Калашников Александр Евгеньевич

Гражданство: Российская Федерация, РСФСР

Научная сфера: Биотехнология, генетика, биоорганическая химия, химия биологически активных соединений. Объекты исследований: млекопитающие, РНК- и ДНК-содержащие вирусы, бактерии
место работы: ФГБНУ Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела, Лаборатория иммуногенетики (2017-2022 гг.), Лаборатория ДНК-технологий (с 2022 г.)

Альма-матер: Московская государственная академия тонкой химической технологии им. М.В. Ломоносова (МГАТХТ им. М.В. Ломоносова). 

Факультет химической технологии и биотехнологии, кафедра биотехнологии. Специальность химическая технология и биотехнология, специализация молекулярная  клеточная биотехнология, бакалавр химических наук, магистр химических наук

Учёная степень = кандидат биологических наук, специальность "Генетика"научный руководитель = доктор биологических наук, доцент Ирина Геннадьевна Удина.

Основными достижениями является участие в научных работах по грантам РНФ (более трех), РФФИ (1), патентах (1), а также публикациях в ключевых отраслевых журналах (более 20). А.Е. Калашников автор более 93 научных трудов (85 в РИНЦ), в том числе 32 в российских журналах из перечня ВАК, 8 методических пособий, 1 патента, 1 монографии.

А.Е. Калашников  известен как специалист в области биотехнологии, генетики, биоорганической химии, вирусологии, генной инженерии, селекции сельскохозяйственных и диких, охотничьих видов животных и является ведущиим российским учёным в области биотехнологии, генетики, биоорганической химии, иммунологии, селекции и генной технологии.

 А.Е. Калашников окончил "Московскую государственную академию тонкой химической технологии им. М.В. Ломоносова" (2002) и аспирантуру ИОГЕН РАН (2013).

• 1999—2002 студент-магистрант. ГНЦ ФГБНУ "Институт биоорганической химии им. акад. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова" РАН, группа белковой инженерии проф., д.б.н. Д.А. Долгих Лаборатории ЯМР-анализа и спектроскопии: разработка технологии очистки искусственных белков ("альбебебетин" с природным пептидом инсулина и интерферона), генная и белковая инженерия, жидкостная хроматография, электрофорез, культивирование микроорганизмов, физико-химический анализ H- и C-ЯМР;

• 2002-2005 аспирант. ГНИЦ "Курчатовского института" ФГБНУ "Институт молекулярной генетики", Лаборатория белковой инженерии акад. С.В. Кострова: разработка и поиск новых продуцентов психрофильных протеаз, генная инженерия и создание новых генетических конструкций экспрессии;

• 2005-2007 специалист. ООО "Beckman Coulter", "Интерлабсервис" ФБУН "ЦНИИ эпидемиологии" Роспотребнадзора: специалист по автоматизации, информатизации и роботизации генетических процессов, разработка генетических тестов в области генетической идентификации, вирусологии и бактериологии;

• 2007 стажировка. АО "ЗИО Подольск" Росатома, сборочно-сварочный цех №3: стажировка на специалиста по металлообработке и сборке теплообменных контуров Na-Na для реакторов разработки ОКБ "Гидропрессс" (Бушерская АЭС, ВВЭР-1000/528);

• 2007-2009 научн. сотр. "Государственный научно-исследовательский институт органической химии и технологии" (ФГУП ГосНИИОХТ, п/я № 74): исследования в области разработок и организации работ по моделированию процессов дегазации отравляющих веществ (нервно-паралитические ОВ класса VX, информатизация процессов производства объекта Центральной авиационной базы ракетного вооружения и боеприпасов ВВС объекта УХО "Леонидовка", контрактная служба в войсках разведки МО РФ (объекты УХО командировок "Горный", "Камбарка", "Марадыковский", "Почеп", "Щучье", "Кизнер" Пензенской, Саратовской областей, Удмуртии, Кавказского военного округа;

• 2009-2014 мл. научн. сотр., научн. сотр., соискатель ученой степени. ФГБНУ "Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН", группа популяционной иммуногенетики доц., докт. биол. наук И.Г. Удиной Лаборатории популяционной генетики проф, докт. биол. наук Д.В. Политова: разработка молекулярно-генетических методов и исследования иммунитета и вирусной нагрузки медоносных пчел, работа по генетике спорта;

• 2010-2011 учитель химии,  ОБЖ и военного дела. ЧООУ "Русская школа Марии Аверьяновой": преподавание химии 9-11 кл., ОБЖ и военное дело 8-11 классы;

• 2011-2017 научн. сотр. ФГБНУ ГНЦ "Институт иммунологии ФМБА": проведение исследований иммунитета человека, РНК и ДНК-вирусов герпеса;

• 2014-2017 научн. сотр. ФГБНУ ФНЦ животноводства - "Всероссийский институт животноводства им. акад. Л.К. Эрнста", Лаборатория молекулярной генетики животных: исследование генетической дифференциации животных, популяционные исследования эукариот, РНК- и ДНК-вирусов;

• 2015 стажировка. ООО "Исследовательский центр Фитоинженерия": исследование методов клонального размножения картофеля и количественного молекулярно-генетического анализа генома вирусов растений;

• 2016 стажировка. ООО "Спутник-К": работа с зарубежными каталогами клеточных культур и иммунологических исследований;

• 2017 стажировка. ФГБНУ "Всероссийский институт генетики и разведения сельскохозяйственных животных": исследование методов иммуногенетики, работы с клональными системами;

• 2018-2019 ст. научн. сотр. ФГБОУ ВО Государственный аграрный университет Северного Зауралья, Лаборатория ДНК-технологий: исследование генетической идентификации скота и патогенов картофеля;

• 2021-2022 преподаватель. ФГБОУ ВО Башкирский государственный педагогический университет им. М. Акмуллы, кафедра генетики и химии: преподавание дисциплин магистратуры и бакалавриата по геномике, биоинформатике и генетике;

• 2021-2022 ст. научн. сотр. ФГБНУ ФИЦ комплексного изучения Арктики им. акад. Н.П. Лаверова УрО РАН, НИИ Архангельский НИИ сельского хозяйства: исследование генотипов иммунитета крупного рогатого скота холмогорской породы, исследования генома картофеля;

• 2016- ст. научн. сотр. ФГБНУ Всероссийский научно-исследовательский институт племенного дела Министерства сельского хозяйства Российской федерации, лаборатория иммуногенетики, лаборатория ДНК-технологий: исследования в области генетической идентификации, структурной и функциональной геномики иммунитета сельскохозяйственных животных.

Владеет английским (C1), немецким (A1), польским (B1) словацким (C1) и чешским языками (C1).

Значимые статьи в отраслевых журналах из перечня ВАК

• Генетические механизмы распознавания бактерий рецепторами врожденного иммунитета крупного рогатого скота / А. Е. Калашников, Е. Р. Гостева, Н. Ф. Щегольков, В. Л. Ялуга // Вестник НГАУ (Новосибирский государственный аграрный университет). – 2023. – № 3(68). – С. 204-216. – DOI 10.31677/2072-6724-2023-68-3-204-216

• Калашников, А. Е. Узнавание патогенов в организме крупного рогатого скота при активации врожденного иммунитета (Обзорная статья) / А. Е. Калашников, Е. Р. Гостева, В. Л. Ялуга // Сельскохозяйственный журнал. – 2023. – № 3(16). – С. 76-90. – DOI 10.48612/FARC/2687-1254/008.3.16.2023

• Пути повышения жизнеспособности голштинизированного отечественного крупного рогатого скота / Г. Н. Сердюк, С. Е. Тяпугин, А. А. Новиков, А. Е. Калашников // Зоотехния. – 2022. – № 6. – С. 8-11. – DOI 10.25708/ZT.2022.43.65.003

• Проблемы и вопросы при прогнозировании генетической племенной ценности сельскохозяйственных животных / А. Е. Калашников, А. И. Голубков, Н. Ф. Щегольков, Е. Р. Гостева // Вестник НГАУ (Новосибирский государственный аграрный университет). – 2022. – № 4(65). – С. 77-96. – DOI 10.31677/2072-6724-2022-65-4-77-96

• Калашников, А. Е. Формирование иммунного статуса у крупного рогатого скота: физиологические механизмы, ветеринарный контроль (обзор) / А. Е. Калашников, Н. Ф. Щегольков, Е. Р. Гостева // Проблемы биологии продуктивных животных. – 2022. – № 4. – С. 5-30. – DOI 10.25687/1996-6733.prodanimbiol.2022.4.5-30

• Калашников, А. Е. Оценка достоверности математических моделей оценки племенной ценности сельскохозяйственных животных / А. Е. Калашников, J. Pribyl, Е. Р. Гостева // Известия Горского государственного аграрного университета. – 2022. – Т. 59-2. – С. 110-122. – DOI 10.54258/20701047_2022_59_2_110

• Применение методов сетевой биологии для анализа биологических основ иммунитета сельскохозяйственных животных / А. Е. Калашников, Т. В. Новикова, Ю. А. Воеводина [и др.] // Аграрный вестник Верхневолжья. – 2022. – № 3(40). – С. 56-66. – DOI 10.35523/2307-5872-2022-40-3-56-66

• Калашников, А. Е. ПЦР-диагностика возбудителей болезней сортов картофеля (Solanum tuberosum) / А. Е. Калашников, Я. А. Кабицкая // Известия Кабардино-Балкарского государственного аграрного университета им. В.М. Кокова. – 2022. – № 2(36). – С. 5-14. – DOI 10.55196/2411-3492-2022-2-36-5-14

• Калашников, А. Е. Изменение встречаемости аллелей EAB-локуса групп крови у скота холмогорской породы вследствие голштинизации / А. Е. Калашников, В. Л. Ялуга // Известия Кабардино-Балкарского государственного аграрного университета им. В.М. Кокова. – 2022. – № 3(37). – С. 66-78. – DOI 10.55196/2411-3492-2022-3-37-66-78

• Геномная селекция как основа племенной работы (обзор) / А. Е. Калашников, А. И. Голубков, В. Г. Труфанов [и др.] // Вестник КрасГАУ. – 2021. – № 7(172). – С. 163-170. – DOI 10.36718/1819-4036-2021-7-163-170

• Генетическая изменчивость и функциональные различия толл - подобных рецепторов / К. Новак, А. Е. Калашников, Л. А. Калашникова [и др.] // Проблемы биологии продуктивных животных. – 2021. – № 2. – С. 22-37. – DOI 10.25687/1996-6733.prodanimbiol.2021.2.22-37

• Составление простых линейных моделей для прогноза племенной ценности животных / А. Е. Калашников, J. Pribyl, А. А. Кочетков [и др.] // Молочное и мясное скотоводство. – 2020. – № 4. – С. 13-16. – DOI 10.33943/MMS.2020.16.48.004

• Составление линейных моделей для прогноза племенной ценности животных в геномной оценке / А. Е. Калашников, J. Pribyl, А. А. Кочетков [и др.] // Молочное и мясное скотоводство. – 2020. – № 5. – С. 28-32. – DOI 10.33943/MMS.2020.31.63.005

• Прожерин, В. П. Генетическая изменчивость быков-производителей Архангельской популяции холмогорской породы крупного рогатого скота по поколениям / В. П. Прожерин, И. В. Селькова, А. Е. Калашников // Вестник Рязанского государственного агротехнологического университета им. П.А. Костычева. – 2020. – № 4(48). – С. 47-54. – DOI 10.36508/RSATU.2020.48.4.007

• Картирование генов врождённого иммунитета крупного рогатого скота отечественных пород для изучения основ формирования селекционнозначимых признаков / А. Е. Калашников, Е. А. Гладырь, А. А. Новиков [и др.] // Зоотехния. – 2019. – № 9. – С. 2-4. – DOI 10.25708/ZT.2019.15.32.001

• Калашников, А. Е. Язык программирования R как инструмент для расчёта племенной ценности животных / А. Е. Калашников, Е. Р. Гостева // Проблемы биологии продуктивных животных. – 2019. – № 3. – С. 106-113. – DOI 10.25687/1996-6733.prodanimbiol.2019.3.106-113

• Калашников, А. Е. Распространение РНК-содержащих вирусов пчел у медоносной пчелы (Apis mellifera) в отдельных регионах России / А. Е. Калашников, И. Г. Удина // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2017. – Т. 35, № 1. – С. 31-35. – DOI 10.18821/0208-0613-2017-35-1-31-35

• Генетическая дифференциация популяций медоносной пчелы ( Apis mellifera L.) и распространение РНК-содержащих вирусов пчел на фоне эпизоотии клеща V ARROA destructor на территории Удмуртии / А. Е. Калашников, И. В. Масленников, Л. М. Колбина, И. Г. Удина // Сельскохозяйственная биология. – 2013. – Т. 48, № 4. – С. 88-92

• О вирусной инфекции пчел в Республике Удмуртия / Л. М. Колбина, Н. А. Санникова, С. Л. Воробьева, А.Е. Калашников [и др.] // Пчеловодство. – 2012. – № 8. – С. 8-35

• Идентификация вируса деформации крыла (DWV) у медоносной пчелы / И. Г. Удина, А. Е. Гришечкин, А. Е. Калашников [и др.] // Вестник Российской академии сельскохозяйственных наук. – 2010. – № 1. – С. 69-71

• Cloning, sequencing, expression, and characterization of protealysin, a novel neutral proteinase from Serratia proteamaculans representing a new group of thermolysin-like proteases with short N-terminal region of precursor / I. V. Demidyuk, A. E. Kalashnikov, E. V. Gasanov [et al.] // Protein Expression and Purification. – 2006. – Vol. 47, No. 2. – P. 551-561. – DOI 10.1016/j.pep.2005.12.005

Методические пособия

• Дунин И.М., Новиков А.А., Калашникова Л. А., Калашников А.Е., Гладырь Е. А., Бурмистрова Л. А., Бородачев А.В., Николенко А.Г.,Ильясов Р. А., Туктаров В.Р., Бойко Е. Г., Удина И.Г. Стандартные методы генетической идентификации, определения достоверности происхождения и бонитировки пчелиных семей. // Методические рекомендации. 2021.- ФГБНУ ВНИИплем.- С.1-78. (DOI: 10.13140/RG.2.2.24373.76004, eLIBRARY ID: 48080581, приложение 1 eLIBRARY ID: 48080650)

• Дунин И.М., Тяпугин С.Е., Голубков А.И., Калашников А.Е.,  Калашникова Л.А., Захаров В.М., Новиков А.А., Щегольков Н.Ф., Дунин М.И., Přibyl J., Ахметов Т.М., Загидуллин Л.Р., Шайдуллин Р.Р.  Формирование моделей оценки племенной ценности животных  // Методическое пособие. 2021.- ФГБНУ ВНИИплем. С. 1-33. (DOI: 10.13140/RG.2.2.17570.50885, eLIBRARY ID: 47151739)

• Тяпугин С.Е., Калашникова Л.А., Новиков А.А,,  Калашников А.Е., Дунин М.И., Schröffelová D., Кабицкая Я.А., Ахметов Т.М., Загидуллин Л.Р., Шайдуллин Р.Р. Методическое пособие по генетической идентификации сельскохозяйственных и диких видов животных // Методическое пособие. 2021.- ФГБНУ ВНИИплем.- С.1-94. ( eLIBRARY ID: 50504094)

• Тяпугин С.Е., Новиков А.А., Калашников А.Е., Калашникова Л.А.,Захаров В.М., Дунин М.И. Форматирование и хранение результатов генетической идентификации и экспертизы племенной продукции в геномной селекции животных // Методическое пособие.- 2021.- ФГБНУ ВНИИплем.- С.1-32. (eLIBRARY ID: 50474712)

• Дунин И.М., Тяпугин С.Е., Пржибыл Й., Калашников А.Е., Щегольков Н.Ф., Захаров В.М., Калашникова Л.А., Дунин М.И., Ахметов Т.М., Загидуллин Л.Р., Шайдуллин Р.Р. Оценка племенной ценности сельскохозяйственных животных и ее использование в селекционной практике. Методическое пособие.- 2021.- ФГБНУ ВНИИплем.- С.1-73. (eLIBRARY ID: 47929912)

• Шичкин Г.И., Калашников А.Е., Шайдуллин Р.Р., Калашникова Л.А., Захаров В.М., Ахметов Т.М., Тюлькин С.В., Загидуллин Л.Р., Щегольков Н.Ф. Система селекции крупного рогатого скота на повышение естественной резистентности // Методические рекомендации.- Казань, 2022 г.,- С. 1-48. (DOI: 10.13140/RG.2.2.27038.31048, eLIBRARY ID: 50016662)