Научная тема: «ГРИБЫ В КОЛЛЕКЦИЯХ КУЛЬТУР: ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ И ПРИКЛАДНЫЕ АСПЕКТЫ»
Специальность: 03.02.12
Год: 2012
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. Впервые получены обобщенные данные о видовом разнообразии мирового коллекционного фонда грибов, определена его доля от общего числа известных (описанных) видов и внутривидовых таксонов грибных организмов.
  2. На основе структуризации и анализа данных по нуклеотидным последовательностям грибов, депонированным в GenBank, проведена оценка степени его видового разнообразия, возможностей и ограничений использования информации GenВank для идентификации новых штаммов грибов.
  3. Результаты сравнительного анализа существующих отечественных и зарубежных регуляторных документов в области биобезопасности, предоставляющие исследователям информацию для планирования и проведения научных экспериментов и биотехнологических разработок. Результаты анализа свидетельствуют об актуальности разработки в РФ новых регуляторных документов, включающих научно обоснованный перечень условно-патогенных и патогенных видов грибов, а также о необходимости их гармонизации с аналогичными документами стран-членов ВТО (связанной со вступлением в эту организацию РФ).
  4. Обобщение экспериментальных результатов по длительному (более 40 лет) сохранению в жизнеспособном состоянии штаммов грибов ВКМ, относящихся более чем к 1220 видам, предоставляет пользователям ценную информацию о методах и сроках гарантированного сохранения культур грибов.
  5. На основе полученных и структурированных аналитических материалов, содержащих разноплановую информацию по грибам, поддерживаемым в культуре, разработана информационно-справочная система FungalDC (Fungal Diversity in Culture Collections). Доступ к ней открыт на сайтах ВКМ (www.vkm.ru) и MycoBank (www.mycobank.org, раздел «Specimens and strains links, All-Russian Collection of Microorganisms»»). Взаимодействие FungalDC в режиме on-line с информационными системами Index Fungorum, MycoBank, GenBank и StrainInfo обеспечивает повышение эффективности поиска конкретных штаммов грибов в коллекциях мира и сопряженной информации.
Список опубликованных работ
Статьи в рецензируемых российских журналах и главы в монографиях и учебных пособиях

1Мирчинк Т.Г., Озерская СМ., Кочкина Г.А. Фенолоксидазная активность микромицетов подстилок и почв // Биологические науки. 1984. №12. С.88-90.

2Озерская СМ., Скворцова М.М., Кочкина Г.А., Дрягина Т.Н., Афонина Е.В. Активация прорастания покоящихся спор Entomophthora thaxteriana Petch // Микология и фитопатология. 1986. Т.20. Вып.4. С. 175-178.

3Запрометова О.М., Озерская СМ., Улезло И.В. Активность некоторых специфических гликозидаз микроскопических грибов почвы и подстилки // Микология и фитопатология. 1987. Т.21. Вып.2. С.148-151.

4Мацкевич Н.В., Денбновецкий Г.Ю., Семашко А.Ю., Налепина Л.Н., Озерская СМ., Бурова Л.Г., Соломахина В.М. Научно-методические указания по изучению и охране редких и находящихся под угрозой исчезновения видов грибов-макромицетов. М.: ВНИИ Охраны природы. 1989. 35с.

5Коллектив авторов. Виды мицелиальных и дрожжевых грибов, поддерживаемых в коллекциях Болгарии, Вьетнама, Монголии, СССР, Чехословакии // Биотехнология, биотехника, biotechnology. Болгария. 1990. № 5-6.

6Озерская СМ., Иванушкина Н.Е. Международная комиссия по таксономии грибов. Элементы кодекса номенклатуры в практике микологов-систематиков // Микология и фитопатология. 1991. Т.25. Вып.3. С.260-263.

7Коллектив авторов. Каталог культур микроорганизмов. Раздел "Мицелиальные грибы". М.: Изд-во ВИНИТИ. 1992. С.93-164.

8Озерская С.М., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е. Информационная база данных о штаммах мицелиальных грибов // Микробиология. 1995. Т.64. №4. С.5-9.

9Калакуцкий Л.В., Озерская С.М., Евтушенко Л.И., Мазанов А.Л. Российские коллекции микроорганизмов // Прикладная биохимия и микробиология. 1996. Т. 32. №1. С.144-154.

10Коваленко А.Е., Нездойминого Э.Л., Мацкевич Н.В., Афанасьева М.М., Лутков А.И., Семашко А.Ю., Иванов А.И., Озерская С.М. Программа концептуальной модели банка региональных данных по редким видам грибов. ВНИИ Охраны природы / Деп. в ВИНИТИ № 3684-B96 от 09.12.1996/. 13c.

11Мацкевич Н.В., Денбновецкий Г.Ю., Мамедова Э.Т., Семашко А.Ю., Лутков А.А., Кучерявая О.А., Новак О.Г., Озерская С.М., Налепина Л.Н., Кобякова Т.Е., Клипцов С.В. Научно-методические указания по криоконсервации редких макромицетов и папоротниковидных с использованием морфологического и цитологического тестирования. ВНИИ Охраны природы / Деп. в ВИНИТИ № 3771-B96 от 17.12.1996/. 20c.

12Озерская С.М. Рецензия на сборник "Биоразнообразие микроорганизмов: роль центров микробных ресурсов" (The Biodiversity of Microorganisms and the Role of Microbial Resource Centres / Ed.: B.Kirsop, D.L.Hawksworth on behalf of the WFCC Bidiversity Committee. World Federation for Culture Collections. UNEP, UK, 1994. 104p.) // Микология и фитопатология. 1996. Т.30. Вып.5-6. С.81-84.

13Озерская С.М. Рецензия на сборник "Международные руководящие принципы техники безопасности ЮНЕП в области биотехнологии". Программа Организации Объединенных Наций по окружающей среде, 1996. 39с. // Микробиология. 1996. Т.66. №6. С.863-864.

14Фонин В.С., Сидякина Т.М., Шаин С.С., Озерская С.М., Павлова Е.Ф. Изучение условий хранения промышленных штаммов паразитарной культуры спорыньи // Прикладная биохимия и микробиология. 1996. Т.32. №4. С.406-410.

15Воронина Э.Г., Мукомолова Т.Ю., Васильев С.В., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Токсические метаболиты коллекционных культур энтомофторовых грибов и первичный отбор активных моноконидиальных изолятов Entomophthora thaxteriana Petch. (Zygomycetes, Entomophthorales) // Микология и фитопатология. 1997. Т.31. Вып.2. С.42-53.

16Иванушкина Н.Е., Еремина С.С., Кочкина Г.А., Запрометова К.М., Озерская С.М. Влияние бифоназола на мицелиальные грибы разных систематических групп // Вестник дерматологии и венерологии. 1997. №4. С.8-9.

17Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Транспортировка потенциально опасных культур грибов // Микология и фитопатология. 1997. Т.31. Вып.4. С.62-71.

18Козловский А.Г., Винокурова Н.Г., Желифонова В.П., Озерская С.М. Исследование алкалоидообразования у грибов рода Penicillium серий Fellutana и Canescentia // Микробиология. 1997. Т.66. №4. С.514-519.

19Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Озерская С.М. Проблемы безопасности при работе с мицелиальными грибами // Вестник дерматологии и венерологии. 1997. №4. С.16-20.

20Козловский А.Г., Винокурова Н.Г., Озерская С.М. Особенности алкалоидообразования у штаммов Penicillium chrysogenum, выделенных из почв различных климатических зон // Микробиология. 1998. Т.67. №4. С.483-487.

21Озерская С.М., Кочкина Г.А. (Перевод). Будапештский договор: Практический кодекс для международных органов по депонированию (The Budapest Treaty: Code of Practice for IDAs / Ed.: M.Bosschaerts. BCCM, Belgium, 1998. 24p.) // Микробиология. 1999. Т.68. № 3. С.423-430.

22Шабаева Э.В., Яшина С.Г., Еремина C.C., Озерская C.М. Опыт культивирования мицелия базидиальных грибов на средах для выращивания тканей растений // Цитология. 1999. №3-4. С.323-324.

23Винокурова Н. Г., Озерская С.М., Желифонова В. П., Аданин В.М. Таксономическое положение и азотсодержащие вторичные метаболиты Penicillium vitale Pidoplichko et Bilai apud Bilai // Микробиология. 2000. Т.69. №3. С.415-419.

24Козловский А.Г., Желифонова В.П., Винокурова Н.Г., Озерская С.М. Влияние микроэлементов на биосинтез метаболитов грибом Penicillium citrinum Thom ВКМ F-1079 // Микробиология. 2000. Т.69. №5. С.642-646.

25Винокурова Н. Г., Озерская С.М., Баскунов Б.П., Аринбасаров М.У. Грибы Penicillium commune Thom и Penicillium clavigerum Demelius - продуценты фумигаклавинов А и Б // Микробиология. 2003. Т.72. №2. С.180-182.

26Козловский А.Г., Желифонова В.П., Аданин В.М., Антипова Т.В., Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Грефе У. Выделенные из вечной мерзлоты грибы вида Penicillium aurantiogriseum Dierckx 1901 - продуценты дикетопиперазиновых алкалоидов рокефортина и 3,12-дигидрокефортина // Прикладная биохимия и микробиология. 2003. Т.39. №4. С.446-451.

27Шабаева Э.В., Яшина С.Г., Еремина C.C., Озерская C.М., Левицкая Г.Е., Егорова Е.Ф., Гахова Э.Н. О сохранении генофонда базидиальных грибов Приокско-Террасного заповедника // Микология и фитопатология. 2004. Т.38. Вып.3. С.59-65.

28Озерская С.М., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Запрометова К.М., Еремина С.С. Мицелиальные грибы во Всероссийской коллекции микроорганизмов (ВКМ ИБФМ РАН) // Прикладная биохимия и микробиология. 2005. Т.41. №5. С.596-600.

29Белова Н.В, Псурцева Н.В., Гачкова Е.Ю., Озерская С.М. Сохранение разнообразия базидиомицетов ex situ в специализированной коллекции культур ЛЕ (БИН) // Микология и фитопатология. 2005. Т.39. Вып.2. С.1-10.

30Винокурова Н.Г., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А., Аринбасаров М.У., Озерская С.М. Синтез микофеноловой кислоты грибами рода Penicillium Link // Прикладная биохимия и микробиология. 2005. Т.41. №1. С.95-98.

31Озерская С.М., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Запрометова К.М., Еремина С.С., Князева Е.В. Состояние коллекций микроорганизмов в России // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии им. Ю.А.Овчинникова. 2006. Т.2. №3. С.51-61.

32Желифонова В.П., Антипова Т.В., Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Козловский А.Г. Грибы Penicillium variabile Sopp 1912, выделенные из многолетнемерзлых древних отложений, как продуценты ругуловазинов // Микробиология. 2006. Т.75. №6. С.742-746.

33Буркин А.А., Кононенко Г.П., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Иммуноферментный анализ PR-токсина в таксономической оценке грибов рода Penicillium Link // Прикладная биохимия и микробиология. 2007. Т.43. №4. С.505-510.

34Кураков А.В., Новикова Н.Д., Озерская С.М., Дешевая Е.А., Геворкян С.А., Гогинян В.Б. Условно-патогенные и токсигенные микроскопические грибы среди деструкторов синтетических полимерных материалов // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2007. Т.41. №5. С.49-55.

35Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А. Патогенные грибы: категоризация биологического риска и разнообразие / В сб. "Микология сегодня" / Ред. Ю.Т.Дьяков, Ю.В.Сергеев. М.: Национальная академия микологии, 2007. С.268-282.

36Озерская С.М., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Князева Е.В., Гиличинский Д.А. Структура комплексов микромицетов в многолетнемерзлых грунтах и криопэгах Арктики // Микробиология. 2008. Т.77. №4. С.542-550.

37Кураков А.В., Геворкян С.А., Гогинян В.Б., Озерская С.М. Разнообразие и особенности состава микроскопических грибов на синтетических полимерных материалах // Прикладная микробиология и биохимия. 2008. Т.44. №2. С.232-235.

38Озерская С.М. Рецензия на сборник «Руководства ОЭСР для биологических ресурсных центров с учетом наилучшей практики» (OECD Best Practice Guidelines for Biological Resource Centres. OECD, 2007, 115p.) // Прикладная биохимия и микробиология. 2008. Т.44. №5. С.615-616.

39Желифонова В.П., Антипова Т.В., Озерская С.М., Кочкина Г. А., Козловский А.Г. Вторичные метаболиты грибов рода Penicillium, выделенных из многолетней мерзлоты, как хемотаксономические маркеры // Микробиология. 2009. Т.78. №3. С.393-398.

40Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А., Еремина С.С., Озерская С.М. Опыт использования современных методов длительного хранения грибов в ВКМ // Микология и фитопатология. 2010. Т.44. Вып.1. С.19-30.

41Антипова Т.В.,Желифонова В.П., Баскунов Б.П., Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Козловский А Г. Новые продуценты биологически активных соединений ‒ грибы рода Penicillium, выделенные из отложений вечной мерзлоты // Прикладная биохимия и микробиология. 2011. Т.47. №3. С.318-323.

42Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А. Микроскопические грибы в связи с проблемами биологической безопасности // Проблемы медицинской микологии. 2011. Т.13. №3. С.3-12.

43Калакуцкий Л.В., Озерская С.М. Биологические ресурсные центры: современное состояние в России и мире, проблемы организации, перспективы развития // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии им. Ю.А.Овчинникова. 2011. Т.7. №1. С.28-40.

44Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А. Таксономическое разнообразие патогенных и условно-патогенных грибов / Елинов Н.П., Васильева Н.В., Маметьева А.А., Николенко М.В., Озерская С.М. Патогенные и условно-патогенные макро- и микромицеты как объекты царства грибов (Fungi), их характеристика с учётом требований международного кодекса ботанической номенклатуры. Вып. I. Учебное пособие. Санкт-Петербург, 2011. Глава 13. С.44-49.

45Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А. Разнообразие грибов третьей (III) и четвёртой (IV) групп патогенности, соответствующих уровням риска BSL-2 и BSL-1 / Елинов Н.П., Васильева Н.В., Маметьева А.А., Николенко М.В., Озерская С.М. Патогенные и условно-патогенные макро- и микромицеты как объекты царства грибов (Fungi), их характеристика с учётом требований международного кодекса ботанической номенклатуры. Вып. I. Учебное пособие. Санкт-Петербург, 2011. Глава 14. С.50-60.

46Козловский А.Г., Желифонова В.П., Антипова Т.В., Баскунов Б.П., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Профили вторичных метаболитов грибов подрода Penicillium рода Penicillium, выделенных из вечномерзлых отложений, как элементы полифазной таксономии // Микробиология. Т.81. 2012

Статьи в зарубежных изданиях

47Vasilenko A.N., Ozerskaya S.M. Package for Cluster Analysis on an IBM PC Computer // BINARY. 1992. V.4. P.64-65.

48Vasilenko A.N., Ozerskaya S.M. Quick Algorithms of Cluster Analysis in BIOMATRIX 3.0 // BINARY. 1994. V.6. P.141-144.

49Kozlovsky A.G., Zhelifonova V.P., Ozerskaya S.M., Vinokurova N.G., Adanin V.M., Grafe U. Cyclocitrinol, a new fungal metabolite from Penicillium citrinum // Pharmazie. 2000. V.55. N.6. P.470-471.

50Kozlovsky A.G., Zhelifonova V.P., Adanin V.M., Ozerskaya S.M., Grafe U. Nosporins A and B, new metabolites from a filamentous fungus, VKM F-3750 // Pharmazie. 2003. V.58. N.1. P.76-77.

51Kozlovsky A.G., Zhelifonova V.P., Antipova T.V., Adanin V.M., Ozerskaya S.M., Ivanushkina N.E., Gollmick F.A., Gräfe U. A new N-carboxylester derivative of 3,12-dihydroroquefortine // Heterocycles. 2003. V.60. N.7. P.1639-1644.

52Ozerskaya S.M., Vasilenko A.N, Verslyppe B., Dawyndt P. FungalDC: a database on fungal diversity in culture collections of the world // Inoculum. Supplement to Mycologia (Newsletter of the Mycological Society of America). 2010. V.61. N.3. P.1-5.

53Ozerskaya S.M., Kochkina G.A., Ivanushkina N.E. Fungal diversity in GenBank: problems and possible solutions // Inoculum. Supplement to Mycologia (Newsletter of the Mycological Society of America). 2010. V.61. N.4. P.1-4.

54Vasilenko A., Ozerskaya S., Stupar O. Current WFCC CC catalogues as a starting ground for networking efforts // WFCC Newsletter. 2011. N.50. P.5-15.

55Ozerskaya S.M. Fungal diversity in Genbank. McGraw-Hill Yearbook of Science and Technology 2012. McGraw-Hill Professional, NY, 2012. P.99-103.

56Ozerskaya S.M., Ivanushkina N.E., Kochkina G.A., Eremina S.S., Vasilenko A.N., ChiginevaN.I. Long Term Preservation of Fungal Cultures in All-Russian Collection of Microorganisms (VKM): Protocols and Results / In: «Laboratory protocols in fungal biology: current methods in fungal biology» / Eds. Gupta V.K., Tuohy M., Manimaran A., Turner K.M., O’Donovan A.) Springer, New York , 2012 (In Press).

57Vasilenko A.N., Ozerskaya S.M. Fungal taxonomic diversity and bioinformatics-related issues / Proceedings of the 6th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE 2012). 2012. - NY. - IEEE Service Center. - P. 633-634.

58Ozerskaya S.M., Kirillova N.P., Vasilenko A.N. FungalDC: a database on fungal diversity in genetic resource collections // IMA Fungus. 2012. V.3. N.1. News. P.9.

Свидетельства о Государственной регистрации

1.Озерская С.М., Кочкина Г.А., Василенко А.Н., Максимова Л.А., Иванушкина Н.Е. FungalDC - Разнообразие грибов в коллекциях культур. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2010620603. Зарегистрировано в Реестре баз данных 13.10.2010.

2.Озерская С.М., Кочкина Г. А., Василенко А.Н., Чигинева Н.И., Иванушкина Н.Е., Карпышева Н.Н., Кириллова Н.П., Растегаева Т.Ф. База данных: Фонд мицелиальных грибов Всероссийской коллекции микроорганизмов ИБФМ РАН. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2011620277. Зарегистрировано в Реестре баз данных 14.04.2011.