Авдеева Елена Витальевна в 1989 году защитила кандидатскую диссертацию в Московском государственном университете. Ученое звание доцент по кафедре ихтиопатологии и гидробиологии присвоено решением Государственного комитета Российской федерации по высшему образованию от 20 декабря 1995 года № 952 Д. Учёное звание профессора по кафедре ихтиопатологии и гидробиологии присвоено приказом Министерства образования и науки Российской федерации от 28 февраля 2012 № 43/нк-1.

В настоящее время является заместителем декана по учебной работе факультета биоресурсов и природопользования и профессором кафедры ихтиопатологии и гидробиологии Калининградского государственного технического университета. Также является членом Пленума УМО в области рыбохозяйственного образования России. Основные научные направления: исследование паразитофауны рыб в естественных водоемах и рыбоводных хозяйствах различного типа Калининградской области; исследование состава микрофлоры рыб и окружающей среды (воды, грунтов и кормов) в естественных водоемах и рыбоводных хозяйствах.

Стаж педагогической деятельности - 28 лет, общий трудовой стаж - 34 года. Авдеева Е.В. ведет курс «Инфекционные и инвазионные болезни рыб» по направлению «Водные биоресурсы и аквакультура», также ведет подготовку магистров в рамках этого же направления по специализации «Ихтиопатология». Под руководством Авдеевой Е.В. в 2004 году Котлярчук Марина Юрьевна защитила кандидатскую диссертацию. В 2008 году защищены две кандидатские диссертации - Казимирченко Оксаны Владимировны, доцента кафедры ихтиопатологии и гидробиологии, и Чу каловой Наталии Николаевны - младшего научного сотрудника сектора паразитологии АтлантНИРО.

За годы работы Авдеева Е.В. являлась руководителем более 30 выпускных квалификационных работ специалистов, а также руководителем 15 магистерских диссертаций. Все выпускники защищались только на «отлично» и «хорошо».

В должности заместителя декана по учебной работе факультета (с 2000 года) участвовала в подготовке выпускников по направлению и специальности «Водные биоресурсы и аквакультура» и направлению «Экология и природопользование». Полностью подготовлены четыре выпуска.

Авдеева Е.В. автор более 100 статей, 10 методических пособий.

Основные научные работы:

Авдеева Е.В. Особенности паразитофауны рыб каскада водохранилищ реки Даугавы // ВИНИТИ, Деп. науч. работ №12/206. - М.э 1988. - С. 143, №942-рх.

Авдеева Е.В. Особенности паразитофауны рыб каскада водохранилищ реки Даугавы; своеобразный характер формирования паразитофауны рыб водохранилищ реки Даугавы // Паразитология. - №3,1989. - С. 244-249.

Авдеева Е.В. Ветеринарно-санитарная экспертиза рыб и профилактика безопасности рыбного сырья и рыбопродуктов. Методическое пособие для студентов механико-технологического факультета, обучающихся по специальности 271000 «Технология продуктов питания». - Калининград: КГТУ, 2002. - 100 с.

Авдеева Е.В. Эпизоотическая ситуация на форелевом хозяйстве «Прибрежное» // Физиолого-биохимические основы кормления рыб в аквакультуре. Сб. науч. трудов. -Калининград, 1995. - С. 59-60.

Авдеева Е.В. Ветеринарно-санитарная экспертиза рыб. Учебник. - М., 2008. - 104 с: ил.

Чукалова Н.Н., Авдеева Е.В. Микрофлора леща Куршского залива // Ветеринария. - 2008, №1.- С. 23-26.

Авдеева Е.В. награждена Почетной грамотой Государственного комитета Российской Федерации по рыболовству (24 июля 2001 г.), Почетной грамотой руководителя Федерального Агентства по рыболовству (2006 г.), знаком «Почетный работник рыбного хозяйства России» (24 сентября 2008 г.), имеет звание «Ветеран труда» (22 декабря 2003 г.).