1.Коршун В.А., Берлин Ю.А. Введение нерадиоактивных репортерных групп в синтетические олигонуклеотиды и их детекция. Биоорган. химия, 1994, 20, № 6, 565–616.
2.Коршун В.А., Манасова Е.В., Берлин Ю.А. Алкинилированные нуклеозиды и их аналоги. Биоорган. химия, 1997, 23, № 5, 324–387.
3.Прохоренко И.А., Коршун В.А., Берлин Ю.А. Резонансный перенос энергии флуоресценции в исследовании нуклеиновых кислот. Биоорган. химия, 1999, 25, № 11, 838–847.
4.Стеценко Д.А., Арзуманов А.А., Коршун В.А., Гейт М.Дж. Пептид-олигонуклеотидные конъюгаты как антисмысловые агенты нового поколения. Молекул. биология, 2000, 34, № 6, 998–1006.
5.Shchepinov M.S., Korshun V.A. Recent applications of bifunctional trityl groups. Chem. Soc. Rev., 2003, 32, No. 3, 170–180.
6.Устинов А.В., Степанова И.А., Дубнякова В.В., Зацепин Т.С., Ножевникова Е.В., Коршун В.А. Модификация нуклеиновых кислот с помощью реакции [3+2]-диполярного циклоприсоединения азидов и алкинов. Биоорган. химия, 2010, 36, № 4, 437–481.
Главы из книг:
7.Korshun V.A., Stetsenko D.A., Gait M.G. Uridine 2′-carbamates: facile tools for oligonucleotide 2′-functionalization. Curr. Protocols Nucl. Acid Chem., 2003, 4.21.1–4.21.26.
8.Prokhorenko I.A., Astakhova I.V., Momynaliev K.T., Zatsepin T.S., Korshun V.A. Phenylethynylpyrene excimer forming hybridization probes for fluorescence SNP detection. Meth. Mol. Biol., 2009, 578 (Single Nucleotide Polymorphisms. A.A. Komar (ed.)), 209–222.
9.Birikh K.R., Bernad P.L., Shmanai V.V., Malakhov A.D., Shchepinov M.S., Korshun V.A. SNP detection using trityl mass tags. Meth. Mol. Biol., 2009, 578 (Single Nucleotide Polymorphisms. A.A. Komar (ed.)), 345–361.
Статьи по ненуклеозидным реагентам для мечения олигонуклеотидов:
10.Prokhorenko I.A., Korshun V.A., Petrov A.V., Gontarev S.V., Berlin Y.A. Incorporation of a pyrene nucleoside analogue into synthetic oligodeoxynucleotides using a nucleoside-like synthon. Bioorg. Med. Chem. Lett., 1995, 5, No. 18, 2081–2084.
11.Korshun V.A., Pestov N.B., Nozhevnikova E.V., Prokhorenko I.A., Gontarev S.V., Berlin Y.A. Reagents for multiple non-radioactive labelling of oligonucleotides. Synth. Commun., 1996, 26, No. 13, 2531–2547.
12.Балакин К.В., Коршун В.А., Прохоренко И.А., Малеев Г.В., Куделина И.А., Гонтарев С.В., Берлин Ю.А. Новый реагент для мечения биомолекул – активированное производное пиренового бихромофора с эксимерной флуоресценцией. Биоорган. химия, 1997, 23, № 1, 33–41.
13.Korshun V.A., Prokhorenko I.A., Gontarev S.V., Skorobogatyi M.V., Balakin K.V., Manasova E.V., Malakhov A.D., Berlin Y.A. New pyrene derivatives for fluorescent labeling of oligonucleotides. Nucleosides & Nucleotides, 1997, 16, No. 7/9, 1461–1464.
14.Балакин К.В., Малахов А.Д., Коршун В.А., Берлин Ю.А. Метод синтеза олигонуклеотидов, меченных пиреном. Биоорган. химия, 1998, 24, № 5, 388–390.
15.Balakin K.V., Korshun V.A., Mikhalev I.I., Maleev G.V., Malakhov A.D., Prokhorenko I.A., Berlin Y.A. Conjugates of oligonucleotides with polyaromatic fluorophores as promising DNA probes. Biosensors & Bioelectronics, 1998, 13, No. 7/8, 771–778.
16.Balakin K.V., Korshun V.A., Esipov D.S., Mikhalev I.I., Berlin Y.A. Perylene-labeled oligonucleotide as a probe in homogeneous hybridization assay. Nucleosides & Nucleotides, 1999, 18, No. 6/7, 1279–1280.
17.Korshun V.A., Balakin K.V., Proskurina T.S., Mikhalev I.I., Malakhov A.D., Berlin Y.A. A pyrene seco-pseudonucleoside in constructing interaction-sensitive fluorescent DNA probes. Nucleosides & Nucleotides, 1999, 18, No. 11/12, 2661–2676.
18.Малахов А.Д., Прохоренко И.А., Кузницова С.В., Скоробогатый М.В., Коршун В.А., Берлин Ю.А. Синтез нового флуоресцентного псевдонуклеозида на основе 9,10-бисфенилэтинилантрацена и его введение в олигонуклеотиды. Биоорган. химия, 1999, 25, № 12, 933–937.
19.Shchepinov M.S., Korshun V.A., Egeland R.D., Southern E.M. Tritylisation of pyrene, perylene and coronene: a new family of switchable fluorescent labels. Tetrahedron Letters, 2000, 41, No. 25, 4943–4948.
20.Малахов А.Д., Коршун В.А., Берлин Ю.А. Синтез и флуоресцентные свойства олигонуклеотидов, содержащих новую флуоресцентную метку – п-(2-бензоксазолил)толан. Биоорган. химия, 2001, 27, № 6, 462–465.
21.Shchepinov M.S., Korshun V.A. Design of multidye systems for FRET-based applications. Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids, 2001, 20, No. 4/7, 369–374.
22.Dioubankova N.N., Malakhov A.D., Stetsenko D.A., Korshun V.A., Gait M.J. (R)-2,4-Dihydroxybutyramide seco-pseudonucleosides: new versatile homochiral synthons for synthesis of modified oligonucleotides. Org. Lett, 2002, 4, No. 26, 4607-4610.
23.Malakhov A.D., Skorobogatyi M.V., Prokhorenko I.A., Gontarev S.V., Kozhich D.T., Stetsenko D.A., Stepanova I.A., Shenkarev Z.O., Berlin Y.A., Korshun V.A. 1-Phenylethynylpyrene and 9,10-bis(phenylethynyl)anthracene, useful fluorescent dyes for DNA labeling: excimer formation and energy transfer. Eur. J. Org. Chem., 2004, No. 6, 1298-1307.
24.Дюбанкова Н.Н., Малахов А.Д., Стеценко Д.А., Коршун В.А. Детекция точечных мутаций с помощью ДНК-зондов, меченных пиреном. Изв. АН, Сер. хим., 2004, № 2, 443-449.
25.Bernad P.L., Jr, Khan S., Korshun V.A., Southern E.M., Shchepinov M.S. ВД-Pixyl protecting group as efficient mass-tag. Chem. Commun., 2005, No. 27, 3466-3468.
26.Khan S., Bernad P.L., Korshun V.A., Southern E.M., Shchepinov M.S. Synthesis of S-pixyl derivatives for mass spectrometric application. Synlett, 2005, No. 16, 2453-2456.
27.Квач МВ., Гонтарев СВ., Прохоренко И.А., Степанова И.А., Шманай В.В., Коршун В.А. Простой реагент для синтеза олигонуклеотидов, меченных 3,3,3´,3´-тетраметил-2,2´-индиодикарбоцианином. Изв. АН, Сер. хим., 2006, № 1, 154-158.
28.Dioubankova N.N., Malakhov A.D., Stetsenko D.A., Gait M.J., Korshun V.A. Phosphoramidites and solid supports based on TV-substituted 2,4-dihydroxybutyramides: universal reagents for synthesis of modified oligonucleotides. Tetrahedron, 2006, 62, No. 29, 6762-6773.
29.Устинов А.В., Коршун В.А. Олигонуклеотиды, содержащие остатки арилацетилена: синтез и постсинтетическая модификация с помощью 1,3-диполярного циклоприсоединения. Изв. АН, Сер. хим., 2006, № 7, 1220-1226.
30.Prokhorenko I.A., Malakhov A.D., Kozlova A.A., Momynaliev K., Govorun V.M., Korshun V.A. Phenylethynylpyrene-labeled oligonucleotide probes for excimer fluorescence SNP-analysis of 23S rRNA gene in clarithromycin-resistant Helicobacter pylori strains. Mutation Res., 2006, J99, No. 1/2, 144-151.
31.Kvach M.V., Tsybulsky D.A., Ustinov A.V., Stepanova I.A., Bondarev S.L., Gontarev S.V., Korshun V.A., Shmanai V.V. 5(6)-Carboxyfluorescein revisited: new protecting group, separation of isomers, and their spectral properties on oligonucleotides. Bioconjugate Chem., 2007, 18, No. 5, 1691-1696.
32.Ustinov A.V., Dubnyakova V.V., Korshun V.A. Perylene diimide-oligonucleotide conjugates constructed by click chemistry. Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids, 2007, 26, No. 6/7, 751-754.
33.Kvach M.V., Prokhorenko I.A., Ustinov A.V., Gontarev S.V., Shmanai V.V., Korshun V.A. Reagents for the selective immobilization of oligonucleotides on solid supports. Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids, 2007, 26, No. 6/7, 809-813.
33. Ustinov A.V., Dubnyakova V.V., Korshun V.A. A convenient „click chemistry‟ approach to perylene diimide-oligonucleotide conjugates. Tetrahedron, 2008, 64, No. 7, 1467-1473.
35.Kvach M.V., Ustinov A.V., Stepanova I.A., Malakhov A.D., Skorobogatyi M.V., Shmanai V.V., Korshun V.A. Convenient synthesis of cyanine dyes: reagents for labeling of biomolecules. Eur. J. Org. Chem., 2008, No. 12, 2107-2117.
36.Filichev V.V., Astakhova I.V., Malakhov A.D., Korshun V.A., Pedersen E.B. DNA glue: 1-, 2- and 4-ethynylpyrenes in the structure of twisted intercalating nucleic acids (TINAs), DNA duplexes/triplexes and interstrand excimer formation. Nucl. Acids Symp. Ser., 2008, No. 52, 347-348.
37.Filichev V.V., Astakhova I.V., Malakhov A.D., Korshun V.A., Pedersen E.B. 1-, 2-, and 4-Ethynylpyrenes in the structure of twisted intercalating nucleic acids: structure, thermal stability, and fluorescence relationship. Chem. Eur. J., 2008, 14, No. 32, 9968-9980.
38.Birikh K.R., Korshun V.A., Bernad P.L., Malakhov A.D., Milner N., Khan S., Southern E.M., Shchepinov M.S. Novel mass tags for single nucleotide polymorphism detection. Anal. Chem., 2008, 80, No. 7, 2342-2350.
39.Ustinov A.V., Shmanai V.V., Patel K., Stepanova I.A., Prokhorenko I.A., Astakhova I.V., Malakhov A.D., Skorobogatyi M.V., Bernad P.L., Jr, Khan S., Shahgholi M., Southern E.M., Korshun V.A., Shchepinov M.S. Reactive trityl derivatives: stabilised carbocation mass-tags for life sciences applications. Org. Biomol. Chem., 2008, 6, No. 24, 4593-4608.
40.Kvach M.V., Stepanova I.A., Prokhorenko I.A., Stupak A.P., Bolibrukh D.A., Korshun V.A., Shmanai V.V. Practical synthesis of isomerically pure 5- and 6-carboxytetramethylrhodamines, useful dyes for DNA probes. Bioconjugate Chem., 2009, 20, No. 8, 1673-1682.
Статьи по сахар-модифицированным производным пиримидиновых нуклеозидов и их флуоресценции в составе ДНК:
41.Korshun V.A., Stetsenko D.A., Gait Mi. Novel uridin-2´-yl carbamates: synthesis, incorporation into oligodeoxyribonucleotides, and remarkable fluorescence properties of 2´-pyren-l-ylmethylcarbamate. J. Chem. Soc, Perkin Trans. 1, 2002, No. 8, 1092-1104.
42.Dioubankova N.N., Malakhov A.D., Stetsenko D.A., Gait M.J., Volynsky P.E., Efremov R.G., Korshun V.A. Pyrenemethyl ara-uridine-2´-carbamate: a strong interstrand excimer in the major groove of a DNA duplex. ChemBioChem, 2003, 4, No. 9, 841-847.
43.Prokhorenko I.A., Dioubankova N.N., Korshun V.A. Oligonucleotide conjugates of Nile Red. Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids, 2004, 23, No. 1/2, 509-520.
44.Dioubankova N.N., Malakhov A.D., Shenkarev Z.O., Korshun V.A. Oligonucleotides containing new fluorescent 1 -phenylethynylpyrene and 9,10-bis(phenylethynyl)anthracene uridine-2´-carbamates: synthesis and properties. Tetrahedron, 2004, 60, No. 21, 4617-4626.
45.Astakhova I.V., Malakhov A.D., Stepanova I.A., Ustinov A.V., Bondarev S.L., Paramonov A.S., Korshun V.A. 1-Phenylethynylpyrene (1-PEPy) as refined excimer forming alternative to pyrene: case of DNA major groove excimer. Bioconjugate Chem., 2007, 18, No. 6, 1972-1980.
46.Lindegaard D., Madsen A.S., Astakhova I.A., Malakhov A.D., Babu B.R., Korshun V.A., Wengel J. Pyrene-perylene as a FRET pair coupled to the N2´-functionality of 2´-amino-LNA. Bioorg. Med. Chem., 2008, 16, No. 1, 94-99.
47.Астахова И.В., Коршун В.А. 2- и 4-Фенилэтинилпирены - новые флуоресцентные метки для ДНК. Биоорган. химия, 2008, 34, № 4, 570-572.
48.Astakhova I.V., Korshun V.A., Wengel J. Novel long-wave emission fluorochrome based upon perylen-3-ylcarbonyl-functionalized 2´-amino-LNA. Collections Symp. Ser., 2008, 10, 307-308.
49.Astakhova I.V., Korshun V.A., Wengel J. (Phenylethynyl)pyrenes attached to 2´-amino-LNA: novel fluorescent dyes with the advantages of long-wave emission, high fluorescence quantum yields and excimer formation. Collections Symp. Ser., 2008, 10, 491-495.
50.Astakhova I.V., Korshun V.A., Jahn K., Kjems J., Wengel J. Perylene attached to 2´-amino-LNA: synthesis, incorporation into oligonucleotides, and remarkable fluorescence properties in vitro and in cell culture. Bioconjugate Chem., 2008, 19, No. 10, 1995-2007.
51.Astakhova I.V., Korshun V.A., Wengel J. Highly fluorescent conjugated pyrenes in nucleic acid probes: (phenylethynyl)pyrenecarbonyl-functionalized locked nucleic acids. Chem. Eur. J., 2008, 14, No. 35, 11010-11026.
52.Astakhova I.V., Lindegaard D., Korshun V.A., Wengel J. Novel interstrand communication systems within DNA duplexes based on 1-, 2- and 4-(phenylethynyl)pyrenes attached to 2´-amino-LNA: high-affinity hybridization and fluorescence sensing. Chem. Commun., 2010, 46, No. 44, 8362-8364.
53.Astakhova I.V., Ustinov A.V., Korshun V.A., Wengel J. LNA for optimization of fluorescent oligonucleotide probes: improved spectral properties and target binding. Bioconjugate Chem., 2011, 22, No. 40, 533-539.
Статьи по 5-алкинильным производным 2′-дезоксиуридинов, их противовирусным свойствам и флуоресценции в составе ДНК:
54.Коршун В.А., Манасова Е.В., Балакин К.В., Прохоренко И.А., Бучацкий А Г., Берлин Ю.А. 5-(1-Пиренилэтинил)-2´-дезоксиуридин, новое флуоресцентное нуклеозидное производное. Биоорган. химия, 1996, 22, № 12, 923-925.
55.Korshun V.A., Manasova E.V., Balakin K.V., Malakhov A.D., Perepelov A.V., Sokolova T.A., Berlin Y.A. New fluorescent nucleoside derivatives - 5-alkynylated 2´-deoxyuridines. Nucleosides & Nucleotides, 1998, 77, No. 9/11, 1809-1812.
56.Малахова Е.В., Малахов А.Д., Кузницова СВ., Варнавский О.П., Кадуцкий А.П., Кожин Д.Т., Коршун В.А., Берлин Ю.А. Реагенты для введения в олигонуклеотиды флуоресцентного 2-фенилбензоксазольного производного дезоксиуридина. Биоорган. химия, 1998, 24, № 9, 688-695.
57.Малахов А.Д., Малахова Е.В., Кузницова СВ., Гречишникова И.В., Прохоренко И.А., Скоробогатый МБ., Коршун В.А., Берлин Ю.А. Синтез и флуоресцентные свойства 5-(1-пиренилэтинил)-2´-дезоксиуридинсодержащих олигонуклеотидов. Биоорган. химия, 2000, 26, № 1, 39-50.
58.Андронова В.Л., Скоробогатый МБ., Манасова Е.В., Берлин Ю.А., Коршун В.А., Галегов Г.А. Противовирусная активность некоторых 5-арилэтинильных производных 2´-дезоксиуридина. Биоорган. химия, 2003, 29, № 3, 289-294.
59.Pchelintseva A.A., Skorobogatyj M.V., Petrunina A.L., Andronova V.L., Galegov G.A., Astakhova I.V., Ustinov A.V., Malakhov A.D., Korshun V.A. Synthesis and evaluation of anti-HSV activity of new 5-alkynyl-2´-deoxyuridines. Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids, 2005, 24, No. 5/7, 923-926.
60.Skorobogatyj M.V., Pchelintseva A.A., Ustinov A.V., Korshun V.A., Malakhov A.D. Perylene attached to DNA through stiff or flexible linker: duplex stability and FRET. Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids, 2005, 24, No. 5/7, 931-934.
61.Андронова В.Л., Пчелинцева А.А., Устинов А.В., Петрунина А.Л., Коршун В.А., Скоробогатый МБ., Галегов Г.А. Противогерпетическая активность 5-алкинильных производных 2´-дезоксиуридина. Вопросы вирусологии, 2006, № 1, 34-38.
62.Skorobogatyi M.V., Kvach M.V., Zhylinskaya M.A., Yarmolinsky D.G., Korshun V.A., Shmanai V.V. 5-Arylethynyl-2´-deoxyuridines: energy transfer and SNP-detection. Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids, 2007, 26, No. 6/7, 767-772.
63.Skorobogatyi M.V., Pchelintseva A.A., Petrunina A.L., Stepanova I.A., Andronova V.L., Galegov G.A., Malakhov A.D., Korshun V.A. 5-Alkynyl-2´-deoxyuridines, containing bulky aryl groups: evaluation of structure-anti-HSV-1 activity relationship. Tetrahedron, 2006, 62, No. 6, 1279-1287.
64.Skorobogatyi M.V., Ustinov A.V., Stepanova I.A., Pchelintseva A.A., Petrunina A.L., Andronova V.L., Galegov G.A., Malakhov A.D., Korshun V.A. 5-Arylethynyl-2´-deoxyuridines, compounds active against HSV-1. Org. Biomol. Chem., 2006, 4, No. 6, 1091-1096.
65.Skorobogatyi M.V., Malakhov A.D., Pchelintseva A.A., Turban A.A., Bondarev S.L., Korshun V.A. Fluorescent 5-alkynyl-2´-deoxyuridines: high emission efficiency of a conjugated perylene nucleoside in a DNA duplex. ChemBioChem, 2006, 7, No. 5, 810-816.
66.St.Vincent M.R., Colpitts C.C., Ustinov A.V., Muqadas M., Joyce M.A., Barsby N.L., Epand R.F., Epand R.M., Khramyshev S.A., Valueva O.A., Korshun V.A., Tyrrell D.L.J., Schang L.M. Rigid amphipathic fusion inhibitors, small molecule antiviral compounds against enveloped viruses. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2010, 707, No. 40, 17339-17344 (2010).
ТЕЗИСЫ КОНФЕРЕНЦИЙ И СИМПОЗИУМОВ
1.Prokhorenko LA., Korshun V.A., Gontarev S.V., Malakhov A.D., Berlin Y.A. Nile red, a dye for efficient oligonucleotide labelling. Third International Symposium on Bioorganic Chemistry. Abstracts. Dagomys, Russia, 1995, 100.
2.Korshun V.A., Prokhorenko LA, Gontarev S.V., Skorobogatyi M.V., Balakin K.V., Manasova E.V., Malakhov A.D., Berlin Y.A. New pyrene derivatives for fluorescent labeling of oligonucleotides. XII International Roundtable “Nucleosides, Nucleotides and their Biological Applications”. Abstracts. La Jolla, CA, USA, 1996, 158.
3.Коршун В.А., Малахов А.Д., Гонтарев СВ., Прохоренко И.А., Берлин Ю.А. Носитель для автоматизированного синтеза олигонуклеотидов, меченных порфирином по 3´-концевому фосфату. Юбилейная научная сессия, посвященная 100-летию со дня рождения профессора НА. Преображенского. Тезисы докладов. Москва, 1996, 94-95.
4.Прохоренко И.А., Балакин К.В., Малеев Г.В., Коршун В.А., Берлин Ю.А. Новое активированное производное пиренового бифлуорофора - синтез и использование для введения в олигонуклеотиды метки с эксимерной флуоресценцией. Юбилейная научная сессия, посвященная 100-летию со дня рождения профессора НА. Преображенского. Тезисы докладов. Москва, 1996, 96-97.
5.Коршун В.А., Манасова Е.В., Малахов А.Д., Балакин К.В., Берлин Ю.А. Синтез новых производных пирена для мечения олигонуклеотидов. Юбилейная научная сессия, посвященная 100-летию со дня рождения профессора Н.А. Преображенского. Тезисы докладов. Москва, 1996, 98-99.
6.Korshun V.A., Manasova E.V., Balakin K.V., Malakhov A.D., Berlin Y.A. New fuorescent nucleoside derivatives - 5-alkynylated 2´-deoxyuridines. International Conference “Nucleic Acids and Related Macromolecules: Synthesis, Structure, Function and Applications”. Abstracts. Ulm, Germany, 1997, P61.
7.Манасова Е.В., Коршун В.А., Кадуцкий А.П., Кожич Д.Т. Нуклеозидные производные 2-фенилбензоксазола. Украшська конференщя “Х1м1я азотвмюних гетероцшшв”. Тези доповадей. Харшв, 1997, 152.
8.Korshun V.A., Berlin Y.A. Fluorescent labels in nucleic acids research. XIII International Round Table “Nucleosides, Nucleotides and their Biological Applications”. Abstracts. Montpellier, France, 1998, Poster 232.
9.Коршун В.А., Балакин К.В., Берлин Ю.А. Флуоресцентные метки в структурных исследованиях нуклеиновых кислот. XVI Менделеевский съезд по общей и прикладной химии. Рефераты докладов и сообщений № 4: Химия живого. Москва, 1998, 84-85.
10.Коршун В.А., Берлин Ю.А. Флуоресцентные метки в исследовании нуклеиновых кислот. IV Чтения, посвященные памяти академика Ю.А. Овчинникова. Тезисы докладов. Москва-Пущино, 1998, 34.
11.Balakin K.V., Korshun V.A., Perepelov A.V., Berlin Y.A. New fluorescent DNA probes. The Fifth World Congress on Biosensors. Abstracts. Berlin, Germany, 1998, 108.
12.Malakhov A.D., Kozhich D.T., Gontarev S.V., Malakhova E.V., Grechishnikova I.V., Skorobogatyi M.V., Prokhorenko I.A., Stetsenko D.S., Korshun V.A., Berlin Y.A. 1-(Phenylethynyl)pyrene and 9,10-bis(phenylethynyl)anthracene, useful luminescent dyes for DNA labeling. 11th European Symposium on Organic Chemistry. Abstracts. Gцteborg, Sweden, 1999, P88.
13.Малахов А.Д., Малахова Е.В., Коршун В.А., Берлин Ю.А. Олигонуклеотиды, содержащие бензоксазолилтолановые и пиренилэтинилфенильные псевдонуклеозидные звенья в качестве донора и акцептора энергии флуоресценции. Школа-конференция «Горизонты физико-химической биологии». Том 1. Тезисы стендовых сообщений. Пущино, 2000, 92-93.
14.Prokhorenko I.A., Kuznitsova S.V., Korshun V.A. A new fluorescent nucleoside analogue for synthesis of oligonucleotide probes. International Conference “Trends in Nucleic Acid Chemistry”. Abstracts. Moscow, Russia, 2000, 10.
15.Malakhov A.D., Prokhorenko I.A., Skorobogatyi M.V., Korshun V.A. 1-(Phenylethynyl)pyrene and 9,10-bis(phenylethynyl)anthracene as useful luminescent dyes for DNA study. International Conference “Trends in Nucleic Acid Chemistry”. Abstracts. Moscow, Russia, 2000, 18.
16.Малахов А.Д., Коршун В.А., Берлин Ю.А. 9,10-Бис(фенилэтинил)антрацен и 1-(фенилэтинил)пирен в качестве донора и акцептора энергии флуоресценции в изучении нуклеиновых кислот. V Чтения, посвященные памяти академика Ю.А. Овчинникова «Биоорганика-2000». Тезисы докладов. Москва-Пущино, 2000, 25.
17.Malakhov A.D., Korshun V.A., Berlin Y.A. Fluorescent oligonucleotide probes based on 9,10-bis(phenylethynyl)anthracene, 1-phenylethynylpyrene, and p-(2-benzoxazolyl)tolane: synthesis and functioning. 7th Conference on Methods and Applications of Fluorescence. Abstracts. Amsterdam, Netherlands, 2001, P126.
18.Малахов А.Д., Прохоренко И.А., Скоробогатый М.В., Дюбанкова Н.Н., Коршун В.А. Синтез флуоресцентных нуклеозидов и их аналогов в качестве инструментов исследования нуклеиновых кислот. Конференция “От современной фундаментальной биологии к новым наукоемким технологиям”. Труды. Пущино, 2001, 75.
19.Дюбанкова Н.Н., Скоробогатый М.В., Пчелинцева А.А., Степанова И.А., Прохоренко И.А., Виноградова Л.А., Малахов А.Д., Берлин Ю.А., Коршун В.А. Модифицированные нуклеозиды и псевдонуклеозиды в синтезе люминесцентных производных олигонуклеотидов. VI Чтения, посвященные памяти академика Ю.А. Овчинникова. Тезисы докладов. Москва-Пущино, 2002, 24.
20.Скоробогатый М.В., Пчелинцева А.А, Манасова Е.В., Андронова В.Л., Галегов Г.А, Коршун В.А. 5-Арилэтинил-2′-дезоксиуридины - новый класс противовирусных нуклеозидов. XV Зимняя международная молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2003, 10.
Дюбанкова Н.Н., Малахов А.Д., Коршун В.А. Новый пиреновый амидофосфит на основе арабиноуридина. XV Зимняя международная молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2003, 34.
Дюбанкова Н.Н., Малахов А.Д., Стеценко Д.А., Гейт М.Дж, Коршун В.А. Новые пиреновые гомохиральне секо-псевдонуклеозиды. XV Зимняя международная молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2003, 35.
Пчелинцева А.А., Скоробогатый М.В., Прохоренко И.А., Коршун В.А. Метод мечения олигонуклеотидов периленовым флуорофором. XV Зимняя международная молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2003, 36.
24.Дюбанкова Н.Н., Малахов А.Д., Прохоренко И.А., Коршун В.А. Флуоресцентные нуклеозид-2´-карбаматы. XVII Менделеевский съезд по общей и прикладной химии. Тезисы докладов. Секция А: Достижения и перспективы химической науки. Казань, 2003, 295.
25.Dioubankova N.N., Malakhov A.D., Stetsenko D.A., Gait M.J., Korshun V.A. ara-Uridine-2′-carbamates: new reagents for introduction of functional groups into the major groove of a DNA duplex. 5th Cambridge Symposium “Nucleic Acids Chemistry & Biology”. Abstracts. Cambridge, UK, 2003, P16.
26. Dioubankova N.N., Malakhov A.D., Stetsenko D.A., Gait M.J., Korshun V.A. Fluorescent uridine-2′-carbamate derivatives for DNA labeling. 5th Cambridge Symposium “Nucleic Acids Chemistry & Biology”. Abstracts. Cambridge, UK, 2003, P17.
Dioubankova N.N., Malakhov A.D., Korshun V.A., Stetsenko D.A., Gait MJ. Versatile homochiral non-nucleoside reagents for oligonucleotide modification. 5th Cambridge Symposium “Nucleic Acids Chemistry & Biology”. Abstracts. Cambridge, UK, 2003, P54.
Prokhorenko I.A., Dioubankova N.N., Korshun V.A. Nile Red - far-visible fluorescent dye on nucleic acids. 5th Cambridge Symposium “Nucleic Acids Chemistry & Biology”. Abstracts. Cambridge, UK, 2003, P78.
Dioubankova N.N., Malakhov A.D., Stetsenko D.A., Korshun V.A., Gait MJ. Non-nucleoside reagents for incorporation of catalytically active groups into oligonucleotides. International Conference "Targeting RNA: Artificial Ribonucleases, Conformational Traps and RNA Interference". Abstracts. Novosibirsk, Russia, 2003, 23.
Andronova V., Skorobogaty M., Berlin Y., Korshun V., Galegov A. Antiherpetic activity of some 5-arylethynyl derivatives of 2´-deoxyuridine in Vero cells. The Sixteenth International Conference on Antiviral Research. Savannah, Georgia, USA, 2003. Antivir. Res., 2003, 57, A62.
Dioubankova N.N., Stetsenko D.A., Malakhov A.D., Korshun V.A., Gait MJ. Pyrene on acyclic scaffold as a universal nucleotide: neither hydrogen bonds nor ribose moiety are needed. 6th International Meeting on Recognition Studies in Nucleic Acids, NACON VI. Abstracts. Sheffield, UK, 2004, 51.
32.Петрунина А.Л., Пчелинцева А.А., Коршун В.А., Малахов А.Д., Скоробогатый М.В. Синтез новых 5-замещенных 2′-дезоксиуридинов, потенциальных противовирусных нуклеозидов. XVI Зимняя молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2004, 6.
33.Астахова И.В., Устинов А.В., Петрунина А.Л., Малахов А.Д., Коршун В.А., Скоробогатый М.В. Необычные 5-арилэтинил-2′-дезоксиуридины. XVI Зимняя молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2004, 46.
34.Дюбанкова Н.Н., Малахов А.Д., Коршун В.А. Пиреновый эксимер для детекции точечных мутаций. XVI Зимняя молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2004, 48.
35.Козлова А.А., Малахов А.Д., Момыналиев К.Т., Прохоренко И.А., Коршун В.А. Применение 1-фенилэтинилпиренового псевдонуклеозида для конструирования эксимеробразующих ДНК-зондов. XVI Зимняя молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2004, 50.
36.Ustinov A.V., Petrunina A.L., Pchelintseva A.A., Astakhova I.V., Stepanova I.A., Malakhov A.D., Andronova V.L., Galegov G.A., Korshun V.A., Skorobogatyj M.V. 2′-Deoxyuridines with bulky 5-substituents as potential anti-HSV compounds. XVI International Roundtable of International Society for Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids. Program and Abstracts. Minneapolis, MN, USA, 2004, 172.
37.Skorobogatyj M.V., Pchelintseva A.A., Ustinov A.V., Korshun V.A., Malakhov A.D. Dye-dye and dye-DNA interactions in modified duplexes. XVI International Roundtable of International Society for Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids. Program and Abstracts. Minneapolis, MN, USA, 2004, 173.
38.Пчелинцева А.А., Устинов А.В., Скоробогатый М.В., Петрунина А.Л., Андронова В.Л., Галегов Г.А., Коршун В.А. Связь структуры и биологической активности: новые антивирусные соединения в ряду 5-арилэтинил-2′-дезоксиуридинов. XVII Зимняя молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2005, 61.
39.Устинов А.В., Астахова И.В., Квач М.В., Шманай В.В., Стеценко Д.А., Дюбанкова Н.Н., Коршун В.А., Малахов А.Д. Молекулярный конструктор: расширение возможностей нанотехнологии нуклеиновых кислот. XVII Зимняя молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2005, 64.
40.Astakhova I.V., Malakhov A.D., Ustinov A.V., Dioubankova N.N., Korshun V.A. Excimer forming 1-, 2- and 4-phenylethynylpyrenes as fluorescent labels for DNA major groove. Nucleic Acid Chemical Biology (NACB) PhD Summer School "Novel Synthetic Nucleic Acids and the Targeting of Biologically Important RNAs". Abstracts. Odense, Denmark, 2005, P-05.
41.Астахова И.В., Малахов А.Д., Коршун В.А. Эксимер 1-фенилэтинилпирена в большой бороздке ДНК. XVIII Зимняя молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2006, 56-57.
42.Устинов А.В., Квач М.В., Шманай В.В., Коршун В.А. Модифицированные олигонуклеотиды, содержащие этинильную группу: синтез и реакция 1,3-диполярного циклоприсоединения к азидам. XVIII Зимняя молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2006, 63.
43.Ustinov A., Dubnyakova V., Korshun V. Click chemistry on DNA: a versatile tool for nanotechnology and photonics. XVII International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids. Conference Book. Bern, Switzerland, 2006, 103.
44.Skorobogatyi M., Kvach M., Zhilinskaya M., Yarmolinsky D., Korshun V., Shmanai V. Through-stack energy transfer for SNP detection. XVII International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids. Conference Book. Bern, Switzerland, 2006, 121.
45.Kvach M., Prokhorenko I., Ustinov A., Gontarev S., Korshun V., Shmanai V. Reagents for selective conjugation of oligonucleotides. XVII International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids. Conference Book. Bern, Switzerland, 2006, 137.
46.Valueva O., Korkach S., Astakhova I., Stepanova I., Korshun V., Ustinov A. 5-Arylethynyl derivatives of 2′-deoxyuridine and arabino-uridine: synthesis and antiviral evaluation. The Nineteenth International Conference on Antiviral Research. San Juan, Puerto Rico, 2006. Antivir. Res., 2006, 70, A68.
47.Астахова И.В., Устинов А.В., Бондарев С.Л., Турбан А.А., Малахов А.Д., Коршун В.А. Фенилэтинилпирены как эксимеробразующие флуоресцентные метки для ДНК. Международная конференция “Физико-химическая биология”, посвященная 80-летию академика Д.Г. Кнорре. Сборник трудов. Новосибирск, 2006, 121.
48.Устинов А.В., Квач М.В., Дубнякова В.В., Прохоренко И.А., Шманай В.В., Коршун В.А. Реакция 1,3-диполярного циклоприсоединения в синтезе модифицированных олигонуклеотидов и ДНК-наноструктур. Международная конференция “Физико-химическая биология”, посвященная 80-летию академика Д.Г. Кнорре. Сборник трудов. Новосибирск, 2006, 177.
49.Dubnyakova V.V., Ustinov A.V., Korshun V.A. Branching and joining by click chemistry: where bioconjugation meets nanotechnology. Nucleic Acid Chemical Biology (NACB) PhD Summer School "Novel Synthetic Nucleic Acids and the Targeting of Biologically Important RNAs". Abstracts. Odense, Denmark, 2007, P-17.
50.Madsen A.S., Lindegaard D., Astakhova I.V., Malakhov A.D., Babu B.R., Korshun V.A., Wengel J. Pyrene-perylene as a FRET pair coupled to the N2′-amino-LNA. Nucleic Acid Chemical Biology (NACB) PhD Summer School "Novel Synthetic Nucleic Acids and the Targeting of Biologically Important RNAs". Abstracts. Odense, Denmark, 2007, P-45.
51.Korkach S.V., Valueva O.A., Doubniakova V.V., Korshun V.A., Ustinov A.V. Pyrimidine nucleosides containing 5-substituent: synthesis and antiviral activity. The Twentieth International Conference on Antiviral Research. Palm Springs, CA, USA, 2007. Antivir. Res., 2007, 74, No. 3, A73.
52.St. Vincent M., Korkach S., Valueva O., Korshun V., Ustinov A., Sсhang L. Nucleoside fusion inhibitors. The Twentieth International Conference on Antiviral Research. Palm Springs, CA, USA, 2007. Antivir. Res., 2007, 74, No. 3, A87.
53.Astakhova I.V., Zatsepin T.S., Korshun V.A. Modified oligonucleotides with phenylethynylpyrenes as fluorescent probes. 3rd Annual Meeting of the Oligonucleotide Therapeutic Society. Abstracts. Berlin, Germany, 2007, 269–270.
54.Astakhova I.V., Malakhov A.D., Korshun V.A. (Phenylethynyl)pyrenes as fluorescent probes for DNA. Trжf for Organisk Kemi Studerende (TOKS) IX. Copenhagen‟s Lyngby, Denmark, 2007, P-13.
55.Astakhova I., Malakhov A., Ustinov A., Bondarev S., Korshun V., Wengel J. Novel multilabeled oligonucleotides containing 1-phenylethynylpyrene ara-2′-uridine-carbamate and LNA: synthesis and photochemical properties. International Symposium on Advances in Synthetic and Medicinal Chemistry (ASMC 07). St. Petersburg, Russia, 2007, T29.
56.Madsen A., Lindegaard D., Astakhova I.V., Malakhov A.D., Babu B.R., Korshun V.A., Wengel J. Pyrene-perylene as a FRET pair coupled to the N2′-functionality of 2′-amino-LNA. 234th ACS National Meeting. Abstracts. Boston, MA, United States, 2007, 336.
57.Дубнякова В.В., Устинов А.В., Коршун В.А. Самосборка биоконъюгатов органических азидов с ДНК с образованием наноструктур. XX Зимняя международная молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2008, 86.
58.Храмышев С.А., Шанг Л.М., Коршун В.А., Устинов А.В. Противовирусные нуклеозиды с ненуклеозидным механизмом действия: ингибирование слияния оболочки вириона и клеточной мембраны. XX Зимняя международная молодежная научная школа “Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии”. Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 2008, 93.
59.Квач М.В., Устинов А.В., Цыбульский Д.А., Коршун В.А., Шманай В.В. Флуоресцентные реагенты для мечения биополимеров. IV Съезд Российского общества биохимиков и молекулярных биологов. Тезисы докладов. Новосибирск, 2008, 482 (с. 277).
60.Устинов А.В., Дубнякова В.В., Квач М.В., Шманай В.В., Коршун В.А. Модифицировать или не модифицировать? ДНК-наноструктуры, содержащие необычные точки разветвления. IV Съезд Российского общества биохимиков и молекулярных биологов. Тезисы докладов. Новосибирск, 2008, 544 (с. 312).
61.Khramyshev S., Valueva O., Korshun V., Ustinov A. Synthesis of structural analogues of dUY11, a potent amphipathic fusion inhibitor nucleoside. The Twenty-First International Conference on Antiviral Research. Montreal, Quebec, Canada, 2008. Antivir. Res., 2008, 78, No. 2, A42.
62.St. Vincent M., Korshun V., Ustinov A., Sсhang L. Herpes simplex virus type 2 exposed to rigid amphipathic fusion inhibitors (RAFIs) are not infectious in a mouse vaginal model. The Twenty-First International Conference on Antiviral Research. Montreal, Quebec, Canada, 2008. Antivir. Res., 2008, 78, No. 2, A64–A65.
63.Устинов А.В., Дубнякова В.В., Коршун В.А. Синтез и гибридизация ДНК-структур, получаемых конъюгацией алкинилированных олигонуклеотидов с органическими полиазидами. Конференция «Химическая биология – фундаментальные проблемы бионанотехнологии». Сборник трудов. Новосибирск, 2009, 56.
64.St. Vincent M., Ustinov A., Barsby N., Joyce M., Tyrrell L., Epand R., Korshun V., Sсhang L. dUY11, a rigid amphipathic fusion inhibitor, inhibits HCV infectivity by modulating membrane curvature. The Twenty-Second International Conference on Antiviral Research. Miami Beach, Florida, USA, 2009. Antivir. Res., 2009, 82, No. 3, A21.
65.Astakhova I.V., Korshun V.A., Wengel J. SNP analysis of HIV protease RNA at drug resistance site 2332-2354 using short fluorescent DNA/LNA probes. XIX International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids. Conference Book. Lyon, France, 2010, 605–606.
66.Colpitts C.C., Ustinov A.V., Korshun V.A., Sсhang L.M. Rigid amphipathic fusion inhibitors (RAFIs) inhibit infectivity of enveloped viruses by targeting envelope lipids to prevent fusion with cellular membranes. The Twenty-Fourth International Conference on Antiviral Research. Sofia, Bulgaria, 2011. Antivir. Res., 2011, 90, No. 2, A30–A31.