Научная тема: «МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ ИММУННОГО ОТВЕТА ПРИ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЯХ ОРГАНОВ ЖЕНСКОЙ РЕПРОДУКТИВНОЙ СИСТЕМЫ»
Специальность: 03.03.03
Год: 2014
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. Для исследования функциональной активности генов иммунного ответа при воспалительных заболеваниях органов женской репродуктивной системы разработаны 32 тест-системы на основе количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени.
  2. Воспалительные процессы слизистой влагалища сопровождаются изменением транскрипционного профиля иммунокомпетентных клеток: повышается экспрессия мРНК генов IL1B, IL8, IL10, CD45, CD69, TLR2, TLR4, TNF, снижается экспрессия мРНК генов GATA3, CD68, IL12A, IL18, TGFB1, RORC.
  3. Установлена генетическая предрасположенность к развитию воспалительных заболеваний нижних отделов половых путей у носителей аллеля С локуса TGFB1 -509 C>T и протективная роль аллеля А локуса TNF -238 G>A в развитии вагинитов.
  4. Профиль экспрессии генов иммунного ответа в эндометрии зависит от фазы менструального цикла и наличия воспаления. При полном симптомокомплексе хронического эндометрита и лимфоидной инфильтрации стромы эндометрия повышена экспрессия мРНК генов IL1B, IL6, IL8, IL10, IL12A, TNF, TGFB1, Foxp3, IL2Ra, LIF, TLR9, VEGFA, TLR2. Склерозирование сосудов и фиброз стромы эндометрия сопровождаются более выраженным изменением цитокинового каскада: повышается экспрессия мРНК генов IL1B, IL6, IL8, IL12A, TGFB1, Foxp3, IL2Ra, LIF, TLR9, VEGFA, TLR2, IL18, IFNG и TLR4.
  5. Определены ассоциации различных видов лактобактерий с состоянием микробиоты влагалища и местного иммунитета: у условно здоровых женщин доминирование L.iners в составе лактофлоры приводит к повышению уровня экспрессии мРНК генов IL8, TLR4, IL10, CD69, CD45 и снижению IL18.
  6. При хроническом эндометрите в полости матки определена ведущая роль бактериального фона, обусловленного условно-патогенными микроорганизмами (Enter obacteriaceae, Gardnerella vaginalis/ Prevotella spp./ Porphyromonas spp., Ureaplasma spp).
  7. Предложены способы оценки функционального состояния местного иммунитета при вагинитах и хроническом эндометрите с фиброзом стромы эндометрия по транскрипционному профилю генов иммунного ответа, основанные на методах многофакторного анализа.
Список опубликованных работ
Статьи в рецензируемых научных изданиях:

1. Донецкова А.Д., Шарова Н.И., Литвина М.М., Бурменская О.В., Трофимов Д.Ю., Ярцев М.Н., Алексеев Л.П., Ярилин А.А. Регуляторные Т-клетки при аллергии у детей. // Медицинская иммунология. - 2008. – Т.10. - №2-3. – С.159-166.

2. Ярилин А.А., Козлов В.А., Бурменская О.В., Аметов А.С., Никонова М.Ф., Трофимов Д.Ю. Естественные регуляторные Т-клетки и связанные с ними цитокины при хроническом аутоиммунном тиреоидите. // Иммунология. – 2008. - №6. – С.357-361.

3.Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Батенева Е.И., Алексеев Л.П., Насонов Е.Л., Александрова Е.Н., Новиков А.А. Разработка комплекса тест-систем на основе ОТ-ПЦР в режиме «реального времени» для определения цитокинового профиля в мононуклеарных клетках крови и синовиальной жидкости при ревматоидном артрите. // Медицинская иммунология. - 2008. – Т.10. - №6. – С.563-570.

4.Савилова А.М., Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Алексеев Л.П., Хаитов Р.М. Метод оценки результатов РБТЛ с помощью количественной полимеразной цепной реакции. // Иммунология. - 2008. – Т.29. - №3. – С.178-182.

5.Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Донецкова А.Д., Батенева Е.И., Ярилин А.А., Алексеев Л.П. Разработка тест-системы для определения уровня экспрессии мРНК Foxp3 на основе ОТ-ПЦР в режиме реального времени. // Иммунология. - 2008. – Т.29. - №3. – С.182-187.

6. Шарова Н.И., Донецкова А.Д., Топтыгина А.П., Митин А.Н., Литвина М.М., Бурменская О.В., Трофимов Д.Ю., Сухих Г.Т., Алексеев Л.П., Ярилин А.А. Экспрессия цитокиновых генов и секреция цитокинов эпителиальными и лимфоидными клетками тимуса человека. // Иммунология. - 2008. – Т.29. - №6. – С.329-334.

7. Ярилин А.А., Козлов В.А., Бурменская О.В., Аметов А.С., Никонова М.Ф., Трофимов Д.Ю. Влияние терапии человеческим рекомбинантным ИЛ-2 (ронколейкином) на естественные регуляторные Т-клетки и связанные с ними цитокины при хроническом аутоиммунном тироидите. // Иммунология. - 2009. - № 2. - С.120-123.

8. Байрамова Г.Р., Муравьева В.В., Донников А.Е., Бурменская О.В., Ворошилина Е.С., Тумбинская Л.В. Оценка эффективности комплексной терапии больных с хроническим рецидивирующим вульвовагинальным кандидозом. // Российский вестник акушера-гинеколога. - 2011. - №2. – С.86-89.

9.Fedenko E.S., Elisyutina O.G., Filimonova T.M., Boldyreva M.N., Burmenskaya O.V., Rebrova O.Y., Yarilin A.A., Khaitov R.M. Cytokine gene expression in the skin and peripheral blood of atopic dermatitis patients and healthy individuals. // Self/Nonself. - 2011. – Vol.2. - №2. – Р.120-124.

10.Филимонова Т.М., Елисютина О.Г., Феденко Е.С., Бурменская О.В., Болдырева М.Н. Влияние топических глюкокортикостероидов на экспрессию генов цитокинов в коже и периферической крови больных атопическим дерматитом. // Российский аллергологический журнал. - 2011. - №3. – С.19-30.

11. Бурменская О.В., Байрамова Г.Р. Непша О.С. Донников А.Е. Цитокиновый профиль иммунокомпетентных клеток влагалища при хроническом рецидивирующем вульвовагинальном кандидозе. // Уральский медицинский журнал. - 2011. - №3. – С.44-49.

12. Бурменская О.В., Байрамова Г.Р., Непша О.С., Трофимов Д.Ю., Муллабаева С.М., Донников А.Е., Екимов А.Н. Состояние локального иммунитета при хроническом рецидивирующем вульвовагинальном кандидозе. // Иммунология. - 2011. - №3. – С.154-159.

13. Филимонова Т.М., Елисютина О.Г., Ниязов Д.Д., Болдырева М.Н., Бурменская О.В., Реброва О.Ю. Локальный и системный иммунный ответ у больных тяжелым атопическим дерматитом. // Российский аллергологический журнал. - 2011. - №5. – С.10-15.

14.Сухих Г.Т., Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Байрамова Г.Р., Непша О.С., Донников А.Е., Дуринян Э.Р., Бирюкова А.М. Профиль экспрессии мРНК генов цитокинов в вагинальных мазках женщин репродуктивного возраста при неспецифическом вагините и бактериальном вагинозе. // Акушерство и гинекология. - 2011. - №7-2. – С.33-38.

15.Кудинова Е.А., Бурменская О.В., Боженко В.К., Васкевич В.Ф., Непша О.С., Мельникова Н.В., Троценко И.Д., Трофимов Д.Ю., Сухих Г.Т. Экспрессия маркеров апоптоза при раке молочной железы. // Технологии живых систем. - 2011. – Т.8. -№7. – С.40-44.

16. Смольникова В.Ю., Краснощока О.Е., Бурменская О.В., Трофимов Д.Ю., Калинина Е.А., Сухих Г.Т. Возможности прогнозирования исходов вспомогательных репродуктивных технологий по уровню спермальных мРНК. // Акушерство и гинекология. - 2012. - №2. – С.36-40.

17. Меджидова М.К., Бурменская О.В., Донников А.Е., Непша О.С., Трофимов Д.Ю., Тютюнник В.Л., Сухих Г.Т. Оценка локальной воспалительной реакции во влагалище по профилю экспрессии мРНК генов цитокинов у беременных накануне родов. // Акушерство и гинекология. - 2012. - №3. – С.26-31.

18. Сухих Г.Т., Бурменская О.В., Смольникова В.Ю., Краснощока О.Е., Трофимов Д.Ю., Донников А.Е., Калинина Е.А. мРНК протаминов и фертилина как потенциальные биомаркеры исхода программ вспомогательных репродуктивных технологий. // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. - 2012. – Т.153. - №4. – С.513-515.

19. Болдырева М.Н., Царев С.В., Чулкина М.М., Савилова А.М., Бурменская О.В., Трофимов Д.Ю., Ильина Н.И., Шартанова Н.В., Алексеев Л.П. Исследование экспрессии генов иммунной системы у спортсменов высших достижений методом ПЦР в реальном времени. // Иммунология. - 2012. - №5. – С.231-236.

20. Чернуха Г.Е., Думановская М.Р., Бурменская О.В., Шубина Е.С., Коган Е.А., Трофимов Д.Ю. Экспрессия генов, регулирующих апоптоз, при разных типах гиперплазии эндометрия и эндометриоидной карциноме. // Акушерство и гинекология. - 2013. - №1. – С.63-69.

21.Думановская М.Р., Чернуха Г.Е., Бурменская О.В., Непша О.С., Павлович С.В., Коган Е.А., Трофимов Д.Ю. Особенности экспрессии маркеров пролиферации в гиперплазированном эндометрии. // Гинекология. - 2013. - №2. – С.4-8.

22.Бестаева Н.В., Назарова Н.М., Прилепская В.Н., Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Суламанидзе Л.А. Папилломавирусная инфекция: новые взгляды на диагностику и лечение. // Гинекология. - 2013. -№3. – С.4-7.

23.Прилепская В.Н., Назарова Н.М., Новикова Е.П., Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Безнощенко О.С. Иммунологические и молекулярно-биологические маркеры, ассоциированные с хроническим цервицитом. // Гинекология. - 2013. - №3. – С.46-51.

24. Bourmenskaya O., Shubina E., Trofimov D., Rebrikov D., Sabdulaeva E., Nepsha O., Bozhenko V., Rogovskaya S., Sukhikh G. Host gene expression profiling of cervical smear is eligible for cancer risk evaluation. // Journal of Clinical Pathology. - 2013. - Vol.66. - №4. – Р.282-285.

25.Бестаева Н.В., Назарова Н.М., Прилепская В.Н., Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Павлович С.В. Папилломавирусная инфекция, обусловленная ВПЧ 52 и 58 типов и ее роль в развитии цервикальных интраэпителиальных неоплазии. // Акушерство и гинекология. - 2013. - №7. – С.45-50.

26.Думановская М.Р., Чернуха Г.Е., Бурменская О.В., Донников А.Е., Трофимов Д.Ю. Вероятность неопластической трансформации при различных типах гиперплазии эндометрия. // Акушерство и гинекология. -2013. - №8. – С.56-62.

27.Тютюнник В.Л., Карапетян Т.Э, Донников А.Е., Кан Н.Е., Бурменская О.В. Изменения локального и системного иммунитета при оппортунистических инфекциях влагалища у беременных. // Акушерство и гинекология. - 2013. - №8. – С.25-29.

28.Ионов О.В., Никитина И.В., Бурменская О.В., Непша О.С., Трофимов Д.Ю., Донников А.Е., Митрохин Д.С., Припутневич Т.В., Любасовская Л.А., Дегтярев Д.Н. Роль метода ПЦР в диагностике врожденных и нозокомиальных инфекции у новорожденных. // Акушерство и гинекология.- 2013. - №11. – С.59-64.

29. Гомболевская Н.А., Бурменская О.В., Демура Т.А., Марченко Л.А., Коган Е.А., Трофимов Д.Ю., Сухих Г.Т. Оценка экспрессии мРНК генов цитокинов в эндометрии при хроническом эндометрите. // Акушерство и гинекология. - 2013. – №11. – С.35-40.

30. Бурменская О.В., Байрамова Г.Р., Непша О.С., Трофимов Д.Ю., Муравьева В.В., Абакарова П.Р., Стрельченко Д.А., Кряжева В.С., Сухих Г.Т. Видовой состав лактобактерий при неспецифических вагинитах и бактериальном вагинозе и его влияние на локальный иммунитет. // Акушерство и гинекология.- 2014. – №1. – С.41-45.

31.Пат. 2464570 Российская Федерация, МПК G01N33/53. Метод диагностики цервикальных интраэпителиальных неоплазий. / Боженко В.К., Кудинова Е.А., Близнюков О.П., Мельникова Н.В., Бурменская О.В.; заявитель и патентообладатель ФГУ "РНЦРР" Минздравсоцразвития России (RU). - № 2010147074/15; заявл. 19.11.2010; опубл. 20.10.2012, Бюл. №29 – 9 с.

32.Пат. 2417263 Российская Федерация, МПК C12Q1/68. Способ диагностики воспалительного процесса при раннем ревматоидном артрите. / Ребриков Д.В., Бурменская О.В., Трофимов Д.Ю.; заявитель и патентообладатель Закрытое акционерное общество "Научно-производственная фирма ДНК-Технология" (RU). -№ 2009101460/15; заявл. 20.01.2009; опубл. 27.04.2011, Бюл. №12 – 20 с.

33. Пат. 2492244 Российская Федерация, МПК C12Q1/68, С12N5/00. Способ оценки степени пролиферации клеток с помощью маркерных генов методом полимеразной цепной реакции. / Савилова А.М., Бурменская О.В., Трофимов Д.Ю., Ребриков Д.В.; заявитель и патентообладатель Закрытое акционерное общество "Научно-производственная фирма ДНК-Технология" (RU). - № 2008100303/10; заявл. 15.01.2008; опубл. 10.09.2013, Бюл. №25 – 16 с.

Материалы симпозиумов и конференций:

34.Папуашвили М.Н., Петрова Т.В., Бурменская О.В., Трофимов Д.Ю. Диагностическая значимость количественного определения РНК вируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1) при альтернативной терапии у ВИЧ-инфицированных пациентов методом ОТ-ПЦР в режиме «реального времени». // Труды XIII Конгресса «Человек и лекарство». – Москва, 2006. - Т.2.

35.Донецкова А.Д., Шарова Н.И., Бурменская О.В., Топтыгина А.П., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П., Ярилин А.А. Выработка цитокинов эпителиальными клетками тимуса человека. // Российский аллергологический журнал. - 2007. — №3-1.

— С.70.

36. Донецкова А.Д., Бурменская О.В., Ярцев М.Н., Трофимов Д.Ю., Алексеев Л.П., Ярилин А.А. Регуляторные Т-клетки при аллергии у детей. // Российский аллергологический журнал. - 2007. — №3-1 . — С.17.

37. Донецкова А.Д., Бурменская О.В., Ярцев М.Н., Трофимов Д.Ю., Ярилин А.А. Анализ экспрессии молекулярного маркера регуляторных клеток FOXP3 в норме и при аллергопатологии у детей. // Медицинская иммунология. - 2007. — Т.9. - № 2-3.

— С.180.

38.Насонов Е.Л., Александрова Е.Н., Новиков А.А., Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В, Ребриков Д.В. Разработка комплексной технологии ранней диагностики воспалительных заболеваний на основе молекулярных маркеров иммунного ответа. // Сборник тезисов итоговой конференции по результатам выполнения мероприятий за 2007 год в рамках приоритетного направления «Живые системы» ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы». – Москва, 2007. – С.124-125.

39.Trophimov D.Y., Burmenskaya O.V, Ebzeeva M. V., Kalinina E.A., Mullabaeva S.M, Kuzjmichev L.N., Sukhikh G.T. Markers associated with success and failure of embryo transfer (ET) during IVF program. // 7th European Congress on Reproductive Immunology. / J Reprod Immunol. - 17-20 September, Marathon, Greece, 2009. - Vol.81. - P.157.

40. Vasilyev E.V., Burmenskaya O.V., Khoroshkeeva O.V., Tetruashvili N.K., Trofimov D.Y., Sukhikh G.T. Parental killer Ig-like receptor and HLA-C genotypes in couples with recurrent miscarriage.// 8th European Congress on Reproductive Immunology. / J Reprod Immunol. - 10-13 November, Munchen, Germany , 2010. – Vol.86. – P.108.

41. Байрамова Г.Р., Непша О.С., Бурменская О.В., Муллабаева С.М., Донников А.Е., Прилепская В.Н., Трофимов Д.Ю. Локальная экспрессия мРНК генов цитокинов у женщин с хроническим вульвовагинальным кандидозом. // Урогенитальные инфекции и репродуктивное здоровье. Сборник материалов III междисциплинарной научно-практической конференции «Урогенитальные инфекции и репродуктивное здоровье: клинико-лабораторная диагностика и терапия». - 3 июня, Санкт-Петербург, 2010. – С.15-16.

42. Краснощока О.Е., Бурменская О.В., Непша О.С., Смольникова В.Ю., Калинина Е.А., Трофимов Д.Ю. Роль спермальных мРНК генов PRM-1, PRM-2, ADAM-2 в прогнозировании исхода программ ВРТ. // Материалы XI Всероссийского научного форума «Мать и Дитя». - 28 сентября - 1 октября, Москва, 2010. – С.411-412.

43.Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Байрамова Г.Р., Непша О.С., Муллабаева С.М., Екимов А.Н., Донников А.Е. Профиль экспрессии мРНК генов цитокинов у женщин с хроническим рецидивирующим вульвовагинальным кандидозом. // Материалы XI Всероссийского научного форума «Мать и Дитя». – 28 сентября - 1 октября, Москва, 2010. - С.531-532.

44.Сабдулаева Э.Х., Роговская С.И., Бурменская О.В., Непша О.С., Трофимов Д.Ю. Молекулярные маркеры в диагностике цервикальной неоплазии шейки матки. // XI Всероссийский научный форум «Мать и дитя 2010». -28 сентября - 1 октября, Москва, 2010. – C.491.

45. Смольникова В.Ю., Трофимов Д.Ю., Краснощока О.Е., Бурменская О.В., Калинина Е.А. Молекулярно-генетический профиль образцов фолликулярной жидкости, полученной при проведении программ ВРТ при селективном переносе одного эмбриона. // Новые технологии в диагностике и лечении гинекологических заболеваний: материалы XXIV Международного Конгресса c курсом эндоскопии. - Москва, 2011. – С.168-169.

46. Шубина Е.С., Бурменская О.В., Трофимов Д.Ю., Непша О.С., Роговская С.И., Сабдулаева Э.Х., Сухих Г.Т. Маркеры предраковых состояний шейки матки. // Труды 54-й научной конференции МФТИ «Проблемы фундаментальных и прикладных естественных и технических наук в современном информационном обществе». Молекулярная и биологическая физика. - Москва: МФТИ, 2011. – С. 34-35.

47. Эбзеева М.В., Калинина Е.А., Бурменская О.В., Непша О.С., Трофимов Д.Ю. Экспрессия мРНК генов иммунной системы (цитокинов и HLA-G) в клетках фолликулярной жидкости. // Тезисы V Международного конгресса по репродуктивной медицине «Репродуктивное здоровье семьи». - Москва, 2011.- С.119-120.

48. Cабдулаева Э.Х., Роговская С.И., Назарова Н.М., Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Непша О.С., Екимов А.Н., Оламова О.А. Выявляемость генотипов ВПЧ при предраковой патологии шейки матки. // IV междисциплинарная научно- практической конференции «Урогенитальные инфекции и репродуктивное здоровье: клинико-лабораторная диагностика и терапия»- 17-18 марта, Москва, 2011. – С.69-70.

49. Smolnikova V.Yu., Trofimov D.Yu., Krasnoschoka O.E., Bourmenskaya O.V., Kalinina E.A. Diagnostic and predictive value of sperm mRNA profile. // Reproductive medicine and beyond: the best poster abstract and oral presentation on The 4th International IVI Congress. - 7-9 April, Valencia, Spain, 2011. – P.28, P-13.

50. Сабдулаева Э.Х., Роговская С.И., Назарова Н.М., Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Непша О.С., Екимов А.Н., Бадалова Л.А. Генотипирование ВПЧ у женщин с различными проявлениями ПВИ шейки матки. // Всероссийский конгресс «Амбулаторно-поликлиническая практика: проблемы и перспективы». - 22-25 мая, Москва, 2011. – С.318-319.

51.Smolnikova V.Yu., Trofimov D.Yu., Krasnosсhоka O.E., Bourmenskaya O.V., Kalinina E.A. Prognostic impact of sperm mRNA profile. // The 14th World Congress on Human Reproduction. - 30 November - 3 December, Melbourne, Australia, 2011. – P.71.

52.Smolnikova V.Yu., Trofimov D.Yu., Bourmenskaya O.V., Krasnoschoka O.E., Kalinina E.A., Sukhikh G.T. Prognostic impact of the follicular fluid mRNA profiling. The Ovary, Gametes, Embryo and Endometrium: poster abstract. // The 1st Biomarker Meeting in Reproductive medicine: emergence of a new field. - 30-31 March, Valencia, Spain, 2012.– P.5.

53. Мельникова Н.В., Боженко В.К., Ашрафян Л.А., Антонова И.Б., Алешикова О.И., Бурменская О.В., Трофимов Д.Ю., Кудинова Е.А, Хунова Л.З., Двинских Н.Ю. Оценка экспрессии мРНК гена р16 при цервикальных интраэпителиальных неоплазиях и раке шейки матки. // Вестник РНЦРР. -2012. - №12.

54. Смольникова В.Ю., Краснощока О.Е., Трофимов Д.Ю., Бурменская О.В., Калинина Е.А., Сухих Г.Т. Спермальные мРНК как прогностические маркеры исхода программ ВРТ. // Материалы VI международного конгресса по репродуктивной медицине. Проблемы репродукции. - Москва, 2012. – С.48.