulii V. Shidlovskii, Maria M. Kurshakova, Alexey N. Krasnov, Daria V. Kopytova, Julia V. Nikolenko, Elena N. Nabirochkina, Làszlò Tora and Sofia G. Georgieva. EMBO workshop “Mechanisms of Nucleocytoplasmic Transport”, Taormina, Italy, 27-31 October, 2007, Abstract book, p. 97
13)Transcription coactivators E(y)2 and SAYP couple different stages of gene expression in the nucleus. Yulii Shidlovskii, Sofia Georgieva. 2nd Szeged Minisymposium on Histone Modifying Complexes, Szeged, Hungary, May 2, 2008, Abstract book, p. 2
14)Новый коактиваторный комплекс BTFly координирует ключевые этапы транскрипции генов. Шидловский Ю. В., Воробьева Н. E., Сошникова Н. В., Николенко Ю. В., Набирочкина Е.Н., Георгиева С.Г. IV Съезд Российского общества биохимиков и молекулярных биологов, Новосибирск, Россия, 11-15 мая 2008 г., Материалы, стр. 134
15)Novel export complex is responsible for efficient transcription and mRNA transport through the nuclear pore. Shidlovskii Y, Kurshakova M, Krasnov A, Kopytova D, Nikolenko J, Nabirochkina E, Spehner Daniele, Schultz P, Làszlò T and Georgieva S. 8th Young Scientist Forum and 33d FEBS Congress, Athens, Greece, 26.06-3.07.2008, Abstact book, p.131
16)Мультидоменный фактор SAYP координирует процессы на промоторе активных генов. Шидловский Ю.В., Воробьева Н.Е., Сошникова Н.В., Георгиева С.Г. IV Российский симпозиум «Белки и пептиды», Казань, Россия, 23-27.06.2009, Сборник тезисов, стр. 354.
17)Multifunctional factor ENY2 is associated with THO complex and is required for its recruitment onto mRNA in Drosophila. Shidlovskii Y. International Meeting on Nuclear Trafficking, Banff, Canada, 24-29.08.2009, Abstract book, p. 48.
18)SAYP is the novel regulator of Jak/Stat pathway. Shidlovskii YV, Kuzmina JK, Panov VV, Georgieva SG. FEBS Special Meeting, Jak-Stat Signalling: from basics to disease, Vienna, Austria, 10-13.02.2010, Abstract book, p.133
19)Mechanism of transcription activation by factor SAYP. Shidlovskii YV, Kuzmina JL, Panov VV, Vorobyeva NE, Soshnikova NV, Georgieva SG, Ilyin YV. International Symposium “Control of gene expression and cancer”, Moscow, Russia, 21-25.06.2010, Abstract book, p.15
20) Новый участник JAK/STAT пути коактиватор транскрипции SAYP/PHF10 важен для поддержания плюрипотентного статуса стволовых клеток. Панов В.В., Кузьмина Ю.Л., Шидловский Ю.В. III Всероссийская научная школа-конференция «Стволовые клетки и регенеративная медицина», Москва, Россия, 25-28 октября 2010. стр. 55
21)Коактиватор транскрипции SAYP – новый участник Jak/Stat пути. Панов В.В., Кузьмина Ю.Л., Шидловский Ю.В. XXIII Международная зимняя молодежная школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии», Москва, Россия, 7-10 февраля 2011, Тезисы докладов, стр. 16
22)SAYP is a novel member of Jak/Stat pathway. Panov VV, Kuzmina JL, Shidlovskii YV. VII International Scientific Conference for Students and PhD Students “Youth and Progress of Biology”, Lviv, Ukraine, April 5-8, 2011, Abstract book, p. 306
23)Novel mechanism of genes activation by SAYP/PHF10 coactivator is important in signaling pathways. Panov VV, Kuzmina JL, Doronin SA, Vorobyeva NE, Soshnikova NV, Georgieva SG, Shidlovskii YV. EMBO Conference Series on Nuclear Structure and Dynamics, L’Isle sur la Sorgue, France, September 28 – October 2, 2011, Abstract book, P-098