Научная тема: «РАЗРАБОТКА МЕТОДОЛОГИИ ИДЕНТИФИКАЦИИ ФУНКЦИЙ ГЕНОВ ARABIDOPSIS THALIANA»
Специальность: 03.00.15
Год: 2008
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:

 

1. Установлено, что гены Synechocystis PCC 6803 - suhB, кодирующий экстрагенный супрессор SuhB из семейства инозитол монофосфатаз, и petF, продуктом которого является ферредоксин, участвуют в контроле фотосинтеза.

2. Показано, что природа «смешанной» ДНК связана с наличием в ядерном и хлоропластном геномах высших растений нескольких семейств консервативных нуклеотидных последовательностей размером 17-32 п.н.

3. Показано, что хлоропластная ДНК растений либо не метилирована совсем, либо метилирована в очень малой степени.

4. Создана методология получения и отбора инсерционных мутантов A. thaliana, которая включает в себя разработку эффективной системы агробактериальной трансформации, конструирование векторных систем для индукции «nul» мутантов и мутантов, обусловленных суперэкспрессией генов, и использование технологии ПЦР-анализа для создания коллекции трансгенных линий и инсерционных мутантов A. thaliana.

5. Разработан метод компенсации гормонального дисбаланса для A. thaliana. Это позволило провести молекулярно-генетический анализ ряда условно летальных мутантов и мутантов со сниженной фертильностью.

6. Установлена функциональная значимость ретротранспозонов на примере рецессивного летального мутанта гипокотиля у A. thaliana. Ген At2g09920, инактивация которого инсерцией Т-ДНК приводит к возникновению мутантного фенотипа, представляет собой ретротранспозон.

7. Идентифицированы функции гена At1g12860 у A. thaliana, в структуру которого входит F-box домен, играющий ключевую роль в убиквитин-зависимом протеолизе, и транскрипционный активатор типа «спираль-петля-спираль». Показано, что катаболическая функция связана с контролем развития семядолей, тогда как его анаболическая функция - с контролем ответа на холодовой стресс.

8. Показано, что потеря функции гена At1g78950, кодирующего фермент из семейства оксидоскваленциклаз, приводит к дефектам развития проростков у A. thaliana.

9. Установлено, что суперэкспрессия гена At1g33390, контролирующего синтез АТФ-зависимой хеликазы из семейства DEAD-box белков, обусловливает образование фасциированного стебля у растений A. thaliana.

10. Показано, что суперэкспрессия гена At5g10080, кодирующего белок А1 класса аспартил протеаз, приводит к замедлению развития растений A. thaliana, изменению их окраски и снижению фертильности.

Список опубликованных работ
1. Мазин А.Л., Бойко Л.М., Огаркова О.А., Ванюшин Б.Ф. Потеря динуклеотидов CpG из ДНК. VI. Метилирование генов митохондрий и хлоропластов // Молекуляр. Биол. 1988. Т. 22. Вып. 6. С. 1688-1696.

2. Ванюшин Б.Ф., Александрушкина Н.И., Огаркова О.А. Цитокинины заметно не изменяют метилирование адениновых остатков ДНК в культуре клеток Escherichia coli B // Биохимия. 1989. Т. 54. Вып. 10. С. 1666-1672.

3. Ванюшин Б.Ф., Огаркова О.А. Отсутствие содержащих метилированный аденин Gm6ATC-последовательностей в хлоропластных и ядерных ДНК бобовых растений // Биохимия. 1990. Т. 55. Вып. 5. С. 946-951.

4. Лысенко Е.С., Гапеева Т.А., Ермакова С.Ю., Еланская И.В., Огаркова О.А., Тарасов В.А. Гомология клонированных фрагментов ДНК цианобактерии Synechocystis 6803 с хлоропластной и ядерной ДНК высших растений // Генетика. 1991. Т. 27. № 4. С. 581-588.

5. Тарасов В.А., Огаркова О.А., Денисенко Ю.В. Гомология между ядерной и хлоропластной ДНК у некоторых видов двудольных растений // Сборник докладов VII Всесоюзного симпозиума «Молекулярные механизмы генетических процессов». М. 1990. С. 140-151.

6. Котлярова Е.Г., Денисенко Ю.В., Огаркова О.А., Тарасов В.А. Гомология между хлоропластной и ядерной ДНК различных видов сем. Fabaceae и Arabidopsis thaliana // Генетика. 1992. Т. 29. № 9. С. 5-10.

7. Лысенко Е С., Огаркова О.А., Тарасов В.А. Локализация клонированных генов фотосинтеза цианобактерии Synechocystis sp. PCC 6803 в ядерном и хлоропластной геномах высших растений // Генетика. 1993. Т. 29. № 2. С. 348-353.

8. Лысенко Е.С., Огаркова О.А., Еланская Е.В., Тарасов В.А., Шестаков С.В. Новая открытая рамка считывания в геноме цианобактерии Synechocystis sp. PCC 6803 // Генетика. 1995. Т. 31. № 2. С. 162-169.

9. Гапеева Т.А., Огаркова О.А., Тарасов В.А., Волотовский И.Д. Новые вектора для трансформации двудольных растений // Генетика. 1995. Т. 31. № 8. С. 1085-1091.

10. Огаркова О.А., Хадеева Н.В., Гордон Н.Ю., Гапеева Т.А., Тарасов В.А. Инсерционный мутагенез Arabidopsis thaliana: получение морфологических мутантов // Генетика. 1997. Т. 33. № 2. С. 223-228.

11. Огаркова О.А., Хадеева Н.В., Яковлева Е.Ю., Тарасов В.А. Трансгенные линии табака для регистрации индуцированной рекомбинации по прямым повторам ДНК // Генетика. 1998. Т. 34. № 3. С. 435-437.

12. Ежова Т.А., Огаркова О.А., Солдатова О.П. Инсерционный мутагенез у растений // Методическое пособие к практикуму по генетики растений на кафедре генетики и селекции Биологического факультета МГУ. Москва. ДИАЛОГ МГУ. 1997. 43 С.

13. Томилов A.A, Томилова Н.Б., Огаркова О.А., Тарасов В.А. Инсерционный мутагенез Arabidopsis thaliana: Увеличение эффективности трансформации прорастающих семян в результате предобработки их ультразвуком // Генетика. 1999. Т. 35. № 9. С. 1214-1222.

14. Tomilov A.A., Tomilova N.B., Ogarkova O.A., Tarasov V.A. Insertional mutagenesis in Arabidopsis thaliana: Presonication of germinating seeds increases the efficiency of their transformation // http://www.shef-ac-press.co.uk/subis

15. Томилов A.A, Томилова Н.Б., Огаркова О.А., Тарасов В.А. Идентификация гена, включенного в контроль развития корневой системы у Arabidopsis thaliana // Генетика. 2001. Т. 37. № 1. С. 36-45

16. Томилова Н.Б., Томилов A.A, Огаркова О.А., Тарасов В.А. Идентификация гена, мутация в котором обуславливает возникновение некрозов семядолей при развитии проростков Arabidopsis thaliana // Генетика. 2001. Т. 37. №1. С. 36-45.

17. Огаркова О.А., Томилова Н.Б., Томилов A.A, Тарасов В.А. Создание коллекции морфологических инсерционных мутантов Arabidopsis thaliana // Генетика. 2001. Т. 37. № 8. С. 1081-1087.

18. Томилова Н.Б., Томилов А.А., Огаркова О.А., Солдатова О.П., Тарасов В.А. Гормон-зависимые инсерционные мутанты Arabidopsis thaliana со сниженной жизнеспособностью и фертильностью. Генетика. 2001. Т. 37. № 9. С.1251-1257.

19. Ezhova T.A., Soldatova O.P., Ondar U.N., Penin A.A., Ogarkova O.A., Tomilov A.A., Tomilova N.B., Tarasov V.A. Genetic collection of Arabidopsis thaliana development mutants. In: Internat. Conf. “Genetic collections, isogenic and alloplasmic lines”. Novosibirsk. Russia. 2001. C. 149-153.

20. Ежова Т.А., Лебедева О.В., Огаркова О.А., Пенин А.А., Солдатова О.П., Шестаков С.В. Arabidopsis thaliana – модельный объект генетики растений // Учебно-методическое пособие по генетике растений. Москва. МАКС Пресс. 2003. 220 С.

21. Огаркова О.А., Томилов А.А., Томилова Н.Б., Тарасов В.А. Cпасение инсерционных рецессивных летальных мутантов Arabidopsis thaliana // Онтогенез. 2004. Т.35. №.3. С.220-228.

22. Фурсова О.В., Погорелко Г.В., Авсюк А.Ю., Томилова Н.Б., Томилов А.А., Тарасов В.А., Огаркова О.А. Идентификация потенциального гена – регулятора развития семядолей у проростков Arabidopsis thaliana// Докл. Акад. Наук. 2004. Т. 395. №. 5. С. 1-3.

23. Ogarkova O.A., Tomilov A.A., Tomilova N.B., Pogorelko G.V., Fursova O.V., Tarasov V.A. Insertional mutagenesis in Arabidopsis thaliana : Collection of morphological insertion mutants // In: Proceedings of international scientific practical conference ”Biotechnology of vegetable, flower and not widely spread crops”. Moscow. 2004. P. 138-141.

24. Ogarkova O.A., Fursova O.V., Tomilova N.B., Tomilov A.A., Pogorelko G.V., Avsiuk A.Yu., Tarasov V.A. Insertional mutagenesis in Arabidopsis thaliana : Identification of a novel gene implicated in cotyledon development // In: Proceedings of international scientific practical conference ”Biotechnology of vegetable, flower and not widely spread crops”. Moscow. 2004. P. 142-145.

25. Огаркова О.А., Томилов А.А., Томилова Н.Б. Тарасов В.А. Идентификация гена, мутация в котором приводит к возникновению рецессивных летальных проростков у Arabidopsis thaliana // Онтогенез. 2005. Т. 36. №. 3. С. 222-224.

26. Огаркова О.А., Томилов А.А., Томилова Н.Б., Тарасов В.А. Идентификация гена, мутация в котором приводит к тропизму гипокотиля у Arabidopsis thaliana // Генетика. 2005. Т. 41. № 3,. С. 427-429.

27. Огаркова О.А., Томилов А.А., Томилова Н.Б., Погорелко Г.В.,Тарасов В.А. Идентификация гена, мутация в котором приводит к морфологическим изменениям гипокотиля у Arabidopsis thaliana // Генетика. 2005. Т. 41. № 2. С. 166-170.

28. Погорелко Г.В., Фурсова О.В., Огаркова О.А., Тарасов В.А. Новая система векторов для индукции суперэкспрессии генов у двудольных растений // Генетика. 2007. Т. 43. № 2. С. 194-201.

29. Pogorelko G.V., Fursova O.V., Ogarkova O.A., Tarasov V.A. A new technique for activation tagging in Arabidopsis // Gene. 2008. V. 44. P. 67-75.