RAE.RU
Энциклопедия
ИЗВЕСТНЫЕ УЧЕНЫЕ
FAMOUS SCIENTISTS
Биографические данные и фото 17373 выдающихся ученых и специалистов
Логин   Пароль  
Регистрация Забыли пароль?
 

Дмитриев Андрей Викторович

Научная тема: « СТРУКТУРНЫЕ И ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ ПРИРОДНЫХ И ХИРАЛЬНО МОДИФИЦИРОВАННЫХ МОДЕЛЬНЫХ ИОННЫХ КАНАЛОВ »

Научная биография   « Дмитриев Андрей Викторович »

Членство в Российской Академии Естествознания

Специальность: 03.00.02

Год: 2009

Отрасль науки: Физико-математические науки

Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:

  1. Теоретическое обоснование комбинированного квантово-классического метода для расчета энергетических профилей, с помощью которого установлено, что в клетке с хирально модифицированными калиевыми каналами с природной первичной структурой будут нарушены многие биологические процессы, обу­словленные функционированием калиевых ионных каналов. Появление остатков iAsp в калий-избирательных каналах и остатков D-Asp в КШ-центре связывания NMDA-рецептора, обусловленное посттрансляционными неферментативными модификациями аминокислотных остатков, приводит к нарушению структуры и функциональных характеристик каналов.
  2. Разработанный и теоретически обоснованный нами метод энергетиче­ского выравнивания структур каналов, с помощью которого были построены D-аминокислотные модельные каналы с природными функциональными характе­ристиками и модифицированной аминокислотной последовательностью из 10 D-аминокислот: Gly, Ala, Ser, Cys, Asp, Asn, Lys, His, Phe, Pro.

Список опубликованных работ

Статьи в рецензируемых научных журналах по списку ВАК

1. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П. Механизм местной анестезии: ориен-тационные эффекты на дальних расстояниях // Биофизика, 2000, Т.45, №6, с. 1066-1071.

2. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П. Поляризационные взаимодействия в системе анестетик-биомембрана: активность производных ацетанилида // Журнал физической химии, 2001, Т.75, №10, с. 1716-1720.

3. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П. Анализ количественных соотноше¬ний структура - анестезирующая активность ацетанилидов с применением регрессионных и квантовохимических методов // Химико-фармацевтический журнал, 2001, Т.35, №6, с. 54-56.

4. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П., Зайнутдинов А.В., Рожков А.Н. Влияние базиса на точность оценки дипольного момента молекулы ацетани-лида // Журнал структурной химии, 2001, Т.42, №6, с. 1222-1225.

5. Дмитриев А.В., Исаева Г.А., Исаев П.П., Барышников В.Г., Ласточкин А.В. Уровни энергии и волновые функции иона в грамицидиновых каналах // Биофизика, 2002, Т.47, №5, с. 864-868.

6. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П. Взаимодействие местных анестети¬ков с модельными ионными каналами // Биофизика, 2002, Т.47, №3, с. 506¬511.

7. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П. Моделирование поляризационных взаимодействий в системе спирт - биомембрана // Известия вузов. Сер. Хи¬мия и хим. технология, 2003, Т.46, №6, с. 101-103.

8. Дмитриев А.В., Твердислов В.А. О методах расчета распределения потенциа¬ла в белковых порах // Биофизика, 2004, Т.49, №3, с. 506-510.

9. Дмитриев А.В., Марков И.В., Барышников В.Г., Твердислов В.А. Об исполь-зовании приближенных силовых полей для расчета распределения электро-статического потенциала мембранных каналов // Журнал структурной химии,

2005, Т.46, №5, с. 624-628.

10. Дмитриев А.В., Исаев П.П., Твердислов В.А. Разделение дальних и ближних взаимодействий в расчетах распределения энергии ионов в мембранных каналах // Журнал структурной химии, 2006, Т.47, №2, с. 255-259.

11. Дмитриев А.В., Марков И.В., Барышников В.Г., Твердислов В.А. Распреде¬ление энергии и ионная избирательность бактериального калиевого канала // Биофизика, 2006, Т.51, №4, с. 624-629.

12. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П. Влияние вязкости растворителя на молекулярную динамику грамицидинового канала // Известия вузов. Серия Химия и химическая технология, 2006, Т.49, №9, с. 40-42.

13. Дмитриев А.В., Марков И.В., Твердислов В.А. Моделирование ионной изби-рательности потенциал-зависимого калиевого канала // Технологии живых систем, 2006, Т.3, №4, с. 39-42.

14. Дмитриев А.В., Твердислов В.А. Моделирование последовательности кодо-нов белок-кодирующей области калиевого канала зеркальной клетки // Тех¬нологии живых систем, 2006, Т.3, №5, с. 39-41.

15. Дмитриев А.В., Исаев П.П., Твердислов В.А. Влияние изомеризации амино-кислотных остатков на структуру аквапорина // Журнал структурной химии, 2006, Т.47, №3, с. 578-580.

16. Дмитриев А.В., Марков И.В., Твердислов В.А. Рацемизация бактериального калиевого канала и хиральная безопасность биосферы // Технологии живых систем, 2006, Т.3, №1, с. 5-8.

17. Дмитриев А.В., Марков И.В., Твердислов В.А. Структура и ионная избира-тельность открытого потенциал-зависимого калиевого канала // Журнал структурной химии, 2007, Т.48, №1, с. 143-145.

18. Коротина А.С., Дмитриев А.В., Марков И.В., Твердислов В.А. Изменение структуры аквапорина в результате биологического старения организма // Известия вузов. Сер. Химия и хим. технология, 2007, Т.50, №5, с. 128-129.

19. Коротина А.С., Дмитриев А.В., Марков И.В., Твердислов В.А. Применение смешанных энергетических профилей ионов в расчетах токовых характери¬стик калиевого мембранного канала // Известия вузов. Сер. Химия и хим. технология, 2007, Т.50, №6, с. 115-116.

20. Коротина А.С., Дмитриев А.В., Твердислов В.А. Моделирование лигандов нативного и хирально модифицированного МШ-центра связывания NMDA-рецептора // Биомедицинская химия, 2008, Т.50, №4, с. 415-416.

Статьи в других журналах, изданиях и тематических сборниках

21. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П. Математическое моделирование межмолекулярных взаимодействий в системе анестетик-биомембрана // Вестник КГУ им. Н.А. Некрасова, 2000, Т.2, №2, с. 50-55.

22. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Николаевский В.А., Исаев П.П. Дескрипторы молекулярной формы в исследованиях местноанестезирующей активности производных фенилпропиофенона // Прикладные информационные аспекты медицины, 2000, Т.3, №2, с. 46-50.

23. Дмитриев А.В., Исаев В.П., Исаева Г.А., Казак Е.В. Молекулярное моделиро¬вание ионных потоков через функциональную мембрану // Вестник КГУ им. Н.А. Некрасова, 2002, №2, с. 8-13.

24. Дмитриев А.В., Исаева Г.А., Исаев П.П., Лузянин С.Е. Исследование ионных потоков через границу раздела раствор/мембрана // Конденсированные среды и межфазные границы, 2002, Т.5, №3, с. 35-40.

25. Dmitriev A.V., Baryshnikov V.G., Markov I.V., Tverdislov V.A. Band and point statistical estimation of channelforming polypeptides potential / Progress in Chemometrics Research. 2005. USA, NY: Nova Science Publishers, P.30-45.

26. Дмитриев А.В., Твердислов В.А. О возможности существования и структур¬ных особенностях зеркального антипода природной клетки // Препринт фи¬зического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова, № 6/2005. Москва, 2005. 50 с.

27. Дмитриев А.В., Исаев П.П. Физическое объяснение водной проницаемости аквапорина AP1 // Вестник КГУ им. Н.А. Некрасова, 2005, Т.5, №4, с. 17-20.

28. Дмитриев А.В., Исаев П.П. Представление молекулы мембранного канала в системе координат с поворотной осью симметрии // Вестник КГУ им. Н.А. Некрасова, 2005, Т.5, №7, с. 4-7.

29. Твердислов В.А., Яковенко Л.В., Дмитриев А.В., Жаворонков А.А., Твердислова И.Л. Происхождение предшественников живой клетки. О двух фундаментальных асимметриях - ионной и хиральной / Проблемы регуляции в биологических системах. Биофизические аспекты / Под общей ред. А.Б. Рубина. Москва-Ижевск: Институт компьютерных исследований, 2007. с. 259-291.

В материалах конференций

30. Дмитриев А.В., Зайнутдинов А.В., Рожков А.Н., Ткаченко К.Н., Исаева Г.А., Исаев П.П. Механизм местной анестезии: модельные взаимодействия в сис¬теме анестетик-мелиттин // Труды молодых ученых России: Сборник мате¬риалов 3-го Всероссийского медицинского конгресса. Ижевск: Изд-во Экс¬пертиза, 2000. с. 16-18.

31. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П., Зайнутдинов А.В., Рожков А.Н. Ма-тематическое моделирование электростатических взаимодействий в системе анестетик-биомембрана // Математика. Образование. Экология. Гендерные проблемы: Тезисы докладов Международной конференции. Воронеж: Изд-во

ВГУ, 2000, с. 54-55.

32. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П., Зайнутдинов А.В., Рожков А.Н., Ткаченко К.Н. Математическое моделирование взаимодействий местных ане¬стетиков с грамицидиновыми каналами биомембраны // Физика и радиоэлек¬троника в медицине и экологии: Тезисы докладов 4-я Международной науч¬но-технической конференции. Владимир: Изд-во Ин-та оценки природ. ре¬сурсов, 2000, с. 47-52.

33. Дмитриев А.В., Исаева Г.А., Исаев П.П. Математическое моделирование межмолекулярных взаимодействий в системе анестетик-биомембрана // Био-химическая физика на рубеже столетий: Тезисы докладов международной конференции. Москва: Изд-во Института биохимфизики РАН, 2000. с. 42.

34. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П., Зайнутдинов А.В., Рожков А.Н. Влияние внешней среды на равновесную геометрию грамицидинового канала // Математика. Компьютер. Образование: Тезисы докладов 8-й Международ¬ной конференции. Москва: Изд-во Прогресс-Традиция, 2001. с. 285.

35. Дмитриев А.В., Зайнутдинов А.В., Рожков А.Н., Исаева Г.А., Исаев П.П. Влияние внешней среды на структурируемость HHSH-конформера грамици¬дина А // Молекулярная физика неравновесных систем: Материалы 3-й Все¬российской научной конференции. Иваново: Изд-во ИГХТУ, 2001. с. 52-56.

36. Дмитриев А.В., Исаева Г.А., Исаев П.П., Слукина Ю.Л. Квантово-механическая модель движения иона в грамицидиновом канале мембраны // Компьютерное обеспечение химических исследований: Тезисы докладов Международного симпозиума. Москва: Изд-во ИОХ РАН, 2001. с. 49-50.

37. Зайнутдинов А.В., Рожков А.Н., Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Исаев П.П. Моделирование равновесной геометрии аминокислот во внешнем электростатическом поле // Компьютерное обеспечение химических исследований: Тезисы докладов Международного симпозиума. Москва: Изд-во ИОХ РАН, 2001. с.

59-60.

38. Dmitriev A., Isaeva G., Isaev P. Analysis of residuals: statistical method in QSAR studies // Abstracts of the 7th Scandinavian Symposium on Chemometrics. 2001, V.3, p. 20-22.

39. Исаева Г.А., Дмитриев А.В., Казак Е.В., Кузьминова Р.В., Исаев П.П. Мате-матическое моделирование физиологического отклика в системе анестетик-мембрана // XVIII Съезд физиологического общества им. И.П. Павлова: Тези¬сы докладов. Казань: Изд-во КГМУ, 2001. c. 104-105.

40. Лузянин С.Е., Дмитриев А.В., Исаева Г.А., Исаев П.П. Теоретическое и экс-периментальное исследование ионных потоков через мембрану // Биология -наука 21-го века: Тезисы докладов 6-й Пущинской конференции молодых ученых. - Пущино: Изд-во ПНЦ, 2002. с. 32.

41. Дмитриев А.В., Барышников В.Г., Лузянин С.Е. О конфигурациях электростатического поля в ионных каналах мембран // Биохимическая физика: тези¬сы докладов 2-й ежегодной молодежной конференции ИБХФ-ВУЗы. Москва: Изд-во ИБХФ РАН, 2002. с. 4.

42. Дмитриев А.В., Барышников В.Г. О движении ионов в порообразующих бел¬ковых молекулах // Молекулярное моделирование: тезисы докладов 3-й Все¬российской конференции. - Москва: Изд-во ГЕОКХИ РАН, 2003. с. 9-10.

43. Мелихов Н.Д., Шмелев Р.В., Дмитриев А.В., Барышников В.Г. О распределе¬нии молекулярного электростатического потенциала в полости порообра-зующих белков // Молекулярное моделирование: тезисы докладов 3-й Все¬российской конференции. - Москва: Изд-во ГЕОКХИ РАН, 2003. с. 94-95.

44. Исаева Г.А., Исаев В.П., Дмитриев А.В. Квантовохимическое исследование проводимости ионных каналов биологических мембран // Молекулярная био¬логия, химия и физика гетерогенных систем: Материалы 7-й Международной конференции, Москва-Плес. 2003. Иваново: Изд-во ЮНОНА, 2003. с. 49-54.

45. Дмитриев А.В., Барышников В.Г., Марков И.В., Твердислов В.А. О меха¬низмах ионной избирательности калиевого канала // 3-й Съезд биофизиков России: тезисы докладов. Воронеж: Изд-во ВГУ, 2004. с. 209-210.

46. Исаева Г.А., Шмелев Р.В., Исаев П.П., Дмитриев А.В., Лапшина Н.П. Моде-лирование биологической активности местноанестезирующих и антиаритми¬ческих препаратов // 3-й Съезд биофизиков России: тезисы докладов. Воро¬неж: Изд-во ВГУ, 2004. с. 525-526.

47. Дмитриев А.В., Марков И.В., Твердислов В.А. Моделирование третичной структуры функционально эквивалентных изомеров трансмембранных бел¬ков // 4-я Всероссийская конференция "Молекулярное моделирование": тези¬сы докладов. Москва, 2005. с. 35-37.

48. Марков И.В., Дмитриев А.В. Разделение дальних и ближних взаимодействий в расчетах распределения энергии в аксиально-симметричных мембранных каналах // Международная конференция «Ломоносов-2005»: тезисы докладов. Москва, 2005. с. 40-41.

49. Марков И.В., Дмитриев А.В. Предсказание первичной и третичной структуры D-изомеров модельных белков функционально эквивалентных природным мембранным белкам // Международная конференция «Ломоносов-2005»: тезисы докладов. Москва, 2005. с. 42-44.