- В работе было впервые проведено детальное ультраструктурное исследование динамики формирования высших уровней компактизации хромосом млекопитающих в профазе митоза. Обнаружено, что митотическая компактиза-ция происходит с образованием как минимум двух промежуточных уровней - хроматиновых фибрилл диаметром 200-250 нм и 400 нм.
- Впервые исследована трехмерная организация доменов факультативного гетерохроматина, соответствующих неактивной Х-хромосоме человека. Показано, что инактивация сопровождается упаковкой хроматина в фибриллы диаметром 200-400 нм, при сохранении доступности внутренних областей Xi для транс-факторов.
- Показано, что репликативные кластеры в поздно-реплицирующемся гете-рохроматине соответствуют хроматиновым доменам диаметром 250-300 нм. Репликация не требует глобальной деконденсации плотно упакованных доменов, и репликативные комплексы распределены равномерно в объеме реплицирующегося домена, не формируя репликативные фабрики.
- Исследована динамика основных архитектурных белков хроматина топо-изомеразы II и конденсинов в процессе профазной компактизации хромосом, а также в экспериментальных условиях, вызывающих изменение степени компак-тизации хромосом in vivo. На основании полученных данных предложена новая модель структурной организации митотических хромосом.
- Впервые продемонстрирована локализация субъединиц конденсина в тельцах Кахаля, а также явление независимой локализации индивидуальных субъединиц конденсинового комплекса в различных структурно-функциональных доменах ядра.
- Разработан новый метод in vivo иммуномечения клеточных белков наноча-стицами золота, и с помощью данного метода впервые удалось визуализовать на ультраструктурном уровне характер упаковки индивидуальных хромосомных локусов в виде хроматиновых фибрилл высшего порядка в интактных клетках.
- Разработан метод индукции линейной и поперечной дифференциации митотических хромосом и впервые продемонстрированы различия в организации рано- и поздно реплицирующихся хроматиновых доменов относительно хромосомной оси.
- Впервые в интактных клетках показано, что индукция транскрипции эухро-матиновых генов сопровождается частичной деконденсацией высших уровней организации хроматина. В то же время, транскрипция может осуществляться на плотно упакованной хроматиновой матрице.
- Впервые прижизненно прослежена динамика ассоциации генов с кластерами интерхроматиновых гранул при активации транскрипции, а также продемонстрирована высокая локальная мобильность транскрибирующихся хромосомных локусов. На основании полученных данных предложена новая модель организации процесса транскрипции в контексте нативного хроматина.
2.Hu Y., Kireev I., Plutz M., Ashourian N., Belmont AS. Large-scale chromatin structure of inducible genes: transcription on a condensed, linear template. J. Cell Biol. (2009), 185:87-100.
3.Kireev I, Lakonishok M, Liu W, Joshi VN, Powell R, Belmont AS. In vivo immunogold labeling confirms large-scale chromatin folding motifs. Nat Methods. (2008), 5(4):311-313.
4.Rego A, Sinclair PB, Tao W, Kireev I, Belmont AS. The facultative heterochromatin of the inactive X chromosome has a distinctive condensed ultrastructure. J Cell Sci. (2008), 121(Pt 7):1119-1127.
5.Novikov DV, Kireev I, Belmont AS. High-pressure treatment of polytene chromosomes improves structural resolution. Nat Methods. (2007), 4(6):483-485.
6.В.Ю. Поляков, О.В. Зацепина, И.И. Киреев, А.Н. Прусов, Д. Фаис, Е.В. Шеваль, Ю.В. Коблякова, С.А. Голышев, Ю.С. Ченцов. Структурно-функциональная модель митотической хромосомы. Биохимия (2006), 71(1):6-16.
7.Kobliakova I, Zatsepina O, Stefanova V, Polyakov V, Kireev I. The topology of early- and late-replicating chromatin in differentially decondensed chromosomes. Chromosome Res. (2005), 13(2):169-181.
8.Sheval EV, Kireev II, Polyakov VY. Stabilization of macromolecular chromatin complexes in mitotic chromosomes by light irradiation in the presence of ethidium bromide. Cell Biol Int. (2004), 28(12):835-843.
9.Kireeva N, Lakonishok M, Kireev I, Hirano T, Belmont AS. Visualization of early chromosome condensation: a hierarchical folding, axial glue model of chromosome structure. J Cell Biol. (2004), 166(6):775-785.
10.Prusov A.N., Kireyev I.I., Polyakov V.Yu. Visible light irradiation of ethidium bromide-stained interphase nuclei causes DNA-protein linking and structural stabilization of nucleoprotein complexes. Photochemistry & Photobiology (2003), 78 (6):592-598.
11.Beenders B, Watrin E, Leganeux V, Kireev I, Bellini M. Distribution of XCAP-E and XCAP-D2 in the Xenopus oocyte nucleus.Chromosome Res., (2003), 11:549-564.
12.Тимирбулатова Э.Р., Киреев И.И., Картавенко Т.В., Гулак П.В., Поляков В.Ю., Ле Геллек К., Узбеков Р.Э. Исследование внутриклеточной локализации белка XCAP-E в клетках линии XL2 (Xenopus laevis) в норме и при ингибировании транскрипции и процессинга рРНК. Цитология (2003), 45:290-297.
13.Курчашова С.Ю., Филимоненко В.В., Гулак П.В., Киреев И.И., Поляков В.Ю., Гозак П. Индукция формирования ядерной оболочки вокруг индивидуальных хромосом под действием гипотонического шока. Цитология (2003), 45:298-307.
14.Uzbekov R, Timirbulatova E, Watrin E, Cubizolles F, Ogereau D, Gulak P, Legagneux V, Polyakov VJ, Le Guellec K, Kireev I. Nucleolar association of pEg7 and XCAP-E, two members of Xenopus laevis condensin complex in interphase cells. J Cell Sci. (2003); 116(Pt 9):1667-1678.
15.Тимирбулатова Э.Р., Киреев И.И., Грабеклис С.А.,Гулак П.В., Ле Геллек К., Поляков В.Ю., Узбеков Р.Э. Внутриклеточная локализация конденси-нов XCAP-E pEg7 в норме и в условиях, вызывающих искусственное изменение структуного состояния митотических хромосом. Цитология (2002); 44(6):576-584.
16.Sheval EV, Prusov AN, Kireev II, Fais D, Polyakov VY. Organization of higher-level chromatin structures (chromomere, chromonema and chromatin block) examined using visible light-induced chromatin photo-stabilization. Cell Biol Int. (2002), 26(7):579-591.
17.Chudinova EM, Kireev IL, Fais D, Gianguzza F, Giudice G, Morici G, Vorobjev IA, Poliakov VY. Noncanonical structural-functional organization of nucleoli in maturing oocytes of sea urchin Paracentrotus lividus. J Submicrosc Cytol Pathol. (2001), 33(3):301-311.
18.Шеваль Е.В., Гулак П.В., Киреев И.И., Чудинова Е.М., Фаис Д., Джангуц-ца Ф., Поляков В.Ю. Особенности сегрегации «неканонического» ядрышка ооцитов морского ежа Paracentrotus lividus. Онтогенез (2001), 32(5):377-383.
19.Коблякова Ю.В., Киреев И.И., Стефанова Е.Н., Зацепина О.В., Поляков В.Ю. Дифференциальная деконденсация митотических хромосом культуры СПЭВ вызванное двойным гипотоническим шоком. Цитология (2001), 43(5):462-470.
20.Шеваль Е.В., Прусов А.Н., Киреев И.И., Поляков В.Ю. Изучение структурных и структурно-функциональных субдоменов интерфазного ядра методом фотостабилизации. Цитология. (2001); 43(2):122-132.
21.Курчашова С.Ю., Прусов А.Н., Гулак П.В., Киреев И.И., Поляков В.Ю. Особенности взаимодействия белка анкоросом p68 с ядерной оболочкой в клеточном цикле. Онтогенез (2000), 31(6):429-439. Russian.
22.Vladimirskaya EA, Kireyev II, Prusov AN, Fais D. Spatial localization of chromosome-nuclear envelope interaction sites. Membr Cell Biol. (1999), 12(6):857-869.
23.Amchenkova AA, Buzhurina IM, Gorgidze LA, Kireyev IV, Panov MA, Polyakov VJ. The role of Ca ions in restoration of the structure of interphase and mitotic chromosomes in PK living cells after hypotonic stress. Cell Biol Int. (1998), 22(7-8):509-515.
24.Ямшанов А.Н., Киреев И.И., Прусов А.Н., Поляков В.Ю. Стабилизация макромолекулярных комплексов хроматина под действием видимого света в присутствие бромистого этидия. Цитология. (1998), 40(4):340-346.
25.Чудинова Е.М., Зацепина О.В., Воробьев И.А., Файс Д., Киреев И.И., Джудиче Д., Поляков В.Ю. Локализация аргентофильных белков в ядрышках ооцитов морского ежа Paracentrotus lividus. Цитология (1998), 40:302-307
26.Крохина Т.Б., Терехов С.М., Киреев И.И., Ляпунова Н.А., Тодоров И.Н. Действие циклогексимида на синтез белка, РНК и ДНК в культуре клеток CHO и диплоидных фибробластов человека. Бюлл. Эксп. Биол.Мед. (1991), 112(8):139-141.
27.Киреев И.И., Зацепина О.В., Поляков В.Ю., Ченцов Ю.С. Динамика структурной реконструкции митотических хромосом после их искусственной деконденсации in vitro. Цитология (1990), 32(5):449-454.
28.Zatsepina O.V., Kireyev I.I., Frolova E.I., Polyakov V.Yu., Chentsov Yu.S. (1990) Chromomere - the structural unit of the chromtin in the interphase nucleus. In: Nuclear structure and functions. Eds. Zbarsky I.B., Harris J.R. Plenum Press, New York., pp. 301-304.
29.Киреев И.И., Зацепина О.В., Поляков В.Ю., Ченцов Ю.С. Ультраструктура митотических хромосом клеток СПЭВ в ходе их обратимой искусственной деконденсации in vivo. Цитология (1988), 30(8):926-932.