Научная тема: «КАРТИРОВАНИЕ И АНАЛИЗ ГЕНОВ И ФУНКЦИОНАЛЬНО-ЗНАЧИМЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ГЕНОМА ЧЕЛОВЕКА»
Специальность: 03.02.07
Год: 2010
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
1. Физические NotI-карты являются эффективным инструментом для верификации протяженных геномных контигов и идентификации новых генов человека. NotI-STS-маркеры следует рассматривать как универсальные маркеры генов.

2. Интеграция вируса папилломы человека происходит в любые участки генома клетки хозяина. Терминация транскрипции интегрированной ДНК вируса осуществляется за счет близлежащих клеточных сигналов полиаденилирования. 3.

Изменение экспрессии генов RHOA, SEMA3B, RARB, GPX1, DAG1, NBEAL2, CKAP2, W91914 и H51703 в опухолях различной локализации является надежным тестом для определения их роли в процессах развития опухоли.

4. Картированные и охарактеризованные нами гены NBEAL2 и ABLIM2 консервативны по своей структуре и функции у млекопитающих. Ген WASF4 имеется только у человека и приматов, что свидетельствует о недавнем его появлении в геноме млекопитающих.

5. Созданная нами тест-система для одновременного определения мутаций CCR5del32 и CCR5m303 в гене CCR5 человека является эффективным инструментом для определения генетической устойчивости к заражению М-тропным вариантом ВИЧ.

Список опубликованных работ
1. Сулимова Г.Е., Компанийцев А.А., Кунижева С.С., Климов Е.А., Рахманалиев Э.Р., Удина И.Г. Картирование в геноме человека EST- и STS-маркеров с использованием панели радиационных гибридов // Генетика. 2000. Т.36. № 7. С.900-907.

2. Сулимова Г.Е., Компанийцев А.А., Мойсяк Е.В., Рахманалиев Э.Р., Климов Е.А., Удина И.Г., Захаров И.А. Радиационное картирование как один из основных методов построения физических карт геномов человека и животных с высоким уровнем разрешения // Радиационная биология. Радиоэкология. 2000. Т.40. №5. С.520-528.

3. Дергунова Л.В., Раевская Н.М., Владыченская И.П., Полтараус А.Б., Климов Е.А., Сулимова Г.Е., Лимборская С.А. Мозгоспецифическая последовательность Hfb1 входит в состав протяженной 3´- нетранслируемой области гена комплексина 2 человека: новые данные in vitro и in silico экспериментов // Молекулярная биология. 2001. Т.35. № 5. С.778-786.

4. Eugene Klimov, Svetlana Vinokourova, Elena Moisjak, Elian Rakhmanaliev, Vera Kobseva, Laimonis Laimins, Fjodor Kisseljov, Galina Sulimova. Human papilloma viruses and cervical tumors: mapping of integration sites and analysis of adjacent cellular sequences // BMC Cancer. 2002. 2:24.

5. Рахманалиев Э.Р., Климов Е.А., Компанийцев А.А., Сулимова Г.Е.. Структура гена CKAP2 (LB1), вовлеченного в процессы онкогенеза человека // Молекулярная биология. 2002. Т.36. №6. С.985-989.

6. Sulimova G.E., Kutsenko A.S., Rakhmanaliev E.R., Udina I.G., Kompaniytsev A.A., Protopopov A.I., Moisjak E.V., Klimov E.A., Muravenko O.V., Zelenin A.V., Braga E.A., Kashuba V.I., Zabarovsky E.R., Kisselev L.L. Human chromosome 3: integration of 60 NotI clones into a physical and gene map // Cytogenet. Genome Res. 2002. V.98. P.177-183.

7. Рахманалиев Э.Р., Апрятин С.А., Николаева И.А., Климов Е.А., Сулимова Г.Е., Сидорович И.Г. Способ одновременного определения мутаций CCR5del32 и CCR5m303 в гене CCR5 человека, обуславливающих генетическую устойчивость обследуемых к инфицированию вирусом иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ1) // Патент RU 2249619 C2. от 23.04.2003.

8. Рахманалиев Э.Р., Климов Е.А., Сулимова Г.Е. Методы картирования геномов млекопитающих // Успехи современной биологии. 2004. Т.124. №3. С.286-302.

9. Сулимова Г.Е., Рахманалиев Э.Р., Климов Е.А., Компанийцев А.А., Удина И.Г., Забаровский Е.Р., Киселев Л.Л. NotI-STS как маркеры генов хромосомы 3 человека // Молекулярная биология. 2005. Т.39. №4. С.687-701.

10. Eugene Klimov, Olga Rud’ko, Elian Rakhmanaliev, Galina Sulimova. Genomic organisation and tissue specific expression of ABLIM2 gene in human, mouse and rat // BBA - Gene Structure and Expression. 2005. V.1730/1. P.1-9.

11. Апрятин С.А., Рахманалиев Э.Р., Николаева И.А., Рубан С.В., Вазыхова Ф.Г., Климов Е.А., Сулимова Г.Е., Сидорович И.Г. Мутация CCR5del32 в гене CCR5 человека влияет на устойчивость к инфицированию М-тропным вариантом ВИЧ-1 // Генетика. 2005. Т.41. №11. С.1559-1562.

12. Debora Angeloni, Arja ter Elst, Ming Hui Wei, Anneke Y. van der Veen, Eleonora A. Braga, Eugene A. Klimov, Tineke Timmer, Luba Korobeinikova, Michael I. Lerman and Charles H.C.M. Buys. Analysis of a new homozygous deletion in the tumor suppressor region at 3p12.3 reveals two novel intronic non-coding RNA genes // Genes, Chromosomes & Cancer. 2006. V.45. №7. P.676-691.

13. Брага Э.А., Логинов В.И., Климов Е.А., Килосанидзе Г., Ходырев Д.С., Каганова Н.Л., Казубская Т.П., Ермилова В.Д., Гарькавцева Р.Ф., Пронина И.В., Рудько О.И., Забаровский Е.Р., Сулимова Г.Е., Киселев Л.Л.. Транскрипция онкогена RHOA в эпителиальных опухолях активируется посредством умножения копий гена и/или деметилирования промоторного района // Молекулярная биология. 2006. Т.40. №5. С.865-877.

14. И.В. Пронина, В.И. Логинов, Е.А. Климов, В.С. Прасолов, Д.С. Ходырев, Т.П. Казубская, Р.Ф. Гарькавцева, Г.Е. Сулимова, Э.А. Брага. Профили изменения экспрессии гена SEMA3B в эпителиальных опухолях // Молекулярная биология. 2009. Т.43. №3. С.439-445.

15. Е.А. Климов. Потенциальные сигналы терминации транскрипции интегрированной ДНК вируса папилломы человека: анализ in silico // Молекулярная биология. 2008. Т.42. №1. С.178-180.

16. Е.А. Климов, Э.Р. Рахманалиев, Г.Е. Сулимова. WASF4 – новый член семейства генов WAS // Молекулярная биология. 2008. Т.42. №4. С.625-628.

17. Коробейникова Л.А., Климов Е.А. Полиморфизм генов CCK, CCK1R и CCK2R у жителей Москвы // Медицинская генетика. 2010. Т.9. №6. C.

18. Е.А. Климов. Интеграции вирусов папилломы человека в геном клетки хозяина и патогенез рака шейки матки // Успехи современной биологии. 2010. Т.130. №4. С.381-389.