Свердруп Антоний Элиас

Свердруп Антоний Элиас – бакалавр по направлению 06.03.01 – Биология, лаборант кафедры генетики Института фундаментальной медицины и биологии Казанского федерального университета.

Исследователь в области динамического моделирования, вычислительной биологии и биоинформатики, молекулярной генетики и филогенетики, биотехнологии и молекулярной биологии, экологии и гидробиологии. Научные интересы - разработка инновационных технологий оценки экологического состояния водоемов по маркерным генам и белкам гидробионтов; динамическое моделирование комплексных систем.

Автор свыше 70 публикаций в ведущих Российских и зарубежных изданиях, в том числе 3 монографий, 2 патентов Российской Федерации и 19 свидетельств о государственной регистрации программы для ЭВМ/базы данных Российской Федерации, 18 статей, цитируемых в базах данных Scopus и Web of science, 19 статей, цитируемых в РИНЦ, 6 учебно-методических пособий и 3 цифровых образовательных ресурсов Казанского федерального университета.

Научный Эксперт Республиканской детской межпредметной конференции исследовательских работ «Юный профессор Казанского университета», волонтер Детского университета при Казанском федеральном университете.

Антоний Элиас Свердруп награжден Российской Академией Естествознания золотой медалью «За верность традициям отечественного образования» и медалью имени А.Нобеля за вклад в развитие изобретательства.

Научные публикации

Монографии

1.               Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Сапробионты озёр Кабан города Казани: выявление индикаторной значимости гидробионтов по маркерным генам. – Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2021. – 320 с.

2.               Летяев В.А., Фролова Л.Л., Свердруп А.Э. Юные профессора Казанского университета. – Казань: Изд-во Казан. Ун-та, 2021. - 278 с.

3.               Фролова Л.Л., Свердруп А.Э., Маланин С.Ю., Деревенская О.Ю., Хусаинов А.М., Харченко А.М. Метагеном гидробионтов озёр Кабан города Казани: Анализ видового разнообразия гидробионтов по маркерным генам. – Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2019. – 216 с.

Патенты Российской Федерации

4.               Фролова Л.Л., Хусаинов А.М., Свердруп А.Э. Способ использования маркерных белков сапробных групп индикаторных организмов для оценки экологического состояния окружающей среды, RU 2702852, 2019 

5.               Фролова Л.Л., Свердруп А.Э. Способ определения сапробности гидробионтов для оценки экологического состояния водоёмов, RU 2698651, 2019

Свидетельства Российской Федерации о государственной регистрации программ для ЭВМ и баз данных

6.               Свердруп А.Э. Программа редактирования текстовых документов // Свидетельство РФ о гос. рег. программы для ЭВМ № 2024611245, 18.01.2024

7.               Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Программа вычисления консенсусных нуклеотидных последовательностей ДНК/РНК // Свидетельство РФ о гос. рег. программы для ЭВМ № 2024611735, 24.01.2024

8.               Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Программа генерации тестовых заданий // Свидетельство РФ о гос. рег. программы для ЭВМ №2024611243, 18.01.2024

9.               Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Программа поиска белков в аминокислотных последовательностях для оптимизации работы с аминокислотными последовательностями в базе данных GenPept // Свидетельство РФ о гос. рег. программы для ЭВМ № 2024611736, 24.01.2024

10.               Свердруп А.Э. Программа поиска генов в геномных последовательностях для оптимизации работы с нуклеотидными последовательностями в базе данных GenBank // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации программы для ЭВМ № 20236677022, 2023, бюл. 8 (09/08/2023)

11.               Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Программа парного сравнения первичных последовательностей ДНК/РНК и белков // Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ  2023611264, 2023. 

12.               Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Программа вычисления статистик нуклеотидных последовательностей ДНК/РНК // Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ  2023611302, 2023.

13.               Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Программа вычисления частоты встречаемости аминокислотных остатков по группам физико-химических свойств в первичных последовательностях белков //Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ  2023611359, 2023.

14.               Свердруп А.Э. Программа построения математических функций для решения биологических задач // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации программ для ЭВМ № 2022619791, 2022.

15.            Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Электронный справочник позвоночных Республики Татарстан // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации базы данных №2022621120, 2022.

16.            Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Программа для редактирования первичных последовательностей ДНК/РНК и белков гидробионтов в формате FASTA // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2021618581, 2021.

17.            Свердруп А.Э., Фролова Л.Л.  Программа для редактирования метагеномных данных гидробионтов // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2021618582, 2021.

18.            Фролова Л.Л., Свердруп А.Э. Индикаторные виды гидробионтов озёр Кабан г. Казани, выявленные по маркерным генам // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации базы данных № 2021621150, 2021.

19.            Фролова Л.Л., Свердруп Х.У., Свердруп А.Э. Программа динамической гидрохимической модели пресноводных водоемов // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации программы для ЭВМ №2019661919, 2019.

20.            Фролова Л.Л., Свердруп Х.У., Свердруп А.Э. Программа динамической модели насыщения кислородом пресноводных водоёмов // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации программы для ЭВМ №2019661315, 2019.

21.            Фролова Л.Л., Свердруп Х.У., Свердруп А.Э. Программа динамической модели загрязнения антибиотиками пресноводных водоёмов // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации программы для ЭВМ №2019661314, 2019.

22.            Фролова Л.Л., Свердруп Х.У., Свердруп А.Э. Программа динамической модели гидрологической системы пресноводных водоёмов // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации программы для ЭВМ №2019661159, 2019.

23.            Фролова Л.Л., Свердруп Х.У., Свердруп А.Э. Программа динамической модели биологической системы пресноводных водоёмов // Свидетельство Российской Федерации о государственной регистрации программы для ЭВМ №2019661316, 2019.

24.            Фролова Л.Л., Свердруп А.Э. Видовой состав гидробионтов озер Кабан (Верхнего, Среднего, Нижнего) г.Казани с указанием номеров маркерных генов в базе данных GenBank и видов-индикаторов по зонам сапробности // Свидетельство Российской федерации о государственной регистрации базы данных №2019622503, 2019.

Статьи в международных изданиях, цитируемых в БД Scopus и Web of science

25.           Sverdrup H.U., Sverdrup A.E. On the supply dynamics of scandium, global resources, production, oxide and metal price, a prospective modelling study using WORLD7 // Biophysical Economics and Sustainability, 2023, 30p [PREPRINT]

26.           Sverdrup H.U., Sverdrup A.E. An assessment of the global supply, recycling, stocks in use and market price for titanium using the WORLD7 model // Sustainable Horizons, 2023. - V.7(100067). - 17p.

27.            Frolova L.L., Sverdrup A.E., Sverdrup H.U. Developing a System Dynamics Model for the Nizhniy Kaban and Sredniy Kaban Lakes, Kazan, Russia, Assessing the Impacts of Phosphorus and Nitrogen Inputs on Lake Ecology // Water, Air, and Soil Pollution, 2021, 232(11), 454 [Scopus, WOS]

28.            Frolova L.L., Sverdrup A.E., Sverdrup H.U. Using the Kaban Lakes Integrated Assessment Model for Investigating Potential Levels of Antibiotic Pollution of the Nizhniy Kaban and Sredniy Kaban Lakes // Water, Air, and Soil Pollution, 2020, 231(8), 430 [Scopus]

29.            Sverdrup H.U., Frolova L.L., Sverdrup A.E. Using a System Dynamics Model for Investigating Potential Levels of Antibiotics Pollution in the Volga River // Water, Air, and Soil Pollution, 2020, 231(4), 173 [Scopus, WOS]

30.            Sverdrup A.E., Frolova L.L. The Innovation Technology Based on Molecular Phylogeny of Bacillariophyceae for Water Quality Monitoring // Springer Proceedings in Earth and Environmental Sciences, 2019, p.76–82 [Scopus]

31.            Sverdrup A.E., Frolova L.L., Sagdeeva, S. The monitoring of Sredniy Kaban lake by 16S rRNA gene amplicon data set-based bacterial diversity  // Journal of Environmental Treatment Techniques, 2019, V. 7 (Special Issue), p.1016–1025 [Scopus]

32.            Sverdrup A.E., Frolova, L.L. The species of diversity of Sredniy Kaban Lake by 18S rRNA of hydrobionts on next-generation sequecing method  // Journal of Environmental Treatment Techniques, 2019, V. 7 (Special Issue), p.1030–1035 [Scopus]

33.            Frolova L.L., Sverdrup A.E. The monitoring of Nizhniy Kaban Lake by 16S rRNA gene amplicon data set-based bacterial diversity  // Journal of Environmental Treatment Techniques, 2019, 7(Special Issue), p.1006–1015 [Scopus]

34.            Kharchenko A., Sverdrup A.E., Frolova L.L. The monitoring of Verkhniy Kaban Lake by rbcL gene of freshwater organisms using next-generation sequencing // International Journal of Green Pharmacy, 2018, 12(3), p.S756–S762 [Scopus]

35.            Frolova L.L, Husainov A.M., Sverdrup, A.E. The correlation between saprobity and mitochondrial genes of indicator fish species based on molecular phylogeny // International Journal of Green Pharmacy, 2017, 11(4), p.S856–S862 [Scopus]

36.            Kharchenko A., Sverdrup A.E., Frolova L.L. Studying Bacterial Diversity of Verhniy Kaban Lake by 16S rRNA Analysis // HELIX, 2019, 9(5), p.5545-5555 [WOS]

37.            Frolova L.L., Sverdrup A.E. Diversity of Verhniy Kaban Lake Species by 18S rRNA of Hydrobionts on Next-Generation Sequencing Method // Bioscience Biotechnology Research Communications, V.12, 5 (Special Issue), p.329-335 [WOS]

38.            Sverdrup A.E., Frolova L.L. A new approach for the determination of species saprobity for water quality monitoring based on the molecular phylogeny / // IIOAB Journal, 2019, 10(4), p.34-41 [WOS]

39.            Sverdrup A.E., Frolova L.L. The next-generation sequencing by rbcL gene of freshwater organism for monitoring of Sredniy Kaban Lake / // REVISTA INCLUSIONES, 6 (Special Issue), p.258-269 [WOS]

40.            Sverdrup A.E., Frolova L.L. The Innovation Technology Based on Molecular Phylogeny of Bacillariophyceae for Water Quality Monitoring // Climate change impacts on hydrological processes and sediment dynamics: measurement, modelling and management, Springer Proceedings in Earth and Environmental Sciences, 2019, p.76-82 [WOS]

41.            Frolova L.L., Sverdrup A.E. 18S rRNA Identification of Hydrobionts of Nizhniy Kaban Lake & Diversity Study through Next Generation Sequencing Method // HELIX, 2019, 9(5), p.5556-5562 [WOS]

42.            Frolova L.L., Sverdrup A.E. The Monitoring of Nizhniy Kaban Lake by rbcL Gene of Fresh Water Organisms Using Next-Generation Sequencing. // Research journal of pharmaceutical biological and chemical sciences, 2018, 9(6), p.262-271 [WOS]

Статьи в Российских изданиях (ВАК)

43.            Свердруп А. Э., Фролова Л.Л. Выявление принадлежности видов гидробионтов озера Верхний Кабан г. Казани к зонам сапробности по маркерному гену 18S рРНК // Учёные записки Крымского федерального университета. – 2020. –Т.6 (72), №4. – С.127-142.

44.            Хусаинов А.М., Фролова Л.Л., Свердруп А.Э. Выявление корреляции между сапробностью и митохондриальным белком COI индикаторных видов коловраток на основе молекулярной филогении //Вестник технологического университета. – 2018. – Т.21 (2). – C. 228-233.

Статьи и Тезисы конференций в зарубежных и российских сборниках (РИНЦ)

45.           Свердруп А.Э. ИССЛЕДОВАНИЕ КОНСЕНСУСНЫХ АМИНОКИСЛОТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ МАРКЕРНОГО БЕЛКА RBCL ФИТОПЛАНКТОННЫХ ОРГАНИЗМОВ ПО ГРУППАМ САПРОБНОСТИ / А.Э. Свердруп, Л.Л.Фролова // Research Forum 2024: сборник статей Международной научно-практической конференции (9 января 2024 г.). - Петрозаводск : МЦНП «НОВАЯ НАУКА», 2024. - с.217-222

46.          Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Исследование консенсусных аминокислотных последовательностей маркерного белка COI по группам сапробности гидробионтов // Наука и технологии: перспективы развития и применения: сборник междунар. науч.-практической конф. - Петрозаводск., 2023. - С. 109-114.

47.            Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Индикаторная значимость зеленых водорослей Sphaeropleales озер Кабан по маркерному гену rbcL // В сборнике: Наука и технологии: перспективы развития и применения. Сборник статей Международной научно-практической конференции. Петрозаводск, 2023. С. 291-299.

48.            Свердруп А.Э. Сапробность Trebouxiophyceae озер Кабан по маркерному гену rbcL // Science innovations 2022: Cб. статей Междун. научно-практ. конф., Петрозаводск : МЦНП Новая наука. - 2022. - C.246-251.

49.            Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Исследование сапробности гидробионтов озера Средний Кабан по маркерному гену 18S рРНК // ADVANCED RESEARCH: PROBLEMS AND NEW APPROACHES: сборник статей II Международной научно-практической конференции. - Петрозаводск : МЦНП Новая наука, 2022. - C.127-134.

50.            Sverdrup A.E., Frolova  L.L. Bioindicators of Kaban lakes identified by marker gene 16S rRNA Cyanobacteria // Multidisciplinary academic research and innovation: abstracts of XXVII International Scientific and Practical Conference. – Amsterdam, 2021. – P. 85-86.

51.            Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Биоиндикаторы Diplostraca озёр Кабан по маркерному гену COI // Материалы 65-й Международной научной конференции Астраханского государственного технического университета.  – Астрахань: Изд-во АГТУ, 2021. – С. 276-278.

52.            Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Сапробные виды гидробионтов озера Верхний Кабан по маркерному гену 18S рРНК // Экология и безопасность жизнедеятельности: сборник XX междунар. науч.-практической конф. – Пенза, 2020. – С.179-182.

53.            Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Сапробные виды гидробионтов озера Средний Кабан по маркерному гену 18S рРНК // Проблемы и мониторинг природных экосистем: сборник 7 всерос. науч.-практической конф. – Пенза, 2020. – С.140-143.

54.            Свердруп А.Э., Фролова Л.Л. Сапробные виды гидробионтов озера Нижний Кабан по маркерному гену 18S рРНК // Проблемы и мониторинг природных экосистем: сборник 7 всерос. науч.-практической конф. – Пенза, 2020. – С. 137-140.

55.            Фролова Л.Л., Свердруп А.Э. Оценка сапробности озер Кабан на основе метагеномного анализа по гену rbcL фитопланктонных организмов // Сборник междунар. науч.-практической конф. Дальневосточная весна. Комсомольск-на-Амуре, 2019. – C.39-41.

56.            Фролова Л.Л., Хусаинов А.М., Свердруп А.Э., Сагдеева С.А. Экологический мониторинг озер Кабан на основе метода секвенирования нового поколения //Химия и инженерная экология XIX: сборник междунар. научной конф. Казань, 2019. – С.280-284.

57.            Назмиев И.А., Семенова Е.В., Свердруп А.Э., Савенкова Д.В., Шербоев М.А., Когогин Д.А. Развитие интеллектуальной собственности в Казанском (Приволжском) федеральном университете // Правовая охрана и защита прав интеллектуальной собственности: история, теория, практика: Сборник статей по материалам VII международной научно-практической конференции. – Пенза, 2019. – C.233-236.

58.            Свердруп А.Э., Сагдеева С.А., Фролова Л.Л. Мониторинг состояния пресноводных водоемов методом филогенетического анализа индикаторных видов //Материалы и технологии XXI века: сборник III междунар. Школы-конф. студентов, аспирантов и молодых ученых. Казань, 2018. – С.149.

59.     Фролова Л.Л., Хусаинов А.М., Свердруп А.Э.  Исследование по сапробности индикаторных видов методом филогенетического анализа гена СО1 коловраток // Химия и инженерная экология (27-29 сентября 2018): сборник XVIII междунар. науч. конф.  Казань, 2018. – С.418-419.

60.            Фролова Л.Л., Свердруп А.Э., Сагдеева С.А. Молекулярно-филогенетический анализ индикаторных видов Cyanobacteria пресноводных водоемов // Экологические чтения 2018: сб. междунар. науч.-практической конф. – Омск: ЛИТЕРА, 2018. – C.308-310.

61.            Фролова Л.Л., Хусаинов А.М., Свердруп А.Э. Бутстрэп-анализ молекулярных филогенетических деревьев индикаторных видов рыб // Химия и инженерная экология: сборник XVII междунар. науч. конф. – Казань, 2017. – С.281-283.

Учебно-методические пособия

62.            Свердруп А.Э., Фролова Л.Л., Задорина И.И. Сборка и аннотация прокариотического генома с использованием web-сервиса Galaxy: учебно-методическое пособие //Казанский университет, 2023. – 61с.

63.            Трушин М.В., Фролова Л.Л., Свердруп А.Э. Web of Science: Возможности использования в научно-образовательном процессе: учебно-методическое пособие //Казанский университет, 2023. – 43 с.

64.            Фролова Л.Л., Трушин М.В., Свердруп А.Э. Оптимизация информационного поиска медицинский и биологических научных публикаций в Российской электронной библиотеке eLIBRARY: учебное пособие // Казанский университет, 2023. – 45 с.

65.            Трушин М.В., Фролова Л.Л., Свердруп А.Э. Использование базы данных Scopus для поиска и анализа научной информации: учебно-методическое пособие //Казанский университет, 2023. – 33 с.

66.            Trushin M.V., Frolova L.L., Sverdrup A.E. Web of Science & Scopus: Key features of scientific information search: Educational and methodical manual // Kazan: Kazan University, 2023. – 64 p.

67.            Фролова Л.Л., Свердруп А.Э. CorelDraw Graphics Suite X6. Создание и редактирование векторных изображений биологических объектов: учебное пособие по курсу «Практикум по построению изображений, компьютерная графика» // Казань: Изд-во Казан.ун-та, 2018. - 38 с.

Цифровые образовательные ресурсы 

68.            Трушин М.В., Фролова Л.Л., Свердруп А.Э., Каюмов А.Р. Работа с информационными ресурсами и информационная безопасность // Цифровой образовательный ресурс по направлению подготовки медицинских специальностей 31.05.01 Лечебное дело, 30.05.01 Биохимия, 31.05.03 Стоматология, id: 5733, 2023.

69.            Пономарева М.Л., Фролова Л.Л., Хамидуллина Р.Г., Свердруп А.Э., Пономарев А.С. Экологическая генетика // Цифровой образовательный ресурс по направлению подготовки 06.04.01 Биология (Магистр, Генетика), id: 5682, 2023.

70.            Каюмов А.Р., Киямова Р.Г., Ионова Н.Э., Гоголев Ю.В., Маркелова М.И., Фролова Л.Л., Свердруп А.Э., Акберова Н.И., Власенкова Р.А. Биоинформатика // Цифровой образовательный ресурс по направлению подготовки: Дополнительная профессиональная программа профессиональной переподготовки - Информатика новых материалов (программист), id: 5808, 2023

Свердруп Антоний Элиас имеет награды

---