Научная тема: «СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ОСОБЕННОСТИ ЗАПАСНЫХ И ЗАЩИТНЫХ БЕЛКОВ РАСТЕНИЙ И ИХ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ В ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ»
Специальность: 03.02.07, 03.01.04
Год: 2010
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:

1. глиадины, кодируемые генами одного кластера, локализованного на коротких плечах хромосом первой гомеологичной группы: хромосомы 1D (блок 1D1) и хромосомы 1В (блок 1В1), существенно различаются по N-концевым аминокислотным последовательностям. Это означает, что в процессе эволюции у предков пшеницы произошло объединение в один кластер генов, кодирующих ω- и γ-глиадины. N-концевые аминокислотные последовательности ω-глиадинов, кодируемых геномом D, значительно дивергировали от последовательностей ω-глиадинов генома В. В то же время аминокислотные последовательности γ-глиадинов, кодируемых хромосомами А, В и D, существенно более консервативны. Хромосомы шестой гомеологичной группы, по всей видимости, кодируют проламины, значительно отличающиеся от проламинов хромосом первой гомеологичной группы.

2. расположение дисульфидных связей – важнейших пост-трансляционных модификаций белков- в двух группах запасных белков суперсемейства проламинов, глиадинах и 2S альбуминах, сходно, но отличается от такового у других членов суперсемейства - ингибиторов α-амилаз и трипсина злаков. Эти различия, по всей вероятности, связаны с необходимостью взаимодействия между ингибиторами и активными центрами ферментов-мишеней;

3. полиморфизм субъединиц кукурбитина, основного запасного глобулина семян тыквенных культур, контролируемого четырьмя локусами, выявляемый с помощью электрофореза, может эффективно использоваться в качестве экспресс-метода определения сортовой чистоты представителей семейства Cucurbitaceae;

4. у растений табака и томатов, содержащих различные гены устойчивости к ВТМ (гены N и табака и гены Tm-1, Tm-2 и Tm-22 томата), в ответ на вирусную инфекцию синтезируются специфические PR-белки, относящиеся к защитной системе растений и отражающие особенности действия генов устойчивости, которые могут быть использованы в качестве маркеров соответствующих генов в селекционном процессе;

5. высокий молекулярный полиморфизм защитных пептидов у вида пшеницы Triticum kiharae Dorof. et Migusch, реализуемый как на генном, так и на пост-транскрипционном уровнях, обеспечивает эффективную защиту от разнообразных патогенов и стрессовых факторов среды, что обусловливает адаптацию пшеницы к неблагоприятным условиям окружающей среды и объясняет ее широкое распространение по всем континентам и климатическим зонам Земного шара. Детерминанты антифунгальной активности дефензинов семейства Poaceae локализованы в С-концевой области их молекул;

6. набор защитных полипептидов, участвующих в борьбе растений с патогенами и абиотическим стрессом («защитный арсенал» растений), видоспецифичен и уникален для каждого вида растений.

Список опубликованных работ
Статьи:

1.Чугунова Е.Ю., Одинцова Т.И., Егоров Ц.А., Созинов А.А. Электрофоретическое исследование гетерогенности солерастворимой фракции белков семян хлопчатника. Биохимия, 1985, т.50, №6, с. 1030-1038.

2.Егоров Ц.А., Одинцова Т.И., Созинов А.А. Селективное выделение омега-глиадинов. Биоорг. химия, 1986, т. 12, №5, с. 599-605.

3.Одинцова Т.И., Егоров Ц.А., Созинов А.А. Выделение омега-глиадинов с применением хроматографии на тиопропил-сефарозе. Биохимия, 1986, т. 51, №7, с. 1124-1131.

4.Дегтяренко Л.В., Одинцова Т.И., Кононков П.Ф. Исследование гетерогенности белков семян огурца методом электрофореза. Вестник с.-х. науки, 1986, №2, 132-134.

5.Батманова Л.С., Одинцова Т.И., Егоров Ц.А., Кононков П.Ф., Созинов А.А. Исследование белков семян капусты методом электрофореза для использования в семенном сортовом контроле, Докл. ВАСХНИЛ, 1987, №7, с. 16-19.

6.Одинцова Т.И., Овчинников А.А., Егоров Ц.А., Созинов А.А. N-концевые последовательности глиадинов различных глиадин-кодирующих локусов. Докл. АН СССР, 1987, т. 296, №5, с. 156-164.

7.Egorov Ts.A., Odintsova T.I. Microsequence analysis of prolamins with gas-phase protein sequencer, In: Gluten Proteins (Lastity R., Bekes F., eds.), 1987, World Scientific Publishing Co., Singapore, p.434-440.

8.Дегтяренко Л.В., Одинцова Т.И., Кононков П.Ф. Электрофорез кукурбитина как метод сортового семенного контроля тыквенных. Доклады ВАСХНИЛ, 1989, №1, с. 17-19.

9.Одинцова Т.И., Дегтяренко Л.В., Егоров Ц.А., Кононков П.Ф. Высокоэффективная жидкостная хроматография белков семян тыквенных культур. Доклады ВАСХНИЛ, 1989, №7, с. 26-28.

10.Одинцова Т.И., Егоров Ц.А. Выделение и характеристика глиадинов из семян Aegilops squarrosa. Биохимия, 1989, т. 54, №3, с. 396-407.

11.Кононков П.Ф., Одинцова Т.И., Дегтяренко Л.В., Батманова Л.С., Крашенинник Н.В., Бунин М.С., Старцев В.И., Осыко Е.В., Егоров Ц.А. Методические указания по анализу белков семян и изоферментов методом электрофореза для контроля сортовой чистоты и селекции капустных и тыквенных культур. ВНИИСиСОК, 1990, Москва, ВАСХНИЛ.

12.Одинцова Т.И., Янаудите Р.Л., Егоров Ц.А., Извекова Л.И., Андреева Э.Н., Пухальский В.А. Белки томатов при инфекции ВТМ. Докл. АН СССР, 1990, т. 313, №3, с. 733-736.

13.Одинцова Т.И., Егоров Ц.А. N-концевые аминокислотные последовательности омега-глиадинов Aegilops longissima. К вопросу о происхождении геномов полиплоидных пшениц. Биохимия, 1990, т. 55, № 3, с. 509-516.

14.Одинцова Т.И., Янаудите Р.Л., Егоров Ц.А., Извекова Л.И., Андреева Э.Н., Пухальский В.А. Обнаружение интерфероноподобных белков в листьях томатов. Докл. АН СССРб 1990, т. 314, № 5, 1250-1252.

15.Фетисов А.В., Одинцова Т.И., Извекова Л.И., Пухальский В.А. Белки листьев огурца при вирусной инфекции. Изв. Акад. Наук., сер. биол., 1991, №4, с. 619-624.

16.Одинцова Т.И., Турищева М.С., Андреева Э.Н., Пухальский В.А. Структурно-функциональные изменения в хлоропластах томатов с разными генами устойчивости к вирусу табачной мозаики. Генетика, 1996, т. 32, №11, с. 1545-1552.

17.Egorov T.A., Odintsova T.I., Musolyamov A.K., Fido R., Tatham A.S., Shewry P.R. Disulphide structure of a sunflower seed albumin: conserved and variant disulphide bonds in the cereal prolamin superfamily. FEBS Letters, 1996, v. 396, p. 285-288.

18.Одинцова Т.И., Фетисов А.В., Егоров Ц.А., Извекова Л.И,, Андреева Э.Н., Пухальсий В.А. Структурные исследования белка оболочки вируса зеленой крапчатой мозаики огурца. Докл. РАСН, 1996, №6, с.26-28.

19.Egorov T.A., Odintsova T.I., Shewry P.R., Tatham A.S. Characterisation of high Mr wheat glutenin polymers by agarose gel electrophoresis and dynamic light scattering. FEBS Letters, 1998, v. 434, p. 215-217.

20.Egorov T.A., Odintsova T.I., Musolyamov A.K. Disulphide mapping of γ-46 gliadin. J. Protein Chem., 1998, v. 17, p. 531-532.

21.Егоров Ц.А., Одинцова Т.И., Мусолямов А.Х., Барбашов С.Ф., Пустобаев В.Н., Андерсен Дж., Репсторф П., Попино И. Частичная аминокислотная последовательность глиадина гамма-46. Биохимия, 1998, т. 63, с. 1243-1250.

22.Егоров Ц.А., Одинцова Т.И., Мусолямов А.Х. Определение дисульфидных связей в глиадине гамма-46. Биохимия, 1999, т. 64, с. 294-297.

23.Oleskina Yu.P., Yurina N.P., Odintsova T.I., Egorov T.A., Otto A., Wittmann-Liebold B., Odintsova M.S. Nucleoid proteins of pea chloroplasts: detection of a protein homologous tо ribosomal protein.. Biochem. Mol. Biol. Int. 1999, v. 47, № 5, p. 757-763.

24.Egorov T.A., Odintsova T.I., Musolyamov A., Tatham A, Shewry P., Hojrop P., and Roepstorff P. Biochemical analysis of alcohol soluble polymeric glutenins, D-subunits and omega-gliadins from wheat cv. Chinese Spring. In: Wheat gluten (Shewry P.R., Tatham, A.S., eds.), 2000, The Royal Society of Chemistry, MPG Books Ltd, Botmin, Cornwall, UK, p. 166-170.

25.Odintsova T.I., Egorov T.A., Musolyamov A.K., Tatham A.S., Shewry P.R., Hojrup P., Roepstorff P. Isolation and characterization of the high-molecular-weight glutenin subunits 17 and 18 from wheat isogenic line L-88-31. In: Wheat gluten (Shewry, P.R., Tatham, A.S., eds.), The Royal Society of Chemistry, MPG Books Ltd, Botmin, Cornwall, UK, 2000, p. 171-174.

26.Одинцова Т.И., Андреева Э.Н., Пухальский В.А., Мусолямов А.Х., Егоров Ц.А. Структурный анализ белка оболочки вируса зеленой крапчатости огурца. Биохимия, 2000, т. 65, №5, с. 672-679.

27.Рожнова Н.А., Геращенков Г.А., Одинцова Т.И., Мусин С.М., Пухальский В.А. Синтез новых белков картофеля in vitro при защитном действии арахидоновой кислоты во время вирусной инфекции. Физиол. Раст., 2001, т. 48, №6, с. 897-905.

28.Родионова Н.А., Дубовая Н.В., Одинцова Т.И., Грачева Т.И., Безбородов А.М. Выделение эндо-1,4-бета-ксиланазы из Geotrichum candidum 3C с разной сорбционной способностью на нерастворимом субстрате. Прикл. биохим. микробиол. 2002, т. 38, №5, с. 490-494.

29.Odintsova T.I., Muller E.-C., Ivanov A.V., Egorov T.A., Bienert R., Vladimirov S.N., Kostka S., Otto A., Wittmann-Liebold B., Karpova G.G. Characterization and analysis of post-translational modifications of the human large cytoplasmic ribosomal subunit proteins by mass spectrometry and Edman sequencing. J. Protein Chem., 2003, v. 22, № 3, р. 249-258.

30.Odintsova T.I., Pukhalsky V.A., Egorov T.A., and Musolyamov A.K. Isolation and characterization of antimicrobial peptides from Triticum kiharae. Annual wheat newsletter, 2003, v. 49, p. 124-125.

31.Коростылева Т.В., Одинцова Т.И., Козловская Г.В., Пухальский В.А. Исследование белков листьев в трансгенных растениях табака, экспрессирующих двунитевую РНК, при вирусной инфекции. Генетика, 2004, т. 40, №4, с. 531-537.

32.Odintsova T.I., Pukhalsky V.A., Musolyamov A.K., Egorov T.A. Analysis of antimicrobial peptides from seeds of Triticum kiharae Dorof. et Migush. Annual wheat newsletter, 2004, v. 50, p. 152-153.

33.Egorov T.A., Odintsova T.I., Pukhalsky V.A., Grishin E.V. Diversity of wheat antimicrobial peptides. Peptides, 2005, v. 26, p. 2064-2073.

34.Rozhnova N., Odintsova T.I., Musin S., Gerashchenkov G. Protein patterns in potato plants in vitro during systemic antiviral resistance induced by alpha-tocopherol acetatae. Proc. Latv. Acad. Sci., 2005, v. 59, p. 67-72.

35.Odintsova T.I., Egorov T.A., Musolyamov A.K., Pukhalsky V.A. Gly-rich antimicrobial peptides from seeds of Triticum kiharae Dorof. et Migusch. Annual wheat newsletter, 2005, v. 51, p. 137-138.

36.Odintsova T.I., Pukhalsky V.A., Musolyamov A.K., Egorov T.A. Defensins of Triticum kiharae and other wheat species. Annual wheat newsletter, 2006, v. 52, p. 119-121.

37.Odintsova T.I., Egorov T.A., Musolyamov A.K., Odintsova M.S., Pukhalsky V.A., Grishin E.V. Seed defensins from T. kiharae and related species: Genome localization of defensin-encoding genes. Biochimie, 2007, v. 89, p. 605-612.

38.Рожнова Н.А., Одинцова Т.И., Геращенков Г.А. Белковый состав листьев табака при индукции антивирусной устойчивости активаторами защитных реакций и ВТМ-инфекцией. Физиол. раст., 2007, т.54, № 6, с. 870-875.

39.Odintsova T.I., Egorov T.A., Musolyamov A.K.,Korostyleva T.V. Kozlovskaya G.V. Pukhalsky V.A. Defensins of Triticum kiharae and diploid Triticum and Aegilops species, Annual wheat newsletter, 2007, v. 53, p. 78-79.

40.Одинцова Т.И., Егоров Ц.А., Коростылева Т.В., Козловская Г.В., Пухальский В.А. Исследование генома культурных растений и их сородичей: исследование спектров дефензинов у устойчивых и восприимчивых к фитопатогенам видов пшеницы. «Динамика генофондов», ФИАН, 2007, с. 139-141, ISBN978-5-902622-13-0.

41.Пухальский В.А., Одинцова Т.И., Извекова Л.И., Андреева Э. Н. Коростылева Т.В., Истомина Е.А., Славохотова А.А., Шиян А.Н.. Козловская Г.В., Оболенкова Л.А., Бадаева Е.Д., Билинская Е.Н. Проблемы естественного и приобретенного иммунитета растений. К развитию идей Н.И. Вавилова, Вестник ВОГиС, 2007, т.11, №3/4, с. 631-650.

42.Славохотова А.А., Андреева Э.Н., Шиян А.Н., Одинцова Т.И., Пухальский В.А. Особенности генов белка оболочки российских штаммов вируса зеленой крапчатой мозаики огурца, Генетика, 2007, т.43, № 11, 1535-1540.

43.Odintsova T.I., Rogozhin E.A., Baranov Yu, Musolyamov A.Kh., Yalpani N., Egorov Ts.A., Grishin E.V. Seed defensins of barnyard grass Echinochloa crusgalli (L.) Beauv. Biochimie, 2008, v. 90, p. 1667-1673.

44.Odintsova T.I., Korostyleva T.V., Odintsova M.S., Pukhalsky A.V., Grishin E.V., Egorov Ts.A. Analysis of Triticum boeoticum and Triticum urartu seed defensins: To the problem of the origin of polyploid wheat genomes. Biochimie, 2008, v. 90, p. 939-946.

45.Рогожин Е.А., Одинцова Т.И., Мусолямов А.Х., Смирнов А.Н., Бабаков А.В., Егоров Ц.А., Гришин Е.В. Выделение и характеристика нового липид-переносящего белка из зерновок ежовника обыкновенного (Echinochloa сrusgalli). Прикладная биохимия и микробиология, 2009, т. 45, №4, с. 403-409.

46.Ощепкова Ю. И., Вешкурова О. Н., Рогожин Е. А., Мусолямов А. Х., Смирнов А. Н., Одинцова Т.. И., Егоров Ц. А., Гришин Е. В., Салихов Ш. И. Выделение липидпереносящего белка Ns-LTP1 из семян чернушки посевной (Nigella sativa). Биоорг. химия, 2009, т. 35, №3; с. 344-349.

47.Odintsova T.I., Vassilevski A.A., Slavokhotova A.A., Musolyamov A.K., Finkina E.I., Khadeeva N.V., Rogozhin E.A., Korostyleva T.V., Pukhalsky V.A., Grishin E.V., Egorov T.A. A novel antifungal hevein-type peptide from Triticum kiharae seeds with a unique 10-cysteine motif. FEBS J. 2009, v. 276, № 15, p. 4266-4275.

48.Odintsova T.I., Rogozhin E.A., Sklyar I.V., Musolyamov A.K., Kudryavtsev A.M., Pukhalsky V.A., Smirnov A.N., Grishin E.V., Egorov T.A. Antifungal activity of storage 2S albumins from seeds of the invasive weed dandelion Taraxacum officinale Wigg. Protein Pept Lett. 2009, v. 17.

49. Utkina L.L., Slavokhotova A.A., Odintsova T.I., Korostyleva T.V., Pukhalskiy V.A., Musolyamov A.K., Egorov T. A. Novel antimicrobial peptides from seeds of Triticum kiharae and Leymus arenarius. Annual Wheat Newsletter, 2009, v. 55, p. 181-183.

Глава в монографии:

Odintsova T.I. and Egorov Ts.A. Wheat antimicrobial peptides. In: Peptidomics: Methods and Applications (Soloviev M., Andren P., Shaw C., eds.), 2008, p. 99-117. John Wiley & Sons, Hoboken, New Jersey.

Авторские свидетельства:

1. Авторское свидетельство №1498410 на изобретение «Способ определения сортовой чистоты семян тыквенных культур», Одинцова Т.И., Дегтяренко Л.В., Кононков П.Ф., зарегистр. в Гос. реестре изобретений СССР 27.05.1987.

2. Авторское свидетельство № 1630703 на изобретение «Способ контроля сортовой чистоты семян крестоцветных культур», Одинцова Т.И., Батманова Л.С., Глазкова-Степаненко И.С., Кононков П.Ф., зарегистр. в Гос. реестре изобретений СССР 01.11.1990.

Патент:

Патент на изобретение №2380374 (РФ) «Пептид, обладающий антимикробной активностью», Одинцова Т.И., Егоров Ц.А., Гришин Е.В., Василевский А.А., Мусолямов А.Х., Рогожин Е.А., Славохотова А.А., Пухальский В.А., Шиян А.Н., зарегистр. в Гос. реестре изобретений РФ 27.01.2010.

Материалы конференций:

1. Одинцова Т.И., Егоров Ц.А. S-бедные проламины. Выделение и характеристика. Всесоюзн. симп. «Молекулярные механизмы генетических процессов», 1987, Москва,, c.133.

1.Kononkov P.F., Degtyarenko L.V., Odintsova T.I. Identification of Cucurbitaceae species and varieties by electrophoresis of cucurbitin. III International symposium ISTA, 1988, Leningrad,

2.Egorov T.A., Odintsova T.I., Pukhalsky V.A., Grishin E.V. Wheat peptidomics. 2nd International Conference “Genomics, Proteomics and Bioinformatics for Medicine”, 2004, Moscow.

3.Егоров Ц.А., Одинцова Т.И., Бабаков Е.В, Пухальский А.В., Гришин Е.В. Разнообразие антимикробных пептидов растений. III сьезд общества биотехнологов России, 2005, Москва, с.111.

4.Одинцова Т.И., Егоров Ц.А., Коростылева Т.В., Козловская Г.В., Пухальский В.А. Исследование дефензинов пшеницы Triticum kiharae Dorof. et Migusch. III международный симпозиум «Проблемы биохимии, радиационной и космической биологии», 2007, Дубна, Россия, с. 178-181.

5.Одинцова Т.И., Егоров Ц.А., Коростылева Т.В., Козловская Г.В., Пухальский В.А. Уникальный антимикробный пептид семян пшеницы Triticum kiharae Dorof. et Migusch. Международная конференция «Современная физиология растений: от молекул до экосистем», 2007, Сыктывкар, Россия, с. 301-302.

6.Одинцова Т.И., Рогожин Е.А., Жабон Е.О., Пухальский В.А., Егоров В.А. Антимикробные пептиды растений. Международная конференция «Научное наследие Н.И. Вавилова - фундамент развития отечественного и мирового сельского хозяйства», 2007, Москва РГАУ-МСХА им. К.А. Тимирязева, с. 178-179.

7.Одинцова Т.И. Дефензины семян пшеницы. III Российский симпозиум «Белки и пептиды», 2007, Пущино-на-Оке, Россия, с.18.

8.Уткина Л.Л., Славохотова А.А., Рогожин Е.А., Одинцова Т.И., Пухальский В.А., Кудрявцев А.М. Экспрессия гена нового антимикробного пептида колосняка песчанного Leumus arenarius в прокариотической системе. V сьезд генетиков и селекционеров, 2009, Москва, с.385.

9.Odintsova T.I., Shcherbakova L, Flavel D., Egorov T.A., Suprunova T. Identification of a novel protein, a putative elicitor from a biocontrol Fusarium oxysporum, inducing tomato resistance to Fusarium wilt pathogen. XIV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, 2009, Quebec City, Canada, p.22.

10.Уткина Л.Л., Славохотова А.А., Коростылева Т.В., Андреев Я.А., Василевский А.А., Рогожин Е.А., Одинцова Т.И., Егоров Ц.А., Гришин Е.В. Гетерологическая экспрессия генов, кодирующих новые защитные пептиды растений зерновок пшеницы Кихара (Triticum kiharae) и колосняка песчаного (Lemus arenarius) в клетках Escherichia coli. V Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», 2009, Москва.

11.Коростылева Т.В., Рогожин Е.В., Андреев Я.А., Одинцова Т.И. Изучение влияния биотических и абиотических факторов на экспрессию гена антимикробного пептида WAMP-1а из пшеницы Triticum kiharae Dorof et Migush, Всероссийская научная конференция «Устойчивость организмов к неблагоприятным факторам внешней среды», 2009, Иркутск, Россия, с. 247-250.