Научная тема: «ЯДЕРНЫЙ АНТИГЕН ПРОЛИФЕРИРУЮЩИХ КЛЕТОК (PCNA): КООРДИНАТОР КЛЕТОЧНЫХ ФУНКЦИЙ В НОРМЕ И ПАТОЛОГИИ»
Специальность: 03.01.04
Год: 2011
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. Имеет место широкий спектр взаимодействий PCNA, причем не только в ядре, но и в цитоплазме.
  2. Обнаружено, что PCNA присутствует в клетке в виде комплекса из двух колец, обеспечивающих одновременное взаимодействие с несколькими белками-партнерами, что позволило сформулировать модель координирующего действия PCNA на репликативной вилке ДНК. Также показано взаимодействие PCNA с гликолитическими ферментами и предложена модель участия PCNA в гликолизе.
  3. Показано наличие множественных посттрансляционных модификаций PCNA, которые участвуют в регуляции взаимодействия PCNA с другими белками.
Список опубликованных работ
1.Naryzhny S. N., Lee H. Proliferating cell nuclear antigen in the cytoplasm interacts with components of glycolysis and cancer // FEBS Lett. 2010. V.584. No.20. P.4292-8.

2.Richard C., Lanner C., Naryzhny S.N., Sherman L., Lee H., Lambert P., Zehbe I. The immortalizing and transforming ability of two common human papillomavirus 16 E6 variants with different prevalences in cervical cancer // Oncogene. 2010. V.29. P.3435-3445.

3.Naryzhny S. N. Blue Dry Western: simple, economic, informative, and fast way of immunodetection // Anal. Biochem. 2009. V.392. No.1. P.90-5.

4.Naryzhny S. N. Proliferating cell nuclear antigen (PCNA): a proteomics view (review) // Cell. Mol. Life Sci. 2008. V.65. No.23. P.3789-808.

5.Naryzhny S. N., Lee H. Characterization of proliferating cell nuclear antigen (PCNA) isoforms in normal and cancer cells: There is no cancer-associated form of PCNA // FEBS Lett. 2007. V.581. No.25. P.4917-20.

6.Naryzhny S. N., DeSouza L.V., Siu K.W.M., Lee H. Characterization of the human proliferating nuclear antigen physico-chemical properties: aspects of double trimer stability // Biochemistry and Cell Biology. 2006. V.84. No.5. P.669-676.

7.Lee H, Naryzhny S. N. Coordination of multiple cellular functions by PCNA: Implication of the PCNA double trimer model // Proliferating cell nuclear antigen (PCNA): Research Signpost, Kerala, India, 2006. P.163-180.

8.Naryzhny S. N., Zhao H., Lee H. Human proliferating cell nuclear antigen (PCNA) may function as a double- homotrimer complex in the mammalian cell // J. Biol. Chem. 2005. V.280. No.14. P. 13888-13894.

9.Naryzhny S. N., Lee H. The post-translational modifications of proliferating cell nuclear antigen (PCNA): acetylation, not phosphorylation, plays an important role in the regulation of its function // J. Biol. Chem. 2004. V.279. No.19. P.20194-20199.

10.Naryzhny S. N., Lee H. Observation of multiple isoforms and specific proteolysis patterns of PCNA in the context of cell-cycle compartments and sample preparations // Proteomics. 2003. V.3. P.930-936.

11.Naryzhny S. N., Lee H. Protein profiles of the Chinese hamster ovary cells in the resting and proliferating stages // Electrophoresis. 2001. V.22. P.1764-1775.

12.Naryzhny S.N., Levina V.V., Varfolomeeva E.Y., Drobchenko E.A., Filatov M.V. Active dissociation of the fluorescent dye Hoechst 33342 from DNA in a living cell: Who could do it? // Electrophoresis. 1999. V.20. P.1033-1038.

13.Naryzhny S.N. "Active" two-dimensional electrophoresis of rat liver DNA-polymerase alpha // Electrophoresis. 1997. V.18. P.553-556.

14.Нарыжный С.Н. Выделение каталитически активной субъединицы протеинкиназы из комплексной формы ДНК-полимеразы альфа печени крысы методом электрофракционирования в денатурирующих условиях // Мол.Биол. 1996. Т.30. № 6(2). С.1403-1408.

14а. Naryzhny S.N. Purification of protein kinase catalytic subunit from the complex form of rat liver DNA polymerase alpha by denaturing electrofractionation // Mol. Biol. 1996. V.30. No.6(2). P.845-849.

15.Naryzhny S.N. Upside-down stopped flow electrofractionation of complex protein mixtures // Anal. Biochem. 1996. V.238. P.50-53.

16.Шевелев И.В., Нарыжный С.Н., Крутяков В.М. Выделение протеинфосфокиназы из комплексной формы ДНК-полимеразы альфа печени крысы // Мол.Биол. 1993. Т.27. №3. С.531-537.

16a. Shevelev I.V., Naryzhny S.N., Krutyakov V.M. Isolation of a proteinphosphokinase from the complex form of rat liver DNA polymerase alpha // Mol. Biol. 1993. V.27. No.3. P.531-537.

17.Нарыжный С.Н. Обнаружение ДНК-связывающих белков в полиакриламидном геле после денатурирующего электрофореза // Мол.Биол. 1992. Т.26. №2. С.307-314.

17а. Naryzhny S.N. Detection of DNA-binding proteins in SDS-polyacrylamide gel electrophoresis // Mol.Biol. 1992. V.26. No.2. P.307-314.

18.Нарыжный С.Н., Крутяков В.М. Анализ белков нормальной и регенерирующей печени крысы методом двумерного электрофореза // Биохимия. 1989. Т.54. №.12. С.2030-2036.

18a. Naryzhny S.N., Krutyakov V.M. The analysis of normal and regenerating rat liver proteins by two-dimensional gel electrophoresis // Biochemistry. 1989. V.54. No.12. P.2030-2036.

19.Нарыжный С.Н. К вопросу об онкомаркерах: о чем нам может рассказать PCNA? // Материалы Всероссийской научной конференции “Медико-генетические проблемы онкологических заболеваний”. 2010. Стерлитамак. Креативная Хирургия и Онкология. 2010. №.4 (Приложение). C.43.

20.Naryzhny S. N., Lee H. Role of PCNA Interactions in cancer: proteomics view // Materials of the HUPO 8th Annual World Congress. 2009. Toronto, Canada. Clinical Proteomics. 2009. V.5. S1. P.72.

21.Naryzhny S. N., Lee H. Proteomics of PCNA: cell transformation is accompanied by up-regulation of PCNA without post-translational modifications // Materials of the HUPO 7th Annual World Congress. 2008. Amsterdam, NL. P.85.

22.Naryzhny S. N., Lee H. Cell transformation is accompanied by up-regulated level of PCNA without post-translational modifications // Materials of CPI (Canadian Proteomic Initiative) Conference. 2007. Ottawa, Canada. P.56.

23.Naryzhny S.N. Coordination of multiple cellular functions by proliferating cell nuclear antigen (PCNA): Structure-functional aspect // Бреслеровские чтения II. Молекулярная генетика биофизика и медицина сегодня. С.-Петербург. 2007. С.1-13.

24.Naryzhny S.N., Lee H. The high level of PCNA may result in genetic instability // Materials of the HUPO 5th Annual World Congress. 2006. Long Beach, USA. Molecular & Celular Proteomics. 2006. V.5. No.10. S.76.

25.Naryzhny S.N., Lee H. Analysis of PCNA Structure and functions by proteomics approach // Materials of the CPS (Canadian Proteomic Society) Conference. Ottawa, Canada. 2005. P.44.

26.Naryzhny S.N., Zhao H., Lee H “The Lord of the Rings: PCNA can coordinate multiple cellular functions due to symmetrical double ring structure // Materials of the CPI (Canadian Proteomic Initiative) Conference. Toronto, Canada. 2005. P.65.

27.Naryzhny S.N., Lee H. Human proliferating cell nuclear antigen (PCNA) may function as a double-homotrimer complex in the mammalian cell // Materials of the HUPO 4th Annual World Congress. Munich, Germany. Molecular & Cellular Proteomics. 2005. V.4. No.8. S.50.

28.Naryzhny S.N., Zhao H., Lee H. Mammalian proliferating cell nuclear antigen (PCNA) has a double homotrimer structure. Can it be molecular Janus? // Materials of the CPS (Canadian Proteomic Society) Сonference. London, Canada. 2004. P.55.

29.Naryzhny S.N., Lee H. Post-translational modifications of proliferating cell nuclear antigen (PCNA): Acetylation, not phosphorylation, plays an important role in the regulation of PCNA function // Materials of the CPI (Canadian Proteomic Initiative) Conference. Montreal, Canada. 2004. P.61.

30.Naryzhny S.N., Lee H. Heterogeneity (micro-proteome) of proliferating cell nuclear antigen _ where is a bottom? // Materials of the CPI (Canadian Proteomic Initiative) Conference. Vancouver, Canada. 2003. P.18.

31.Naryzhny S.N and Lee H. PCNA Turnover in Cell Cycle and Involvement in DNA Repair is Linked to Modification by Ubiquitin // Materials of the HUPO 2nd Annual & IUBMB XIX World Congress. Montreal, Canada. Molecular & Cellular Proteomics. 2003. V.2. No9. P.746.

32.Naryzhny S.N., Lee H. About multiple forms of PCNA, or proteomics (microproteomics) approach to PCNA heterogeneity // Materials of the -5th Siena 2-D Electrophoresis Meeting, (from Genome to ProteomeSiena, Italy. 2002. P.281.

33.Naryzhny S.N., Lee H. Protein profiles of the Chinese hamster ovary cells in the resting and proliferating stages // Materials of the 4th Siena 2-D Electrophoresis Meeting, (from Genome to Proteome). Siena, Italy. 2000. P.402.

34.Naryzhny S.N., Becker E.G., Sinitsyn A.P. Detection and study of cellulases and other proteins from Chaetomium cellulolyticum: 2D-electrophoresis maps of secreted proteins from different fungal strains // Materials of the International Conference "Biocatalysis-98, Fundamentals and Applications". Pushchino, Russia. 1998. P.47.

35.Нарыжный С.Н. Прибор для препаративного электрофракционирования ДНК и белков: cвидетельство №4533, Российская Федерация, МПК C12P19/00. №95111359, заявл. 03.07.1995, опубл. 16.07.1997, Бюл. №7.

36.Нарыжный С.Н.; Метод препаративного электрофракционирования ДНК и белков: патент №2104082, Российская Федерация, МПК B01D57/02, G01N27/28. №95111365, заявл. 03.07.1995, опубл. 10.02.1998, Бюл. №4.

37.Naryzhny S.N. Discrete preparative electrofractionation of complex protein mixture // PNPI Research Report 1994-1995. Gatchina. 1996. P.215-217.

38.Naryzhny S.N., Levina V.V., Varfolomeeva E.Y., Drobchenko E.A., Filatov M.V. Active dissociation of the fluorescent dye Hoechst 33342 from DNA in a living cell: Who could do it? // Materials of the 3th Siena 2-D Electrophoresis Meeting, (from Genome to Proteome). Siena, Italy. 1998. P.259.

39.Naryzhny S.N. "Active" two-dimensional electrophoresis of rat liver DNA-polymerase alpha // Materials of the 2th Siena 2-D Electrophoresis Meeting, (from Genome to Proteome). Siena, Italy. 1996. P.116.