Научная тема: «ТЕРМОФИЛЬНЫЕ ГИДРОГЕНОГЕННЫЕ КАРБОКСИДОТРОФНЫЕ ПРОКАРИОТЫ»
Специальность: 03.00.07
Год: 2008
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:

1. Термофильные гидрогеногенные карбоксидотрофные прокариоты широко распространены в наземных и глубоководных гидротермальных местах обитания и составляют существенную часть микробных сообществ гидротерм.

2. Ключевыми ферментами процесса анаэробного окисления СО с образованием водорода являются СО дегидрогеназы и гидрогеназы, фиксация углерода происходит с участием СО дегидрогеназы по пути Вуда-Льюнгдаля.

3. В гидротермальных местах обитания, населенных анаэробными термофильными микробными сообществами, и идет активный процесс трансформации СО, причем основным продуктом является СО2.

4. Термофильные гидрогеногенные СО-окисляющие прокариоты разнообразны по фенотипическим свойствам и не образуют единую филогенетическую группу.

5. Существуют как факультативно, так и облигатно зависящие от СО термофильные гидрогеногенные карбоксидотрофные прокариоты, в разной степени чувствительные к высоким концентрациям СО.

Список опубликованных работ
1. Светличный В.А., Соколова Т.Г., Герхардт М., Заварзин Г.А. (1990) Новая

группа анаэробных термофильных карбоксидобактерий выделяющих водород.

Докл. АН СССР, 314: 742-745

2. Svetlichny V.A., Sokolova T.G., Kostrikina N.A., Zavarzin G.A. (1991) Anaerobic

extremely thermophilic carboxydotrophic bacteria in hydrotherms of Kunashir Island.

Microbial Ecology, 21: 1-7

3. Svetlichny, V. A., Sokolova T. G., Gerhardt M., Ringpfeil M., Kostrikina

N. A. & Zavarzin G. A. (1991). Carboxydothermus hydrogenoformans

gen.nov., sp.nov., a CO-utilizing thermophilic anaerobic bacterium from

hydrothermal environments of Kunashir Island. System Appl Microbiol 14,

254-260.

4. Светличный В.А., Соколова, Т.Г., Кострикина, Н.А., Лысенко А.М. (1994)

Carboxydothrmus restrictus sp.nov. – новая термофильная анаэробная

карбоксидотрофная бактерия. Микробиология, 63, 523-528

5. Пушева М.А., Соколова, Т.Г. (1995). Распределение активностей СО-

дегидрогеназы при СО-зависимом и пируват-зависимом росте анаэробной

термофильной карбоксидотрофной бактерии Carboxydothermus hydrogenoformans.

Микробиология, 64, 581-586.

6. Бонч-Осмоловская Е.А., Мирошниченко М.Л., Слободкин А.И.,

Соколова Т.Г., Карпов Г.А., Кострикина Н.А., Заварзина Д.Г.,

Прокофьева М.И., Русанов И.И., Пименов Н.В. (1999) Биоразнообразие

анаэробных литотрофных прокариот в наземных гидротермах Камчатки.

Микробиология, 68:398-406

7. Sokolova T.G., Gonzales J.M. , Kostrikina N.A., Chernyh N.A., Tourova T.P.,

Bonch-Osmolovskaya E.A., Robb F.T. (2001) Carboxydobrachium pacificum gen.

nov., sp.nov., a new anaerobic thermophilic carboxydotrophic acterium from Okinawa

Trough. Int J System Bacteriol, 51: 141-149

8. Sokolova T.G., Kostrikina N.A., Chernyh N.A., Tourova T.P., Kolganova T.V.,

Bonch-Osmolovskaya E.A. (2002) Carboxydocella thermoautotrophica gen. nov., sp.

nov., a novelanaerobic CO-utilizing thermophile from a Kamchatkan hot spring. Int J

System Evol Microbiol, 52:1961-1967

9. Субботина И.В., Черных Н.А., Соколова Т.Г., Кубланов И.В., Бонч-

Осмоловская Е.А., Лебединский А.В. (2003) Олигонуклеотидные зонды для

детекции представителей рода Thermoanaerobacter . Микробиология, 72: 377-382

10. Sokolova, T. G., Gonzalez, J. M., Kostrikina, N. A., Chernyh, N. A., Slepova, T.

V., Bonch-Osmolovskaya E.A. & Robb, F.T. (2004a). Thermosinus carboxydivorans

gen. nov., sp. nov., a new anaerobic thermophilic, carbon-monoxide-oxidizing,

hydrogenogenic bacterium from a hot pool of Yellowstone National Park. Int J Syst

Evol Microbiol 54: 2353-2359

11. Sokolova, T. G., Jeanthon, C., Kostrikina, N. A., Chernyh, N. A., Lebedinsky,

A. V., Stackebrandt, E. & Bonch-Osmolovskaya, E. A. (2004b). The first evidence of

anaerobic CO oxidation coupled with H2 production by a hyperthermophilic archaeon

isolated from a deep-sea hydrothermal vent. Extremophiles, 8: 317-3236

12. Sokolova T. G., Kostrikina N. A., Chernyh N. A., Kolganova T.V., Tourova T.P.,

Bonch-Osmolovskaya E.A. (2005). Thermincola carboxydiphila gen.nov., sp.nov., a

new anaerobic carboxydotrophic hydrogenogenic bacterium from a hot spring of Lake

Baikal area. Int J Syst Evol Microbiol, 55: 2069-2073

13. Slepova T.V., Sokolova T.G., Lysenko A.M., Tourova T.P., Kolganova T.V.,

Kamzolkina O.V., . Karpov G.A., Bonch-Osmolovskaya E.A. (2006) Carboxydocella

sporoproducens sp. nov., a novel anaerobic CO-utilizing/H2-producing thermophile

bacterium from Kamchatka hot spring. Int J Syst Evol Microbiol, 56: 797-80014

14. Slobodkin A.I., Sokolova T.G., Lysenko A.M., Wiegel J. (2006) Reclassification of

Thermoterrabacterium ferrireducens as Carboxydothermus ferrireducens comb. nov.,

and emended description of the genus Carboxydothermus. Int J Syst Evol Microbiol,

56:2349-2351

15. Zavarzina D.G., Sokolova T.G., Tourova T.P.,Chernyh N.A., Kostrikina N.A.,

Bonch-Osmolovskaya E.A. (2007). Thermincola ferriacetica sp. nov., a new anaerobic,

thermophilic, facultatively chemolithoautotrophic bacterium capable of dissimilatory

Fe(III) reduction. Extremophiles, 11(1):1-7

16. Sokolova T., Hanel J., Oneynwoke R.U., Reysenbach A.-L., Banta A., Geyer R.,

Gonzalez J., Whitman W.B., Wiegel J. (2007) Novel chemolithotrophic, thermophilic,

anaerobic bacteria Thermolithobacter ferrireducens gen. nov., sp. nov. and

Thermolithobacter carboxydivorans sp. nov. Extremophiles, 11(1): 145-157

17. Слепова Т.В., Русанов И.И., Соколова Т.Г., Бонч-Осмоловская, Пименов Н.В.

(2007) Радиоизотопное измерение интенсивности трансформации СО

анаэробными термофильными прокариотами. Микробиология, 76 (5): 594-601

18. Slepova T.V., Sokolova T.G., Kolganova T.V., Tourova T.P. and Bonch-

Osmolovskaya E.A. Carboxydothermus siderophilus sp. nov., a novel thermophilic

hydrogenogenic carboxydotrophic dissimilatory Fe(III)-reducing bacterium from

Kamchatka hot spring. Int J Syst Evol Microbiol, in press

19. Kozina I., Hodges M., Lee K., Wagner I., Wiegel J., Slobodkin A., Tourova T.,

Bonch-Osmolovskaya E., Sokolova T. Isolation of Caldanaerobacter strains from

terrestrial hot springs and description of Caldanaerobacter uzonensis sp.nov. Int J Syst

Evol Microbiol, submitted.

Обзоры

1. Слободкин А.И., Заварзина Д.Г., Соколова Т.Г., Бонч-Осмоловская Е.А.

(1999) Диссимиляционное восстановление неорганических акцепторов

электронов термофильными анаэробными прокариотами. Микробиология,

68:600-622

2. Bonch-Osmolovskaya E.A., Miroshnichenko M.L., Sokolova T.G., Slobodkin A.I.

(2004) Thermophilic microbial communities: new physiological groups, new habitats.

In: Proceedings of Winogradsky Institute of Microbiology. Collected articles on the

Institute 70th Anniversary. P.29-40

3. Robb FT, Gonzalez JM, Sokolova T, Chernyh N, Lebedinski A, Eisen JA, Wu, M,

Tallon LJ, Jones K. (2005) Primary energy metabolism in geothermal environments:

The role of carbon monoxide. First Biannual Workshop on Geothermal Biology and

Geochemistry in Yellowstone National Park. Ed. W. Inskeep

4. Sokolova TG (2008) The genus Carboxydocella Sokolova, Kostrikina, Chernyh,

Tourova, Kolganova,and Bonch-Osmolovskaya 2002, 1965 VP. Second edition of

Bergey´s manual of systematic bacteriology, vol. 3

5. Sokolova TG (2008) The genus Thermosinus Sokolova, González, Kostrikina,

Chernyh, Slepova, Bonch-Osmolovskaya, and Robb 2004, 2357VP. Second edition of

Bergey´s manual of systematic bacteriology, vol. 3

6. Sokolova TG & Zavarzina DG (2008) The genus Thermincola Sokolova, Kostrikina,

Chernyh, Kolganova, Tourova, Bonch-Osmolovskaya 2005, 2072.VP. Second edition

of Bergey´s manual of systematic bacteriology, vol. 3

Тезисы конференций.

1. Svetlichny V.A., Sokolova T.G., Gerhardt M., Zavarzin G.A. (1990) New COutilizing

H2-forming anaerobic extremely thermophilic bacterium – Carboxydothermus

hydrogenoformans. In: Thermophily today. International meeting on cell constituents,

genetics and biotechnological applications of thermophilic microorganisms. Viterbo,

Italy, May 7-9, 1990, p.30

2. Gerhardt M., Ringpfeil M., Svetlichny V.A., Sokolova T.G., Zavarzin G.A.,

Neumann A.,Genyi K. Bath- and Fed-Bath-Fermentation des strict anaerobic

thermophilic bacterium – Carboxydothermus hydrogenus. Iahustagung der

Biotechnologen (Dichema), January 30 – February 1, 1991, Berlin, p.28

3. Bonch-Osmolovskaya E.A., Miroshnichenko M.L., Sokolova T.G., Slobodkin A.I.

Lithotrophic thermophilic anaerobes from Kamchatka thermal areas. Thermophiles’98.

International Conference, Brest, France, 1998. Absracts. B-02.

4. Sokolova T.G., Kostrikina N.A., Bonch-Osmolovskaya E.A., Gonzales J.M., Robb

F.T. Isolation of new anaerobic thermophilic marine carbon monoxide utilizing

bacterium from the hot vent of Okinawa trough. Thermophiles’98. International

Conference, Brest, France, 1998. Absracts. B-P31.

Miroshnichenko M.L., Bonch-Osmolovskaya E.A., Chernyh N.A., SlobodkinA.I.,

5. Sokolova T.G., Kostrikina N.A., Chernyh N.A., Slobodkin A.I., Bonch-

Osmolovskaya E.A., Gonzales J.M., Robb F.T. Isolation of new anaerobic thermophilic

carbon monoxide oxidizing Fe(III) reducing bacterium from a hot spring of

Yellowstone National Park. Abstracts of 3rd International Congress on Extremophiles.

3-7 Sept. 2000, Hamburg, Germany, p.67

6. Sokolova T.G., Kostrikina N.A., Chernyh N.A., Slobodkin A.I., Bonch-

Osmolovskaya E.A., Gonzales J.M., Robb F.T. Isolation of new anaerobic thermophilic

carbon monoxide oxidizing Fe(III) reducing bacterium from a hot spring of

Yellowstone National Park. Abstracts of 3rd International Congress on Extremophiles.

3-7 Sept. 2000, Hamburg, Germany, p.67

7. Sokolova T.G., Gonzales J.M. , Kostrikina N.A., Chernuh N.A., Tourova T.P.,

Robb F.T., Bonch-Osmolovskaya E.A. (2001). Anaerobic CO oxidation and H2

production by thermophilic bacteria from terrestrial and deep-sea hot vents. In:

Proceedings of the 15th International Symposium of Environmental Biogeochemistry,

Wroclaw, Poland, September 11-15, 2001, p. 227

8. Sokolova T.G., Kostrikina N.A., Janthon C., Nercessian O.G., Bonch-

Osmolovskaya E.A. Anaerobic extremely thermophilic carbon monoxide oxidizing

hydrogen-producing archaeon from deep-sea hot vent at East Pacific Rise. In:

Thermophiles 2001 International Conference, New Delhi, India, December 3-7, 2001,

p. 3.

9. Sokolova T.G., González J., Kostrikina N.A., Chernyh N.A.,Tourova T.P., Bonch-

Osmolovskaya E.A., Robb F.Anaerobic CO-oxidizing, H2-producing prokaryotes from

volcanic habitats. Workshop «Astrobiology in Russia» March 25-29, 2002,

St.Petersburg, Russia

10. Bonch-Osmolovskaya E.A., Miroshnichenko M.L., Sokolova T.G., Zavarzina

D.G., Slobodkin A.I. Novel anaerobic thermophilic prokaryotes from terrestrial and

deep-sea volcanic habitats. In: Thermophiles 2001 International Conference, New

Delhi, India, December 3-7, 2001, p. 3.

11. Sokolova T.G., Gonzales J., Kostrikina N.A., Chernyh N.A., Tourova T.P., Bonch-

Osmolovskaya E.A., Robb F.T. Thermophilic anaerobic CO-oxidizing, H2-producing

prokaryotes. In: The 4th International Congress on Extremophiles. Naples, September

22-26, 2002, p. 417.

12. Lebedinsky, A., Subbotina, I., Chernyh, N., Sokolova T., Robb, F., Bonch-

Osmolovskaya, E. (2004). Is the metabolism of diverse hydrogenogenic

carboxydotrophs determined by specific-type carbon monoxide dehydrogenases and

hydrogenases? In: The 5th International Congress on Extremophiles. Cambridge,

Maryland, September 19-23, 2004, p.54.

13. Sokolova, T. (2004). Metabolic and phylogenetic diversity of thermophilic

hydrogenogenic CO-oxidizing prokaryotes. In: The 5th International Congress on

Extremophiles. Cambridge, Maryland, September 19-23, 2004, p.106.

14. Slepova, T., Subbotina, I., Chernyh, N., Tourova, N., Kostrikina, N., Sokolova T.

(2004). Carboxydocella sporoforma sp.nov., a novel anaerobic thermophilic, COutilizing

hydrogenogenic bacterium from a Kamchatka hot spring. In: The 5th

International Congress on Extremophiles. Cambridge, Maryland, September 19-23,

2004, p.112.

15. Sokolova T.G. (2005) Thermophilic hydrogenogenic CO-oxidizing prokaryotes.

In: Thermophiles ’05. From evolution to revolution. September 18 – 22. p.56-5716.

16. Slepova T.V., Sokolova T.G., Kolganova T.V. (2006) Anaerobic thermophilic COutilizing

hydrogenogenic microorganisms from terrestrial hot springs of Geyzer valley

and Uzon Caldera, Kamchatka, Russia. In: Thermophiles ’05. From evolution to

revolution. September 18 – 22. p.12417.

17. Sokolova T.G. (2006) Thermophilic hydrogenogenic CO-oxidizing prokaryotes from

hot volcanic environments. In: 2nd FEMS congress of European microbiologists. Spain,

Madrid, July 4-8

18. Слепова Т.В., Колганова Т.В. и Соколова Т.Г. Распространение анаэробных

термофильных СО-окисляющих/Н2-образующих микроорганизмов в наземных

горячих источниках Долины Гейзеров и Кальдеры Узон, Камчатка, Россия.

Молодежная школа-конференция "Актуальные аспекты современной

микробиологии", Ноябрь 2005, Москва, Россия.

19. Slepova T.V., Sokolova T.G., Kolganova T.V. and Bonch-Osmolovskaya E.A.

Anaerobic thermophilic CO-utilizing hydrogenogenic microorganisms from terrestrial

hot springs of Geyser Valley and Uzon Caldera, Kamchatka, Russia. International

workshop “Biodiversity, molecular biology and biogeochemistry of thermophiles”,

August 2005, Petropavlovsk-Kamchatky, Russia.

20. Slepova T., Sokolova T. and Kolganova T. Anaerobic thermophilic COutilizing

hydrogenogenic microorganisms from terrestrial hot springs of Geyser valley

and Uzon caldera, Kamchatka, Russia. International conference “Thermophiles”,

September 2005, Cold Coast, Australia. Abstract P45.

21. Lebedinsky A., Subbotina I., Slepova T., Chernyh N. and Sokolova T. Occurrence

of coo-type gene clusters in phylogenetically diverse thermophilic CO-oxidizing H2-

producing prokaryotes. International conference “Thermophiles”, September 2005,

Cold Coast, Australia. Abstract P46.

22.Slepova T.V., Sokolova T.G., Kolganova T.V., Pimenov N.V., Rusanov I.I. and

Bonch-Osmolovskaya E.A. Hydrogenogenic CO-oxidizing prokaryotes in microbial

communities of Kamchatka hot environments. 11th International Symposium on

Microbial Ecology, August 2006, Vienna, Austria. Abstract 374.

23.Slepova T.V., Sokolova T.G., Kolganova T.V., Tourova T.P., Kostrikina N.A.,

Bonch-Osmolovskaya E.A. A novel thermophilic hydrogenogenic CO-oxidizing

Fe(III)-reducing bacterium. International conference “Extremophiles”, September

2006, Brest, France. Abstract P032.

24.Slepova T., Sokolova T., Rusanov I., Pimenov N., Lebedinsky A., Kolganova T.,

Kostrikina N., Bonch-Osmolovskaya E. CO transformation by anaerobic microbial

communities of Kamchatka hot springs. International conference “Thermophiles”,

September 2007, Bergen, Norway. Abstract L9.