Научная тема: «РОЛЬ МИКРОБИОЦЕНОЗОВ ОТКРЫТЫХ ПОЛОСТЕЙ В ФОРМИРОВАНИИ РЕАКТИВНОСТИ ОРГАНИЗМА; ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ КРИТЕРИИ ДИСБИОЗОВ ДЛЯ ОЦЕНКИ СОСТОЯНИЯ ЗДОРОВЬЯ ЧЕЛОВЕКА»
Специальность: 03.02.03; 14.03.09
Год: 2013
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. Изменения уровней микробиологических показателей, гуморальных факторов микробиоценозов и активности TLR слизистых открытых полостей отражают патогенетические механизмы инфекционных заболеваний и могут быть диагностическими и прогностическими критериями динамики течения инфекционно-воспалительных процессов различной локализации.
  2. Выявление нарушений микроэкологии биотопов влагалища, кишечника и ротоглотки у беременных женщин, в том числе, с нарушением течения гестационного процесса, определяет необходимость проведения коррекции дисбиотических состояний.
  3. Оценка показателей микробного пейзажа позволяет дифференцировать распространенный гнойный вторичный или послеоперационный перитонит,  верифицировать возбудителей инфекции, корректировать и оценивать эффективность проводимой терапии, а также прогнозировать исход патологического процесса.
  4. Показана возможность влияния патогенов на формирование повышенной чувствительности макроорганизма к гетерологичным возбудителям инфекционного процесса на местном и организменном уровне. Доказана связь генотипических и фенотипических свойств возбудителей с патогенетическими механизмами и особенностями клинического течения инфекционных заболеваний.
Список опубликованных работ
1. Филатова Н. Нормализация микрофлоры влагалища с помощью иммунологического препарата «Кипферон, суппозитории» / Филатова Н., Макаров И., Афанасьев С., Алёшкин В., Воропаева Е.А. // Врач. – 2003.-№ 11.- С. 62-63.

2. Боровкова Е.И. Диагностические критерии определения риска внутриутробного инфицирования плода и угрозы прерывания беременности на ранних сроках / Боровкова Е.И., Воробьёв А.А., Воропаева Е.А., Алёшкин В.А., Сидорова И.С., Афанасьев С.С., Селькова Е.П., Несвижский Ю.В., Матвеевская Н.С. // Эпидемиология, Вакцинопрофилактика. Научно-практический журнал. – 2004. - №1 (14).- С. 45-50.

3. Алёшкин В.А. Становление пробиотикотерапии в России /Алёшкин В.А., Афанасьев С.С., Поспелова В.В., Воробьёв А.А., Феклисова Л.В., Несвижский Ю.В., Амерханова А.М., Пожалостина Л.В., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С., Давыдкин В.Ю., Лахтин В.М., Давыдкин И.Ю. // Вестник Российской академии медицинских наук. – 2005. – № 12. – С. 3-13.

4. Воропаева Е.А. Микроэкология и показатели гуморального иммунитета влагалища женщин с неспецифическими воспалительными заболеваниями гениталий. /Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Кудрявцева М.В., Алешкин В.А., Воробьев А.А., Несвижский Ю.В., Филатова Н.Г., Афанасьев М.С., Матвеевская Н.С. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2005. - № 3. - С. 65-69.

5. Алёшкин В.А. Микробиология и иммунология дисбиозов респираторного и урогенитального трактов / Алёшкин В.А., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Афанасьев М.С. // Аллергология и иммунология. - 2005. - Т. 6, № 3. - С. 354-355.

6. Афанасьев С.С. Влияние препаратов цитокинов на устойчивость бактерий к антибиотикам in vitro / Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Воробьёв А.А., Рубальский О.В., Несвижский Ю.В., Воропаева Е.А. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2005. - № 3. - С. 95-97.

7. Воропаева Е.А. Применение Кипферона при лечении уреаплазмоза у женщин / Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Кудрявцева М.В., Афанасьев М.С., Калмыков А.А., Денисов А.К., Мигранова О.М. // Фарматека. - 2006. - № 10 - С. 48-53.

8. Алёшкин В.А. Чувствительность микрофлоры влагалища к антибиотикам при уреаплазмозе у женщин / Алёшкин В.А., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Кудрявцева М.В., Афанасьев М.С., Байракова А.Л. // Сборник материалов XIII Российского национального конгресса “Человек и лекарство”. - М., 2006. - С. 51.

9. Афанасьев С.С. Иммуноглобулины влагалища при уреаплазмозе у женщин / Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Воропаева Е.А., Кудрявцева М.В., Афанасьев М.С., Матвеевская Н.С., Панурина Р.Л. // Сборник материалов XIII Российского национального конгресса “Человек и лекарство”. - М., 2006. - С. 56-57.

10. Кудрявцева М.В. Лечение уреаплазмоза с применением иммуномодуляторов / Кудрявцева М.В., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Афанасьев М.С., Матвеевская Н.С. // Сборник материалов XIII Российского национального конгресса “Человек и лекарство”. - М., 2006. - С. 184-185.

11. Воропаева Е.А. Микробиоценоз влагалища - критерий эффективности терапии / Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Кудрявцева М.В., Афанасьев М.С. // Сборник материалов XIII Российского национального конгресса “Человек и лекарство”. - М., 2006. - С. 96.

12. Воропаева Е.А. Микробиологические и иммунологические характеристики дисбиотических нарушений биотопов слизистых оболочек респираторного и урогенитального трактов / Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Воробьёв А.А., Матвеевская Н.С., Несвижский Ю.В., Афанасьев М.С., Кудрявцева М.В., Панурина Р.Л. // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2006. - № 1. - С. 3-5.

13. Воропаева Е.А. Новый иммунобиологический препарат «Кипферон, суппозитории» при лечении хронического уреаплазмоза у женщин / Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Кудрявцева М.В., Денисов А.К., Кондрашин Ю.И., Мигранова О.М. // Гинекология. - 2006. - Том 8, № 3. - С. 32-36.

14. Воропаева Е.А. Микробиологические и иммунологические критерии оценки эффективности лечения уреаплазмоза женщин / Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Воробьев А.А., Кудрявцева М.В., Несвижский Ю.А., Афанасьев М.С., Матвеевская Н.С., Панурина Р.Л. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2007 - № 2. - С. 65-70.

15. Макаров О.В. Инфекции в акушерстве и гинекологии. Монография. / Макаров О.В., Алёшкин В.А., Савченко Т.Н., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Ганковская Л.В., Хашукоева А.З., Бахарева И.В., Каюкова С.И., Протопопова Л.О., Афанасьев М.С., Гиммельфарб Е.И., Новикова Л.И. // М., «МЕДпресс-информ». - 2007. - 464 с.

16. Алешкин В.А. Уровни иммуноглобулинового профиля влагалища как прогностический тест при уреаплазмозе у женщин / Алешкин В.А., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Кудрявцева М.В., Афанасьев М.С., Матвеевская Н.С., Панурина Р.Л. // Сборник материалов XIV Российского национального конгресса «Человек и лекарство». - М., 2007. - С. 45.

17. Воропаева Е.А. Анализ лечения уреаплазмоза с применением иммуномодуляторов в динамике / Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Афанасьев М.С., Кудрявцева М.В. // Сборник материалов XIV Российского национального конгресса «Человек и лекарство». - М., 2007. - С. 74.

18. Воропаева Е.А. Об эффективности лечения хронического уреаплазмоза у женщин с использованием нового иммунологического препарата Кипферон / Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Кудрявцева М.В., Афанасьев М.С., Калмыков А.А., Денисов А.К., Кондрашин Ю.И. // Трудный пациент. - 2007. - Т. 5, № 1. - С. 28-33.

19. Афанасьев С.С. Перспективы применения нового отечественного иммунобиологического препарата «Кипферон, суппозитории» в лечении инфекционных заболеваний / Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Иванов С.Г., Феклисова Л.В., Рубальский О.В., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С., Калмыков А.А., Денисов А.К. // Трудный пациент. - 2007. - Т. 5, № 3. - С. 49-53.

20. Феклисова Л.В. Применение отечественного иммунобиологического препарата Кипферон®суппозитории в комплексной терпи детей, больных ангиной / Феклисова Л.В., Галкина Л.А., Казакова С.П., Репина И.Б., Воропаева Е.А., Алёшкин В.А., Афанасьев С.С. // Педиатрия. - 2007. - Том 86, № 5. - С. 93-98.

21. Гостищев В.К. Третичный перитонит: возможности его профилактики / Гостищев В.К., Станоевич У.С., Алёшкин В.А., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Шкроб Л.О., Матвиевская Н.С., Попов Д.В. // Хирургия. - 2007. - № 9. - С. 15-18.

22. Воропаева Е.А. Протеазная активность микрофлоры ротовой полости больных пародонтитом / Воропаева Е.А., Байракова А.Л., Бичучер А.М., Дьяков В.Л., Козлов Л.В. // Биомедицинская химия. - 2008. - Том 54, Выпуск 6. - С. 706-712.

23. Воропаева Е.А. Микрофлора биотопов влагалища, ротоглотки и кишечника женщин с угрозой прерывания беременности на ранних сроках / Воропаева Е.А., Алёшкин В.А., Макаров О.В., Афанасьев С.С., Савченко Т.Н., Протопопова Л.А., Несвижский Ю.В., Байракова А.Л., Матвиевская Н.С., Егорова Е.А., Метельская В.А., Гречишникова О.Г., Афанасьев М.С., Панурина Р.Л., Хашукоева А.З. // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2008. - № 2. - С. 6-12.

24. Байракова А.Л. Уровень экспрессии генов TLR-2 и TLR-4 как прогностический критерий излеченности при урогенитальном хламидиозе / Байракова А.Л., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Кафарская Л.И., Ефимов Б.А., Шкопоров А.Н., Гречишникова О.Г., Метельская В.А., Афанасьев М.С., Егорова Е.А. // Человек и лекарство: сборник материалов XV Российского национального конгресса. - М., 2008. - С. 387-388.

25. Гречишникова О.Г. Лабораторная база диагностики хламидиоза / Гречишникова О.Г., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Метельская В.А., Байракова А.Л., Слободенюк В.В., Афанасьев М.С., Егорова Е.А. // Человек и лекарство: сборник материалов XV Российского национального конгресса. – М., 2008. - С. 430-431.

26. Байракова А.Л. Уровни экспрессии генов TLR-2 и TLR-4 как показатели динамики патогенетических изменений при урогенитальном хламидиозе / Байракова А.Л., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Кафарская Л.И., Ефимов Б.А., Шкопоров А.Н., Гречишникова О.Г., Метельская В.А., Афанасьев М.С., Егорова Е.А. // Идеи Пастера в борьбе с инфекциями. Материалы четвертой международной конференции. - СПб, 2008. - С. 53.

27. Байракова А.Л. Роль и биологическое значение Толл-подобных рецепторов в антиинфекционной резистентности организма / Байракова А.Л., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Егорова Е.А., Метельская В.А., Гречишникова О.Г., Афанасьев М.С., Рубальский О.В. // Вестник Российской академии медицинских наук. – 2008. – № 1. – С. 45-54.

28. Караулов А.В. Прогностическая значимость экспрессии генов TLR-2 и TLR-4 при урогенитальном хламидиозе у женщин / Караулов А.В., Афанасьев М.С., Байракова А.Л., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Кафарская Л.И., Шкопоров А.Н., Несвижский Ю.В., Леваков С.А. // Российский иммунологический журнал. – 2008. – Т. 2, № 2-3. – С. 178.

29. Алешкин В.А. Уровни экспрессии генов TLR-2 и TLR-4 как критерий оценки эффективности алгоритмов терапии при хламидиозе / Алешкин В.А., Воропаева Е.А., Караулов А.В., Байракова А.Л., Афанасьев С.С., Кафарская Л.И., Несвижский Ю.В., Ефимов Б.А., Шкопоров А.Н., Гречишникова О.Г., Леваков С.А., Метельская В.А., Афанасьев М.С., Егорова Е.А., Слободенюк В.В., Фандеева Е.В. // Современные представления об иммунокоррекции. Материалы Всероссийской научно-практической конференции. – Пенза, 2008. – С. 8-10.

30. Воропаева Е.А. Связь уровней экспрессии генов TLR-2 и TLR-4 с изменениями микробиоценоза урогенитального тракта при урогенитальном хламидиозе у женщин / Воропаева Е.А., Караулов А.В., Байракова А.Л., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Кафарская Л.И., Несвижский Ю.В., Ефимов Б.А., Шкопоров А.Н., Гречишникова О.Г., Леваков С.А., Метельская В.А., Афанасьев М.С., Егорова Е.А., Слободенюк В.В., Фандеева Е.В. // Иммунопатология, Аллергология, Инфектология. – 2008 – № 2. – С. 68-76.

31. Афанасьев С.С. Связь уровней экспрессии генов TLR-2 и TLR-4 с изменениями цитокинового профиля урогенитального тракта при урогенитальном хламидиозе у женщин / Афанасьев С.С., Байракова А.Л., Воропаева Е.А., Алёшкин В.А., Караулов А.В., Кафарская Л.И., Несвижский Ю.В., Топтыгина А.П., Ефимов Б.А., Шкопоров А.Н., Гречишникова О.Г., Леваков С.А., Кострова О.М., Метельская В.А., Афанасьев М.С., Егорова Е.А., Слободенюк В.В., Фандеева Е.В. // Естественные науки. – 2008 – № 4 (25). – С. 62-73.

32. Метельская В.А. Современные методы лабораторной диагностики хламидиозов / Метельская В.А., Алешкин В.А., Зверев В.В., Гречишникова О.Г., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Несвижский Ю.В., Афанасьев М.С., Байракова А.Л., Егорова Е.А. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2008 – № 4. – С. 111-117.

33. Макаров О.В. Инфекции в акушерстве и гинекологии. – Монография, 2-е издание. / Макаров О.В., Алёшкин В.А., Савченко Т.Н., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Ганковская Л.В., Хашукоева А.З., Бахарева И.В., Каюкова С.И., Протопопова Л.О., Афанасьев М.С., Гиммельфарб Е.И., Новикова Л.И. // М., «МЕДпресс-информ». - 2009. - 464 с.

34. Гречишникова О.Г. Сравнительная характеристика методов лабораторной диагностики урогенитального хламидиоза у больных в зависимости от остроты клинических проявлений / Гречишникова О.Г., Слободенюк В.В., Воропаева Е.А., Алешкин В.А., Афанасьев С.С., Метельская В.А., Байракова А.Л., Афанасьев М.С., Егорова Е.А. // Человек и лекарство: сборник материалов XVI Росс. Нац. конгресса – М, 6-10 апр. 2009. – С. 76.

35. Гречишникова О.Г. Фенотипическая характеристика штаммов хламидий, выделенных от человека и обезьян культуральным методом / Гречишникова О.Г., Слободенюк В.В., Алешкин В.А., Лапин Б.А., Афанасьев С.С., Ликов В.Ф., Воропаева Е.А., Джикидзе Э.К., Несвижский Ю.В., Воложанцев Н.В., Полещук Н.Н., Светоч Э.А., Дятлов И.А., Афанасьев М.С., Рубальский О.В., Метельская В.А., Байракова А.Л., Рубанин Л.В., Егорова Е.А., Рубальский Е.О., Квачева З.Б., Евсегнеева И.В., Караулов А.В. // Иммунопатология, Аллергология, Инфектология. – 2009 – № 3. – С. 44-53.

36. Слободенюк В.В. ПЦР-детекция и идентификация возбудителей хламидийных инфекций человека и обезьян / Слободенюк В.В., Алешкин В.А., Лапин Б.А., Афанасьев С.С., Кокушков Д.В., Гречишникова О.Г., Воропаева Е.А., Джикидзе Э.К., Несвижский Ю.В., Воложанцев Н.В., Светоч Э.А., Дятлов И.А., Афанасьев М.С., Рубальский О.В., Метельская В.А., Байракова А.Л., Егорова Е.А., Рубальский Е.О., Евсегнеева И.В., Караулов А.В. // Иммунопатология, Аллергология, Инфектология. – 2009 - № 3. - С. 54-62.

37. Слободенюк В.В. Генотипирование и анализ антибиотикорезистентности штаммов Chlamydia trachomatis, выделенных от человека и обезьян / Слободенюк В.В., Караулов А.В., Алешкин В.А., Гречишникова О.Г., Афанасьев С.С., Лапин Б.А., Джикидзе Э.К., Несвижский Ю.В., Воложанцев Н.В., Светоч Э.А., Дятлов И.А., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С., Метельская В.А., Егорова Е.А., Байракова А.Л. // Иммунопатология, Аллергология, Инфектология. – 2009 – № 4. – С. 74-81.

38. Слободенюк В.В. Сравнительная характеристика методов верификации Chlamydia trachomatis у человека и обезьян / Слободенюк В.В., Алешкин В.А., Афанасьев С.С., Гречишникова О.Г., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С., Метельская В.А., Байракова А.Л., Егорова Е.А., Лапин Б.А., Джикидзе Э.К., Караулов А.В., Несвижский Ю.В., Теплый Д.Л., Рубальский О.В., Рубальский Е.О. // Естественные науки. – 2009 – № 1 (26). – С. 65-71.

39. Байракова А.Л. Уровни экспрессии генов TLR-2 и TLR-4 как способ оценки формы и прогноза течения урогенитальной хламидийной инфекции у женщин / Байракова А.Л., Гречишникова О.Г., Алешкин В.А., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Метельская В.А., Афанасьев М.С. // Биологическая безопасность в современном мире. Материалы науч.-практ. конф. 21-22 апреля 2009, ФГУН ГНЦ ПМБ – Оболенск, С. 98-100.

40. Афанасьев С.С. Молекулярные механизмы индукции врождённого иммунитета / Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Байракова А.Л., Воропаева Е.А., Несвижский Ю.В., Кафарская Л.И., Егорова Е.А., Афанасьев М.С., Метельская В.А., Гречишникова О.Г., Куракова А.А. // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2009. - № 4. - С. 42-49.

41. Алешкин В.А. Связь уровней МРНК TLR-2 и TLR-4 с изменениями иммуноглобулинового профиля урогенитального тракта при урогенитальном хламидиозе у женщин / Алешкин В.А., Караулов А.В., Байракова А.Л., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Кафарская Л.И., Несвижский Ю.В., Ефимов Б.А., Шкопоров А.Н., Афанасьев М.С., Гречишникова О.Г., Леваков С.А., Метельская В.А., Матвеевская Н.С., Панурина Р.Л., Егорова Е.А., Слободенюк В.В., Фандеева Е.В. // Иммунология. - 2009. - Т. 30, № 3. - С. 165-170.

42. Байракова А.Л. Экспрессия гена TLR-2 как показатель состояния локального иммунитета у женщин с урогенитальной хламидийной инфекцией / Байракова А.Л., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Алёшкин В.А., Фандеева Е.В., Афанасьев М.С., Гречишникова О.Г., Метельская В.А., Слободенюк В.В. // Научное обеспечение противоэпидемической защиты населения: сборник материалов юбилейной Всероссийской науч.-практ. конференции. - Нижний-Новгород.- 2009. – С. 172-173.

43.Урбан Ю.Н. Применение метода ПЦР в реальном времени для определения видового разнообразия бифидобактерий / Урбан Ю.Н., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С. // Гастроэнтерология. - Санкт-Петербург. - 2009. - № 4. - С. 40.

44. Топтыгина А.П. Особенности индукции местного иммунного ответа у больных урогенитальным хламидиозом / Топтыгина А.П., Афанасьев С.С., Байракова А.Л., Воропаева Е.А., Алёшкин В.А., Кафарская Л.И., Афанасьев М.С., Фандеева Е.В. // Российский иммунологический журнал. - 2009. - Том 3(12), № 2. - С. 171-176.

45. Слободенюк В.В. Изучение генотипов и антибиотикорезистентности штамммов Chlamydia trachomatis, выделенных от человека и обезьян / Слободенюк В.В., Караулов А.В., Алешкин В.А., Гречишникова О.Г., Афанасьев С.С., Лапин Б.А., Джикидзе Э.К., Несвижский Ю.В., Воложанцев Н.В., Светоч Э.А., Дятлов И.А., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С., Алешкин А.В., Метельская В.А., Егорова Е.А., Байракова А.Л. // Человек и лекарство: сборник материалов XVII Росс. Нац. Конгресса, М, 12-16 апр.2010. – С. 719.

46. Гречишникова О.Г. Сравнительный анализ прямых методов лабораторной диагностики урогенитального хламидиоза / Гречишникова О.Г., Алешкин В.А., Афанасьев С.С., Слободенюк В.В., Караулов А.В., Несвижский Ю.В., Рубальский О.В., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С., Метельская В.А., Байракова А.Л., Егорова Е.А., Рубальский Е.О. // Астраханский медицинский журнал. – 2010 – Т. 5., № 2. – С. 80-86.

47. Байракова А.Л. Уровни экспрессии TLR-2 и TLR-4 как прогностический критерий излеченности при хламидиозе / Байракова А.Л., Воропаева Е.А., Алёшкин В.А., Афанасьев С.С., Караулов А.В., Кафарская Л.И., Несвижский Ю.В., Ефимов Б.А., Шкопоров А.Н., Гречишникова О.Г., Леваков С.А., Метельская В.А., Афанасьев М.С., Егорова Е.А., Слободенюк В.В., Фандеева Е.В. // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2010. - № 4. - С. 35-42.

48. Афанасьев М.С. Роль врождённого иммунитета и микроорганизмов биотопов слизистых оболочек урогенитального тракта женщин в патогенезе хламидийной инфекции / Афанасьев М.С., Караулов А.В., Алёшкин В.А., Афанасьев С.С., Несвижский Ю.В., Воропаева Е.А. // Сеченовский Вестник. - 2010. - № 2 (2). - С. 64-69.

49. Слободенюк В.В. Спонтанный хламидиоз у обезьян как модель хламидийной инфекции / Слободенюк В.В., Каркищенко Н.Н., Афанасьев С.С., Лапин Б.А., Алёшкин В.А., Караулов А.В., Несвижский Ю.В., Пчелинцев С.Ю., Джикидзе Э.К., Афанасьев М.С., Воропаева Е.А. // Биомедицина. - 2010. - № 5. - С. 6-16.

50. Алёшкин В.А. Нарушение микробиоценозов у детей: многоцентровое исследование. Сообщение I. Микробиоценоз и дисбактериоз ротоглотки у детей / Алёшкин В.А., Галимзянов Х.М., Афанасьев С.С., Караулов А.В., Рубальский О.В., Несвижский Ю.В., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С. // Астраханский медицинский журнал. - 2010. -Т. 5. - № 3. - С. 9-13.

51. Метельская В.А. Колонизационная резистентность и иммунологическая реактивность слизистых ротоглотки у детей в норме и при бронхолёгочных заболеваниях / Метельская В.А., Алёшкин В.А., Воропаева Е.А., Караулов А.В., Несвижский Ю.В., Афанасьев С.С., Матвеевская Н.С., Панурина Р.Л., Бичучер А.М., Гречишникова О.Г., Байракова А.Л., Урбан Ю.Н., Алёшкин А.В., Слободенюк В.В., Егорова Е.А. // Вестник Российской академии медицинских наук. – 2010 – № 7. – С. 10-15.

52. Караулов А.В. Адгезия клетками назофаригеального и буккального эпителия индигенных и условно-патогенных микроорганизмов как показатель резистентности респираторного тракта детей с бронхитами и пневмониями / Караулов А.В., Метельская В.А., Алёшкин В.А., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Гречишникова О.Г., Несвижский Ю.В., Кокушков Д.В., Алёшкин А.В., Егорова Е.А., Урбан Ю.Н., Слободенюк В.В., Байракова А.Л. // Иммунопатология, Аллергология, Инфектология. – 2010. – № 3. – С. 37-46.

53. Феклисова Л.В. Оптимизация методов лечения детей с вирусно-бактериальными инфекциями различной этиологии / Феклисова Л.В., Мескина Е.Р., Галкина Л.А., Целипанова Е.Е., Казакова С.П., Савицкая Н.А., Караулов А.В., Алёшкин В.А., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Волохович Т.Т. // Новая медицинская технология. - М.- 2010.- 15 с.

54. Карпова Е.П. Роль инфекции в развитии патологии верхнего отдела дыхательных путей у детей. / Карпова Е.П., Захарова И.Н., Солдатский Ю.Л., Афанасьев С.С., Тулупов Д.А., Воропаева Е.А., Вагина Е.А., Метельская В.А. // Пособие для врачей.- М.- 2010.- 218 с.

55. Топтыгина А.П. Изменения в цитокиновом профиле сыворотки крови и слюны детей при остром и хроническом бронхите / Топтыгина А.П., Метельская В.А., Воропаева Е.А., Алёшкин В.А., Караулов А.В., Афанасьев С.С. // Российский иммунологический журнал. - 2011. -Том 5(14). - № 2. - С. 145-149.

56. Караулов А.А. Колонизационная резистентность слизистых цервикального канала как неотъемлемая составляющая местного иммунитета / Караулов А.А., Афанасьев М.С., Алёшкин В.А., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А. // Иммунология. - 2011. -Том 32, № 1. - С. 11-15.

57. Афанасьев М.С. Микробиотоп влагалища и его патогенетическая роль при уреаплазмозе и хламидиозе / Афанасьев М.С., Караулов А.В., Алёшкин В.А., Галимзянов Х.М., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Несвижский Ю.В., Рубальский Е.О., Егорова Е.А. // Астраханский медицинский журнал. – 2011 – Т. 6. - № 1. – С. 137-142.

58. Алёшкин В.А. Нарушение микробиоценозов у детей: многоцентровое исследование. Сообщение II. Микробиоценоз и дисбактериоз влагалища у девочек / Алёшкин В.А., Галимзянов Х.М., Афанасьев С.С., Караулов А.В., Несвижский Ю.В., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С. // Астраханский медицинский журнал. – 2011 – Т. 6. - № 1. – С. 222-225.

59. Алёшкин В.А. Нарушение микробиоценоза у детей: многоцентровое исследование. Сообщение III. Микробиоценоз и дисбактериоз кишечника / Алёшкин В.А., Галимзянов Х.М., Афанасьев С.С., Караулов А.В., Несвижский Ю.В., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С., Рубальский Е.О. // Астраханский медицинский журнал. - 2011. -Т. 6. - № 2. - С. 124-128.

60. Лахтин М.В. Поведение Candida tropicalis и Candida krusei в присутствии пробиотических лектинов / Лахтин М.В., Алёшкин В.А., Лахтин В.М., Афанасьев С.С., Караулов А.В., Галимзянов Х.М., Несвижский Ю.В., Байракова А.Л., Воропаева Е.А., Алёшкин А.В., Рубальский Е.О. //Астраханский медицинский журнал. - 2011. -Т. 6. - № 3. - С. 97-101.

61. Караулов А.В. Установление генотипических и фенотипических свойств возбудителя и его филогенетического положемия в семействе Chlamydiaceae штаммов хламидий, выделенных от обезьян и человека с хламидийной патологией / Караулов А.В., Слободенюк В.В., Алёшкин В.А., Гречишникова О.Г., Афанасьев С.С., Джикидзе Э.К., Несвижский Ю.В., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С., Алёшкин А.В., Метельская В.А., Егорова Е.А., Байракова А.Л. // Вестник Российской академии медицинских наук. – 2011 – № 7. – С. 16-21.

62. Макаров О.В. Микрофлора влагалища и цервикального канала у женщин с полипами шейки матки / Макаров О.В., Савченко Т.Н., Алёшкин В.А., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Мельнгиков А.В., Батиян Т.С. // Вестник Российского государственного медицинского университета. - 2011. - № 4. - С. 43-47.

63. Зверев В.В. Микроэкология и гуморальный иммунитет слизистых открытых полостей человека в норме и при патологических состояниях. / Зверев В.В., Несвижский Ю.В., Воропаева Е.А., Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Караулов А.В., Галимзянов Х.М., Макаров О.В., Богданова Е.А., Рубальский О.В., Афанасьев М.С., Матвеевская Н.С., Афанасьев Д.С., Савченко Т.Н., Метельская В.А., Рубальская Е.Е., Рубальский Е.О. // Учебное пособие для системы послевузовского профессионального образования врачей. – Астрахань - Москва. - 2011. - 80 с.

64. Феклисова Л.В. Клинико-лабораторная эффективность применения отечественного комбинированного пробиотика «Флорин Форте» в комплексном лечении детей с инфекционной респираторной патологией и при острых кишечных инфекциях. / Феклисова Л.В., Целипанова Е.Е., Мескина Е.Р., Галкина Л.А., Савицкая Н.А., Кирсанова С.П., Русанова Е.В., Троянский И.В., Воропаева Е.А., Пожалостина Л.В., Афанасьев С.С., Алёшкин В.А. // Учебное пособие.- М.- 2011.- 36 с.

65. Караулов А.В. Хламидийная инфекция. Новые аспекты патогенеза, иммунологии, верификации и лечения инфекции у человека и приматов. / Караулов А.В., Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Лапин Б.А., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С., Слободенюк В.В., Алёшкин А.В., Байракова А.Л., Гречишникова О.Г., Дятлов И.А., Галимзянов Х.М., Евсегнеева И.В., Джикидзе Э.К., Рубальский О.В., Несвижский Ю.В., Миронов А.Ю., Фотиади О.Г., Кафарская Л.И., Кострова О.М., Топтыгина А.П., Матвеевская Н.С., Афанасьев Д.С., Рубальский Е.О., Светоч Э.А., Пчелинцев С.Ю., Логунов О.В., Новикова Л.И., Ликов В.Ф. // М.- 2012.- 256 с.

66. Лахтин М.В. Защита потенциальных антител человека от протеолиза секретами клинических штаммов кандид в присутствии лектинов пробиотических бактерий человека / Лахтин М.В., Козлов Л.В., Лахтин В.М., Алёшкин В.А., Афанасьев С.С., Караулов А.В., Несвижский Ю.В., Байракова А.Л., Воропаева Е.А., Афанасьев М.С., Бичучер А.М., Панурина Р.Л., Рубальский Е.О. // Астраханский медицинский журнал. – 2012 – Т. 7, № 1. – С. 63-68.

67. Савченко Т.Н. Нарушение микробиоценоза влагалища как фактор невынашивания беременности / Савченко Т.Н., Макаров О.В., Алёшкин В.А., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Мельников А.Н., Стрыгина В.А. // Научно-практический медицинский журнал Лечение и профилактика. - 2012.- № 1(2). - С. 39-43.

68. Караулов А.В. Показатели колонизационной резистентности слизистых ротоглотки как объективные критерии мукозального иммунитета при бронхитах у детей / Караулов А.В., Алёшкин В.А., Воропаева Е.А., Метельская В.А., Слободенюк В.В., Афанасьев М.С., Затевалов А.М., Топтыгина А.П., Афанасьев С.С., Несвижский Ю.В., Урбан Ю.Н., Рубальский Е.О., Матвеевская Н.С. // Иммунология. - 2012. - Том 33, № 5. - С. 255-259.

69. Воропаева Е.А. Оценка микробиоценоза влагалища при акушерской и гинекологической патологии / Воропаева Е.А., Караулов А.В., Афанасьев С.С., Алёшкин В.А., Макаров О.В., Несвижский Ю.В., Афанасьев М.С., Матвеевская Н.С., Савченко Т.Н., Рубальский О.В. // Новая медицинская технология.- Москва-Астрахань.- 2012.- 50 с.

70. Aleshkin V.A. Use of interferon for preventing microorganisms to acquire antibiotic resistance in ureaplasmosis treatment of women / Aleshkin V.A., Afanasiev S.S., Voropaeva E.A., Afanasiev M.S. // International J. on Immunorehabilitation. - 2006. - Vol. 8, № 1. - P. 46.

71. Slobodenuk V.V. The comparative estimation of diagnostic value of laboratory methods for urogenital chlamydiosis in humans and monkeys / Slobodenuk V.V., Aleshkin V.A., Lapin B.A., Karaulov A.V., Afanasiev S.S., Grechishnikova O.G., Voropaeva E.A., Jikidze E.K, Nesvizskii U.V., Afanasiev M.S., Metelskaia V.A., Birakova A.L., Egorova E.A. // FEMS 2009, 3rd Congress of European Microbiologists. Gothenburg, Sweden, June 28-Juli 2, 2009.

72. Karaulov Alexander Identification of Phylogenetic Position in the Chlamydiaceae Family for Chlamydia Strains Released fromMonkeys and Humans with Chlamydial Pathology / Karaulov Alexander, Aleshkin Vladimir, Slobodenyuk Vladimir, Grechishnikova Olga, Afanasyev Stanislav, Lapin Boris, Dzhikidze Eteri, Nesvizhsky Yuriy, Voropayeva Elena, Afanasyev Maxim, Aleshkin Andrei, Metelskaya Valeria, Yegorova Ekaterina, Bayrakova Alexandra. // Infectious Diseases in Obstetrics and Gynecology. – Volume 2010, Article ID 130760, 11 pages.

Патенты РФ на изобретение

1. Пат. № 2249821 Российская Федерация МПК G 01 N 33/48. Способ оценки микробиоценоза влагалища / Е.А. Воропаева, С.С. Афанасьев, В.А. Алешкин, А.А. Воробьев, Ю.В. Несвижский, О.В. Рубальский, Н.Г. Филатова, М.В. Кудрявцева, М.С. Афанасьев, Н.С. Матвеевская; заявитель и патентообладатель ГУ МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Минздрава РФ. - № 2004112817; заявл. 27.04.2004; зарег. во ФГУП «Роспатент» 10.04.2005; Бюл. № 10.

2. Пат. № 2279469 Российская Федерация МПК С12N 1/10. Основа для выделения и культивирования микроорганизмов / А.А. Воробьёв, Ю.В. Несивжский, В.А. Алёшкин, Е.А. Богданова, С.С. Афанасьев, О.В. Рубальский, Е.В. Герасимова, Е.А. Воропаева, В.Ю. Давыдкин, И.Ю. Давыдкин; заявители и патентообладатели А.А. Воробьёв, Ю.В. Несвижский, В.А. Алёшкин, Е.А. Богданова, С.С. Афанасьев, О.В. Рубальский, Е.В. Герасимова, Е.А. Воропаева, В.Ю. Давыдкин, И.Ю. Давыдкин. - № 2005109344/13; заявл. 01.04.2005; зарег. во ФГУП «Роспатент» 10.07.2006; Бюл. № 19.

3. Пат. № 2322506 Российская Федерация МПК С12Q 1/02. Способ определения защитного действия покрытия капсул для штамма Bifidobacterium adolescentis MC42 от содержимого желудка / В.А. Алёшкин, Б.А. Лапин, С.С. Афанасьев, Э.К. Джикидзе, К.В. Симавонян, В.Ю. Давыдкин, И.Ю. Давыдкин, Е.А. Воропаева, О.В. Рубальский, Л.И. Холодилова, А.В. Мелихова, Л.И. Трофимова, Т.И. Кебу, А.Л. Байракова, В.А. Калашникова, М.С. Афанасьев, Т.П. Егорова; заявители и патентообладатели ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора, ГУ НИИ МП РАМН. - № 2006142790/13; заявл. 05.12.2006; зарег. во ФГУП «Роспатент» 20.04.2008; Бюл. № 11.

4. Пат. № 2327995 Российская Федерация МПК G 01 N 33/569; C 12 Q 1/68. Способ диагностики хронического урогенитального хламидиоза /А.Л. Байракова, В.А. Алешкин, Е.А. Воропаева, С.С. Афанасьев, Л.И. Кафарская, О.М. Кострова, Ю.В. Несвижский, О.В. Рубальский, О.Г. Гречишникова, В.А. Метельская, А.Н. Шкопоров, Б.А. Ефимов, А.А. Куракова, Е.А. Егорова, К.В. Поздняков, М.С. Афанасьев, А.М. Затевалов, Е.В. Хохлова; заявитель и патентообладатель ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора. - № 2007123483; заявл. 25.06.2007; зарег. во ФГУП «Роспатент» 27.06.2008; Бюл. № 18.

5. Пат. № 2333005 Российская Федерация МПК А61К 35/76. Способ профилактики нозокомиального перитонита /В.А. Алёшкин, В.К. Гостищев, С.С. Афанасьев, У.С. Станоевич, Е.А. Воропаева, О.В. Рубальский, Л.О. Шкроб, А.Л. Байракова, М.С. Афанасьев, А.А. Куракова, Д.С. Афанасьев; заявитель и патентообладатель ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора.-№ 2006144767/14; заявл. 18.12.2006; зарег. во ФГУП «Роспатент» 10.09.2008; Бюл. № 25.

6. Пат. № 2377311 Российская Федерация МПК C12Q 1/18. Способ прогнозирования дестабилизации микробиоценоза организма млекопитающего /С.В. Грачёв, Ю.В. Несвижский, В.А. Алёшкин, С.С. Афанасьев, О.В. Рубальский, Е.А. Богданова, Е.А. Воропаева, Е.О. Рубальский, Е.В. Герасимова; заявители и патентообладатели ГОУВПО ММА им. Н.М. Сеченова Росздрава, ГОУВПО АГМА Росздрава, ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора. - № 2008108191/13; заявл. 05.03.2008; зарег. во ФГУП «Роспатент» 27.12.2009; Бюл. № 36.

7. Пат. № 2377006 Российская Федерация МПК А61К 35/76. Препарат, содержащий стафилококковый бактериофаг в качестве препарата для лечения кандидоза / Ю.В. Несвижский, В.А. Алёшкин, С.С. Афанасьев, О.В. Рубальский, И.М. Макеева, Е.А. Богданова, Е.А. Воропаева, С.В. Грачёв, О.С. Аляутдина, Ю.Ф. Космачёв, Е.О. Рубальский; заявители и патентообладатели ГОУ ВПО ММА им. Н.М. Сеченова Росздрава, ГОУ ВПО АГМА Росздрава, ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора. - № 2008118996/15; заявл. 15.05.2008; зарег. во ФГУП «Роспатент» 27.12.2009; Бюл. № 36.

8. Пат. № 2385945 Российская Федерация МПК C 12 Q 1/68. Способ прогнозирования манифестной или стертой формы хламидийной инфекции человека или обезьян и набор для его осуществления / В.В. Слободенюк, В.А. Алешкин, С.С.Афанасьев, Б.А. Лапин, Е.А. Воропаева, В.А. Баннов, О.М. Кострова, А.В. Караулов, Э.К. Джикидзе, Н.В. Воложанцев, И.А. Дятлов, Э.А. Светоч, О.Г. Гречишникова, В.А. Метельская, А.Л. Байракова, М.С. Афанасьев, Е.А. Егорова, О.В. Рубальский, Д.С. Афанасьев, Е.О. Рубальский, Ю.Н. Урбан, А.Н. Куракова; заявитель и патентообладатель ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора.- № 2008151548/13; заявл. 26.12.2008; зарег. во ФГУП «Роспатент» 10.04.2010; Бюл. № 10.

9. Пат. № 2385946 Российская Федерация МПК C 12 Q 1/68. Способ диагностики хламидийной инфекции человека или обезьян и набор для его осуществления / В.В. Слободенюк, В.А. Алешкин, С.С.Афанасьев, Б.А. Лапин, Е.А. Воропаева, В.А. Баннов, О.М. Кострова, А.В. Караулов, Э.К. Джикидзе, Н.В. Воложанцев, И.А. Дятлов, Э.А. Светоч, О.Г. Гречишникова, В.А. Метельская, А.Л. Байракова, М.С. Афанасьев, Е.А. Егорова, О.В. Рубальский, Д.С. Афанасьев, Е.О. Рубальский, Ю.Н. Урбан, А.Н. Куракова; заявитель и патентообладатель ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора.- № 2008151550/13; заявл. 26.12.2008; зарег. во ФГУП «Роспатент» 10.04.2010; Бюл. № 10.

10. Пат. № 2443782 Российская Федерация МПК C 12Q 1/04. Способ генотипирования Chlamydia trachomatis / В.В. Слободенюк, В.А. Алешкин, С.С.Афанасьев, Б.А. Лапин, Х.М. Галимзянов, Е.А. Воропаева, Ю.В. Несвижский, А.В. Алёшкин, О.М. Кострова, А.В. Караулов, О.В. Рубальский, Э.К. Джикидзе, И.А. Дятлов, Э.А. Светоч, О.Г. Гречишникова, В.А. Метельская, А.Л. Байракова, М.С. Афанасьев, Е.А. Егорова, Д.С. Афанасьев, Ю.Н. Урбан, Е.О. Рубальский; заявители и патентообладатели ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора, ГОУВПО АГМА Росздрава. - № 2010132294/10; заявл. 03.08.2010; зарег. во ФГУП «Роспатент» 27.02.2012; Бюл. № 6.

11. Пат. № 2390022 Российская Федерация МПК GO1N 33/48. Способ диагностики угрозы прерывания беременности /Т.Н. Савченко, О.В. Макаров, А.З. Хашукоева, В.А. Алёшкин, Е.А. Воропаева, С.С. Афанасьев, Л.О. Протопопова, Н.С. Матвеевская; заявитель и патентообладатель ГОУВПО РГМУ Федерального агенства по здравоохранению и социальному развитию.- № 2007146816/15; завял. 19.12.2007; зарег. во ФГУП «Роспатент» 20.05.2010; Бюл. № 14.

12. Пат. № 2394559 Российская Федерация МПК А61К 31/165. Способ установления неспецифического противоинфекционного действия иммуномодулирующего иммунобиологического препарата / В.А. Алёшкин, Б.А. Лапин, С.С. Афанасьев, Э.К. Джикидзе, К.В. Симавонян, О.В. Рубальский, Е.А. Воропаева, В.Ю. Давыдкин, И.Ю. Давыдкин, Л.И. Холодилова, А.В. Мелихова, Т.И. Кебу, А.Л. Байракова, М.С. Афанасьев, Т.П. Егорова, Е.О. Рубальский, Т.О. Голикова, Е.А. Егорова, А.А. Куракова; заявители и патентообладатели ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора, ГУ НИИ МП РАМН, ГОУВПО АГМА Росздрава.- № 2008102621/14; заявл. 28.01.2008; зарег. во ФГУП «Роспатент» 20.07.2010; Бюл. № 20.

13. Пат. № 2430365 Российская Федерация МПК GO1N 33/48. Способ оценки микробиоценоза полости матки у женщин с полипами эндометрия в постменопаузальном периоде / О.В. Макаров, Т.Н. Савченко, В.А. Алёшкин, С.С. Афанасьев, Е.А. Воропаева, Н.С. Матвеевская, О.Г. Гречишникова, Т.С. Батиян; заявитель и патентообладатель ГОУВПО РГМУ Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию. - № 2010120937/15; заявл. 26.05.2010; зарег. Во ФГУП «Роспатент» 27.09.2011; Бюл. № 27.

14. Пат. № 2426537 Российской Федерации МПК А61К 31/375. Способ лечения полипов цервикального канала / Т.Н. Савченко, В.А. Алёшкин, С.С. Афанасьев, Е.А. Воропаева, С.В. Камоева, О.Г. Гречишникова, О.В. Макаров, А.В. Мельников; заявители и патентообладатели ГОУ ВПО РГМУ Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию, ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора. - №2010118991/15; завял. 13.05.2010; зарег. Во ФГУП «Роспатент» 20.08.2011; Бюл. № 23.