Научная тема: «НОВЫЕ БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ПАТОГЕНЫ В ПИЩЕВЫХ ПРОДУКТАХ: ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЕ ОБОСНОВАНИЕ И РАЗРАБОТКА СИСТЕМЫ КОНТРОЛЯ С ПРИМЕНЕНИЕМ МЕТОДОВ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОГО И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА»
Специальность: 14.02.01
Год: 2010
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:

1.                  Изменение свойств микроорганизмов в условиях развитого индустриального производства  и антропогенной трансформации внешней среды сопровождается нарастанием патогенного потенциала некоторых видов бактерий, появлением новых или эволюционно измененных возбудителей заболеваний с пищевым путем передачи (эмерджентных пищевых патогенов).

2.                  В свете современных концепций  микроорганизмы  Listeria monocytogenes, Salmonella, энтерогеморрагические E.coli, Campylobacter jejuni, Enterobacter sakazakii, S.aureus характеризуются экологическим своеобразием, детерминированностью источников выделения и по частоте обнаружения являются доминирующими среди обширной группы возбудителей пищевых зоонозов.

3.                 Феномен появления новых и вновь возникающих патогенов сопровождается усилением роли оппортунистических инфекций и их возбудителей: обнаружение среди энтеробактерий нового вида Enterobacter sakazakii характеризует тенденцию изменения экологической ниши и расширения спектра эмерджентных патогенных бактерий  среди хорошо изученных популяций семейства Enterobacteriaceae; уточнение таксономических характеристик потенциальных патогенов с неясным систематическим положением повышает надежность системы микробиологического контроля.

4.                 Изучение основных закономерностей  эпидемиологии, экологии и биологических свойств Listeria monocytogenes, а также  экспериментальное исследование поведения этих микроорганизмов в модельных системах, имитирующих условия производства пищевых продуктов, позволит расширить базу данных для разработки новых критериев безопасности и анализа степени микробиологического риска возникновения пищевого листериоза.

5.                 Появление среди известных токсических метаболитов бактерий и грибов «суперантигенов» и других модуляторов системных иммунных реакций повышает степень риска, связанную с накоплением в пищевых продуктах токсинов потенциально патогенных и токсигенных микроорганизмов (S.aureus, B.cereus, микромицеты и др.), что диктует необходимость изучения условий  токсинообразования и создания методов их выявления и идентификации.

6.                 Изучение биологии эмерджентных патогенов и системных механизмов регуляции экспрессии генов факторов патогенности этих бактерий позволяет разработать новые методические подходы с использованием высокоспецифичных комбинированных схем бактериологического и молекулярно-генетического анализа  путем подбора наиболее информативных биохимических тестов и генотипирования.

Список опубликованных работ
Монографии

1.Ефимочкина Н.Р. Эмерджентные бактериальные патогены в пищевой микробиологии (Монография) /М., Издательство РАМН, 2008, 256 с.

2.Карликанова Н.Р., Куваева И.Б., Карликанова С.Н. Листерии в молоке и молочных продуктах / Москва – Углич, 1999, 121 с.

Статьи в журналах, рекомендованных ВАК РФ:

3.Ефимочкина Н.Р. Роль физико-химических и биологических воздействий в формирова-нии толерантности бактерий, контаминирующих пищевые продукты./ ЖМЭИ, 2009, № 4, с.120-125.

4.Ефимочкина Н.Р. Идентификация нового вида патогенных микроорганизмов Enterobacter sakazakii с использованием современных таксономических подходов./ ж. Вопросы питания, 2009, № 3, с.25-32

5.Ефимочкина Н.Р., Чоха О.А., Пименова В.В., Шевелева С.А. Изучение токсигенных свойств мицелиальных грибов - продуцентов цитринина, выделенных из пищевых про-дуктов./ Вопросы питания, 2008, т.77, № 4, с. 70-76.

6.Ефимочкина Н.Р. Молекулярно-генетические методы в идентификации пищевых пато-генных бактерий./ ж. Вопросы питания, 2007, № 2, с. 4-15.

7.Ефимочкина Н.Р. Некоторые закономерности появления эмерджентных пищевых пато-генов./ ж. Вопросы питания, 2006, № 4, с.9-15.

8.Ефимочкина Н.Р., Быкова И.Б., Барбер Н.В., Нитяга И.М., Шевелева С.А. Обнару-жение Enterobacter sakazakii в детских сухих молочных продуктах./ ж. Вопросы детской диетологии, 2005, т.3, № 4, с.46-49.

9.Ефимочкина Н.Р., Шевелева С.А., Нитяга И.М., Тартаковский И.С.и др. Современные подходы к идентификации листерий при производственном контроле ферментирован-ных мясных продуктов /Вопросы питания, 2005, № 2, с.39-45

10.Ефимочкина Н.Р., Карликанова С.Н. Выделение L. monocytogenes из молока и молоч-ных продуктов./ж. Молочная промышленность, №5, 2004, с.36-38

11.Ефимочкина Н.Р., С.А. Шевелева, И.Б. Куваева и др. Индикация и серологический скрининг условно-патогенных энтеробактерий, выделенных из продуктов питания и объектов внешней среды./ж. Вопросы питания, 2002, № 6, с.29-34.

12.Ефимочкина Н.Р. Методы определения эмерджентных патогенных бактерий Listeria monocytogenes в молоке и молочных продуктах / ж.Молочная промышленность, 2007, № 3, с.38-42.

13.Ефимочкина Н.Р., Миргородский Б.Г., Карликанова С.Н. и др. Совершенствование методических подходов к конструированию и оценке качества сухих питательных сред. /ж. Молочная промышленность, №3, 2006, c.36-41

14.Ефимочкина Н.Р., С.Н.Карликанова, В.Ф. Семенихина, И.В.Рожкова. Расширение ас-сортимента сухих питательных сред для санитарно-гигиенической оценки молочных продуктов./ж. Молочная промышленность, №7, 2005, с.44-45

15.С.А.Шевелева, Н.Р.Ефимочкина, А.А. Иванов и др. Пищевые отравления и инфекции в Российской Федерации за период 1992-2001 гг.: состояние проблемы и тенден-ции./Гигиена и санитария, 2003. № 3, с.38-45

16.Карликанова Н.Р., Семенихина В.Ф., Рожкова И.В. и др. Сухие питательные среды для микробиологического контроля. / Молочная промышленность, 1999, № 3, с.14-15

17.Карликанова Н.Р., Куваева И.Б., Захарова Н.П. Исследование возможности накопле-ния энтеротоксинов S.aureus при выработке и хранении плавленых сыров./Вопросы питания, 1995, № 1, с.15-17

18.Карликанова Н.Р., Куваева И.Б., Лукина И.Б. Обнаружение энтеротоксигенных стафи-лококков в молоке и сыре ./ Вопросы питания, 1994, № 4, с.29-31

19.Карликанова Н.Р., Шевелева С.А. Выявление бактерий рода Erwinia при санитарно-микробиологическом контроле детских сухих молочных продуктов. / Вопросы питания, 1991, № 3, с.42-45

20.Батищева С.Ю., Кузнецова Г.Г., Быкова И.Б., Ефимочкина Н.Р., Шевелева С.А. Влия-ние плесневых грибов, потребляемых с пищей, на кишечную микрофлору у крыс/ ж. Во-просы питания, 2009, № 2. с.42-46

21.С.А.Шевелева, И.В. Гмошинский, Ефимочкина Н.Р., и др.. Влияние потребляемых с пищей спор плесеней на протекание системной анафилаксии у крыс./ ж. Вопросы пита-ния, 2004, № 6, с.14-17

22.Шевелева С.А., Ефимочкина Н.Р., Нестеренко Л.Н., Тутельян В.А., Гинцбург А.Л. и др. Требования к медико-биологической оценке и гигиеническому контролю за оборотом пищевой продукции, полученной из генно-инженерно-модифицированных микроорга-низмов./ Вопросы питания, 2008, т.77, № 3, с.49-57

Работы, опубликованные в других изданиях:

23.Тутельян В.А., С.А. Шевелева, Н.Р.Ефимочкина. 7-й доклад Программы ВОЗ по контролю за пищевыми инфекциями и интоксикациями в Европе за 1993-1998 гг. Раздел: Российская Федерация. WHO Surveillance Programme for Control of Foodborne Infections and Intoxications in Europe./ FAO/WHO, Берлин, 2001 г., с.292-297

24.Тутельян В.А., С.А. Шевелева, Н.Р.Ефимочкина. 8-й доклад Программы ВОЗ по кон-тролю за пищевыми инфекциями и интоксикациями в Европе за 1999-2000 гг. Раздел: Российская Федерация. /FAO/WHO, Берлин, 2003 г.

25.Шевелева С.А., Лисицын А.Б., Любченко В.И., Коршунова Т.Н., Карликанова Н.Р., Сохранность вареных колбас в оболочке «Амитан»./ Мясная Индустрия, 1997, № 6.

26.Шевелева С.А., Карликанова Н.Р. О регламентировании показателя Listeria monocytogenes в пищевых продуктах и сырье в России./ Информационный бюллетень. «Здоровье населения и среда обитания», МЗ РФ, ФЦСЭН, 1999, №11, с.22-24.

27.Карликанова Н.Р., Шевелева С.А., Куваева И.Б. и др. К вопросу о микробиологическом контроле препаратов и продуктов с пробиотическими свойствами. / Всероссийская. Конференция с межд. участием «Пробиотики и пробиотич. продукты в профилактике и лечении наиболее распрост. заболеваний человека», М., 1999, с.27-29.

28.Шевелева С.А., Ефимочкина Н.Р., Народицкий Б.С., Нестеренко Л.Н. Нормативные требования к пищевым продуктам, полученным с использованием генно - инженерно-модифицированных микроорганизмов. Материалы 5 Московского межд. Конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития», 16-20 марта 2009 г., с.133-134.

29.Ефимочкина Н.Р., Черкашин А.В., Шевелева С.А. Поиск новых штаммов молочнокислых бактерий – продуцентов антибактериальных веществ./ Материалы 5 Московского межд. Конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития», с.65-66.

30.Батищева С.Ю., Ефимочкина Н.Р., Шевелева С.А. Оценка пробиотической микрофлоры в обогащенных пищевых продуктах и БАД к пище./ Материалы 5 Московского межд. Конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития», с.49-50.

31.Ефимочкина Н.Р. Совершенствование методов микробиологического контроля безо-пасности биотехнологических продуктов. /Материалы 5 Московского межд. Конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития», 16-20 марта 2009 г., с.27-28.

32.Шевелева С.А., Ефимочкина Н.Р., Чоха О.А. Экспериментальное изучение токсигенного потенциала продуцентов цитринина в зерне злаковых. /Материалы III Cъезда токсикологов России, г. Москва, 1 – 5 декабря 2008 г.

33.Черкашин А.В., Ефимочкина Н.Р., Шевелева С.А. Изучение антагонистической активности лактобактерий из естественных заквасок в отношении патогенных бактерий – возбудителей пищевых токсикоинфекций. /Материалы Х Всероссийского конгресса диетологов и нутрициологов «Питание и здоровье», 1 – 3 декабря 2008 г., с.119-120.

34.Ефимочкина Н.Р., Шевелева С.А., Тартаковский И.С., Карпова Т.И. Выделение и идентификация листерий при микробиологическом контроле пищевых продуктов. /Материалы 6-й Всероссийской научно - практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика – 2007», 28-30 ноября 2007 г.

35.Шевелева С.А., Ефимочкина Н.Р. Анализ микробиологического риска как основа для совершенствования системы оценки безопасности и контроля пищевых продуктов. /Мат. X Всероссийского съезда гигиенистов и санитарных врачей, М., 2007.

36.Ефимочкина Н.Р., С.А.Шевелева, А.М.Григорьев. Применение метода ДНК-РНК гиб-ридизации для обнаружения патогенов в пищевых продуктах./ II Международная конференция «Молекулярная медицина и биобезопасность», Москва, 2005, c.127.

37.Шевелева С.А., Шурышева Ж.Н., Н.Р.Ефимочкина. Проблемы и задачи изучения пи-щевого кампилобактериоза в Российской Федерации. /VIII Всероссийский конгресс «Оптимальное питание - здоровье нации», М., 26-28 окт. 2005 г., с.297.

38.Ефимочкина Н.Р., Тартаковский И.С., Ермолаева С.А. и др. Современные методы идентификации и типирования патогенных листерий и их применение для обеспечения безопасности продуктов питания. /VIII Всероссийский конгресс «Оптимальное питание - здоровье нации», М., 26-28 окт. 2005 г., с.250

39.Быкова И.Б., Н.Р.Ефимочкина. Сравнение эффективности молекулярно - биологических и культуральных методов при контроле качества пищевых продуктов. /III Моск. Межд. Конгресс «Биотехнология: состояние и персп. развития», М., 2005, ч.2, с.92-93.

40.Ефимочкина Н.Р., С.А. Шевелева, А.М. Григорьев, И.Б. Быкова. Оценка взаимодействия патогенных микроорганизмов рода Salmonella с технологической микрофлорой ферментированных продуктов./III Московский Международный Конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», Москва, 14-18 марта 2005, ч.2., с. 101-102.

41.Ефимочкина Н.Р., Шевелева С.А. Изучение выживаемости некоторых возбудителей заболеваний с пищевым путем передачи в ферментированных пищевых продуктах. /VIII Всеросс. конгресс «Оптимальное питание - здоровье нации», М., 2005 г., с. 93.

42.Барбер Н.В., Шевелева С.А., Н.Р.Ефимочкина и др. Задачи контроля остаточных количеств антибиотиков в пищевых продуктах. /Материалы III межрегион. научно-практ. конф. «Питание здорового и больного человека», С-Петербург, 2005, с.12-13

43.Шевелева С.А., Кузнецова Г.Г., Батищева С.Ю, Н.Р.Ефимочкина. Функциональная эффективность различных кисломолочных и пробиотических продуктов. /Материалы Межд. Конференции «Пробиотики, пребиотики, синбиотики и функциональные продукты питания. Современное состояние и перспективы», М., 2004, с.11.

44.Шевелева С.А., Н.Р.Ефимочкина. Использование комплекса генотипических и феноти-пических признаков – необходимый подход к идентификации малоизученных патогенов в пищевых продуктах. /Материалы I Международной Конференции «Молекулярная медицина и биобезопасность», М., октябрь 2004 г.

45.С.А.Шевелева, Ж.Н. Шурышева, Ефимочкина Н.Р. Проблемы и задачи изучения пищевого кампилобактериоза в Российской Федерации./Мат. Международной научно-практической Конференции «Политика здорового питания в республике Казахстан», Алматы, октябрь 2004 г.

46.С.А.Шевелева, Н.Р.Ефимочкина. Стратегия анализа риска в пищевой микробиологии и задачи её внедрения./Материалы Пленума Межведомственного научного совета по эко-логии человека и гигиене окружающей среды РФ «Угрозы здоровью человека: современные гигиенические проблемы и пути их решения», Москва, 2002 г., с.286-289.

47.Ефимочкина Н.Р., С.А.Шевелева, И.М.Нитяга. Изучение выживаемости энтеротокси-генных эшерихий в процессе хранения ферментированных мясопродуктов./ Мат. 2 Межд. Конгресса «Биотехнология: состояние и персп. развития» М., 2003, с.154-155.

48.Ефимочкина Н.Р., С.А.Шевелева, Н.В.Барбер. Оптимизация иммуноферментного метода анализа для определения сульфаниламидов в пищевых продуктах животного происхождения./ Материалы YII Всероссийского Конгресса с международным участием «Здоровое питание населения России», Москва, ноябрь 2003, с. 181.

49.Ефимочкина Н.Р., С.А.Шевелева, И.М.Нитяга. Выделение L.monocytogenes из пищевых продуктов с применением метода иммуномагнитной сепарации. /Мат.YII Всеросс. Конгресса с межд. участием «Здоровое питание населения России», М.,2003 г., с. 182.

50.С.А.Шевелева, И.Б.Куваева. Н.Р.Ефимочкина. Пробиотические продукты: квалификация и регламентация требований к характеристикам. /Мат. Межд. научно-практ. Конференции памяти Г.И.Гончаровой «Пробиотические микроорганизмы - современное состояние вопроса и перспективы использования», М., 2002, с.13- 14.

51.Ефимочкина Н.Р., С.А.Шевелева. Микробиологический контроль пищевых продуктов, обогащенных пробиотическими микроорганизмами./ Мат. Межд. научно-практ. Конфе-ренции памяти Г.И.Гончаровой «Пробиотические микроорганизмы - современное состояние вопроса и перспективы использования», М., 2002, с. 14.

52.Тартаковский И.С., С.А.Шевелева, С.А.Ермолаева, Ефимочкина Н.Р. Выделение, идентификация и типирование листерий – новый важный компонент контроля безопасности продуктов питания. /Материалы YIII съезда Всероссийского общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов., 2002, Москва, т.3, с.342

53.С.А.Шевелева, Ефимочкина Н.Р. Нормирование Listeria monocytogenes в пищевых про-дуктах в Российской Федерации. Сб. докл. Межд. Конф. «Нейроинфекции: бешенство, губкообразная энцефалопатия крупного рогатого скота, Крейцфельда – Якоба и др. при-онные болезни; листериоз; болезнь Ауески; болезнь Тешена», г.Покров, с.11.

54.С.А.Шевелева, Н.Р.Ефимочкина. Принципы регламентации микроорганизмов в пищевых продуктах, выработанных по новым технологиям. /Материалы Всероссийского съезда гигиенистов и санитарных врачей, 2001, Москва, т.1.

55.Шевелева С.А., Ефимочкина Н.Р. Современные подходы к оценке микробиологической безопасности продуктов для питания беременных, кормящих женщин и детей./ Материалы III Российского Форума «Мать и дитя», Москва, 22-26 окт. 2001, с. 636

56.Куваева И.Б., Шевелева С.А., Ефимочкина Н.Р. Особенности санитарно - микробиоло-гической экспертизы продуктов детского питания. / Мат. I Всеросс. Конгресса с межд. уча-стием «Питание детей: XXI век», М., 2000.

57.Ефимочкина Н.Р., С.А.Шевелева, В.Ф.Семенихина, И.В.Рожкова, С.Н.Карликанова. Применение сухих питательных сред для микробиологического контроля продуктов дет-ского питания. / Мат. I Всеросс. Конгресса с межд. участием «Питание детей: XXI век», М., 2000, с.174-175.

58.С.А.Шевелева, Ефимочкина Н.Р. Гигиеническая оценка сроков годности продуктов детского питания. / I Всеросс. Конгр. «Питание детей: XXI век», М., 2000, с.172-173.

59.Куваева И.Б., Шевелева С.А., Н.Р.Карликанова. Создание сухих питательных сред для микробиологического контроля качества пищевых продуктов./Научно-практ. конференция «Прогрессивные, экологически безопасные технологии технологии хранения и комплексной переработки сельхозпродукции», М., 1998, с.193-194.

60.Zakharova N.P., Karlikanova N.R., Kuvajeva I.B. Presence of Staphylococcus enterotoxins in processed cheeses. 24th International Dairy Congress “Dairying in a new global environment”, 1994, Melbourne, Australia, p.290.

61.Шевелева С.А., Куваева И.Б., Карликанова Н.Р. Проблемы микробиологической безо-пасности продуктов детского питания при их гигиенической сертификации. /Межд. кон-ференция. «Науч. и практ. аспекты совершенствования качества продуктов детского и геродиетического питания», М., Пищепромиздат, 1997.

62.Куваева И.Б., Шевелева С.А., Карликанова Н.Р., Быкова И.Б. Микроэкология молока и молочных продуктов в зависимости от санитарно-технического состояния. /Сессия РАМН «Химия и здоровье. Экология человека и инф. заболеваемость», С.-Пб., 1995.

63.Карликанова Н.Р., Куваева И.Б., Карликанова С.Н. Изучение возможности выживания листерий в процессе выработки и хранения плавленых сыров. /Межд. Симпозиум «Пищевые зоонозы – сальмонеллезы, кампилобактериоз, иерсиниозы, листериоз. Методы и средства диагностики, лечения и профилактики»,1995, М., с.101

64.Карликанова С.Н., Куваева И.Б., Карликанова Н.Р. Изучение заготавливаемого молочного сырья по микробиологическим критериям безопасности. /Нучно-техническая конференция «Вклад науки в развитие маслоделия и сыроделия», 1994, г.Углич, с. 20.

65.Куваева И.Б., Карликанова Н.Р., Быкова И.Б. Степень контаминации молочных продуктов бактериями рода Klebsiella / Нучно-техническая конференция «Вклад науки в развитие маслоделия и сыроделия», 1994, г.Углич, с. 183.

66.Карликанова Н.Р., Куваева И.Б. Изучение возможности контаминации молочных про-дуктов условно-патогенной микрофлорой. /Нучно-техническая конференция «Вклад науки в развитие маслоделия и сыроделия», 1994, г.Углич, с. 182.

67.Куваева И.Б., Карликанова Н.Р. Исследование свойств энтеротоксигенных стафилококков. /Нучно-техн. конф.«Вклад науки в развитие маслоделия и сыроде лия»,1994, Углич, с. 184.

68.Калунянц К.А., Смирнова Т.А., Карликанова Н.Р. Интенсификация производства на основе применения протеолитических ферментных препаратов микробного происхождения в молочной промышленности. Обзорная информация «Молочная промышленность», М., АгроНИИТЭИ ММП, 1987, 108 с.