RAE.RU
Энциклопедия
ИЗВЕСТНЫЕ УЧЕНЫЕ
FAMOUS SCIENTISTS
Биографические данные и фото 17064 выдающихся ученых и специалистов
Логин   Пароль  
Регистрация Забыли пароль?
 

Годовикова Татьяна Сергеевна

Научная тема: « ХИМИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ФОТОАФФИННОЙ МОДИФИКАЦИИ БЕЛКОВ РЕАГЕНТАМИ НА ОСНОВЕ АРОМАТИЧЕСКИХ АЗИДОВ »

Научная биография   « Годовикова Татьяна Сергеевна »

Членство в Российской Академии Естествознания

Специальность: 02.00.10

Год: 2007

Отрасль науки: Химические науки

Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:

  1. В результате настоящей работы оформилось новое научное направление исследования строения продуктов фотоаффинной модификации белков, основанное на получении физико-химических характеристик исследуемого объекта путем последовательного использования конкретных моделей, обеспечивающих пространственное сближение реагирующих группировок - остатка арилазида и бокового радикала аминокислоты.
  2. Результаты, полученные при детальном исследовании процессов фотолиза ароматических азидов в водных растворах, и установление строения продуктов фотоиндуцированного взаимодействия арилазидных реагентов с функциональными группами белков не только проливают свет на механизмы фотоаффинной модификации белков такого типа реагентами, но и представляют несомненную практическую ценность. Они позволяют сформулировать на качественном уровне некоторые зависимости направления фотоиндуцированных реакций арилазидных реагентов от строения субстрата (аминокислотного остатка) и типа заместителей в арильном кольце азида. Это способствует осознанному выбору фотоактивируемой группы при конструировании фотоактивируемого реагента.
  3. В рамках работы разработаны новые подходы к получению фотоаффинных реагентов на основе ароматических азидов для структурно-функциональных исследований надмолекулярных комплексов матричного биосинтеза. Для введения арилазидных группировок по терминальным фосфатам деблокированных
  4. олигодезоксирибонуклеотидов впервые использованы цвиттер-ионные производные олигонуклеотидов.   С   их   применением   получен   ряд   новых   фотоактивируемых амидофосфатов олигодезоксирибонуклеотидов, несущих п-азидофениламино-алкильную группу, селективную в отношении функциональных групп белков.
  5. Впервые осуществлен ферментативный синтез ДНК-дуплексов, содержащих арилазидные группы в С-5 положении дезоксиуридинов обеих цепей ДНК, благодаря использованию 5-[3-(E)-(4-азидо-2,3,5,6-тетрафторбензамидо)-пропенил-1]-2´-
  6. дезоксиуридин-5´-трифосфата в качестве фотоактивируемого аналога элонгирующего субстрата в полимеразной цепной реакции с Taq-полимеразой. Это представляет практический интерес, например, для ферментативного синтеза фотоактивируемых ДНК-аптамеров, так как использование такого типа дезоксинуклеозид-5´-трифосфата позволяет исключить стадию пост-селекционной модификации аптамера. Предложено новое направление использования арилазидных ДНК-зондов в методе флуоресцентной гибридизации in situ для фотоиндуцированного маркирования как целой хромосомы, так и ее определенного участка.
  7. Сконструированы новые аналоги инициирующего и элонгирующего субстратов для ферментов матричного синтеза РНК: γ-амидофосфаты АТР, несущие п-азидофениламиноалкильную группу, и производные UTP, содержащие остаток ароматического азида, присоединенный к С-5 положению гетероцикла через аминоаллильный спейсер. С использованием арилазидных аналогов UTP методом высокоселективного мечения исследован репликативный комплекс вируса клещевого энцефалита, и выявлены неструктурные белки (NS3 и NS5), выполняющие функцию репликаз на разных стадиях развития вирусной инфекции.

Список опубликованных работ

1. Годовикова Т.С., Зарытова В.Ф., Халимская Л.М. Реакционноспособные фосфамиды моно- и олигонуклеотидов // Биоорган. химия. 1986. Т. 12. С. 475-481.

2. Годовикова Т.С., Зарытова В.Ф., Райт В.К., Лебедев А.В., Самуков В.В. Некоторые аспекты амидирования моноэтерифицированного фосфата нуклеотидов и динуклеотидов при действии трифенилфосфина и 2,2’-дипиридилдисульфида // Изв. Сиб. Отд. АН СССР. Сер. хим. наук. 1986. Вып. 2. С. 110-115.

3. Zarytova V.F., Godovikova T.S., Kutyavin I.V., Khalimskaya L.M. Reactive oligonucleotide derivatives as affinity reagents and probes in molecular biology // In: Biophosphates and Their Analogues – Synthesis, Structure, Metabolism and Activity / Eds. Bruzik K.S., Stec W.J. Elsevier Sci. Publ.. Amsterdam, 1987. P. 149-164.

4. Годовикова Т.С., Зарытова В.Ф., Мальцева Т.В., Халимская Л.М. Активные производные олигонуклеотидов с цвиттер-ионной концевой фосфатной группой для конструирования аффинных реагентов и зондов // Биоорган. химия. 1989. Т. 15. С. 1246-1253.

5. Кудряшова Н.В., Шаманина М.Ю., Годовикова Т.С., Ананько Е.А., Ахмадиева Ф.Ф., Ромащенко А.Г. Особенности взаимодействия ДНК-полимеразы I Е. coli и ее большого фрагмента с γ-п-азидоанилидом dTTP // Биохимия. 1993. Т. 58. С. 224-233.

6. Knorre D.G., Godovikova T.S., Nevinsky G.A. Oligonucleotide and their derivatives as a tool to study protein-nucleic acids interaction // In: Evolutionary biochemistry and related areas of physicochemical biology / Eds. B. Poglazov et al.. Bach Institute of Biochemistry and ANKO. Moscow, 1995. P. 297-313.

7. Годовикова Т.С., Березовский М.В., Кнорре Д.Г. Фотоаффинная модификация аминокислотных производных олигонуклеотидов в комплементарном комплексе // Биоорган. химия. 1995. Т. 21. С. 858-867.

8. Godovikova T.S., Knorre V.D., Maksakova G.A., Sil’nikov V.N. Synthesis of azidoaniline derivatives of oligonucleotides and investigaion of their photochemical behavior // Bioconjugate Chem. 1996. P. 343-348.

9. Кобец Н.Д., Горожанкин А.В., Годовикова Т.С., Сильников В.Н., Кнорре Д.Г. Аффинная модификация хроматина фотореакционноспособными производными олиготимидилата // Докл. АН. 1996. Т. 349. С. 822-825.

10. Годовикова Т.С. Алексеев П.В., Кнорре Д.Г. Новое фосфорилирующее производное олигодезоксирибонуклеотидов // Докл. АН. 1997. Т. 357. C. 259–262.

11. Godovikova T.S., Kolpashchikov D.M., Orlova T.N., Richter V.A. New photoreactive deoxynucleoside-5’-triphosphates substitutes for thymidine-5’-triphosphate in the polymerase chain reaction // FASEB J. 1997. V. 11. P. 1367.

12. Кнорре Д.Г., Биченкова Е.В., Коваль В.В., Алексеев П.В., Кнорре В.Д., Нордхоф Э., Годовикова Т.С. Новый подход к изучению взаимодействия аминокислот по их боковым радикалам с арилазидами // Биоорган. химия. 1998. Т. 24. С. 663-669.

13. Knorre D.G., Alekseyev P.V., Gerassimova Yu.V., Sil’nikov V.N., Maksakova G.A., Godovikova T.S. Intraduplex photocross-linking of p-azidoaniline residue and amino acid side chains linked to the complementary oligonucleotides via a new phosphorylating intermediate formed in the Mukayama system // Nucleosides&Nucleotides. 1998 V. 17. P. 397-410.

14. Knorre D.G., Godovikova T.S. Photoaffinity labeling as an approach to study nucleoprotein complexes (обзор) // FEBS Lett. 1998. V. 433. P. 9-14.

15. Наседкина Т.В., Мальков Р.Б., Федорова Л.И., Годовикова Т.С., Колпащиков Д.М., Полетаев А.И. Использование фотопришиваемых ДНК-зондов для флуоресцентной гибридизации in situ // Цитология. 1998. Т. 40. С. 763-767.

16. Mishchenko E.L., Reinbolt J., Markushin Yu.Ya., Ehresman B. And Godovikova T.S. Tyrosin 54 and tryptophan 108 of N’-(d-biotinyl)-1,4-diaminobutane streptavidin are photolabelled by N-(2-nitro-5-azidobenzoyl)-N’-(d-biotinyl)-1,4-diaminobutane and (N-4-azidophenyl)-N’-(d-biotinyl)-1,4-diaminobutane, respectively. Isolation, spectrophotometric characterization and sequence analysis of photolabelled peptides // J. Photochem. Photobiol. B:Biol.. 1998. V. 45. P. 9-18.

17. Кнорре Д.Г., Годовикова Т.С. Химические подходы к исследованию нуклеопротеидных структур (обзор) // Изв. АН. Сер. хим. 1999. С. 1225-1231.

18. Godovikova T.S., Kolpashchikov D.M., Orlova T.N., Richter V.A., Ivanova T.M., Grochovsky S.L., Nasedkina T.V., Victorova L.S., Poletaev A.I. 5-[3-(E)-(4-Azido-2,3,5,6-tetrafluorobenzamido)propenyl-1]-2’-deoxyuridine-5’-triphosphate substitutes for thymidine-5’-triphosphate in the polymerase chain reaction // Bioconjugate Chem. 1999. V. 10. P. 529-537.

19. Morozova O.V., Kolpashchikov D.M., Ivanova T.M., Godovikova T.S. Synthesis of a new photocross-linking 5-C-base-substituted UTP analogs and their application in highly selective affinity labeling of the tick-borne encephalitis virus RNA replicase proteins // Nucleosides&Nucleotides. 1999. V. 18. P. 1513-1514.

20. Туницкая В.Л., Кочетков С.В., Годовикова Т.С., Кочетков С.Н. Взаимодействие РНК-полимеразы бактериофага Т7 с аффинными модификаторами - аналогами нуклеозидтрифосфатов // Молекуляр. биология. 2000. Т. 34. С. 60-66.

21. Mishchenko E.L., Kozhanova L.A., Denisov A.Yu, Gritsan N.P., Markushin Yu.Ya, Serebriakova M.V., Godovikova T.S. Study of the chemical structures of photo-cross-linking products between Tyr and the 5-azido-2-nitrobenzoyl residue // J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 2000. V. 54. P. 16-25.

22. Alekseyev P.V., Romanova I.V., Shakirov M.M., Godovikova T.S. p-Azidophenyl phosphate is a photoactivatable phosphorylating reagent and p-benzoquinone monoimine precursor // J. Photochem. Photobiol. B:Biol.. 2001. V. 65. P. 39-46.

23. Popova T.V., Denisov A.Yu., Shakirov M.M., Komarova N.I., Alekseyev P.V., Serebriakova M.V., Godovikova T.S. // Long-lived reactive intermediate photogenerated from N-(5-azido-2-nitrobenzoyl)-N´-(d-biotinyl)-1,2-diaminoethane as an affinity reagent to streptavidin // J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 2001. V. 61. P. 68-77.

24. Popova T.V., Mal’shakova V.S., Alekseyev P.V., Kudryashova N.V., Shakirov M.M, Savinkova L.L., Drachkova I.A., Godovikova T.S. Photoanalogues of the initiation substrates of the RNA polymerase II, 5-azido-2-nitrobenzoyl derivatives of the ATP γ-amidophosphate: the possible photoinduced degradation of the functional group to an N-arylhydroxylamine // Nucleosides, Nucleotides&Nucleic Acids. 2004. V. 23. P. 921–925.

25. Кнорре Д.Г., Кудряшова Н.В., Попова Т.В., Шакиров М.М., Мальшакова В.С., Шпенев О.Е., Савинкова Л.К., Серебрякова М.В., Годовикова Т.С. Фотоактивируемые аналоги инициирующего субстрата РНК-полимеразы II на основе производных γ-амидофосфатов NTP: синтез, химические и фотохимические реакции функциональных групп // Биоорган. химия. 2005. Т. 34. С. 332-343.

Комментарии:

Если вы считаете, что какое-то сообщение нарушает Правила, оскорбляет Вас как личность, несёт заведомо ложную информацию, и должно быть удалено, сообщите нам по адресу sergey@rae.ru

Ваше имя
Текст комментария
Введите число с изображения

Антиспам защита

При добавлении комментария Вы соглашаетесь с пользовательским соглашением