Научная тема: «ИССЛЕДОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНЫХ МЕХАНИЗМОВ ФУНКЦИОНИРОВАНИЯ ПРОДУКТОВ ГЕНА TRITHORAX В РЕГУЛЯЦИИ ТКАНЕСПЕЦИФИЧЕСКОЙ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ У DROSOPHILA MELANOGASTER»
Специальность: 03.01.03; 03.01.07
Год: 2011
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. Определена структура и локализация в эмбрионах на разных стадиях развития альтернативно сплайсируемых транскриптов гена trithorax (trx) Drosophila melanogaster.
  2. Детектированы соответствующие альтернативным транскриптам основные белковые изоформы Триторакса (TRX). Установлено, что TRX является ядерным белком и способен связываться с определенными участками политенных хромосом слюнных желёз.
  3. Проведен сравнительный анализ первичной структуры гена trx и соответствующих альтернативных транскриптов у Drosophila virilis и у Drosophila melanogaster. Выявлена высокая консервативность как структуры этого гена, так и распределения его транскриптов в эибриогенезе.
  4. TRX и ASH1, продукт другого гена группы Триторакса, непосредственно взаимодействуют, и их участки связывания с политенными хромосомами совпадают или находятся в непосредственной близости друг от друга.
  5. Исследован in vivo регуляторный элемент PRE/TRE из дальней промоторной области гена Ultrabithorax. Выявлена необычно сложная его структура, состоящая из многих функционально значимых участков, способных взаимодействовать с белками и активационной и репрессионной систем.
  6. В расширенной промоторной области гена fork head уточнены границы и продемонстрирована функциональная значимость in vivo нового регуляторного элемента (TRE), необходимого для TRX-зависимого поддержания экспрессии этого гена в клетках слюнных желёз личинки дрозофилы. Получены данные о ко-локализации TRE со скаффолд / матрикс-ассоциированными участками хромосом.
  7. Проведено крупномасштабное исследование изменений транскрипции генов человека (на микрочипах фирмы Аффиметрикс) в случае лейкемий с хромосомными нарушениями, затрагивающими ген ALL1/MLL1 (гомолог дрозофилиного TRX). Выявлены гены, которые могут быть непосредственно вовлечены в онкогенез. Полученные результаты демонстрируют наличие характерного рисунка транскрипционной активности генов в ALL1-ассоциированных опухолях.
  8. Белок TRX, известный как хромосомный белок и важный компонент системы поддержания транскрипционно активного состояния многих генов, может быть выявлен в ассоциации с не хромосомными элементами ядерного скелета.
  9. Разработан новый подход к исследованию клеточных компонентов (в том числе и пока неизвестных), ассоциированных с определённым белком на примере получения однодоменных мини-антител к компонентам хроматина, ассоциированным с регуляторным белком Триторакс (TRX).
  10. Продемонстрирован новый метод наблюдения за антигеном в живых клетках с помощью специально генерированных флуоресцирующих мини-антител.
Список опубликованных работ
1.Sedkov I., Tillib S., Mizrokhi L. and Mazo A. (1994) The bithorax complex is regulated by trithorax earlier during Drosophila embryogenesis than is the Antennapedia complex, correlating with a bithorax-like expression pattern of distinict early trithorax transcripts. Development 120,1907-1917.

2.Kuzin B., Tillib S., Sedkov I., Mizrokhi L. and Mazo A. (1994) The Drosophila trithorax gene encodes a chromosomal protein and directly regulates the region-specific homeotic gene fork head. Genes & Dev. 8,2478-2490.

3.Tillib S., Sedkov Y., Mizrokhi. L., Mazo A. (1995) Conservation of structure and expression of the trithorax gene between Drosophila virilis and Drosophila melanogaster. Mechanisms of Development 53, 113-122.

4.Rozenblatt-Rosen O., Rosovskaya T., Burakov D., Tillib S., Sedkov Yu., Blechman J., Nakamura T.,Croce C., Mazo A. and Canaani E.(l998) The C-terminal SET domains of ALL-I and TRITHORAX interact with the INII and SNRI proteins, components of the SWI/SNF complex. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 4152-4157.

5.Sedkov Y., Benes J., Berger J., Riker K., Tillib S., Jones R. and Mazo A. (1999) Molecular genetic analysis of Drosophila trithorax-related gene that encodes a novel SET domain protein. Mechanisms of Development 82, 171-179.

6.Tillib S., Petruk S., Sedkov Y., Kuzin A., Fujioka M., Goto T. and Mazo A. (1999) Trithorax and Polycomb group response elements within a Ultrabithorax transcription maintenance unit consist of closely situated but separable sequences. Mol. Cell. Biol. 19, 5289-5202.

7.Rosovskaya T., Tillib S., Smith S. , Sedkov Y., Rozenblatt-Rosen O., Petruk S., Yano T., Nakamura T., Ben-Simchon L., Gildea J., Croce C., Shearn A., Canaani E and Mazo A. (1999) Trithorax and ASH1 interact directly and associate with the Trithorax-Group responsive bxd region of the Ultrabithorax promoter. Mol. Cell. Biol. 19, 6441-6447.

8.Petruk S., Sedkov Y., Smith S., Tillib S., Kraevsky V., Nakamura T., Canaani E., Croce C.M., Mazo A. Epigenetic regulator trithorax and acetyltransferase dCBP act in a protein complex to maintain expression of a homeotic gene. Science, 2001, 294: 1331-1334.

9.Tillib S.V., Mirzabekov A.D. (2001) Advances in the analysis of DNA sequence variations using oligonucleotide microchip technology. Curr Opin Biotechnol. 12, 53-58.

10.Rozovskaia T., Ravid-Amir O., Tillib S., Getz G., Feinstein E., Agrawal H., Nagler A., Rappaport E.F., Issaeva I., Matsuo Y., Kees U.R., Lapidot T., Lo Coco F., Foa R., Mazo A., Nakamura T., Croce C.M., Cimino G., Domany E., Canaani E. Expression profiles of acute lymphoblastic and myeloblastic leukemias with ALL-1 rearrangements. Proc Natl Acad Sci U S A. 2003, 100(13):7853-7858.

11.Л.А.Лебедева, С.В.Тиллиб. Глобальный фактор поддержания тканеспецифического активного состояния генов Diosophila melanogaster белок TRITHORAX, ассоциирован с ядерным матриксом. Генетика 2003, 39(2):250-258.

12.Smith S.T., Petruk S., Sedkov Y., Cho E., Tillib S., Canaani E., Mazo A. Modulation of heat shock gene expression by the TAC1 chromatin-modifying complex. Nature Cell Biol. 2004; 6(2):162-7.

13.Rothbauer U., Zolghadr K., Tillib S., Nowak D., Schermelleh L., Gahl A., Backmann N., Conrath K., Muyldermans S., Cardoso M.C., Leonhardt H. Targeting and tracing antigens in live cells with fluorescent nanobodies. Nature Methods 2006, 3, 887-889.

14.Ряховский А.А., Тиллиб С.В. Иммунопреципитационное картирование TRX-ассоциированных участков хромосом в промоторе гена fkh в клетках слюнных желез Drosophila melanogaster. Генетика 2007, Т. 43, №9, С. 1181-1189.

15.Ряховский А.А., Тиллиб С.В. Колокализация S/MAR и TRE в регуляторных участках хромосом тканеспецифически экспрессирующихся генов Drosophila melanogaster. Доклады Академии Наук 2007, Т. 416, №3, С. 416-419.

16.Вятчанин А.С., Тиллиб С.В. Новый подход к исследованию клеточных компонентов, ассоциированных с определённым белком. Доклады Академии Наук. 2008.Т.421. №6. С. 826-829.

17.Вятчанин А.С., Тиллиб С.В. Модификации процедуры фагового дисплея для повышения эффективности селекции антиген-связывающих доменов особых одноцепочечных верблюжьих антител. Биотехнология. 2008. №4. С. 32-34.

18.S. Muyldermans, T.N. Baral, V. Cortez Retamozzo, P. De Baetselier, E. De Genst, J. Kinne, H. Leonhardt, S. Magez, V.K. Nguyen, H. Revets, U. Rothbauer, B. Stijlemans, S. Tillib, U. Wernery, L. Wyns, Gh. Hassanzadeh-Ghassabeh and D. Saerens. Camelid immunoglobulins, nanobody technology. Veterinary Immunology and Immunopathology. 2009,128(1-3):178-83.

19.Тиллиб С.В., Иванова Т.И., Васильев Л.А. Фингерпринтный анализ селекции «наноантител» методом фагового дисплея с использованием двух вариантов фагов-помощников. 2010. Acta Naturae 2, №3 (6), 100-108.

20.Тиллиб С. В. «Верблюжьи антитела» - эффективный инструмент для исследований, диагностики и терапии. 2011. Молекулярная биология 45, №1, 77-85.