Научная тема: «АУТОРЕГУЛЯЦИЯ СТРЕССОВОГО ОТВЕТА МИКРООРГАНИЗМОВ»
Специальность: 03.02.03
Год: 2011
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. Микроорганизмы различных таксономических групп обладают способно­ стью синтезировать специфические метаболиты - внеклеточные адаптогены (ВА), функцией которых является регуляция эффективности компенсаторно- приспособительных реакций, обеспечивающих адаптацию микробных популяций к изменяющимся или неблагоприятным условиям окружения.
  2. Стрессы, запрограммированные в циклах развития микробных культур, и стрессорные воздействия окружающей среды, являются факторами, стимулирую­щими биосинтез микробных адаптогенов.
  3. Обратимая адгезия клеток суспензионных культур является формой их адап­тации к стрессорам разной природы. Ауторегуляторы адгезии концентрационно контролируют переходы между стадиями обратимой адгезии и планктонного су­ществования.
  4. Микробные алкилоксибензолы могут обладать функциями адаптогенов. За­щитные эффекты АОБ в зависимости от их химической структуры реализуются как протекция клеток микроорганизмов от повреждающих воздействий или как сигнал тревоги для мобилизации защитных ресурсов клеток. Функции АОБ как сигналов тревоги опосредуются через контроль экспрессии генов стрессовых ре-гулонов. Механизм протекторного действия АОБ включает их функционирование как структурных модификаторов ферментных белков, а также как антиоксидантов.
  5. Фенотипическая диссоциация популяции, составляющая её адаптивный по­тенциал, регулируется алкилоксибензолами, которые контролируют развитие оп­ределённого варианта.
Список опубликованных работ
Экспериментальные статьи

1.Николаев Ю.А. Защитное влияние тетрациклинчувствительного штамма Escherichia coli на рост тетрациклин-устойчивого штамма в присутствии тетрациклина при совместном культивировании. // Микробиология. 1996. Т. 65, Вып. 6. С. 759-763.

2.Николаев Ю.А. Множественный защитный эффект экзометаболита (экзометаболитов), выделяемого Escherichia coli при обработке тетрациклином. // Микробиология. 1996. Т.65. Вып.6, С. 764-768.

3.Николаев Ю.А. Участие внеклеточных метаболитов в адаптации Escherichia coli к стрес¬сам. //Микробиология, 1997, Т. 66, Вып. 1, С.38-41.

4.Николаев Ю.А. Обнаружение двух новых внеклеточных адаптогенных факторов у Escherichia coli К-12. // Микробиология, 1997. Т. 66, Вып. 6, С. 785-789.

5.Николаев Ю.А. Сравнительное изучение свойств двух внеклеточных протекторов, выде¬ляемых Escherichia coli при повышенной температуре. //Микробиология. 1997. Т. 66, Вып. 6, С. 790-795.

6.Николаев Ю.А., Воронина Н.А. Перекрестное действие внеклеточных факторов адапта¬ции к стрессу у микроорганизмов. // Микробиология, 1999. Т. 68. № 1. С. 45-50.

7.Николаев Ю.А., Проссер Дж. И. Внеклеточные факторы, влияющие на адгезию Pseudo-monas fluorescens на стекле. // Микробиология, 2000. Т. 69 . № 2. С. 231-236 .

8.Николаев Ю.А., Проссер Дж. И. Свойства адгезина и антиадгезина Pseudomonas fluorescens. // Микробиология, 2000. Т. 69. No 2. С. 237-242 .

9.Николаев Ю.А., Милько Е.С. Адгезивные и ростовые свойства R- и S-диссоциантов Pseudomonas fluorescens. // Микробиология, 2000. Т. 69. № 2. С. 293-294 .

10.Николаев Ю.А., Проссер Дж. И., Виттли Р.И. Регуляция прилипания клеток Pseudomonas fluorescens к стеклу летучими соединениями, выделяемыми культурой. // Микробиоло¬гия, 2000. Т.69 № 3. С. 352-355.

11.Николаев Ю.А., Проссер Дж. И. и Паников Н.С. Внеклеточные факторы адаптации к не¬благоприятным условиям среды в периодической культуре Pseudomonas fluorescens. // Микробиология, 2000. Т.69 . № 5. С. 629-635.

12.Николаев Ю.А., Паников Н.С., Лукин С.М., Осипов Г.А. Насыщенные C21-C33 углеводо¬роды - авторегуляторы адгезии Pseudomonas fluorescens на стекле. // Микробиология, 2001. Т. 70. № 2. С. 174-181.

13.Паников Н.С. и Николаев Ю.А. Рост и адгезия Pseudomonas fluorescens в периодической культуре: кинетический анализ действия внеклеточных антиадгезинов. // Микробиоло¬гия, 2002. Т. 71. № 5. С. 619-628.

14.Николаев Ю.А., Паников Н.С. Внеклеточная протеаза как регулятор адгезии Pseudomo-nas fluorescens.//Микробиология,2002.Т.71.№ 5. С.629-634.

15.S.G. Batrakov, T.A. Rodionova, S.E. Esipov, N.B. Polyakov, V.I. Sheichenko, N.V. Shek-hovtsova, S.M. Lukin, N.S. Panikov, Yu.A. Nikolaev. A novel lipopeptide, an inhibitor of bac¬terial adhesion, from the thermophilic and halotolerant subsurface Bacillus licheniformis 603.//Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids, 2003, V.1634, Iss. 3, P. 107-115.

16.Родионова Т.А., Шеховцова Н.В., Паников Н.С. и Николаев Ю.А. Рост и адгезия Bacillus licheniformis в зависимости от условий культивирования.// Микробиология. 2003. Т. 72. № 4. С. 521-527.

17.Степаненко И.Ю., Страховская М.Г., Беленикина Н.С., Николаев Ю.А., Мулюкин А.Л., Козлова А.Н., Ревина А.А., Эль-Регистан Г.И. Защита Saccharomyces cerevisiae алкилок-сибензолами от окислительного и радиационного поражения. // Микробиология 2004. Т. 73. № 2. С. 204-210.

18.Родионова Т.А., Николаев Ю.А. Защитное действие обратимой адгезии термофильной бактерии Bacillus licheniformis 603 от N-этилмалеимида. // Микробиология. 2004. Т. 73. № 6. С. 133-134.

19.Степаненко И.Ю., Мулюкин А.Л., Козлова А.Н., Николаев Ю.А., Эль-Регистан Г.И. Роль алкилоксибензолов в адаптации Micrococcus luteus к температурному шоку. // Микро¬биология. 2005. Т. 74. № 1. С. 26-33.

20.El-Registan G.I., Mulyukin A.L., Nikolaev Y.A., Stepanenko I.Y., Kozlova A.N., Martirosova, E.I., Shanenko E.F., Strakhovskaya M.G., Revina A.A. The role of microbial low-molecular-weight autoregulatory factors (alkylhydroxybenzenes) in resistance of microorganisms to radia¬tion and heat shock. // J. Adv. Space Res. 2005. V. 36, Iss. 9, P. 1718-1728.

21.Милько Е.С., Хабибуллин С.С., Николаев Ю.А., Козлова А.Н., Эль-Регистан Г.И. Дина-мика роста и состава популяций смешанных культур R-, S- и M-диссоциантов Pseudo-monas aeruginosa. // Микробиология. 2005. Т. 74. № 4. С. 475-482.

22.Хабибуллин С.С., Николаев Ю.А., Лойко Н.Г., Голод Н.А., Милько Е.С., Воейкова Т.А., Эль-Регистан Г.И. Ауторегуляция фенотипической диссоциации у Bacillus licheniformis. Журнал микробиол., эпидемиол. и иммунобиологии. 2006. № 6. С. 9-13.

23.Suzina N.E., Mulyukin A.L., Dmirtiev V.V., NikolaevY.A., ShorokhovaA.P., Bobkova Y.S., BarinovaE.S., PlakunovV.K., El-RegistanG.I., Duda V.I. The structural bases of long-term anabiosis in non-spore-forming bacteria. Adv.SpaceRes.2006.V.38.P. 1209-1219.

24.Мартиросова Е.И., Николаев Ю.А., Шаненко Е.Ф., Крупянский Ю.Ф., Лойко Н.Г., Эль-Регистан Г.И. Использование алкилоксибензолов для повышения активности и стабиль¬ности ферментов// Химическая технология. 2007. № 6. С. 250-256.

25.Конаныхина И.А., Шаненко Е.Ф., Николаев Ю.А., Эль-Регистан Г.И. Разработка спосо-бов защиты пивоваренных дрожжей от теплового шока // Пиво и напитки. 2007. № 1. С. 18-19.

26.Конаныхина И.А., Шаненко Е.Ф., Николаев Ю.А., Эль-Регистан Г.И. Разработка спосо-бов защиты пивоваренных дрожжей от осмотического стресса.// Хранение и переработка сельхозсырья. 2007. № 3. С. 40-41.

27.Конаныхина И.А., Шаненко Е.Ф., Николаев Ю.А., Эль-Регистан Г.И. Стабилизация дрожжей Saccharomyces cerevisiae. // Хранение и переработка сельхозсырья. 2007. № 8. С. 44-45.

28.Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Эль-Регистан Г.И., Николаев Ю.А., Ненова С.В., Молостов Е.В., Кириллов Д.А. Влияние химического аналога внеклеточных микробных ауторегу-ляторов на антилизоцимную активность бактерий.//Журн. микробиол., эпидемиол., им-мунобиол. 2007. № 6. С. 3-6.

29.Николаев Ю.А., Плакунов В.К., Воронина Н.А., Немцева Н.В., Плотников А.О., Гоголева О.А., Муравьева М.Е., Овечкина Г.В. Влияние бактерий-спутников на рост Chlamydomonas reinhardtii в альго-бактериальном сообществе // Микробиология. 2008. Т. 77. № 1. С. 89-95.

30.Николаев Ю.А., Лойко Н.Г., Степаненко И.Ю., Шаненко Е.Ф., Мартиросова Е.И., Пла-кунов В.К., Козлова А.Н., Борзенков И.А., Коротина О.А., Родин Д.С., Крупянский Ю.Ф., Эль-Регистан Г.И. Изменение физико-химических свойств белков, модифицированных алкилоксибензолами // Прикладная биохимия и микробиология. 2008. Т. 44. № 2. С. 159-167.

31.Конаныхина И.А., Шаненко Е.Ф., Лойко Н.Г., Николаев Ю.А.,Эль-Регистан Г.И. Регули¬рующее действие микробных АОБ различной структуры на стрессовый ответ дрож¬жей.//Прикладная биохимия и микробиология. 2008. Т. 44, № 5, с. 571-575.

32.Петровский А.С., Дерябин Д.Г., Лойко Н.Г., Михайленко Н.А., Кобзева Т.Г., Канаев П.А., Николаев Ю.А., Крупянский Ю.Ф., Козлова А.Н., Эль-Регистан Г.И. Регуляция ал-килоксибензолами функциональной активности лизоцима // Микробиология. 2009. Т. 78. № 2. С. 176-185.

33.Голод Н.А., Лойко Н.Г., Лобанов К.В., Миронов А.С., Воейкова Т.А., Гальченко В.Ф., Николаев Ю.А. Эль-Регистан Г.И. Роль микробных ауторегуляторов – алкилоксибензо-лов в контроле экспрессии стрессовых регулонов // Микробиология. 2009. Т. 78. № 6. С. 731-741.

34.Николаев Ю.А., Борзенков И.А., Калинин М.В., Воронина Н.В., Тарасов А.Л., Плакунов В.К., Беляев С.С., Гальченко В.Ф., Эль-Регистан Г.И. Антимикробные свойства феноль-ных липидов. Прикладная биохимия и микробиол. 2010. Т. 46. №2. С.172-179.

35.Николаев Ю.А., Тарасов А.Л., Борзенков И.А., Гальченко В.Ф., Эль-Регистан Г.И. Роль алкилоксибензолов в адаптации бактерий к неблагоприятным условиям роста// Микро¬биология. 2010. Т. 79. №6. С. 760-766.

Обзоры

1.Николаев Ю.А. Внеклеточные факторы адаптации бактерий к неблагоприятным услови¬ям среды. // Прикладная биохимия и микробиология. 2004. Т.40. № 4. С.387-397.

2.Николаев Ю.А., Мулюкин А.Л., Степаненко И.Ю., Эль-Регистан Г.И. Ауторегуляция стрессового ответа микроорганизмов Микробиология. 2006. Т. 75. № 4. С. 489-496.

3.Эль-Регистан Г.И., Мулюкин А.Л., Николаев Ю.А., Сузина Н.Е., Гальченко В.Ф., Дуда В.И. Адаптогенные функции внеклеточных ауторегуляторов микроорганизмов // Микро¬биология. 2006. Т. 75. № 4. С. 446-456.

4.Николаев Ю.А., Плакунов В.К. Биопленка–«город микробов» или аналог многоклеточ¬ного организма?//Микробиология. 2007.Т.76. № 2. С. 149-163.

5. Плакунов В.К., Николаев Ю.А. Микробные биопленки – перспективное направление со-временной биотехнологии // Вода: химия и экология. 2008. № 2. С. 11-13.

Учебное пособие

1. Плакунов В.К., Николаев Ю.А. Основы динамической биохимии. М. Логос, 2010.

Изобретения

1.RU № 02329300 от 26.12.2006. Способ получения засевных дрожжей. Конаныхина И.А., Шаненко Е.Ф., Николаев Ю.А., Эль-Регистан Г.И.

2.RU № 2400069 от 11.06.2009. Способ защиты материалов от микробного разрушения. Эль-Регистан Г.И., Николаев Ю.А., Калинин М.В., Гальченко В.Ф., Борзенков И.А., Коз-лова А.Н., Мулюкин А.Л., Гернет М.В., Шаненко Е.Ф., Воронина Н.А., Кочеткова А.А., Шатилова Т.И.

Заявки на изобретение

1.№ 2009109569 от 17.03.2009. Способ защиты материалов от микробного разрушения, Эль-Регистан Г.И., Николаев Ю.А., Калинин М.В., Гальченко В.Ф., Борзенков И.А., Коз-лова А.Н., Мулюкин А.Л., Гернет М.В., Шаненко Е.Ф., Воронина Н.А., Кочеткова А.А.

2.№ 2009134293 от 15.09.2009, Способ получения биологически активного компонента для средства, предназначенного для ухода за кожей и компонент, полученный этим спосо¬бом. Николаев Ю.А., Эль-Регистан Г.И.

3.№ 2010108915 от 11.03.2010, Способ направленного изменения активности ферментных белков, Эль-Регистан Г.И., Николаев Ю.А., Калинин М.В., Гальченко В.Ф., Гернет М.В., Шаненко Е.Ф., Лойко Н.Г., Дерябин Д.Г., Головлёва Л.А., Соляникова И.П., Мартиросо-ва Е.И.

4.№ 2010108916 от 11.03.2010, Стабилизатор ферментных белков Эль-Регистан Г.И., Ни-колаев Ю.А., Калинин М.В., Гернет М.В., Шаненко Е.Ф., Лойко Н.Г.

Тезисы конференций

1.Rodionova T.A., Nikolaev Yu.A., Shekhovtsova N.V., Panikov N.S. Reversible adhesion of Bacil-lus licheniformis is an active adaptive response to unfavourable growth conditions// Int. Symp. on Bacteriology and Appl. Мicrobiology, Paris, 2002.

2.Rodionova T.A., Shekhovtsova N.V., Panikov N.S., Ryzhikova I.A., Turova T.P., Nikolaev Y.A. Isolation and identification of microorganisms which are primary colonizators of solid surfaces in parametrical borehole// Int. Symp. on Subsurface Microbiology, Copenhagen, 2002. P. 51.

3.Степаненко И.Ю., Шишкина М.Л., Мартиросова Е.И., Шаненко Е.Ф., Витол И.С., Николаев Ю.А., Эль-Регистан Г.И. Механизм действия алкилоксибензолов на физико-химические свойства белков. // В сб. докладов всероссийской научно-технической конференции-выставки «Высокоэффективные пищевые технологии, методы и средства их реализации». Москва. 2003. С. 195-199.

4.Эль-Регистан Г.И., Крылов И.А., Николаев Ю.А., Шаненко Е.Ф., Воейкова Т.А., Ревина А.А., Мулюкин А.Л. Роль алкилоксибензолов в стрессоустойчивости микроорганизмов и перспективы их использования для биотехнологии // Материалы 2го Московского Междуна¬родного Конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва. 10-14 но¬ября 2003. С. 266.

5.El-Registan G.I., Mulyukin A.L., Nikolaev Yu.A., Stepanenko I.Yu., Shanenko E.F., Strakhovskaya M.G., Revina A.A. The role of microbial low-molecular-weight autoregulatory fac-tors (alkylhydroxybenzenes) in resistance of microorganisms to radiation. // Abstract 35th CO-SPAR Scientific assembly. Paris, France. 2004. http//www. cosis. net./abstract/COSPAR04/00353/ COSPAR04-A-00353-1.pdf.

6.Эль-Регистан Г.И., Николаев Ю.А., Степаненко И.Ю., Мулюкин А.Л., Мартиросова Е.И., Шаненко Е.Ф. Роль алкилоксибензолов в стрессоустойчивости клеток микроорганизмов и механизмы их протекторного действия //Вторая международная конференция «Микробное разнообразие: состояние, стратегия сохранения, биологический потенциал. Пермь-Казань-Пермь. 2005. С. 108-109.

7.Мартиросова Е.И., Николаев Ю.А., Эль-Регистан Г.И. Использование алкилоксибензолов в процессах повышения активности стабильности ферментов //Всероссийская молодёжная школа-конференция «Актуальные аспекты современной микробиологии». Москва. 2005. С. 96-97.

8.Крупянский Ю.Ф., Ещенко Г.В., Михайлюк М.Г., Есин С.В., Коротина О.А., Окишева Е.А., Родин Д.С., Нокс П.П., Николаев Ю.А., Эль-Регистан Г.И. Структурно-динамичесие харак-теристики белков: влияние гидратации и химических шаперонов. Тезисы докладов Пятой Национальной конференции по применению рентгеновского, синхротронного излучений, нейтронов и электронов для исследования наноматериалов и наносистем. Москва, 2005. с.60.

9.Krupyanskii Yu.F., Mikhailyuk M.G., Esin S.V., Korotina O.A., Okisheva E.A., Knox P.P., Ni-kolaev Yu.A., El – Registan G. I. Effects of hydration and interactions with chemical chaperones on protein dynamics. European Biophysics J. V.34, № 6, 2005, p.615.

10.Ю.Ф.Крупянский, О.А.Коротина, Н.Г.Лойко, Ю.А.Николаев, Д.С.Родин, Г.И.Эль-Регистан Изучение механизма посттрансляционной модификации белков // Материалы третьей науч-но-практической конференции "МЕДБИОТЕК". Москва. 2006. С. 51.

11.Ю.Ф. Крупянский, Коротина О.А., Есин С.В., Михайлюк М.Г., Родин Д.С., Дембо К.А., Вол¬ков В.В. Николаев Ю.А., Эль-Регистан Г.И. Эффекты взаимодействия химических шаперо-нов с ферментами: изменение структуры, динамики и функциональной активности // Тезисы докладов VI национальной конференции по применению рентгеновского, синхротронного излучений, нейтронов и электронов для исследования материалов. Москва. 2007. С. 46.

12.Голод Н.А., Лойко Н.Г., Козлова А.Н., Николаев Ю.А. Популяционная вариабельность мо-лочнокислых бактерий Lactobacillus acidophilus AT-41 и Lactococcus lactis ТБ-2 //Материалы Всероссийской конференции с международным участием «Фундаментальные и прикладные аспекты исследования симбиотических систем». 25-27 сентября 2007. Саратов. С. 45.

13.Голод Н.А., Лойко Н.Г., Козлова А.Н., Николаев Ю.А. Дунин Д.А., Нематов А.Л.,Эль-Регистан Г.И. Популяционная вариабельность молочнокислых бактерий Lactobacillus acidophilus AT-41 и Lactococcus lactis ТБ-2 // Материалы Международной научно-практической конференции «Биотехнология. Вода и пищевые продукты». 11-13 мая. Моск¬ва. 2008. С. 80.