Научная тема: «ЦИТОСКЕЛЕТ КАК СИСТЕМА ПУТЕЙ ВНУТРИКЛЕТОЧНОГО ТРАНСПОРТА В КЛЕТКАХ ЖИВОТНЫХ»
Специальность: 03.03.04
Год: 2014
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. Позиционирование центросомы осуществляется благодаря совместной работе цитоплазматического динеина, актомиозиновой системы и сил, продуцируемых динамичными плюс-концами микротрубочек. Динамика плюс-концов микротрубочек оказывает дестабилизирующий эффект на положение центросомы. Центрирование осуществляется за счёт тянущего усилия динеиновых моторов, приложенного пропорционально длине микротрубочек, и центростремительного тока актина; активность динеина при этом регулируется малой ГТФазой Cdc42. Таким образом, в интерфазных клетках животных существует сложный саморегулирующийся процесс поддержания центра симметрии тубулиновой транспортной системы.
  2. Цитоплазматический динеин и протеинкиназа LOSK участвуют в заякоривании минус-концов микротрубочек на центросоме и организуют их в радиальную звезду, не влияя при этом на процесс нуклеации. Нарушение работы любого из этих белков приводит к хаотизации всей системы микротрубочек. Активность динеина обеспечивает структурную целостность центросомы, а активность протеинкиназы LOSK необходима для поддержания уровня центросомного динактина. Ингибирование LOSK приводит к нарушениям клеточной адгезии, динамики фокальных контактов, поляризации и локомоции клетки. Таким образом, динеин и киназа LOSK входят в число белков, необходимых для функционирования центросомы как центра организации тубулиновой транспортной сети.
  3. Миозин-зависимый транспорт органелл по цитоплазме происходит лишь при условии непрерывного тредмиллинга микрофиламентов. Тредмиллинг исключает возможность перемещения грузов по микрофиламентам в сторону их минус-концов. Таким образом, однонаправленность транспорта по актину определяется свойствами элементов цитоскелета, образующих транспортную сеть, а не наличием или отсутствием в цитоплазме соответствующих моторных белков.
Список опубликованных работ
Статьи в журналах

1.Бураков А.В. Перемещение по субстрату цитопластов клеток CV-1, имеющих центросому и лишённых её // Цитология. – 2003. – т.45(2). – с.132-142

2.Burakov A., Nadezhdina E., Slepchenko B., Rodionov V. Centrosome positioning in interphase cells // Journal of Cell Biology. – 2003. – Vol.162.№ 6. – p.963-969.

3.Бураков А.В., Коваленко О.В., Потехина Е.С., Надеждина Е.С., Зиновкина Л.А. Для организации микротрубочек на центросоме интерфазных клеток in vivo необходима активность протеинкиназы LOSK (SLK) // Доклады Академии Наук. – 2005. – т.403. № 6. – c.840-842

4. Бураков А.В., Надеждина Е.С. Динеин и динактин как организаторы системы клеточных микротрубочек // Онтогенез. – 2006. –т.37.№ 5. – с.1-17

5.Brodsky I.B., Burakov A.V., Nadezhdina E.S. Microtubules’ interaction with cell cortex is required for their radial organization, but not for centrosome positioning // Cell Motility and the Cytoskeleton. – 2007. –Vol.64.№ 6. – p.407-417

6.Жаппарова О.Н., Бураков А.В., Надеждина Е.С. Динеин-динактиновый комплекс необходим для удержания, но не для нуклеации микротрубочек на центросоме // Биохимия. – 2007. – т.72.№ 11. – с.1515-1524

7.Burakov A, Kovalenko O, Semenova I, Zhapparova O, Nadezhdina E, Rodionov V. Cytoplasmic dynein is involved in the retention of microtubules at the centrosome in interphase cells // Traffic. – 2008. – Vol.9.№ 4. – p.472-80.

8.Burakov AV, Zhapparova ON, Kovalenko OV, Zinovkina LA, Potekhina ES, Shanina NA, Weiss DG, Kuznetsov SA, Nadezhdina ES. Ste20-related Protein Kinase LOSK (SLK) Controls Microtubule Radial Array in Interphase // Molecular Biology of the Cell. – 2008. – Vol.19(5). – p.1952-1961

9.Semenova I*, Burakov A*, Berardone N, Zaliapin I, Slepchenko B, Svitkina T, Kashina A, Rodionov V. Actin dynamics is essential for Myosin-based transport of membrane organelles // Current Biology. – 2008. – Vol.18(20). – p.1581-1586. *(Contributed equally)

10. Усова Е.В., Бураков А.В., Шпильман А.А., Надеждина Е.С.Нарушение радиальной системы интерфазных микротрубочек при избытке сыворотки в среде культивирования клеток // Биофизика. – 2008. – т.53,№ 6. – c.972-977

11. Zhapparova ON, Bryantseva SA, Dergunova LV, Raevskaya NM, Burakov AV, Bantysh OB, Shanina NA, Nadezhdina ES. Dynactin Subunit p150Glued Isoforms Notable for Differential Interaction with Microtubules // Traffic. – 2009. – Vol.10(11). – p.1635-46.

12. Zhu J, Burakov A, Rodionov V, Mogilner A. Finding the Cell Center by a Balance of Dynein and Myosin Pulling and Microtubule Pushing: a Computational Study // Molecular Biology of the Cell. – 2010. – Vol.21(24). – p.4418-27.

13. Бураков А.В., Надеждина Е.С. Протеинкиназа LOSK в регуляции сети микротрубочек и в клеточной локомоции // Биофизика. – 2010. – т.55, № 6. – c.996- 1001

14. Burakov A, Nadezhdina E. Association of nucleus and centrosome: magnet or velcro? // Cell Biology International. – 2013. – Vol.37(2). – p.95–104

Статьи в сборниках

15. Надеждина Е.С., Фокин А.И., Бураков А.В. Аппарат Гольджи и его роль в организации микротрубочек в клетках // Сборник Роль цитоскелета в жизнедеятельности культивируемых клеток, ред. Пинаев Г.П., Богданова М.С., Кольцова А.М., издание политех. университета, Санкт-Петербург, – 2013. – 116–128

Тезисы докладов на конференциях

16.Бураков А.В., Надеждина Е.С. Влияет ли центросома на перемещение фибробластоподобных клеток по субстрату? // Цитология. 2001. т.43. №4. с.324-325

17.Potekhina E.S., Zinovkina L.A., Chernyak B.V., Burakov A.V., Gusev N.B., Kuznetsov S.A., Nadezhdina E.S. Ste20-related Protein Kinases LOSK Phosphorylates Both Actin-Binding Protein Calponin and Apoptosis-Related Protein Bcl-2 // Molecular Biology of the Cell. 2001. Suppl. Vol. 12. p. 415a

18.Burakov A.V., Nadezhdina E.S., Rodionov V.I. The Nature of the Centering Force // Molecular Biology of the Cell. 2002. Suppl. Vol. 13. p. 199a

19.Zinovkina L., Burakov A., Kovalenko O., Potekhina E., Nadezhdina E. Catalytically Dead LOSK(SLK) Kinase Domain Inhibits Microtubule Organization Activity of Centrosome // Cell Motility and the Cytoskeleton. 2003. Vol. 54. №2. p. 182

20.Kovalenko O.V., Zinovkina L.A., Burakov A.V., Nadezhdina E.S. Long Ste20-related protein kinase (LOSK/SLK) is involved in development and maintenance of cellular microtubule radial array // Workshop Information of EMBO/FEBS Workshop on Frontiers in Cytoskeleton Research, 2003, p. 60

21.Burakov A., Nadezhdina E., Slepchenko B., Rodionov V. Position of the centrosome in interphase cells is determined by cytoplasmic dynein // Workshop Information of EMBO/FEBS Workshop on Frontiers in Cytoskeleton Research, 2003, p. 131

22.Бураков А.В., Надеждина Е.С., Родионов В.И. Механизмы, обеспечивающие расположение центросомы в геометрическом центре клеток // Цитология. 2003. т.45. №9. с. 852-853

23.Коваленко О.В., Бураков А.В., Зиновкина Л.А., Потехина Е.С., Надеждина Е.С. Протеинкиназа LOSK/SLK регулирует радиальное расположение микротрубочек в клетке // Цитология. 2003. т.45. №9. с. 886-887

24.Бураков А.В. Функции моторного белка динеина в центросоме // Материалы 9й Международной школы-конференции молодых учёных «Биология – наука XXI века», 2005, с. 11

25.Burakov A.V., Kovalenko O.V., Zinovkina L.A., Potekhina E.S., Zhapparova O.N., Kuznetsov S.A., Nadezhdina E.S. Ste2-related Mammalian Protein Kinase Losk is Involved in Development of Cellular Microtubule Radial Array // Materials of 45th ASCB Annual Meeting, 2005, p.671a-672a

26.Burakov A.V., Nadezhdina E.S. Centrosomal dynein – the supposed role in microtubule organization // Materials of International Symposium «Biological motility: basic research and practice», 2006, p.72-73

27.Nadezhdina E.S., Burakov A.V., Kovalenko O.V., Zhapparova O.N., Rodionov V.I. Dynein and dynactin in organization of microtubule radial array // Materials of International Symposium «Biological motility: basic research and practice», 2006, p. 98-99

28.Nadezhdina E.S., Burakov A.V., Kovalenko O.V., Zhapparova O.N., Brodsky I.B., Zinovkina L.A., Potekhina E.S., Shanina N.A., Rodionov V.I. Dynein, dynactin and protein kinase LOSK in microtubule array organization // Materials of International Conference on “Protein biosynthesis, structure and function”, 2007, p.51

29.Burakov A.V., Kovalenko O.V., Zhapparova O.N., Nadezhdina E.S., Rodionov V.I. Dynein and Dynactin in Microtubule Array Organization // Materials of ASCB/ECF summer meeting «Dynamic Interplay Between Cytoskeletal and Membrane Systems», 2007, p.30-31

30.Бураков А.В., Жаппарова О.Н., Коваленко О.В., Родионов В.И., Надеждина Е.С. Динеин, динактин и протеинкиназа LOSK как организаторы радиальной системы клеточных микротрубочек // Цитология. 2007. т.49. №9. с.722-723

31.Burakov A.V., Semenova I.V., Rodionov V.I., Nadezhdina E.S. Actin dynamics is required for intracellular myosin-dependent transport // Materials of international symposium «Biological motility: achievements and perspectives», 2008, Vol.2, p. 209-210

32.Nadezhdina E.S., Zhapparova O.N., Kovalenko O.V., Burakov A.V., Shanina N.A., Bryantseva S.A. Phosphorylation of one of new dynactin p150glued subunit isoforms with protein kinase LOSK is required for radial organization of microtubules in interphase // Materials of international symposium «Biological motility: achievements and perspectives», 2008, Vol.2, p. 246-247

33.Shpilman A.A., Burakov A.V., Nadezhdina E.S. In silico VS in vitro: Mimitation v.1.0. program allows to predict morphological and dynamic changes of tubulin cytoskeleton caused by microtubule stabilization // Materials of international symposium «Biological motility: achievements and perspectives», 2008, Vol.2, p. 274-275

34.Usova E.V., Burakov A.V., Nadezhdina E.S. Excess of growth factors in culture medium induces changes in microtubule organization in Vero cells and subsequent mitotic malfunctions // Materials of international symposium «Biological motility: achievements and perspectives», 2008, Vol.2, p. 284-285

35.A.V. Burakov, O.N. Zhapparova, E. Nadezhdina. LOSK/SLK Kinase Is Essential for Intercellular Coordination and Directed Cell Locomotion in Experimental Wound. Materials of ASCB 49th Annual Meeting, 2009, p.127

36.С.А. Брянцева, А.В. Бураков, О.Н. Жаппарова, Е.С. Надеждина. Новые изоформы белка p150Glued, основной субъединицы динактина. Цитология 2010, том 52 №3, с.257-258

37.А.В. Бураков, Е.С. Надеждина. Протеинкиназа LOSK(SLK) регулирует межклеточные взаимодействия и направленное перемещение клеток по субстрату. Цитология, 2010, том 52 №3, с.258

38.A.V. Burakov, O.N. Zhapparova, E.S. Nadezhdina. LOSK kinase is essential for directed cell locomotion and intercellular interactions. Materials of International Symposium “Biological motility from fundamental achievements to nanotechnologies”, Pushchino, Russia, 2010 May 11-16., page 62-63

39.E. S. Nadezhdina, I. B. Brodsky, A. V. Burakov. (2010) Transport Organelles of Early Secretory Pathway Contribute to Microtubule Radial Array Organization. Mol. Biol. Cell, v. 21, 2040

40.O. N. Zhapparova, S. Bryantseva, A. V. Burakov, N. A. Shanina, E. S. Nadezhdina. (2010) The Role of Dynactin Phosphorylation in the Organization of Microtubules. Mol. Biol. Cell, v. 21, 2041

41.Бродский И.Б., Бураков А.В., Жаппарова О.Н., Фокин А.И., Надеждина Е.С. Центросома и аппарат Гольджи в организации клеточных микротрубочек // Сборник тезисов ежегодной научной конференции Института белка РАН. 2011. с.10

42.Бродский И.Б., Бураков А.В., Надеждина Е.С. Образование радиальной системы микротрубочек в бесцентросомных цитопластах зависит от линии клеток и определяется органеллами раннего везикулярного транспорта // Цитология. 2011. т.53., №9. с.693-694

43.Бураков А.В., Фокин А.И., Надеждина Е.С. Роль аппарата Гольджи в организации системы микротрубочек в различных клетках // Цитология. 2011. т.53., №9. с.694

44.A.I Fokin, I.B. Brodsky, E.S. Nadezhdina, A.V. Burakov. Differential contributions of Golgi to microtubule organization in affined cells // Materials of International Symposium “Biological motility. Fundamental and Applied Science”, Pushchino, Russia, 2012 May 11-15., page 54

45.Надеждина Е.С., Бураков А.В., Фокин А.И. Вариабельность микротрубочки-организующей активности аппарата Гольджи. Сборник тезисов ежегодной научной конференции Института белка РАН, стр. 13, Пущино, 8-9 июня 2013

46.A.I. Fokin, A.V. Burakov, E.S. Nadezhdina. Variations in Golgi capability to organize microtubules. FEBS Journal, vol. 280, suppl.1, 2013, page 202.

47.А.И.Фокин, А.В.Бураков, Е.С.Надеждина. Роль аппарата Гольджи в организации микротрубочек. I. Регуляция организации микротрубочек протеинкиназами. Цитология. 2013 т.55 с.659.

48.A. Fokin, I. Brodsky, E. Nadezhdina and A. Burakov. The search of molecular mechanisms of natural variability of Golgi-mediated microtubule organization. Molecular Biology of the Cell, 2013, vol. 24, 1184