Сёмин Борис Владимирович

1. Экспериментально доказано, что геном беспозвоночных населяют эндогенные ретровирусы, также как геном млекопитающих.
2. Обнаружен феномен межклеточного перемещения ретроэлементов от одной соматической клетки к другой и межвидовая передача эндогенных ретровирусов и ретротранспозонов. Показано, что такой перенос определен вирусоподобными частицами ретроэлементов. На модели культивируемых клеток разработана система, моделирующая  процесс межклеточных перемещений эндогенного ретровируса.
3. Процесс межклеточной передачи частиц ретротранспозонов не связан с геном env, несмотря на то, что классическая схема предусматривает необходимость гликопротеина Env для распространения ретровируса. Межклеточные перемещения частиц эндогенного ретровируса могут быть определены его структурным белком, т.е. обнаружен альтернативный путь распространения ретровируса, обеспечивающий его межвидовую передачу.
4. Ряд белков, кодируемых геномом клетки-хозяина, может использоваться структурными белками ретровируса  для выхода из клеток или проникновения в них. Определены несколько клеточных белков, взаимодействующих с Gag gypsy: убиквитин, SUMO и казеиновая киназа типа 2.
5. Gag gypsy способен образовывать вирусоподобные частицы в гетерологичной эукариотической системе экспрессии. Он самодостаточен для мультимеризации в глобулярные частицы без участия каких-либо факторов эукариотической клетки, поскольку, экспрессированный в бактериях, способен также образовывать частицы.
6. Нуклеокапсид существенно влияет на организацию частиц Gag gypsy, и эту функцию определяет последовательность аминокислотных остатков на его N-конце (проксимальная часть нуклеокапсида). Формирование частиц эффективно происходит в присутствии РНК или однонитевых олигонуклеотидов произвольной последовательности.

1. Gorelova T.V. Reverse transcription intermediates of mobile genetic elements in Drosophila melanogaster cells. / T.V. Gorelova, M. Sh. Kybaneishvili, B.V. Syomin, N.G. Schuppe // Acta Biologica Hungarica. - 1986. - Vol. 37. - P. 37-38.

2. Syomin B.V. Difference in intracellular localisation of retrotransposons reverse transcription intermediates / B.V. Syomin, N.G. Schuppe // Drosophila Information Service (DIS Journal). - 1988. - Vol. 66. - P. 139.

3. Syomin B.V. Intracellular distribution of sequences homologous to Drosophila retrotransposons changes with the age of culture / B.V. Syomin, N.G. Schuppe // Drosophila Information Service (DIS Journal). - 1988. - Vol.67. - P. 76.

4. Сёмин Б.В. Внутриклеточное распределение нуклеотидных последовательностей гомологичных мобильным диспергированным генам // Генетика. - 1989. - Т. 25.- №6. - C. 981-992.

5. Сёмин Б.В. Выявление ДНК-связывающих белков в препаратах вирусоподобных частиц Drosophila melanogaster / Б.В. Сёмин, К.В. Кандрор, А.В.Семакин, A.B., Цупрун В.Л., A.С. Степанов // Доклады Академии Наук СССР. - 1992. - Т. 322. - №1. - С. 166-169.

6. Цупрун В.Л. Савнительная характеристика вирусоподобных частиц, выделенных из среды культивирования клеток Drosophila melanogaster и Drosophila virilis // В.Л. Цупрун, Б.В. Сёмин, К.В. Кандрор, А.В.Семакин, A.С. Степанов // Цитология. - 1992. – Т. 34. - № 9. - С.118.

7. Syomin B.V. Presence of gypsy (mdg4) retrotransposon in the extracellular virus like particles / B.V. Syomin, K.V. Kandror, A.B. Semakin, V.L.Tsyprun, A.S. Stepanov // FEBS Letters. - 1993. - Vol.323. - N.3. - P. 285-288.

8. Сёмин Б.В. Исследование некоторых биохимических характеристик вирусоподобных частиц gypsy (МДГ4) / Б.В. Сёмин, К.В. Кандрор, А.В.Семакин В.Л. Цупрун, A.С. Степанов // Биохимия. - 1994. - Т,59. - №4. - C. 363-369.

9. Сёмин Б.В. Внутриклеточные вирусоподобные частицы ретротранспозона Gypsy (МДГ4) как фактор инфекционности / Б.В. Сёмин, Ю.В. Ильин // Доклады Академии Наук. - 1994. – Т.339. - № 6. - С. 838-841.

10. Рачинский A.З. Клонирование и экспрессия в E. coli GAG-подобного белка gypsy (мдг4) / A.З. Рачинский, О.А. Tyрапов, А.С. Степанов, Б.В. Сёмин, Ю.В. Ильин // Доклады Академии Наук. - 1997. - Т.357. - № 4. - С. 554–557.

11. Сёмин Б.В. Связывание с нуклеиновыми кислотами белка, кодируемого первой открытой рамкой считывания ретротранспозона gypsy (МДГ4) / Б.В.Сёмин, О.А. Tyрaпoв, А.С. Степанов и Ю.В. Ильин // Молекулярная биология. - 1999. – Т.33. - № 3. - С. 423-427.

12. Syomin B.V. Drosophila melanogaster endogenous retrovirus gypsy can propagate in Drosophila hydei cells / B.V. Syomin, L.I. Fedorova, S.A. Surkov, Y.V. Ilyin // Molecular and General Genetics. - 2001. - Vol. 264. - N. 5. - P. 588-594.

13. Маликова M.А. Фосфорилирование белка, кодируемого первой открытой рамкой считывания ретротранспозона gypsy гомологичной и гетерологичной казеиновыми киназами типа 2 / М.А. Маликова, Б.В. Сёмин Б, А.С. Степанов // Биохимия. - 2001. - Т.66. - № 2. - С. 254-260.

14. Сёмин Б.В. Экспрессированный в бактериальной системе полипротеин Gag ретроэлемента gypsy (МДГ4) способен формировать мультимерные комплексы / Б.В. Сёмин, В.И. Попенко, М.А. Маликова, O.A. Tурaпoв, A.С. Степанов, Ю.В. Ильин // Доклады Академии Наук. - 2001. - Т.380.- № 2. - С. 266-268.

15. Сёмин Б.В. Гомологичная и гетерологичная казеиновые киназы типа 2 одинаковым образом влияют на сродство структурного полипротеина Gag gypsy (МДГ4) к РНК / Б.В. Сёмин, М.А. Маликова, А.С. Степанов, Ю.В. Ильин // Молекулярная биология. - 2002.- Т.36. - № 1. - С. 40-42.

16. Сёмин Б.В. Ретротранспозон МДГ3 способен перемещаться между соматическими клетками неродственных видов при их совместном культивировании / Б.В. Сёмин, Т.Я. Леонова, Ю.В. Ильин // Молекулярная биология. - 2002. - Т.36. - N4. - С. 617-622.

17. Syomin B.V. Evidence for horizontal transfer of the LTR retrotransposon mdg3 that lacks an env-gene / B.V. Syomin, T. Leonova, Y.V. Ilyin // Molecular Genetics and Genomics. - 2002. - Vol. 267. - N. 3. - P. 418-423.

18. Сёмин Б.В. Эрантивирусы Drosophila / Б.В. Сёмин, Ю.В. Ильин // Генетика. - 2003. – Т.39. - № 5. - С. 657-663.

19. Сёмин Б.В. Распределение транскриптов ретротранспозона МДГ3 в культуре клеток / Б.В. Сёмин, Ю.В. Ильин // Молекулярная биология. - 2003. – Т. 37. - № 4. - С. 634-636.

20. Сёмин Б.В. Функциональные мотивы, выявляемые в аминокислотной последовательности Gag ретровируса Gypsy / Б.В. Сёмин, Ю.В. Ильин // Доклады Академии Наук. - 2004. – Т. 398. - № 3. - С. 419-421.

21. Сёмин Б.В., Pelisson A., Ильин Ю.В., Bucheton А. Экспрессия структурного белка Gag ретровируса gypsy рекомбинантным бакуловирусом в культуре клеток Spodoptera frugiperda / Б.В. Сёмин, А. Pelisson, Ю.В. Ильин, А. Bucheton // Доклады Академии Наук. - 2004. - Т.398. - № 5. - С. 702-704.

22. Сёмин Б.В. Многообразие ДКП ретротранспозонов и механизмы их участия в реорганизации генома / Б.В. Сёмин, Ю.В. Ильин // Генетика. - 2005. – Т. 41. - №4. - С. 542-548.

23. Сёмин Б.В. Детекция структурного белка (Gag) эндогенного ретровируса МДГ4 (gypsy) в культивируемых клетках / Б.В. Сёмин, Ю.В. Ильин // Доклады Академии Наук. - 2006. – Т. 408. - № 1. - С. 125-127.

24. Сёмин Б.В. Структуры, образуемые рекомбинантной формой белка Gag ретровируса Gypsy в бактериальных клетках / Б.В. Сёмин, Н.А. Казило, О.Г.Леонова Иванова Ю.Л., Ю.В. Ильин, В.И. Попенко // Доклады Академии Наук. - 2007. - Т. 417. - № 3. - С. 414-416.

25. Сёмин Б.В. Структурный белок Gag ретровируса D. melanogaster МДГ4 (gypsy) формирует вирусоподобные частицы в бактериальной клетке / Б.В.Сёмин, Л.А. Иванова, В.И. Попенко, Ю.В. Ильин // Молекулярная биология. - 2011. – Т. 45. - №3. - С. 517–523.

Патенты:

26. Пат. № 2282854 Российская Федерация, МПК G01N 33/49, Способ диагностики лейкоза крупного рогатого скота / Б.В. Сёмин, М.И. Гулюкин; заявитель и патентообладатель ГНУ ВИЭВ им. Я.Р.Коваленко.- №2004138714/15; заявл. 30.12.04; опубл. 27.08.06, Бюл. №24.-5с.

Тезисы докладов:

27. Syomin B.V. Virus-like particles and RNA-DNA complexes of mobile genetic elements in cultured cells of Drosophila / B.V. Syomin, T.V. Gorelova, M.Sh. Kybaneishvili, N.G. Schyppe // Abstracts of 3-th Soviet Union Symposium on Genetic of Somatic Cultured Cells. - Moscow. - 1986. - P. 42 -43.

28. Gorelova T.V. Reverse transcription intermediates of mobile genetic elements in Drosophila melanogaster cells / T.V. Gorelova, M.Sh. Kybaneishvili, B.V. Syomin, N.G. Schuppe // Abstracts of 2-d European Congress on Cell Biology. - 1986. - P.146.

29. Syomin B.V. Extrachromosomal nucleic acids of retrotransposones / B.V. Syomin, M.Sh. Kybaneishvili, N.G. Schuppe // Abstract of 6-th Soviet Union Symposium «Molecular mechanisms of genetical processes». - Moscow. - 1987. - P.43.

30. Syomin B.V. Intracellular distribution of nucleotide sequences of Drosophila retrotransposones. - Abstracts of 6-th Soviet Union Symposium on problems of biology and genetics of Drosophila. Odessa. - 1989. - P. 81.

31. Брауде-Золоторёва Т.Я. Совместное культивирование клеток Drosophila melanogaster и Drosophila virilis in vitro влечёт интеграцию нуклеотидных последовательностей, гомологичных ретротранспозонам Drosophila melanogaster в генои Drosophila virilis / Т.Я. Брауде-Золоторёва, Б.В. Сёмин // 4-й симпозиум по генетике культивируемых соматических клеток: Сб. науч. тр. - Москва-Звенигород. - 1989. - С.17.

32. Сёмин Б.В. Исследование специфичности РНК-белкового взаимодействия по первичным нуклеотидным и аминокислотным последовательностям ретротранспозонов / Б.В. Сёмин, Ж.А. Пак // Симпозиум «Теоретические и прикладные аспекты молекулярной биологии»: Сб. науч. тр. - Москва-Самарканд. - 1991. - С.173.

33. Syomin B.V. Experimental approach of LTR retrotransposons interspecific transfer / B.V. Syomin, L.I. Fedorova, S.A. Surkov, T.Ya. Leonova, Y.V. Ilyin // Abstract book of 42nd Annual Drosophila Research Conference. - March 21-25, 2001. - Washington DC. - USA. - 900C(A311)

34. Syomin B.V. Phosphorylation and interactions of a retrotransposon with the genome / B.V. Syomin, M.A. Malikova, O.A. Turapov, A.S. Stepanov, Y.V. Ilyin.// Abstract book of 42nd Annual Drosophila Research Conference. - March 21-25, 2001. - Washington DC. - USA. - 407B (A144)

35. Syomin B.V. Are functions of gypsy nucleocapsid (NC) protein regulated by cellular partners? / B.V. Syomin, A. Pelisson, Y.U. Ilyin, A. Bucheton // 4-th International Retroviral NC Symposium. - 2003, September. - Strasburg, France.- P.92.

36. Cёмин Б.В. Патогенный потенциал эндогенных ретровирусов животных определен их способностью к межвидовому горизонтальному переносу / Б.В. Cёмин, Ю.В. Ильин // Международная конференция «Развитие международного сотрудничества в области изучения инфекционных заболеваний»: Сб. науч. тр. - Новосибирск. - 2004. - С. 78-79.

41. Kazilo N. The Gag homologue of Drosophila retrovirus Gypsy assembles into spherical particles in E. coli / N. Kazilo, O. Leonova, M. Leyzerovich, V. Popenko, Yu. Ilyin, B. Syomin // 50-th Annual Drosophila Research Conference. - March 4-8, 2009. - Chicago, USA. - (1015A). - P.146.

38. Сёмин Б.В. Экспрессируемый в бактериальной клетке структурный белок (GAG) ретроэлемента MДГ4 формирует два различных типа структур / Б.В. Сёмин, О.Г. Леонова, В.И. Попенко, Ю.В. Ильин // XXIII Российская конференция по электронной микроскопии: Сб. науч. тр. - Черноголовка. - 2010 г. - С. 423.

39. Сёмин Б.В. Создание наночастицы для молекулярной терапии в ветеринарии. // Международная научно-практическая конференция «Актуальные проблемы инфекционных болезней молодняка и других возрастных групп сельскохозяйственных животных, рыб и пчел», посвящённой 50-летию со дня основания лаборатории лейкозологии, лаборатории ихтиопатологии и отдела охраны полезной энтомофауны: Сб. науч. тр. - М: ВИЭВ - С. 241-242.