- Разработан подход для расчета дескрипторов (факторов) водородной связи органических соединений, заключающийся в использовании аддитивно-мультипликативной модели и термодинамических характеристик Н-комплексов.
- Предложена модель липофильности органических соединений, основанная на линейной комбинации двух молекулярных дескрипторов: поляризуемости и протоноакцепторного фактора водородной связи.
- Разработаны локальные модели неполярного и полярного наркоза, основанные на молекулярной поляризуемости и факторах Н-связи.
- Созданы и применены алгоритмы для классификации химических соединений по типу токсического действия, отличающиеся от известных алгоритмов тем, что они используют локальные регрессионные модели наркоза.
- Предложены глобальные модели острой токсичности, основанные на молекулярном сходстве, физико-химических дескрипторах и перекрывающихся кластерах.
- Разработана рекуррентная модель для описания токсичности органических соединений, отличающаяся от известных моделей отсутствием дескрипторов.
- Разработана модель ретардантной активности солей четвертичного аммония на основе факторов водородной связи и других физико-химических дескрипторов.
- Впервые предложен и разработан фрактальный 3D дескриптор молекулярной структуры, представляющий из себя фрактальную размерность гистограмм межатомных расстояний.
- Впервые разработан и применен подход для установления количественной связи между структурой и свойством (активностью), выраженными в виде двумерных кривых.
2.Раевский О.А., Григорьев В.Ю. Сборник задач по курсу «Конструирование биологически активных веществ». М.: МХТИ, 1986. 80 с.
3.Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Соловьев В.П., Иванов А.Н., Соколов В.Б., Мартынов И.В. Электронодонорные и акцепторные функции физиологически активных и модельных соединений. Х. Электронодонорные функции О-метилхлорформимино-О-этилметилфосфоната // Журн. общ. химии. 1987. Т. 57. № 9. С. 2073-2078.
4.Григорьев В.Ю., Соловьев В.П., Раевский О.А., Иванов А.Н., Соколов В.Б., Чепакова Л.А., Брель В.К., Мартынов И.В. Электронодонорные и акцепторные функции физиологически активных и модельных соединений. XII. Термодинамические параметры молекулярных комплексов некоторых фосфорилированных оксимов с фенолом и дифениламином // Журн. общ. химии. 1988. Т. 58. № 4. С. 761-766.
5.Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Соловьев В.П., Мартынов И.В. Электроноакцепторные энтальпийные факторы фенолов // Докл. АН СССР. 1988. Т. 298. № 5. С. 1166-1169.
6.Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Соловьев В.П., Мартынов И.В. Электроноакцепторные энтропийные факторы фенолов // Докл. АН СССР. 1988. Т. 299. № 6. С. 1433-1438.
7.Раевский О.А., Соловьев В.П., Григорьев В.Ю. Термодинамические характеристики водородной связи фенолов с органическими основаниями // Рукопись деп. ВИНИТИ 1988. № 1001-В88. 83 с.
8.Raevsky O.A., Solov’ev V.P., Solotnov A.F., Grigor’ev V.Yu., Kireev D.B. The Electron-Donor Function of the Phosphorylic Oxygen // Proceedings of the 11-th International Conference on Phosphorus Chemistry. Tallinn. 1989. P. I-75.
9.Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Соловьев В.П. Моделирование связи структура – активность. II. Оценка электронодонорных и акцепторных функций активных центров в молекулах физиологически активных веществ // Хим.-фармац. журн. 1989. Т. 23. № 11. С. 1294-1300.
10.Григорьев В.Ю., Соловьев В.П., Додонов М.В., Брель В.К., Мартынов И.В., Раевский О.А. Электронодонорные и акцепторные функции физиологически активных и модельных соединений. XIV. Электроноакцепторная способность группы N-H дифторнитроацетанилидов // Журн. общ. химии. 1989. Т. 59. № 4. С. 846-851.
11.Григорьев В.Ю., Соловьев В.П., Раевский О.А., Иванов А.Н., Соколов В.Б., Мартынов И.В. Электронодонорные и акцепторные функции физиологически активных и модельных соединений. XV. Использование мультипликативного правила факторов для оценки термодинамических характеристик водородной связи дифторнитроацетанилидов с фосфорилированными оксимами // Журн. общ. химии. 1990. Т. 60. № 3. С. 527-530.
12.Гафуров Р.Г., Чистяков В.Г., Кокурин А.В., Григорьев В.Ю., Прошин А.Н., Раевский О.А., Муромцев Г.С., Мартынов И.В. Связь химической структуры и активности регуляторов роста растений. Сообщение 1. Влияние стерического параметра катиона на антигиббереллиновую активность хлоридов диалкилпиперидиниев // Агрохимия. 1991. № 12. С. 81-85.
13.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Yu., Solov’ev V.P., Kireev D.B., Sapegin A.M., Zefirov N.S. Drug Design H-bonding Scale // In: QSAR: Rational Approaches to the Design of Bioactive Compounds / Silipo C., A. Vittoria A., Eds. Amsterdam: Elsevier Science Publishers, 1991. P. 135-138.
14. Григорьев В.Ю., Раевская О.Е., Раевский О.А. База данных «Термодинамика водородной связи» // Тезисы IX Всесоюзной конференции «Химическая информатика». Черноголовка, МО. 1992. С. 33.
15.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Yu., Kireev D.B., Lukoyanov N.V., Glinka R., Brzezinska E. QSAR Models of  - Adrenergic Activity of Some Substituted Phenethylamines // Proceedings of the 12-th International Symposium on Medicinal Chemistry. Basel. 1992. P. P-037A.
16.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Yu., Mednikova E. QSAR H-Bonding Descriptors // Proceedings of the 9-th European Symposium on Structure-Activity Relationships: QSAR and Molecular Modelling. Strasbourg. 1992. P. O-22.
17.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Yu., Kireev D.B., Zefirov N.S. Correlation Analysis and H-bond Ability in Framework of QSAR // J. Chim. Phys. 1992. Vol. 89. P. 1747-1753.
18.Raevsky O.A., Grigor´ev V.Yu., Kireev D.B., Zefirov N.S. Complete Thermodynamic Description of H-Bonding in the Framework of Multiplicative Approach // Quant. Struct.-Act. Relat. 1992. Vol. 11. № 1. P. 49-63.
19.Raevsky O., Dolmatova L., Grigor’ev V., Lisyansky I., Bondarev S. Molecular Recognition Descriptors in QSAR // In: QSAR and Molecular Modelling: Concepts, Computional Tools and Biological Applications / Sanz F., Giraldo J., Eds. Barselona: Prous Science Publ., 1995. P. 241-245.
20.Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Трепалин С.В., Шапер К. Расчет гидрофобности на основе поляризуемости и водородной связи // Тезисы IV Российского конгресса «Человек и лекарство». Москва. 1997. С. 288.
21.Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Трепалин С.В., Герасименко В.А., Раздольский А.Н., Шапер К. Оптимизация компьютерного конструирования лекарств на основе физико-химических параметров // Тезисы VI Российского конгресса «Человек и лекарство». Москва. 1999. С. 463.
22.Раевский О.А., Григорьев В.Ю. Количественное описание липофильности органических соединений на основе поляризуемости и акцепторной способности к образованию водородной связи // Хим.-фармац. журн. 1999. Т. 33. № 5. С. 46-49.
23.Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Трепалин С.В. Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ HYBOT (Hydrogen Bond Thermodynamics) № 990090 от 26 февраля 1999 г., Москва, Федеральная служба по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам.
24.Григорьев В.Ю. Расчет вклада водородной связи в энтальпию испарения и нормальную точку кипения органических соединений // Рукопись деп. ВИНИТИ 04.06.99. № 1820-В99. 22 с.
25.Григорьев В.Ю. Комплексный метод оценки протонодонорной способности фенолов // Рукопись деп. ВИНИТИ 19.07.2000. № 2012-В00. 13 с.
26.Раевский О.А., Скворцов В.С., Григорьев В.Ю., Трепалин С.В. Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ Программный комплекс HYBOT (HYdrogen BOnd Thermodynamics) in UNIX № 2002610496 от 4 апреля 2002 г., Москва, Федеральная служба по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам.
27.Гафуров Р.Г., Григорьев В.Ю., Прошин А.Н., Чистяков В.Г., Мартынов И.В., Зефиров Н.С. Роль молекулярных параметров солей четвертичного аммония в формировании их антигиббереллиновой (ретардантной) активности // Биоорг. химия. 2004. Т. 30. № 6. С. 656-662.
28.Гафуров Р.Г., Григорьев В.Ю., Прошин А.Н., Чистяков В.Г., Мартынов И.В., Зефиров Н.С. Роль молекулярных параметров солей четвертичного аммония в формировании их антигиббереллиновой (ретардантной) активности // Докл. РАН. 2004. Т. 394. № 5. С. 710-714.
29.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Yu., Raevskaja O.E., Schaper K.-J. Physicochemical Properties/Descriptors Governing the Solubility and Partitioning of Chemicals in Water-Solvent-Gas systems. Part.1. Partitioning between Octanol and Air // SAR QSAR Environ. Res. 2006. Vol. 17. № 3. P. 285-297.
30.Grigor’ev V.Yu., Weber E.E., Raevsky O.A. Classification SAR Models of Chemicals Toxicity to Guppy, Fathead Minnow and Rainbow Trout on the Basis of Structure Similarity // Fourth International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources. Moscow. 2007. P. 99.
31.Tikhonova O.V., Skvortsov V.S., Grigor’ev V.Yu., Raevsky O.A. 3D-QSAR Models of Irreversible and Reversible Inhibitors of Acetylcholinesterase // Fourth International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources. Moscow. 2007. P. 162.
32.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Yu., Weber E.E., Dearden J.C. Classification and Quantification of the Toxicity of Chemicals to Guppy, Fathead Minnow and Rainbow Trout. Part 1. Nonpolar Narcosis Mode of Action // QSAR Comb. Sci. 2008. Vol. 27. № 11-12. P. 1274 – 1281.
33.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Yu., Dearden J.C., Weber E.E. Classification and Quantification of the Toxicity of Chemicals to Guppy, Fathead Minnow, and Rainbow Trout. Part 2. Polar Narcosis Mode of Action // QSAR Comb. Sci. 2009. Vol. 28. № 2. P. 163-174.
34.Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Тихонова О.В. Развитие моделей взаимосвязи структуры и токсического действия химических соединений по отношению к Guppy // Хим.-фармац. журн. 2009. Т. 43. № 3. С. 100-104.
35.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Yu., Modina E.A., Raevskaya O.E., Liplavsky Ja.V. Classification- and Regression-Based QSAR of Chemical Toxicity on the Basis of Structural and Physicochemical Similarity // Workshop on "Satisfying REACH Requirements in Predictive Toxicology". Rome. 2009. P. 12-13.
36.Григорьев В.Ю., Раевский О.А. Рекуррентная модель острой токсичности гомологического ряда нормальных спиртов // Материалы XVII Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Москва. 2010. С. 600.
37.Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Модина Е.А. Компьютерные модели взаимосвязи структуры органических соединений и их острой токсичности // Материалы XVII Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Москва. 2010. С. 708-709.
38.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Yu., Modina E.A., Worth A.P. Classification- and Regression-Based QSAR of Acute Chemical Rodent Toxicity // Proceedings of the 18-th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships. Rhodes. 2010. P. 77-78.
39.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Yu., Modina E.A., Worth A.P. Prediction of Acute Toxicity to Mice by the Arithmetic Mean Toxicity (AMT) Modelling Approach // SAR QSAR Environ. Res. 2010. Vol. 21. № 3-4. P. 265-275.
40.Raevsky O.A., Grigor’ev V.Y., Liplavskaya E.A., Worth A.P. Prediction of Acute Rodent Toxicity on the Basis of Chemical Structure and Physicochemical Similarity // Mol. Inf. 2011. Vol. 30. № 2-3. P. 267-275.
41.Григорьев В.Ю., Раевский О.А. Фрактальная размерность гистограмм межатомных расстояний – новый 3D дескриптор молекулярной структуры // Журн. общ. химии. 2011. Т. 81. № 3. С. 353-359.
42.Григорьев В.Ю., Раевский О.А. Рекуррентная модель острой токсичности в гомологических рядах органических соединений // Хим.-фармац. журн. 2011. Т. 45. № 4. С. 124-129.
43.Григорьев В.Ю., Раевский О.А. Гистограмма межатомных расстояний – новый 3D дескриптор молекулярной структуры // Материалы XVIII Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Москва. 2011. С. 552.
44.Липлавская Е.А., Григорьев В.Ю., Раевский О.А. Предсказание острой токсичности органических соединений по отношению к грызунам на основе структурного и физико-химического сходства // Материалы XVIII Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Москва. 2011. С. 612.
45.Raevsky O.A., Grigoriev V.Yu., Liplavskaya E.A., Worth A.P. Calculations of Acute Intravenous Toxicity in Mice Based on Local Regression Models in Superoverlapping Clusters (LRMSC) // Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. 2011. Vol. 5. № 4. P. 346-356.
46. Григорьев В.Ю., Раевский О.А. Исследование количественной связи между функцией радиального распределения и кривой давления насыщенного пара в ряду н-алканов на основе модифицированной линейной динамической модели // Журн. физ. химии. 2012. Т. 86. № 3. С. 417-422.