Научная тема: «ИДЕНТИФИКАЦИЯ НОВЫХ ГЕНОВ ДРОЖЖЕЙ S. POMBE И ИХ РОЛЬ В РЕКОМБИНАЦИОННОЙ РЕПАРАЦИИ ДНК»
Специальность: 03.01.07
Год: 2011
Отрасль науки: Биологические науки
Основные научные положения, сформулированные автором на основании проведенных исследований:
  1. Впервые идентифицированы три новых гена (rhp55+, rlp1+ и sfr1+) в клетках дрожжей S. pombe с функцией в рекомбинационной репарации двуцепочечных разрывов ДНК, два из которых, rhp55+ и rlp1+, кодируют белки S. pombe с гомологией к E. coli RecA.
  2. Открыт новый путь сборки Rad51 - нуклеопротеинового филамента, действующий параллельно Rad51-паралогам Rhp55-Rhp57 и Rlp1. Полученные данные опровергают общепринятую модель одного линейного пути образования Rad51 - филамента в клетках дрожжей и позволяют рассматривать возможность многообразия механизмов медиаторных путей в клетках высших эукариот.
  3. Показан новый Cds1 - независимый путь в механизме толерантности к УФ - повреждениям ДНК в дрожжах S. pombe, контролируемый белком Sfr1.
  4. Идентифицирован новый домен (PSA) в белке Sfr1, используемый в качестве модуля для ассоциации с Rad51Sp, ключевым белком гомологичной рекомбинации. Молекулярный анализ привел к идентификации белков с потенциальными PSA повторами и в других эукариотических организмах, что позволяет предположить консервативность этих доменов в низших эукариотах, в частности, в грибах.
Список опубликованных работ
1.Гаврилова Е.В., Мехедов С.Л., Прозоров А.А., Хасанов Ф.К. Ген B. subtilis rec223: клонирование и функция белка. Генетика. 1992 28:29-39.

2.Khasanov F.K., Zvingila D.J., Zainullin A.A., Prozorov A.A., Bashkirov V.I. Homologous recombination between plasmid and chromosomal DNA in Bacillus subtilis requires approximately 70 bp of homology. Molecular and General Genetics. 1992. 234:494-497.

3.Sekiguchi J., Akeo K., Yamamoto H., Khasanov F.K., Alonso J.C., Kuroda A. Nucleotide sequence and regulation of a new putative cell wall hydrolase gene, cwlD, which affects germination in Bacillus subtilis. Journal of Bacteriology. 1995. 177:5582-5589.

4.Khasanov F.K., Savchenko G.V., Bashkirova E.V., Korolev V.G., Heyer W.D., Bashkirov V.I. A new recombinational DNA repair gene from Schizosaccharomyces pombe with homology to Escherichia coli RecA. Genetics. 1999. 152:1557-1572.

5. Хасанов Ф.К., Башкиров В.И. Амплификация ДНК происходит между коровой последовательностью репликационного ориджина ori+ ts плазмиды, инегрированной в хромосому, и его аналогом в геноме клетки. Молекулярная биология. 2000 34:804-808.

6. Tsutsui Y, Khasanov FK, Shinagawa H, Iwasaki H, Bashkirov VI. Multiple interactions among the components of the recombinational DNA repair system in Schizosaccharomyces pombe. Genetics. 2001. 159:91-105.

7.Хасанов Ф.К., Башкиров В.И. Рекомбинационная репарация в Schizosaccharomyces pombe: роль в поддержании целостности генома. Молекулярная биология. 2001. 35:750-763.

8.Khasanov FK, Salakhova AF, Chepurnaja OV, Korolev VG, Bashkirov VI. Identification and characterization of the rlp1+, the novel Rad51 paralog in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe. DNA repair (Amst). 2004. 3:1363-1374.

9.Салахова А.Ф., Савченко Г.В., Хасанов Ф.К., Чепурная О.В., Королев В.Г., Башкиров В.И. Ген dds20+ контролирует новый Rad51Sp – зависимый путь рекомбинационной репарации в Schizosaccharomyces pombe. Генетика. 2005 41:736-745.

10.Вагин Д.А., Хасанов Ф.К., Башкиров В.И. Роль белков рекомбинационной репарации в переключении типа спаривания в клетках делящихся дрожжей. Генетика. 2006. 42:487-493.

11.Вагин Д.А., Башкиров В.И., Хасанов Ф.К. Анализ мутаций в локусе mat1 у штамма Schizosaccharomyces pombe с делецией гена rhp55+. Генетика. 2006. 42:602-610.

12.Султанова А.Н., Салахова А.Ф., Башкиров В.И., Хасанов Ф.К. Клеточные фенотипы мутанта по гену, кодирующему Rad51 паралог в делящихся дрожжах. Генетика. 2007. 43:183-188.

13.Салахова А.Ф., Башкиров В.И., Хасанов Ф.К. Dds20 оперирует в cds1 – независимом механизме толерантности УФ – индуцированных повреждений ДНК в клетках Schizosaccharomyces pombe. Генетика. 2007. 43:417-421.

14.Khasanov F.K., Salakhova A.F., Khasanova O.S., Grishchuk A.L., Chepurnaja O.V., Korolev V.G., Kohli J., Bashkirov V.I. Genetic analysis reveals different roles of Schizosaccharomyces pombe sfr1/dds20 in meiotic and mitotic DNA recombination and repair. Current Genetics. 2008. 54:197-211.

15.Хасанова О.С., Башкиров В.И., Хасанов Ф.К. Картирование сайта взаимодействия между рекомбинационными белками в дрожжевых клетках. Доклады Академии Наук. 2010. 434:242-244.

Тезисы конференций:

16. V. Bashkirov, F. Khasanov, G. Savchenko, V. Korolev and W.-D. Heyer Schizosaccharomyces pombe rhp55+ encodes a novel protein with homology to bacterial RecA proteins. Abstracts of FASEB Conference on Genetic Recombination, Snowmass Village, Snowmass, Colorado, USA, August 3-7 1997.

17. W.-D. Heyer, V.I. Bashkirov, F.K. Khasanov, and G.V. Savchenko. The Schizosaccharomyces pombe rhp55+ gene is involved in recombinational repair of DNA double- strand breaks. Abstracts of Symposium on Molecular and Cellular Mechanisms of Genetic Recombination, Osaka, Japan, 1998.

18.D.A. Vagin, F.K. Khasanov, V.I. Bashkirov. rhp55+ gene is involved in mating-type switching in S. pombe. Abstracts of International Conference “Molecular Genetics of Eukaryotes”, Moscow. February 4-7 2003.

19.Khasanov Fuat, Albina F. Salakhova, Edgar Hartsuiker, Galina V. Savchenko, Vladimir G. Korolev, Alexandra Grishchuk, Juerg Kohli, Antony M. Carr, Vladimir I. Bashkirov. Novel Rad51Sp-dependent pathway of recombination/repair in Schizosaccharomyces pombe mediated by Dds20 protein. Genetic Recombination & Genome Rearrangements. FASEB Meeting. Snowmass Village, Snowmass, Colorado, USA. July 26-31 2004.

20.Khasanov F.K. Khasanova O.S. Recombinational repair in the fission yeast. Scientific Meeting on DNA Repair, Recombination & Replication, Zurich, Switzerland, December 13-15 2006.

21. Khasanova O, Khasanov F. A novel type of repeats mediates interaction between Schizosaccharomyces pombe Rad51 and Sfr1 proteins. 4th Int. Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB’09, Moscow, Russia, July 20-23, 2009.

22. Khasanova O.S., Khasanov F.K. The novel protein motif that responsible for association with Rad51 in fungi. International Symposium «Control of Gene Expression and Cancer», Moscow, Russia, June 21-25, 2010.