Научная тема: «ПОЛНОГЕНОМНЫЕ ПОДХОДЫ К ФУНКЦИОНАЛЬНОМУ АНАЛИЗУ ПОВТОРЯЮЩИХСЯ ЭЛЕМЕНТОВ»
Специальность: 03.00.03
Год: 2008
Отрасль науки: Биологические науки
Список опубликованных работ
ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЕ СТАТЬИ:

1) E. Gogvadze, C. Barbisan, M.-H. Lebrun and A. Buzdin (2007) Tripartite chimeric pseudogene from the genome of rice blast fungus Magnaporthe grisea suggests double template jumps during long interspersed nuclear element (LINE) reverse transcription. BMC Genomics, 8(1):360

2) I. Kholodenko, R. Kholodenko, V. Sorokin, A. Tolmazova, O. Sazonova, A. Buzdin (2007) Anti-apoptotic effect of retinoic acid on retinal progenitor cells mediated by a protein kinase A-dependent mechanism. Cell Research, 17(2):151-62.

3) Buzdin A., Kovalskaya-Alexandrova E., Gogvadze E., Sverdlov E. (2006) At Least 50% of Human-Specific HERV-K (HML-2) Long Terminal Repeats Serve In Vivo as Active Promoters for Host nonrepetitive DNA Transcription. J Virol., 80(21):10752-62.

4) A. Buzdin, E. Kovalskaya-Alexandrova, E. Gogvadze, E. Sverdlov (2006) GREM, a technique for genome-wide isolation and quantitative analysis of promoter active repeats. Nucleic Acids Res., 34(9): e67.

5) И.В.Холоденко, A. A. Буздин, Р.В.Холоденко, Ю.А.Байбикова, В.Ф.Сорокин, В.Н.Ярыгин, Е.Д.Свердлов (2006) Сокультивирование клеток-предшественников сетчатки (КПС) мыши с культурой клеток пигментного эпителия влияет на особенности дифференцировки КПС. Биохимия 71(7):767-74.

6) Kovalskaya, E., Buzdin, A., Gogvadze, E., Vinogradova, T., Sverdlov, E.D. (2006) Functional human endogenous retroviral LTR transcription start sites are located between the R and U5 regions. Virology, Mar 15; 346(2):373-378.

7) Гогвадзе, E., Буздин, A., Свердлов, E. (2005) Множественные акты смены матрицы в ходе LINE-опосредованной обратной транскрипции являются общим механизмом образования химерных ретроэлементов у млекопитающих. Биоорганическая химия, 31(1):82-89

8) Chalaya T., Gogvadze E., Buzdin A., Kovalskaya E., Sverdlov E.D. (2004). Improving specificity of DNA hybridization-based methods. Nucleic Acids Res., 32(16):e130.

9) Buzdin, A., Gogvadze, E., Kovalskaya, E., Volchkov, P., Ustyugova, S., Illarionova, A., Fushan, A., Vinogradova, T., Sverdlov, E. (2003) The human genome contains many types of chimeric retrogenes generated through in vivo RNA recombination. Nucleic Acids Res., 31(15):4385-4390.

10) Буздин, A., Лебедев, Ю., Свердлов, E. (2003) Человек-специфичные вставки LTR HERV-K в интронах генов имеют неслучайную ориентацию и, возможно, участвуют в антисмысловой регуляции экспрессии генов. Биоорганическая химия, 29(1):103-106.

11) Buzdin, A., Ustyugova, S., Khodosevich, K., Mamedov, I., Lebedev, Y., Hunsmann, G., Sverdlov, E. (2003) Human-specific subfamilies of HERV-K (HML-2) long terminal repeats: three master genes were active simultaneously during branching of hominoid lineages. Genomics, 81(2):149-156.

12) Buzdin, A., Ustyugova, S., Gogvadze, E., Lebedev, Y., Hunsmann, G., Sverdlov, E. (2003) Genome-wide targeted search for human specific and polymorphic L1 integrations. Human Genetics, 112(5-6):527-533.

13) Buzdin, A., Ustyugova, S., Gogvadze, E., Vinogradova, T., Lebedev, Y., Sverdlov, E. (2002) A new family of chimeric retrotranscripts formed by a full copy of U6 small nuclear RNA fused to the 3´ terminus of L1. Genomics, 80(4):402-406.

14) Mamedov, I., Batrak, A., Buzdin, A., Arzumanyan, E., Lebedev, Y., Sverdlov, E. (2002) Genome-wide comparison of differences in the integration sites of interspersed repeats between closely related genomes. Nucleic Acids Res., 30(14):e71.

15) Буздин, A., Ревина, Л., Костина, Л., Залунин, И., Честухина, Г. (2002) Взаимодействие белков молекулярной массы 65- и 62-кДа из апикальных мембран эпителия кишечника личинок Aedes aegypti с эндотоксинами Bacillus thuringiensis Cry4B и Cry11A. Биохимия, 67(5):540-546.

16) Buzdin, A., Khodosevich, K., Mamedov, I., Vinogradova, T., Lebedev, Y., Hunsmann, G., Sverdlov, E. (2002) A technique for genome-wide identification of differences in the interspersed repeats integrations between closely related genomes and its application to detection of human-specific integrations of HERV-K LTRs. Genomics, 79(3):413-422.

ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ:

17) A. Buzdin (2007) Human specific endogenous retroviruses. TheScientificWorldJournal, 7: 1848-1868.

18) Buzdin A, Gogvadze E, Lebrun MH. (2007) Chimeric retrogenes suggest a role for the nucleolus in LINE amplification. FEBS Lett., 581(16):2877-82. Epub 2007 May 25.

19) Buzdin, A. (2006) Transposable elements and their use for target site specific gene delivery. Current Pharmacogenomics, March; 4(1): 1-8.

20) Гогвадзе, E., Буздин, A. (2005) Новый механизм образования ретрогенов в геномах млекопитающих: рекомбинация in vivo в ходе обратной транскрипции РНК. Молекулярная биология, 39(3):364-373.

21) Buzdin, A., Vinogradova, T., Lebedev, Y., Sverdlov, E. (2005) Genome-wide experimental identification and functional analysis of human specific retroelements. Cytogenet. Genome Res.;110(1-4):468-474., in the special issue: "Retrotransposable elements and genome evolution"

22) Buzdin, A. (2004) Retroelements and formation of chimeric retrogenes. CMLS, Cell. Mol. Life Sci. 61(16):2046-2059

МОНОГРАФИИ, ГЛАВЫ В КНИГАХ:

23) Книга “Nucleic acids hybridization: modern applications”. Редакторы: Anton Buzdin, Sergey Lukyanov; Springer (2007) ISBN 978-1-4020-6039-7.

24) Nucleic acids hybridization: potentials and limitations (Anton Buzdin)

глава в книге “Nucleic acids hybridization: modern applications”. Редакторы: Anton Buzdin, Sergey Lukyanov, Springer (2007) ISBN 978-1-4020-6039-7.

25) Selective suppression of polymerase chain reaction and its most popular applications (Sergey Lukyanov, Konstantin Lukyanov, Nadezhda Gurskaya, Ekaterina Bogdanova, Anton Buzdin).

глава в книге “Nucleic acids hybridization: modern applications”. Редакторы: Anton Buzdin, Sergey Lukyanov, Springer (2007) ISBN 978-1-4020-6039-7.

26) Suppression subtractive hybridization (Sergey Lukyanov, Denis Rebrikov, Anton Buzdin).

глава в книге “Nucleic acids hybridization: modern applications”. Редакторы: Anton Buzdin, Sergey Lukyanov, Springer (2007) ISBN 978-1-4020-6039-7.

27) Stem-loop oligonucleotides as hybridization probes and their practical use in molecular biology and biomedicine (Anton Buzdin, Sergey Lukyanov).

глава в книге “Nucleic acids hybridization: modern applications”. Редакторы: Anton Buzdin, Sergey Lukyanov, Springer (2007) ISBN 978-1-4020-6039-7.

28) Coincidence cloning: robust technique for isolation of common sequences (Anton Buzdin).

глава в книге “Nucleic acids hybridization: modern applications”. Редакторы: Anton Buzdin, Sergey Lukyanov, Springer (2007) ISBN 978-1-4020-6039-7.

29) DNA hybridization in solution for mutation detection (Anton Buzdin)

глава в книге “Nucleic acids hybridization: modern applications”. Редакторы: Anton Buzdin, Sergey Lukyanov, Springer (2007) ISBN 978-1-4020-6039-7.

30) Current attempts to improve the specificity of nucleic acids hybridization (Anton Buzdin).

глава в книге “Nucleic acids hybridization: modern applications”. Редакторы: Anton Buzdin, Sergey Lukyanov, Springer (2007) ISBN 978-1-4020-6039-7.