Научная тема: «ВОПРОСЫ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ И АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ВАРИАБЕЛЬНОСТИ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА»
Специальность: 03.02.02
Год: 2013
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  • показана эффективность использования разработанной панели дезоксиолигонуклеотидных зондов для изучения генетической вариабельности и генотипирования штаммов ВКЭ;
  • доказано, что наряду с генотипами 1-3 ВКЭ, существуют, по меньшей мере, еще два - генотип 4 (штамм 178-79) и генотип 5 («группа 886»);
  • генотип 3 вируса КЭ доминирует на территории Российской Федерации; генотип 1 циркулирует преимущественно на Дальнем Востоке, однако встречается в небольшой пропорции по всему ареалу; генотип 2 является минорным на территории РФ и не выявлен на Дальнем Востоке; генотип 4 обнаружен на юге Восточной Сибири, а генотип 5 - в Восточной Сибири и Монголии;
  • определенное сочетание аминокислот в 22 позициях, расположенных по всему вирусному полипротеину, является генотипспецифическим признаком ВКЭ;
  • результаты исследования (сравнительный анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей, а также исходы гибридизационных тестов) показывают, что генетические структуры штаммов 178-79 и 886-84 -прототипов генотипов 4 и 5 включают чередующиеся последовательности, характерные для генотипов 1, 2 и 3. Такую особенность структуры генома, с большой долей вероятности, можно интерпретировать как итог рекомбинационных событий между представителями трех основных генотипов и, следовательно, рассматривать как косвенное указание на существование рекомбинации у флавивирусов млекопитающих, переносимых клещами.
Список опубликованных работ
1.Злобин В.И., Демина Т.В., Мамаев Л.В., Бутина Т.В., Беликов С.И., Горин О.З., Джиоев Ю.П., Верхозина М.М., Козлова И.В., Воронко И.В., Адельшин Р.В., Грачев М.А. Анализ генетической вариабельности штаммов вируса клещевого энцефалита по первичной структуре фрагмента гена белка оболочки Е // Вопр. вирусол. - 2001. - № 1. - С. 12-16.

2.Злобин В.И., Демина Т.В., Беликов С.И. Бутина Т.В., Горин О.З., Адельшин Р.В., Грачев М.А. Генетическое типирование штаммов вируса клещевого энцефалита на основе анализа гомологии фрагмента гена белка оболочки // Вопр. вирусол. - 2001. - № 1. - С. 17-21.

3.Злобин В.И., Газо М.Х., Беликов С.И., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Верхозина М.М., Козлова И.В., Адельшин Р.В., Дорощенко Е.К. Молекулярные зонды для генетического типирования вируса клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. - 2001. - № 4. - С. 43-47.

4.Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Козлова И.В., Верхозина М.М., Данчинова Г.А., Адельшин Р.В., Дорощенко Е.К., Кулакова Н.В. Новая концепция природной генетической вариабельности вируса клещевого энцефалита // Тихоокеанск. мед. журн. – 2001. - № 2. - С. 75-78.

5.Злобин В.И., Погодина В.В., Дрокин Д.А., Газо М.Х., Бочкова Н.Г., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Беликов С.И., Козлова И.В., Верхозина М.М. Специфическое определение флавивирусов методом молекулярной гибридизации с синтетическими дезоксиолиго-нуклеотидными зондами // Вопр. вирусол. – 2003. - Т. 48, № 3. – С. 23-27.

6.Адельшин Р.В., Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Газо М.Х., Козлова И.В., Верхозина М.М., Вотяков В.И., Титов Л.П., Самойлова Т.И., Данчинова Г.А., Хаснатинов М.А., Воронко И.В., Голубович С., Тешанович М., Приймяги Л.С., Василенко В.А. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита в Европейской России и некоторых странах Балтии, Восточной и Юго-Восточной Европы // Эпидемиол. и вакцинопрофилактика. – 2006. - № 2 (27). – С. 27-34.

7.Карань Л.С., Маленко Г.В., Бочкова Н.Г., Левина Л.С., Пиванова Г.П., Колясникова Н.М., Гамова Е.Г., Трухина А.Г., Злобин В.И., Верхозина М.М., Козлова И.В., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Погодина В.В. Применение молекулярно-генетических методик для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюлл. СО РАМН. - 2007. - № 4 (126). – С. 34-40.

8.Верхозина М.М., Злобин В.И., Козлова И.В., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Беликов С.И., Борисов В.А., Данчинова ГА., Арбатская Е.В., Лисак О.В., Дорощенко Е.К., Протасова Е.Г. Эколого-генетический анализ региональной популяции вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири // Бюлл. СО РАМН. - 2007. - № 4 (126). – С. 53-60.

9.Злобин В.И., Верхозина М.М., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Адельшин Р.В., Козлова И.В., Беликов С.И., Хаснатинов М.А., Данчинова Г.А., Исаева Е.И., Гришечкин А.Е. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. – 2007. – № 6. – С. 4–13.

10. Верхозина М.М., Злобин В.И., Козлова И.В., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Лисак О.В., Дорощенко Е.К., Протасова Е.Г. Эколого-эпидемиологический и молекулярно-генетический анализ популяции вируса клещевого энцефалита на территории Иркутской области // Эпидемиол. и вакцинопрофилактика. – 2008. - №1 (38). – 12-18.

11. Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Верхозина М.М., Козлова И.В., Ткачев С.Е., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Злобин В.И. Генетическая вариабельность и генотипирование вируса клещевого энцефалита с помощью дезоксинуклеотидных зондов // Вопр. вирусол. – 2009. - № 3. – С. 33-42.

12. Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Верхозина М.М., Козлова И.В., Ткачев С.Е., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Злобин В.И. Молекулярная эпидемиология вируса клещевого энцефалита: географическая вариабельность, определяемая методами молекулярной гибридизации // Эпидемиол. и вакцинопрофилактика. – 2009. - № 3 (46). – С. 27-39.

13. Demina T.V., Dzhioev Yu.P., Verkhozina M.M., Kozlova I.V., Tkachev S.E., Plyusnin A., Doroshchenko E.K., Lisak O.V., Zlobin V.I. Genotyping and characterization of the geographical distribution of tick-borne encephalitis virus variants with a set of molecular probes // J. Med. Virol. – 2010. – Vol. 82(6). – P. 965-976.

14. Козлова И.В., Верхозина М.М., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Карань Л.С., Колясникова Н.М., Рар В.А., Фоменко Н.В., Ткачев С.Е., Богомазова О.Л., Борисов В.А., Туваков М.К., Злобин В.И. Сочетанные очаги трансмиссивных клещевых инфекций на территории Прибайкалья // Эпидемиол. и вакцинопрофилактика. – 2010. - № 4 (53). – С. 40-46.

15. Парамонов А.И. Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Букин Ю.С., Козлова И.В., Приставка А.А., Саловарова В.П. Выявление потенциальных событий рекомбинации в нуклеотидных последовательностях вируса клещевого энцефалита // Известия Иркутского государственного университета. Серия биология. Экология. – 2010. – Т. 3, № 4. – С. 40-43.

16. Джиоев Ю.П., Парамонов А.И., Демина Т.В., Козлова И.В., Верхозина М.М., Ткачев С.Е., Приставка А.А., Саловарова В.П., Злобин В.И. Обнаружение рекомбинаций у вируса клещевого энцефалита с помощью компьютерного анализа вирусных геномов // Вопр. вирусол. – 2011. - № 2. – С. 14-18.

17. Козлова И.В., Верхозина М.М., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Ткачев С.Е., Карань Л.С., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Сунцова О.В., Парамонов А.И., Черноиванова О.О., Ревизор А.О., Злобин В.И. Комплексная характеристика оригинальной группы штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на территории Восточной Сибири // Сиб. Мед. журнал. – 2012. - № 4. – С.80-85.